Heatmap: Cluster_233 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.19 -0.37 -0.15 -0.13 -0.06 -0.22 0.14 0.11 0.36 0.15 0.07 0.13
-0.13 -0.27 -0.17 -0.52 -0.08 -0.13 0.12 0.09 0.17 0.33 0.26 0.1
-0.02 -0.05 -0.18 -0.03 -0.01 -0.0 -0.01 -0.03 0.12 0.08 0.04 0.08
-0.1 -0.22 -0.4 -0.66 -0.23 0.01 0.21 0.27 0.29 0.3 0.26 -0.08
-0.27 -0.33 -0.18 -0.18 -0.01 -0.07 -0.02 0.07 0.32 0.24 0.15 0.12
0.01 -0.41 -0.57 -0.9 -0.44 -0.59 0.07 0.02 0.69 0.63 0.43 0.07
0.02 -0.17 -0.15 -0.06 0.01 -0.12 0.05 0.09 0.14 0.12 -0.02 0.05
-0.12 -0.11 -0.16 -0.3 -0.0 -0.08 0.0 0.11 0.13 0.25 0.23 -0.04
-0.0 -0.15 -0.32 -0.28 -0.26 -0.29 0.08 0.05 0.35 0.31 0.26 0.03
0.13 -0.18 -0.16 -0.32 -0.03 -0.21 -0.04 0.03 0.18 0.13 0.27 0.08
-0.04 -0.35 -0.27 -0.32 -0.02 -0.24 -0.05 0.14 0.3 0.24 0.2 0.2
0.1 -0.07 -0.19 -0.39 -0.18 -0.2 0.03 0.11 0.2 0.27 0.19 -0.03
0.08 -0.17 -0.14 -0.22 -0.09 -0.21 0.05 0.08 0.25 0.2 0.05 0.02
-0.06 -0.27 -0.18 -0.09 0.1 0.0 0.07 0.17 0.13 0.08 -0.07 0.05
-0.06 -0.06 -0.14 -0.08 -0.08 0.0 -0.04 0.04 0.24 0.0 0.06 0.07
-0.08 -0.17 -0.25 -0.46 -0.48 -0.25 0.04 -0.04 0.34 0.38 0.35 0.26
0.05 -0.1 -0.11 -0.22 -0.15 -0.18 -0.05 -0.05 0.17 0.15 0.15 0.24
0.06 -0.08 -0.04 -0.2 -0.12 -0.18 0.06 0.13 0.16 0.07 0.05 0.04
-0.09 -0.17 -0.12 -0.18 0.08 -0.07 0.06 0.13 0.19 0.07 -0.0 0.06
0.11 -0.11 -0.13 -0.21 -0.12 0.01 -0.02 0.06 0.13 0.08 0.09 0.06
-0.17 -0.12 0.02 -0.1 0.01 -0.08 0.09 0.22 0.09 0.04 -0.08 0.04
0.09 -0.29 -0.28 -0.41 -0.34 -0.23 -0.04 0.31 0.44 0.35 0.18 -0.12
-0.15 -0.09 -0.14 -0.2 -0.1 -0.01 0.04 0.15 0.23 0.23 0.07 -0.12
-0.05 -0.19 -0.12 -0.08 -0.04 -0.19 -0.11 0.03 0.3 0.18 0.04 0.15
-0.08 -0.26 -0.2 -0.12 -0.09 -0.08 0.15 0.14 0.23 0.08 0.07 0.08
-0.11 -0.09 -0.13 -0.02 -0.02 -0.11 -0.11 0.14 0.08 0.11 0.11 0.1
-0.07 -0.07 -0.06 -0.33 -0.19 -0.22 0.08 0.03 0.21 0.26 0.18 0.06
-0.03 -0.12 -0.19 -0.18 -0.02 0.02 0.01 0.02 0.17 0.08 0.03 0.18
-0.16 -0.02 -0.11 -0.34 -0.08 -0.04 0.07 0.07 0.13 0.22 0.15 0.02
0.08 -0.18 -0.19 -0.11 -0.01 -0.05 -0.01 0.26 0.06 0.03 0.01 0.03
-0.01 -0.18 -0.18 -0.09 -0.01 -0.09 -0.04 0.04 0.21 0.15 0.04 0.1
-0.01 -0.24 -0.15 -0.15 0.02 -0.1 -0.02 0.11 0.32 0.14 0.02 -0.02
-0.08 -0.1 -0.17 -0.17 -0.1 -0.08 0.04 0.13 0.18 0.12 0.14 0.02
-0.19 0.01 -0.23 -0.23 -0.04 -0.21 0.16 0.06 0.2 0.12 0.17 0.06
-0.08 -0.09 -0.06 -0.13 -0.05 -0.01 0.02 0.08 0.21 0.08 0.02 -0.01
-0.05 -0.14 -0.1 -0.1 0.02 -0.11 0.0 0.18 0.1 0.05 0.02 0.08
0.07 0.02 -0.08 -0.23 -0.29 -0.33 -0.03 0.06 0.25 0.17 0.15 0.09
0.03 -0.09 -0.15 -0.16 -0.05 -0.06 -0.03 0.06 0.03 0.2 0.1 0.08
0.15 -0.26 -0.16 -0.31 -0.15 -0.05 0.02 0.16 0.2 0.16 0.17 -0.03
-0.01 -0.05 -0.13 -0.3 -0.09 -0.09 -0.01 0.14 0.1 0.18 0.11 0.08
-0.1 -0.09 -0.34 -0.5 -0.1 -0.12 0.1 0.13 0.26 0.26 0.16 0.13
-0.04 -0.06 -0.16 -0.19 -0.04 -0.13 0.08 0.11 0.11 0.09 0.12 0.06
-0.1 -0.07 -0.2 -0.27 -0.01 -0.03 0.05 0.01 0.15 0.14 0.16 0.1
-0.03 -0.07 -0.17 -0.21 -0.08 -0.15 0.04 0.09 0.13 0.12 0.17 0.1
-0.26 -0.15 -0.27 -0.56 -0.06 -0.07 0.07 0.22 0.3 0.16 0.11 0.26
-0.08 -0.14 -0.01 -0.19 0.03 -0.02 -0.01 0.09 0.14 0.03 0.03 0.09
0.07 -0.18 -0.21 -0.16 -0.04 -0.01 0.01 0.05 0.14 0.08 0.08 0.1
-0.05 -0.16 -0.14 -0.1 -0.07 -0.03 -0.02 0.07 0.19 0.12 -0.02 0.16
0.18 -0.1 -0.21 -0.26 -0.21 -0.16 -0.05 0.09 0.19 0.24 0.16 0.01
-0.11 -0.03 -0.06 -0.14 -0.02 -0.11 0.17 -0.03 0.11 0.07 0.08 0.04
0.03 -0.19 -0.13 -0.06 -0.03 -0.1 0.05 0.11 0.12 0.08 -0.01 0.11
-0.04 -0.2 -0.09 -0.18 -0.03 0.02 -0.0 0.11 0.15 0.09 -0.08 0.2
-0.06 -0.11 -0.14 -0.11 -0.02 0.03 -0.03 0.04 0.14 0.1 0.04 0.09
0.14 -0.23 -0.18 -0.28 -0.12 -0.14 -0.01 0.19 0.11 0.19 0.08 0.13
-0.09 -0.13 -0.04 -0.11 0.04 -0.14 0.06 0.09 0.17 -0.0 0.0 0.11
-0.06 -0.19 -0.08 -0.07 -0.07 0.09 0.01 0.14 0.04 0.02 0.13 0.03
-0.02 -0.22 -0.29 -0.34 -0.12 -0.22 0.01 0.3 0.33 0.23 0.02 0.11
0.42 -0.42 -0.6 -0.46 -0.15 -0.58 0.04 -0.27 0.31 0.42 0.47 0.16
-0.14 -0.26 -0.28 -0.38 -0.0 -0.0 0.03 0.43 0.16 0.27 0.15 -0.2
0.02 -0.18 -0.25 -0.07 -0.03 -0.12 0.02 0.05 0.19 0.1 0.1 0.1
0.05 -0.03 -0.23 -0.39 0.03 -0.05 -0.01 0.09 0.17 0.04 0.14 0.11
0.03 -0.19 -0.16 -0.12 -0.03 -0.01 0.01 0.05 0.12 0.13 -0.02 0.14
0.03 -0.24 -0.15 -0.09 -0.03 -0.04 0.07 0.07 0.21 0.08 -0.03 0.06
-0.19 -0.09 -0.1 -0.2 -0.02 -0.02 0.04 0.1 0.18 0.11 0.07 0.07
0.02 -0.26 -0.25 -0.15 -0.12 -0.12 0.03 0.11 0.17 0.14 0.2 0.13
-0.21 -0.43 -0.27 -0.14 0.12 -0.29 0.15 0.0 0.32 0.15 0.12 0.26
0.01 -0.12 -0.15 -0.27 -0.06 -0.12 0.06 0.17 0.16 0.19 0.01 0.05
-0.15 -0.14 -0.06 -0.11 -0.07 -0.11 0.07 0.07 0.24 0.11 0.02 0.08
-0.07 -0.23 -0.13 -0.19 -0.08 -0.0 -0.03 0.28 0.18 0.15 0.09 -0.07
- -0.4 -0.68 - - - - 1.93 -0.83 0.64 1.82 0.19
0.07 -0.14 -0.04 -0.38 0.02 -0.07 0.08 -0.0 0.16 0.07 0.13 0.02
-0.0 -0.15 -0.2 -0.17 0.05 -0.05 0.1 0.0 0.19 -0.0 0.04 0.13
0.05 -0.01 -0.14 -0.29 -0.11 -0.07 0.05 0.13 0.07 0.15 0.12 -0.01
0.06 -0.26 -0.28 -0.28 0.06 -0.19 0.03 0.12 0.22 0.1 0.09 0.18
-0.11 -0.45 -0.17 -0.29 -0.03 -0.13 -0.01 0.02 0.19 0.43 0.24 0.09
-0.02 0.03 -0.18 -0.56 -0.02 -0.12 0.07 0.06 0.2 0.13 0.19 0.07
0.04 -0.15 -0.17 -0.13 -0.12 -0.11 0.02 0.15 0.19 0.03 0.12 0.07
-0.02 -0.18 -0.24 -0.24 -0.18 -0.14 0.02 0.12 0.24 0.24 0.17 0.11

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.