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Heatmap: Cluster_93 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.64 0.16 0.54 0.58 0.28 0.13 -0.26 0.14 -0.1 -0.38 -0.61 -0.54
-1.52 1.05 1.32 1.28 0.51 0.3 -0.79 -0.16 -2.96 -2.33 -2.56 -4.88
0.31 -0.2 0.15 0.11 0.44 0.06 0.41 -0.26 -0.43 -0.33 0.06 -0.82
-0.04 -0.0 0.1 0.01 0.02 -0.03 -0.05 -0.06 0.1 0.05 -0.01 -0.11
0.06 -0.07 0.39 0.47 0.04 0.1 0.05 0.11 -0.11 -0.4 -0.34 -0.68
-0.27 0.58 0.42 0.74 0.12 0.2 -0.4 -0.06 -0.26 -0.65 -0.54 -0.84
1.04 -1.32 0.11 -0.52 -0.89 1.17 1.45 -0.05 -0.81 -1.24 -2.33 -3.78
2.71 - 1.73 - - 0.18 - - -0.01 - - -
0.17 0.19 0.18 0.17 0.0 -0.1 -0.2 -0.04 0.02 -0.13 -0.2 -0.15
-0.28 -0.18 0.63 0.78 0.3 -0.07 -0.02 -0.25 -0.2 -0.28 -0.48 -0.74
0.23 0.03 0.13 0.25 0.27 -0.1 0.04 -0.21 -0.02 -0.18 -0.3 -0.3
-0.04 -0.32 -0.06 0.31 -0.02 0.2 0.2 0.18 -0.03 0.01 -0.21 -0.38
0.36 -0.18 0.07 0.17 0.03 0.02 -0.18 0.09 0.08 -0.18 -0.12 -0.29
0.2 0.12 0.15 0.07 0.05 0.08 0.07 -0.15 0.14 -0.16 -0.29 -0.4
0.19 0.01 0.28 0.14 0.08 -0.07 0.04 -0.05 -0.18 -0.08 -0.18 -0.29
-0.5 -0.11 0.5 0.75 0.29 -0.17 -0.08 -0.05 -0.32 -0.07 -0.25 -0.6
-0.07 0.13 0.25 0.1 0.13 -0.05 -0.11 -0.19 -0.03 0.01 -0.02 -0.22
0.11 0.23 0.16 0.07 0.09 -0.0 -0.05 0.08 -0.1 -0.38 -0.17 -0.15
-0.08 -0.0 0.24 0.14 0.18 0.05 0.06 0.05 -0.15 -0.3 -0.16 -0.12
0.05 -0.04 0.01 0.04 0.14 0.05 0.02 0.0 0.04 -0.06 -0.08 -0.21
0.35 0.36 0.34 0.07 0.31 -0.12 -0.08 -0.54 -0.05 -0.26 -0.61 -0.18
0.33 0.08 0.31 0.02 0.06 -0.42 -0.07 -0.22 0.02 0.01 -0.1 -0.18
0.14 0.56 0.3 0.03 0.25 -0.0 -0.05 -0.01 -0.19 -0.45 -0.39 -0.63
-0.11 -0.02 0.07 0.11 -0.03 0.22 0.05 0.07 -0.03 -0.23 -0.06 -0.09
-0.43 0.44 0.31 0.68 0.26 0.4 -0.17 0.04 -0.41 -0.48 -0.82 -0.78
1.08 0.91 0.35 0.21 -0.24 0.29 -0.33 -0.07 -0.92 -1.09 -1.01 -1.89
-0.55 0.49 0.45 0.07 0.24 -0.14 -0.41 0.15 -0.24 -0.22 0.08 -0.35
-0.0 0.06 0.13 0.17 0.01 -0.11 -0.08 -0.03 -0.08 -0.03 -0.05 -0.02
2.29 - 2.49 -0.3 - - - - - -0.61 - -
-0.04 0.1 0.28 0.11 -0.01 -0.11 -0.09 -0.01 0.08 -0.06 -0.1 -0.24
-0.05 -0.04 0.19 0.09 0.16 0.17 0.07 0.1 0.0 -0.17 -0.41 -0.24
2.65 - 1.99 - 0.83 - - - - - - -
-0.47 0.14 0.42 0.22 0.54 0.37 0.15 0.1 -0.18 -0.56 -0.57 -0.99
0.47 -0.24 0.19 0.29 0.36 0.11 -0.02 0.05 -0.2 -0.55 -0.24 -0.68
0.23 -0.22 -0.25 0.1 0.37 0.14 -0.13 0.04 0.1 -0.1 -0.14 -0.32
0.02 0.11 0.1 0.14 -0.02 0.13 0.02 0.13 -0.09 -0.22 -0.21 -0.19
0.12 0.13 0.27 0.15 0.16 -0.27 0.06 -0.05 -0.23 -0.09 -0.15 -0.24
0.32 -0.33 -0.17 0.36 0.05 0.05 0.03 0.21 0.17 -0.01 -0.27 -0.76
0.06 -0.07 0.01 0.06 -0.0 0.01 0.06 0.02 0.15 -0.02 -0.11 -0.19
-0.05 0.1 0.16 0.22 0.07 -0.06 -0.09 0.03 0.13 -0.19 -0.15 -0.26
0.03 0.39 0.47 0.58 0.2 0.06 -0.03 -0.16 -0.19 -0.49 -0.73 -0.92
-0.28 -0.55 0.03 0.33 0.41 0.14 0.06 -0.24 0.21 -0.01 0.02 -0.45
-0.25 0.42 0.36 0.49 0.18 -0.0 -0.44 -0.07 -0.3 -0.17 -0.35 -0.28
0.1 0.4 0.29 0.19 0.21 -0.05 0.07 0.09 -0.22 -0.3 -0.57 -0.59
-0.19 -0.01 0.08 -0.05 -0.0 0.0 -0.03 0.01 0.08 0.07 0.07 -0.05
-0.19 -0.08 -0.0 0.1 0.05 0.24 0.05 0.22 0.17 -0.26 -0.16 -0.24
-0.01 -0.06 0.04 -0.05 0.07 0.14 0.12 0.16 0.05 -0.08 -0.17 -0.27
0.05 0.08 0.06 0.02 0.13 -0.06 -0.09 -0.04 -0.05 -0.06 -0.03 -0.03
0.23 -0.01 0.7 0.93 -0.33 -0.38 0.15 0.22 -0.47 -0.64 -1.44 -0.43
0.14 0.16 0.33 0.19 0.18 -0.15 0.11 0.07 -0.05 -0.29 -0.45 -0.52
0.04 -0.03 0.18 0.01 0.03 -0.03 0.02 0.14 0.04 -0.25 -0.1 -0.09
-0.04 0.06 0.21 0.15 0.18 0.08 0.05 0.05 0.01 -0.2 -0.32 -0.35
-0.17 -0.71 0.24 0.64 0.41 0.15 0.35 -0.16 0.03 -0.19 -0.36 -1.05
0.15 0.15 0.1 0.29 0.06 -0.18 -0.04 0.04 0.03 -0.25 -0.16 -0.32
-0.12 -0.05 -0.1 0.27 0.02 0.13 0.26 0.02 -0.07 -0.19 0.0 -0.27
-0.25 -0.01 -0.09 0.3 0.11 0.11 -0.05 -0.05 -0.07 0.09 0.03 -0.21
1.97 0.95 1.57 - -0.92 - - - 0.19 -0.46 -0.34 -
0.8 -1.01 0.21 -0.94 0.02 0.57 0.59 0.19 -0.33 0.04 -0.69 -1.01
0.08 0.03 0.08 0.08 0.08 0.0 -0.0 0.03 0.04 -0.17 -0.16 -0.12
-0.35 0.28 0.25 0.29 0.37 0.22 -0.13 0.15 -0.07 -0.38 -0.47 -0.57
0.17 0.18 0.15 0.22 0.07 0.08 -0.12 0.03 -0.06 -0.25 -0.31 -0.29
0.06 -0.34 0.54 0.43 -0.06 -0.04 -0.24 0.03 0.13 -0.55 -0.61 0.18
0.36 0.52 0.38 0.78 -0.22 -0.22 0.05 0.31 -0.27 -0.74 -1.06 -1.45
-0.79 -0.18 0.42 0.43 0.49 0.38 0.44 -0.14 -0.28 -0.34 -0.47 -0.85
0.13 -0.03 0.1 0.06 0.04 0.03 0.0 0.0 0.22 -0.31 -0.1 -0.23
0.23 0.23 0.53 0.48 0.44 0.36 -0.09 -0.01 -0.49 -0.82 -0.98 -1.09
-0.24 0.25 0.41 0.21 0.04 -0.13 -0.08 -0.03 -0.02 -0.15 -0.14 -0.32

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.