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Heatmap: Cluster_5 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.12 -0.08 0.08 0.22 0.24 0.22 -0.09 -0.39 -0.43 -0.1 0.05 0.22
-0.48 -0.18 0.23 0.46 0.54 0.38 0.13 -0.22 -0.32 -0.36 -0.41 -0.31
-0.02 0.19 0.25 0.23 -0.0 0.04 -0.11 -0.18 -0.15 -0.16 -0.17 -0.01
-1.95 -0.3 0.02 0.25 0.49 0.25 -0.17 -0.59 -0.15 0.11 0.27 0.48
-0.18 -0.09 -0.04 0.19 0.29 0.29 0.09 -0.22 -0.31 -0.18 -0.02 0.02
-0.59 -0.3 0.06 0.39 0.55 0.39 0.2 -0.21 -0.33 -0.33 -0.25 -0.08
-0.27 0.05 0.18 0.17 0.19 0.12 -0.0 -0.11 -0.01 -0.1 -0.23 -0.09
-0.61 -0.18 0.13 0.36 0.43 0.29 -0.06 -0.32 -0.25 -0.05 -0.06 -0.02
-0.85 -0.34 0.12 0.22 0.4 0.04 -0.15 -0.55 0.04 0.1 0.11 0.37
-0.5 -0.24 0.24 0.49 0.57 0.35 0.23 -0.2 -0.26 -0.5 -0.57 -0.24
-0.71 -0.5 0.22 0.98 0.68 0.42 -0.15 -0.67 -0.54 -0.43 -0.57 -0.03
-0.36 -0.21 -0.07 0.21 0.3 0.31 0.12 -0.1 -0.21 -0.15 -0.07 0.07
0.02 -0.08 -0.01 0.23 0.32 0.14 0.02 -0.37 -0.35 -0.25 -0.05 0.2
-0.09 -0.07 -0.19 -0.09 0.06 0.04 0.2 -0.04 0.1 -0.0 0.06 -0.01
-0.22 0.22 0.15 0.42 0.15 0.2 -0.09 -0.19 -0.54 -0.36 -0.21 0.17
-0.94 -0.27 0.03 0.16 0.3 0.15 -0.02 -0.31 0.01 0.07 0.19 0.24
-0.43 -0.17 -0.01 -0.04 0.15 0.07 -0.02 -0.23 -0.16 0.15 0.19 0.34
-0.45 -0.26 0.07 0.24 0.32 0.12 -0.0 -0.4 -0.14 0.04 0.06 0.19
-0.69 -0.17 0.09 0.27 0.24 0.19 -0.15 -0.4 -0.03 0.1 0.03 0.23
-0.39 -0.2 0.09 0.23 0.36 0.31 0.08 -0.21 -0.13 -0.18 -0.19 0.0
-0.19 -0.14 -0.08 0.16 0.18 0.35 0.03 -0.31 -0.4 -0.24 0.16 0.27
0.02 -0.04 -0.11 -0.01 0.14 0.1 -0.02 -0.25 -0.29 -0.11 0.16 0.31
-0.06 0.11 0.15 0.18 0.18 0.22 0.07 -0.08 -0.2 -0.28 -0.26 -0.14
-0.49 -0.08 0.13 0.33 0.26 0.3 -0.03 -0.32 -0.29 -0.14 -0.06 0.14
-0.44 -0.14 0.16 0.36 0.51 0.38 0.17 -0.34 -0.4 -0.43 -0.31 0.01
-0.31 -0.15 -0.09 0.03 0.14 0.19 -0.02 -0.22 -0.12 0.11 0.14 0.2
-0.71 -0.17 0.19 0.4 0.33 0.23 -0.0 -0.31 -0.15 -0.08 -0.11 0.04
-0.16 -0.18 -0.04 0.04 0.07 0.1 0.01 -0.13 -0.13 0.04 0.11 0.22
-0.12 -0.28 -0.05 -0.04 0.16 0.03 0.19 -0.02 0.11 -0.06 0.01 0.02
-0.49 -0.24 -0.07 0.09 0.28 0.01 -0.11 -0.47 -0.23 0.22 0.38 0.3
-0.07 0.17 0.06 0.17 0.16 0.24 0.03 -0.18 -0.32 -0.28 -0.13 0.01
-0.19 0.02 0.06 0.2 0.15 0.2 0.05 0.02 -0.12 -0.07 -0.11 -0.28
-0.43 -0.08 0.08 0.24 0.28 0.25 0.03 -0.26 -0.29 -0.12 0.01 0.1
-0.02 0.01 -0.04 0.13 0.1 0.11 -0.0 -0.19 -0.18 -0.07 -0.0 0.12
-0.1 -0.22 -0.07 0.11 0.1 0.11 0.04 -0.07 0.03 0.02 0.0 -0.01
0.0 -0.11 -0.01 0.06 0.09 0.08 0.01 -0.27 -0.12 -0.02 0.01 0.21
-0.23 -0.07 0.07 0.39 0.46 0.35 0.03 -0.32 -0.22 -0.19 -0.38 -0.2
-0.43 -0.42 -0.09 0.44 0.28 0.07 -0.14 -0.16 -0.08 0.11 0.04 0.15
0.11 -0.09 -0.16 -0.04 0.29 0.25 0.11 -0.34 -0.26 -0.19 -0.03 0.2
-0.81 -0.26 0.09 0.31 0.32 0.27 -0.01 -0.29 -0.13 0.04 0.01 0.09
-0.45 0.05 0.21 0.43 0.37 0.34 -0.06 -0.27 -0.59 -0.4 -0.23 0.14
-0.21 -0.16 -0.01 0.05 0.24 0.17 0.05 -0.18 -0.08 -0.11 -0.02 0.18
-0.39 -0.26 0.09 0.31 0.51 0.39 0.14 -0.25 -0.39 -0.31 -0.18 -0.06
0.04 0.1 0.08 0.19 0.13 0.15 -0.07 -0.21 -0.31 -0.19 -0.08 0.07
-0.69 -0.3 0.04 0.47 0.76 0.63 0.26 -0.32 -0.53 -0.59 -0.54 -0.2
-0.19 -0.14 -0.07 0.01 0.01 -0.07 -0.07 -0.15 -0.05 0.19 0.19 0.27
-0.28 -0.14 0.03 0.2 0.26 0.25 0.01 -0.27 -0.24 -0.1 -0.01 0.13
-0.57 -0.18 0.16 0.51 0.53 0.49 0.16 -0.14 -0.4 -0.47 -0.5 -0.24
-0.88 -0.24 0.05 0.34 0.36 0.31 0.04 -0.31 -0.17 -0.08 -0.03 0.17
-0.41 -0.28 0.06 0.33 0.43 0.25 0.12 0.01 -0.11 -0.29 -0.29 -0.11
-0.33 -0.3 -0.29 0.13 0.53 0.18 -0.27 -0.81 -0.64 -0.08 0.34 0.73
0.0 -0.34 -0.03 0.27 0.36 0.37 0.06 -0.54 -0.17 -0.21 -0.07 0.01
-0.22 -0.06 -0.03 0.14 0.13 0.23 0.05 -0.16 -0.22 -0.1 -0.01 0.14
-0.38 -0.26 -0.09 0.21 0.32 0.27 0.02 -0.24 -0.21 -0.01 0.04 0.12
-0.35 -0.15 0.07 0.2 0.17 0.15 -0.04 -0.19 -0.16 0.03 0.08 0.08
-0.63 -0.2 0.11 0.3 0.31 0.16 -0.12 -0.28 -0.21 0.05 0.06 0.19
-0.19 0.05 0.18 0.19 0.32 0.13 0.05 -0.19 -0.24 -0.22 -0.2 -0.02
-0.31 -0.17 -0.12 0.04 0.16 0.21 0.06 -0.15 -0.15 0.0 0.15 0.17
-1.05 -0.52 -0.38 0.12 0.6 0.39 0.33 0.21 0.08 0.1 0.02 -0.77
-0.31 -0.1 -0.07 0.07 0.21 0.12 0.0 -0.2 -0.1 0.06 0.13 0.11
-0.3 -0.2 0.0 0.28 0.5 0.28 0.08 0.01 -0.15 -0.27 -0.22 -0.28

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.