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Heatmap: Cluster_298 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.23 0.03 -0.11 0.03 -0.12 -0.04 -0.1 -0.05 -0.06 -0.04 0.04 0.14
0.08 -0.01 -0.06 -0.01 -0.1 0.01 -0.09 -0.06 -0.05 0.01 0.12 0.14
0.47 0.07 -0.34 -0.73 -0.1 -0.97 -0.2 0.04 -0.09 -0.35 0.66 0.62
0.82 -0.33 -0.71 -0.3 -0.3 -0.36 -0.39 -0.46 -0.13 -0.08 0.6 0.64
0.29 0.05 -0.3 -0.49 -0.43 0.1 -0.4 -0.35 -0.22 0.09 0.33 0.75
0.15 0.06 0.03 0.07 -0.08 -0.01 -0.09 0.02 -0.16 -0.1 0.05 0.03
0.21 0.17 -0.01 0.12 -0.1 -0.04 -0.12 -0.12 -0.21 -0.12 0.0 0.15
0.26 0.14 -0.09 -0.15 -0.18 -0.17 -0.32 -0.26 -0.3 -0.1 0.28 0.57
0.1 0.04 -0.05 0.07 -0.09 -0.04 -0.12 -0.04 -0.09 0.02 0.05 0.12
0.07 0.14 0.05 0.12 -0.12 0.09 -0.09 -0.11 -0.14 -0.1 -0.0 0.05
0.25 -0.06 -0.1 -0.28 -0.41 -0.11 0.02 0.08 -0.05 0.08 0.14 0.28
0.21 0.04 -0.1 -0.14 -0.22 -0.03 -0.04 -0.03 -0.15 0.07 0.12 0.19
0.33 0.42 0.04 -0.11 -0.51 -0.11 -0.29 -0.45 -0.46 0.14 0.18 0.39
0.12 0.09 0.06 -0.16 -0.16 -0.07 -0.21 0.09 -0.2 0.07 0.14 0.15
0.02 -0.01 0.04 0.1 -0.02 0.05 -0.05 0.01 -0.08 -0.1 0.01 0.02
0.16 -0.48 -0.58 -0.06 -0.16 -0.06 -0.06 0.11 0.18 0.06 0.21 0.39
0.09 0.1 0.01 0.12 -0.14 0.07 -0.08 -0.1 -0.1 -0.05 0.02 0.01
0.25 0.27 0.01 0.14 -0.11 -0.05 -0.11 -0.08 -0.27 -0.15 -0.02 0.03
0.21 0.06 -0.05 0.09 -0.08 0.07 -0.07 -0.04 -0.13 -0.1 -0.01 -0.0
0.21 0.1 0.05 0.11 -0.11 -0.03 -0.08 -0.12 -0.22 -0.07 0.01 0.08
0.2 0.14 0.08 0.1 -0.08 -0.06 -0.12 -0.11 -0.15 -0.16 0.06 0.05
0.7 0.13 -1.0 -1.59 -0.72 -0.56 0.13 -0.58 -0.21 0.55 0.97 0.13
0.14 0.04 -0.01 0.08 -0.04 0.02 -0.06 -0.03 -0.08 -0.08 -0.01 0.02
0.17 0.15 -0.07 0.11 -0.09 0.01 -0.1 -0.09 -0.24 -0.14 0.08 0.14
0.33 -0.01 -0.22 -0.14 -0.37 -0.06 -0.06 -0.11 -0.09 0.15 0.25 0.17
0.2 0.16 -0.08 0.13 -0.19 0.02 -0.16 -0.09 -0.32 -0.11 0.11 0.21
0.13 0.11 0.09 0.18 -0.03 0.02 -0.11 -0.06 -0.17 -0.11 -0.1 -0.01
0.14 0.1 0.03 0.16 -0.1 0.05 -0.1 -0.02 -0.07 -0.15 -0.05 -0.02
-0.07 0.06 -0.27 -0.27 -0.31 0.09 -0.02 0.05 -0.37 0.04 0.34 0.46
0.16 0.26 0.08 0.12 -0.18 0.02 -0.08 -0.07 -0.29 -0.23 0.04 0.06
0.14 0.16 0.06 0.06 -0.12 0.09 -0.06 -0.1 -0.12 -0.21 -0.03 0.08
0.22 0.17 0.05 0.13 -0.16 0.04 -0.05 -0.1 -0.16 -0.19 -0.09 0.07
0.12 0.12 0.01 0.06 -0.1 -0.06 -0.06 -0.07 -0.1 -0.02 -0.0 0.07
0.23 0.14 -0.0 0.1 -0.13 -0.01 -0.12 -0.06 -0.16 -0.09 0.01 0.03
0.14 0.16 0.02 0.1 -0.03 -0.01 -0.05 -0.01 -0.29 -0.14 -0.04 0.08
0.33 -0.1 -0.18 -0.17 -0.21 -0.05 -0.2 -0.22 -0.08 0.02 0.19 0.46
-0.23 -0.25 -0.13 -0.2 -0.19 -0.21 0.16 0.12 -0.04 -0.04 0.34 0.45
0.14 0.56 -0.45 -0.12 -0.87 -0.33 -0.28 0.04 -0.0 0.06 0.25 0.42
0.2 0.12 -0.01 0.17 -0.07 0.03 -0.13 -0.11 -0.13 -0.14 -0.03 0.04
0.39 -0.38 -0.23 -0.19 -0.23 -0.14 -0.04 -0.0 0.06 0.13 0.21 0.22
0.07 0.05 -0.02 0.06 -0.07 0.04 -0.04 -0.05 -0.05 -0.01 -0.02 0.04
0.21 0.13 0.05 0.19 -0.15 -0.04 -0.11 -0.13 -0.16 -0.13 -0.04 0.1
-0.01 -0.14 -0.08 -0.1 -0.12 -0.0 -0.12 -0.01 -0.06 0.13 0.2 0.25
0.37 0.14 -0.05 -0.57 -0.45 -0.03 -0.23 -0.23 -0.42 0.16 0.32 0.53
0.22 0.11 0.0 -0.13 -0.14 0.02 -0.02 -0.04 -0.08 -0.02 0.02 0.04
0.01 0.1 0.02 0.05 -0.04 0.04 -0.07 -0.0 -0.14 -0.07 0.0 0.07
0.22 0.12 -0.14 -0.13 -0.13 0.01 -0.05 -0.22 -0.12 0.02 0.14 0.2
0.2 0.06 0.01 0.12 -0.08 -0.0 -0.08 -0.05 -0.16 -0.14 -0.05 0.13
0.2 0.15 -0.05 -0.12 -0.18 -0.01 -0.11 -0.09 -0.1 0.03 0.08 0.14
0.58 -0.23 -1.24 -0.95 -0.08 0.15 -0.63 -0.06 0.03 0.16 0.33 0.73
0.01 0.09 0.04 0.11 -0.03 -0.0 -0.08 -0.05 -0.15 -0.08 0.06 0.04
1.14 0.61 -0.04 -0.44 -0.58 -0.27 -0.43 -0.4 -0.42 -0.33 -0.27 0.26
0.17 0.26 -0.19 -0.14 -0.38 0.1 -0.04 0.01 -0.22 -0.07 0.09 0.25
0.08 0.12 0.04 0.08 -0.15 -0.02 -0.11 0.01 -0.05 -0.04 0.01 0.0

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.