Heatmap: Cluster_96 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.07 -0.09 -0.21 -0.16 -0.02 -0.03 0.05 -0.06 0.09 0.11 0.08 0.13
0.23 0.12 0.03 0.1 -0.04 -0.27 -0.28 -0.19 0.01 0.09 0.03 0.06
- 2.02 - - - - - - - - 2.99 -
0.37 0.04 -0.02 -0.09 -0.17 -0.13 -0.17 -0.08 0.05 0.03 0.07 0.02
0.52 0.07 -0.18 -0.26 -0.17 -0.26 -0.18 -0.19 0.18 0.13 0.06 0.06
1.51 0.79 -1.49 -0.08 -0.61 - -0.41 - 0.63 -0.25 0.76 -0.66
0.21 0.04 -0.09 0.01 -0.19 -0.26 -0.11 -0.11 0.1 0.12 0.1 0.11
0.51 0.11 0.01 -0.4 -0.28 -0.11 -0.05 0.03 -0.08 0.07 0.07 -0.09
0.08 -0.12 -0.22 -0.33 -0.06 -0.15 -0.03 0.09 0.13 0.18 0.16 0.19
0.54 0.08 -0.12 -0.32 -0.34 -0.14 -0.31 -0.24 0.09 0.28 0.26 -0.07
0.37 0.01 -0.12 -0.09 -0.02 -0.08 -0.13 -0.07 0.08 0.03 0.04 -0.11
0.6 0.22 -0.02 -0.46 -0.63 -0.21 -0.52 -0.27 0.27 0.32 0.16 -0.01
0.52 0.06 -0.21 -0.29 -0.25 -0.35 -0.18 -0.06 0.03 0.1 0.23 0.15
0.32 0.12 -0.13 -0.04 -0.03 -0.11 -0.17 0.0 0.0 -0.06 0.02 0.02
0.46 0.03 -0.18 -0.15 -0.26 -0.22 -0.45 -0.29 -0.1 0.14 0.29 0.4
0.37 -0.08 -0.24 -0.23 -0.12 -0.17 0.01 0.0 0.01 0.02 0.18 0.14
- 1.69 -0.11 - 0.65 - -1.02 - - -1.08 2.25 -0.87
0.3 -0.02 -0.02 -0.07 -0.08 -0.13 -0.1 -0.22 0.06 0.14 0.03 0.04
0.26 0.09 -0.11 -0.13 -0.22 -0.31 -0.2 -0.1 -0.01 0.12 0.19 0.26
1.37 0.12 -0.77 -1.45 -0.83 -1.24 -0.62 -1.11 0.34 0.28 0.28 0.67
0.21 0.06 -0.07 -0.06 -0.05 -0.13 -0.1 -0.11 0.05 0.06 0.11 -0.03
0.09 0.1 0.0 -0.18 -0.07 -0.03 -0.07 -0.03 -0.04 0.1 0.12 -0.03
1.25 0.55 0.01 -0.53 -0.94 -0.84 -0.47 -0.31 -0.34 -0.53 0.31 0.17
0.7 -0.07 -0.57 -0.27 -0.25 -0.25 -0.36 -0.27 0.01 0.12 0.17 0.49
0.43 -0.08 -0.23 -0.18 -0.1 -0.3 -0.2 -0.32 0.1 0.18 0.2 0.26
0.28 -0.05 -0.35 -0.24 -0.24 -0.24 -0.25 -0.2 0.1 0.28 0.36 0.27
0.44 0.17 -0.12 -0.1 -0.08 -0.17 0.07 -0.18 -0.01 0.06 0.06 -0.29
0.47 0.12 -0.18 -0.11 -0.12 -0.32 -0.12 -0.04 -0.03 0.06 0.03 0.08
0.64 0.07 -0.37 -0.47 -0.18 -0.59 0.01 -0.1 -0.04 0.23 0.21 0.14
0.3 0.07 -0.21 -0.43 -0.24 -0.21 0.08 0.03 -0.0 0.11 0.14 0.19
0.54 -0.03 -0.25 -0.46 -0.59 -0.31 -0.17 -0.25 0.12 0.36 0.41 0.13
0.64 0.32 -0.45 -0.08 -0.48 0.24 -0.34 -0.08 0.19 -0.17 0.31 -0.71
0.32 0.01 -0.4 -0.34 -0.35 -0.13 -0.04 -0.17 0.04 0.23 0.29 0.27
0.36 -0.1 -0.44 -0.05 -0.16 -0.18 -0.06 -0.36 -0.02 0.07 0.16 0.49
0.18 -0.22 -0.12 -0.19 -0.1 -0.28 -0.08 -0.11 0.13 0.16 0.22 0.27
0.29 0.06 -0.1 -0.03 -0.11 -0.09 -0.12 -0.09 -0.01 0.14 0.04 -0.03
0.48 0.02 -0.38 -0.4 -0.36 -0.42 -0.06 -0.02 0.01 0.15 0.36 0.26
0.32 0.14 -0.12 -0.13 -0.18 -0.24 -0.17 -0.2 0.04 0.24 0.1 0.06
1.31 0.49 -0.26 -0.72 -0.55 -0.89 -0.45 -0.76 -0.11 0.23 0.18 -0.17
0.25 0.08 -0.06 -0.02 -0.13 -0.23 -0.04 -0.08 -0.07 0.03 0.1 0.12
2.0 0.23 -2.58 - -2.51 -0.12 - - 0.72 0.44 1.36 -
0.9 0.06 -0.72 -0.54 -0.61 -0.47 -0.42 -0.48 0.11 0.22 0.22 0.62
1.22 -0.87 -0.95 -0.79 -0.41 -0.79 -0.19 -0.93 -0.0 -0.03 0.52 0.91
0.39 0.05 -0.03 -0.11 -0.09 -0.27 -0.05 -0.07 -0.01 -0.05 0.09 0.05
0.21 -0.01 -0.2 -0.26 -0.32 -0.21 -0.1 -0.09 0.04 0.2 0.3 0.27
0.45 0.18 -0.09 -0.2 -0.15 -0.16 -0.14 -0.05 -0.02 -0.01 0.05 0.01
2.97 - - - - - - - - - 2.06 -
0.36 -0.03 -0.29 -0.25 -0.24 -0.22 -0.16 -0.09 0.0 0.12 0.24 0.34
0.44 0.04 -0.17 -0.23 -0.25 -0.25 -0.1 -0.08 0.13 0.12 0.0 0.17
2.22 - - - - - - 0.52 - 1.77 1.32 -
0.25 -0.18 -0.19 -0.24 -0.03 -0.15 -0.05 -0.02 0.06 0.04 0.17 0.22
0.65 -0.03 -0.61 -0.35 -0.5 -0.29 -0.22 -0.12 0.16 0.29 0.32 0.17
0.89 0.27 -0.13 -0.44 -0.41 -0.56 -0.23 -0.16 -0.01 0.0 0.08 0.09
0.03 -0.08 -0.09 -0.07 -0.08 -0.04 -0.09 -0.3 0.09 0.05 0.06 0.4
0.3 0.02 -0.09 -0.04 -0.11 -0.07 -0.11 -0.03 0.06 -0.01 0.12 -0.1
0.57 0.25 -0.46 -0.52 -0.45 -0.53 -0.45 -0.4 0.1 0.12 0.35 0.64
0.51 0.29 -0.2 -0.2 -0.17 -0.43 -0.21 -0.52 -0.03 0.14 0.09 0.34
0.42 0.11 -0.15 -0.25 -0.22 -0.18 -0.23 -0.27 -0.06 0.1 0.16 0.35
2.01 - 0.76 - -0.18 - - - - - 2.43 -
-0.02 -0.12 -0.1 -0.16 0.01 -0.04 0.04 -0.07 0.13 0.12 0.06 0.12
0.17 0.05 -0.0 -0.01 -0.01 -0.0 -0.13 -0.16 -0.03 0.06 0.02 0.02
0.08 -0.14 -0.1 -0.14 0.01 -0.14 0.02 -0.05 0.13 0.1 0.14 0.05
0.09 -0.14 -0.31 -0.1 -0.16 -0.13 0.04 -0.04 0.13 0.19 0.15 0.18
1.12 0.24 -1.79 - 0.17 -0.28 0.29 -0.72 0.16 0.23 0.98 -1.68
2.97 - - - - - - - - - 2.06 -
0.07 -0.26 -0.19 0.05 -0.12 -0.17 -0.02 0.03 0.17 0.11 0.12 0.12
0.26 0.08 -0.1 -0.19 -0.08 -0.09 -0.12 -0.07 0.06 0.12 0.08 -0.02
0.31 0.15 0.16 -0.08 -0.15 -0.44 -0.53 -0.31 0.23 0.18 0.08 0.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.