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Heatmap: Cluster_119 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.39 0.21 -0.31 0.5 -0.16 0.21 -0.07 0.15 -0.11 -0.33 -0.08 0.11
- - 0.42 1.46 0.67 2.29 - - 0.5 - - -
- - 1.48 2.62 -1.36 0.5 - -0.91 -1.84 - -1.24 -
0.48 0.15 0.4 -0.01 0.47 0.34 -0.77 -0.72 -0.07 -0.53 -0.5 -0.02
0.1 0.17 0.1 0.01 0.04 -0.19 0.07 -0.16 -0.1 0.03 -0.04 -0.08
-1.32 0.16 0.8 0.93 0.22 -1.97 -1.16 0.54 -0.62 -0.06 -0.5 0.25
-0.22 0.03 0.09 0.25 0.03 0.1 -0.01 0.1 -0.12 -0.11 -0.14 -0.06
-0.88 0.23 0.79 0.34 -0.44 -0.45 -0.68 -0.68 -0.22 0.37 -0.04 0.54
-0.08 0.08 -0.01 -0.14 0.15 -0.0 -0.01 0.04 0.02 -0.04 0.12 -0.15
0.06 -0.05 0.64 0.61 -1.02 0.45 -0.22 -0.08 -0.75 -0.01 -0.71 0.07
-0.37 - 0.73 -0.26 0.58 1.15 -1.53 - -1.88 0.39 1.21 -0.38
-0.85 -1.49 0.59 1.76 -0.94 0.28 0.45 - -0.47 - 1.07 -1.87
0.09 0.11 -0.03 0.11 -0.14 -0.31 -0.05 0.15 -0.1 -0.12 0.13 0.09
0.06 -0.04 -0.11 0.05 -0.17 0.04 0.0 0.09 0.01 0.05 -0.09 0.07
0.38 0.39 0.44 0.06 -1.11 -4.12 0.38 0.45 -0.09 -0.4 -1.14 0.72
-0.05 -0.14 -0.06 0.18 -0.16 0.04 0.1 0.04 0.16 0.0 -0.12 -0.05
-2.83 0.65 0.45 0.46 0.26 0.34 -0.13 -0.14 -0.5 -0.55 -0.08 -0.11
0.45 0.43 0.73 0.06 -0.46 -1.12 -0.19 -0.79 -0.25 -0.42 -0.53 0.73
-0.58 0.62 0.08 0.07 0.02 -0.24 -0.62 0.16 0.05 0.12 -0.11 0.02
1.48 -1.88 0.33 0.26 -0.79 -0.73 -0.41 0.78 -1.39 -0.62 0.61 -1.89
-0.04 0.02 0.14 0.01 -0.04 0.08 0.09 0.04 -0.11 -0.13 -0.0 -0.09
0.23 0.21 0.04 0.16 0.15 0.1 -0.07 0.07 -0.1 -0.31 -0.84 0.06
0.73 - -0.11 0.91 -0.52 -0.29 -0.16 0.19 0.41 0.57 0.08 -3.11
- - - 2.38 0.41 2.45 - - - - - -
- - - 1.41 -1.48 0.2 1.28 0.52 -0.1 1.13 -0.24 -
-0.02 -0.31 -0.07 -0.01 0.05 -0.01 -0.26 0.17 -0.1 0.12 0.09 0.26
-0.07 0.65 -0.25 0.21 0.38 0.91 -0.88 -0.9 -0.33 -0.46 -0.78 0.16
0.07 0.12 -0.16 0.01 -0.16 -0.04 0.19 -0.02 -0.04 -0.0 -0.0 0.0
-0.37 -0.22 -0.01 0.09 0.05 0.04 0.01 -0.19 -0.56 0.04 0.4 0.42
- - - 1.83 -2.18 1.61 1.08 -1.57 -1.26 -2.26 0.72 -1.09
- -0.04 -0.3 1.94 - 0.69 - -2.39 -0.39 1.02 0.56 -1.71
0.28 0.04 0.06 0.11 0.11 0.02 -0.11 -0.1 -0.2 -0.22 -0.11 0.04
-0.1 -0.61 0.24 0.24 -0.72 0.51 0.24 -0.15 -0.69 -0.23 -0.01 0.56
- 1.33 -0.49 0.74 0.54 -0.52 -0.56 -0.73 -2.01 0.35 - 1.1
-0.27 -0.17 0.05 0.1 0.27 0.41 0.27 -0.17 -0.11 -0.12 -0.63 0.08
-0.22 -0.08 0.07 0.08 0.08 -0.12 0.13 -0.22 -0.02 0.03 0.17 0.03
0.45 0.05 -0.37 -0.5 -1.11 -0.63 0.59 -0.63 0.53 0.18 -0.19 0.5
- -1.65 0.42 1.71 -0.87 1.65 - - 1.31 - -0.62 -1.89
-0.28 0.14 0.37 -0.01 -0.35 -0.18 -0.17 0.02 -0.15 0.18 0.2 0.05
0.07 0.45 0.39 0.12 -0.3 0.57 0.07 0.1 -1.74 -1.09 -0.24 0.2
0.7 0.34 1.15 0.73 -0.54 -0.04 -1.43 -0.65 -0.61 -1.01 -1.67 0.13
-0.24 -0.32 -0.35 0.73 0.36 0.37 0.51 -0.11 0.08 -0.74 -0.69 -0.53
-0.03 0.13 -0.11 0.17 0.2 0.25 0.26 -0.26 -0.12 -0.17 -0.17 -0.31
- -0.02 0.52 0.09 -1.33 1.41 -0.55 -0.92 -0.32 0.85 0.39 -1.61
-0.32 -0.15 0.36 0.36 -0.01 -0.18 0.2 -0.05 -0.11 -0.19 -0.09 -0.0
0.22 0.04 0.13 0.15 -0.11 -0.59 -0.22 0.08 -0.5 0.26 -0.27 0.45
0.07 0.15 0.13 0.07 0.01 -0.05 0.01 -0.01 -0.09 -0.11 -0.22 0.0
- 0.14 -0.48 -0.6 0.14 -0.63 -0.4 0.38 0.48 0.69 0.21 0.63
0.33 0.58 0.11 0.01 0.24 0.54 0.24 -0.62 -0.73 -1.34 -0.75 0.14
1.1 0.4 -0.39 0.08 -3.08 - -0.61 1.31 -0.51 0.29 - 0.61
-0.06 0.03 0.02 0.02 -0.03 0.03 0.07 -0.1 -0.01 -0.04 -0.06 0.12
0.12 0.55 -0.63 0.47 -0.48 0.34 -0.44 -0.83 0.07 -0.16 0.23 0.01
-0.04 0.22 0.19 -0.03 -0.02 0.09 -0.14 0.03 -0.15 -0.14 -0.04 -0.02
0.14 -0.02 0.15 0.14 0.03 -0.12 -0.08 -0.07 -0.07 -0.13 0.02 -0.03
0.66 0.14 0.14 -0.51 -0.4 -1.79 0.31 0.19 -0.72 0.25 -1.38 0.92
-0.24 - 1.2 1.64 - 1.24 - -0.82 1.02 -1.46 - -1.25
0.67 0.95 -0.02 -0.26 0.27 -0.5 -1.96 -0.94 -0.63 -0.5 0.2 0.55
- - 0.23 2.82 0.39 1.29 - - - - - -
-0.09 0.05 0.12 0.08 -0.03 -0.06 0.19 -0.04 0.01 -0.08 -0.14 -0.06
-0.46 -0.39 0.23 0.97 0.43 0.14 0.55 -0.42 -0.97 -0.61 -0.39 -0.33
-0.04 -0.08 0.28 0.29 0.01 0.22 0.08 0.18 -0.29 -0.37 -0.11 -0.37
-0.11 0.04 -0.33 0.16 -0.03 0.14 -0.12 -0.27 -0.26 0.14 0.1 0.36
-0.2 -0.03 -0.01 0.17 0.01 0.04 0.04 0.02 0.1 0.01 -0.15 -0.04
- - - 2.77 - 2.37 - - - - - -
-0.11 0.19 -0.08 0.21 -0.22 -0.25 0.24 -0.18 -0.16 -0.08 0.22 0.09
-0.12 0.07 0.02 0.19 0.16 0.07 0.01 -0.11 -0.09 -0.15 -0.15 0.05
0.17 -0.06 0.06 -0.08 0.15 -0.04 -0.05 -0.29 0.04 0.12 0.02 -0.09
0.03 -0.02 0.09 0.56 -0.21 -0.39 -0.12 0.15 -0.13 0.06 -0.48 0.18
-0.63 0.25 0.25 0.36 0.31 -0.28 -0.25 -0.95 0.1 0.42 -0.17 -0.03
0.73 0.99 -1.02 -2.04 -2.33 -1.69 -0.85 1.01 0.21 -0.38 0.37 0.41
-0.12 0.74 0.04 -0.17 0.24 0.78 -0.51 -0.18 -0.35 -1.48 -0.28 0.06
-0.06 0.05 0.19 -0.11 0.11 0.02 -0.06 -0.17 0.03 -0.1 0.08 -0.02
0.1 0.18 0.09 -0.15 -0.06 -0.03 -0.08 0.01 -0.04 -0.04 0.01 -0.03
- - - 2.52 - 2.65 - - - - - -
-0.31 - -1.56 1.56 -0.5 - 0.51 0.11 - 0.43 1.35 -0.32
0.58 -2.53 0.1 1.11 -0.31 1.17 -1.84 -0.17 0.0 -0.76 0.04 -1.9
0.13 0.13 0.15 0.17 -0.17 -0.16 -0.11 -0.13 -0.07 -0.2 0.06 0.13

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.