Heatmap: Cluster_161 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	1 h after light	3 h after light	5 h after light	7 h after light	9 h after light	11 h after light	13 h after light	15 h after light	1 h after dark	3 h after dark	5 h after dark	7 h after dark
Pp1s100_220V6	-1.2	-0.62	-0.16	0.14	0.16	0.35	0.4	0.33	0.14	0.03	-0.14	-0.13
Pp1s102_63V6	-0.35	-0.21	-0.14	-0.06	0.02	0.09	0.24	0.13	0.19	0.05	0.04	-0.12
Pp1s103_99V6	-0.44	-0.8	-0.24	-0.09	0.26	0.17	0.32	0.32	0.46	0.13	-0.2	-0.43
Pp1s11_136V6	-0.93	-0.57	-0.34	-0.05	-0.01	0.36	0.5	0.49	0.39	0.01	-0.29	-0.32
Pp1s122_170V6	-0.69	-0.23	-0.01	0.13	0.08	0.2	0.2	0.28	0.02	-0.07	-0.05	-0.09
Pp1s125_14V6	-0.5	-0.38	-0.13	0.18	-0.02	0.0	0.04	0.09	0.18	0.32	0.04	-0.02
Pp1s125_69V6	-0.55	-0.22	-0.03	0.12	0.13	0.11	0.15	0.14	0.19	0.04	-0.11	-0.12
Pp1s128_98V6	-0.66	-0.73	-0.28	-0.13	0.17	0.17	0.34	0.33	0.36	0.15	-0.02	-0.2
Pp1s129_140V6	-1.01	-0.43	0.05	0.15	0.23	0.14	0.17	0.3	0.12	-0.0	0.01	-0.17
Pp1s12_160V6	-1.06	-0.36	0.08	0.17	0.14	0.25	0.21	0.3	0.19	0.1	-0.1	-0.45
Pp1s136_188V6	-0.52	-0.08	-0.06	0.07	0.05	-0.04	0.11	0.04	0.31	0.17	0.0	-0.18
Pp1s139_38V6	-0.55	-0.17	-0.09	-0.02	0.12	0.14	0.13	0.22	0.13	0.03	-0.04	-0.06
Pp1s13_380V6	-0.3	-0.47	-0.0	0.12	0.25	0.1	0.18	0.17	0.24	-0.03	-0.21	-0.25
Pp1s13_403V6	-0.7	-0.45	-0.16	-0.05	0.22	0.17	0.39	0.24	0.19	-0.0	-0.13	-0.04
Pp1s150_116V6	-0.23	-0.24	-0.28	-0.08	0.09	0.11	0.2	0.18	0.31	0.07	-0.07	-0.22
Pp1s15_398V6	-0.41	-0.41	-0.2	0.11	0.15	0.19	0.12	0.13	0.24	0.08	0.01	-0.21
Pp1s165_3V6	-0.53	-0.3	-0.02	0.11	0.17	0.04	0.16	0.12	0.24	0.03	-0.05	-0.14
Pp1s166_109V6	-0.66	-0.47	-0.08	0.23	0.06	0.26	0.21	0.33	0.12	-0.0	-0.06	-0.28
Pp1s167_55V6	-0.58	-0.52	-0.16	0.32	0.33	0.15	0.24	0.23	0.1	-0.12	-0.22	-0.12
Pp1s167_88V6	-0.15	-0.31	-0.01	-0.1	0.21	0.12	0.19	0.06	0.15	0.04	-0.03	-0.27
Pp1s16_230V6	-0.31	-0.06	0.05	0.13	0.1	0.15	0.0	0.14	0.04	-0.03	-0.11	-0.19
Pp1s170_74V6	-0.32	-0.3	-0.07	0.1	0.18	-0.14	0.16	-0.04	0.26	0.14	-0.01	-0.08
Pp1s176_64V6	-0.2	-0.21	-0.09	0.24	0.12	0.24	0.17	0.08	0.11	-0.02	-0.29	-0.33
Pp1s177_61V6	-0.58	-0.71	-0.2	-0.04	0.38	0.14	0.21	0.14	0.31	0.07	-0.05	-0.04
Pp1s178_11V6	-0.24	-0.17	-0.01	0.01	0.05	0.08	0.14	0.14	0.07	0.04	-0.06	-0.11
Pp1s185_2V6	-0.27	-0.35	0.07	0.09	0.34	0.13	0.15	0.0	0.04	0.01	-0.15	-0.2
Pp1s185_93V6	-0.39	-0.33	-0.06	-0.04	0.15	0.11	0.06	0.18	0.14	0.02	0.12	-0.1
Pp1s191_118V6	-0.32	-0.31	-0.11	0.08	0.29	0.13	0.06	-0.03	0.07	0.01	-0.01	0.03
Pp1s19_140V6	-0.17	-0.11	-0.06	-0.03	-0.05	0.06	0.1	0.13	0.13	0.03	0.0	-0.07
Pp1s212_117V6	-0.43	-0.21	0.01	0.15	0.18	0.08	-0.02	0.14	0.13	0.07	-0.03	-0.19
Pp1s215_24V6	-0.66	-0.56	-0.2	-0.06	0.14	0.27	0.25	0.29	0.37	0.13	-0.07	-0.35
Pp1s21_381V6	-0.48	-0.45	-0.07	-0.04	0.29	0.1	0.17	0.2	0.23	0.06	-0.07	-0.16
Pp1s222_136V6	-1.62	-0.75	-0.09	0.26	0.26	0.32	0.27	0.14	0.17	0.16	0.08	-0.16
Pp1s224_83V6	-0.6	-0.08	0.17	0.3	0.31	0.27	0.03	0.03	0.02	-0.1	-0.46	-0.19
Pp1s22_345V6	-0.57	-0.13	0.01	0.16	0.21	0.27	0.14	0.04	0.01	-0.01	-0.06	-0.28
Pp1s231_7V6	-0.36	-0.28	0.18	-0.05	0.38	0.07	0.29	0.1	0.03	-0.04	-0.23	-0.29
Pp1s241_27V6	-0.3	-0.33	-0.17	0.05	0.1	0.19	0.14	0.17	0.15	0.07	-0.08	-0.12
Pp1s242_68V6	-0.73	-0.16	-0.05	0.1	0.16	0.07	0.1	0.14	0.23	0.15	-0.06	-0.16
Pp1s243_3V6	-0.56	-0.45	-0.03	0.11	0.25	0.21	0.29	0.29	0.11	-0.19	-0.11	-0.22
Pp1s245_50V6	-0.19	-0.09	0.1	0.2	0.09	-0.01	-0.02	0.08	-0.01	-0.03	-0.04	-0.12
Pp1s246_137V6	-3.05	-1.68	-0.1	0.58	0.42	0.75	0.45	0.67	0.11	-0.25	-0.67	-0.7
Pp1s246_138V6	-2.45	-0.91	0.23	0.51	0.57	0.57	0.5	0.37	0.11	-0.28	-0.61	-1.09
Pp1s25_31V6	-0.75	-0.3	-0.01	-0.01	0.09	0.17	0.2	0.18	0.18	0.14	-0.05	-0.11
Pp1s278_9V6	-0.65	-0.36	-0.02	-0.06	0.13	0.24	0.19	0.14	0.32	0.04	-0.01	-0.24
Pp1s284_21V6	-1.04	-0.53	0.02	0.2	0.34	0.26	0.18	0.03	0.23	0.03	-0.12	-0.1
Pp1s285_47V6	-0.47	-0.12	0.1	0.19	0.12	0.19	0.01	0.09	-0.01	-0.07	0.03	-0.18
Pp1s28_90V6	-0.97	-0.66	-0.19	0.11	0.3	0.32	0.29	0.32	0.39	0.01	-0.19	-0.4
Pp1s297_5V6	-0.98	-2.28	-2.1	-0.8	0.34	0.82	0.94	0.72	0.53	0.1	-0.44	-0.68
Pp1s29_343V6	-0.05	-0.11	0.02	0.07	0.14	0.08	0.03	0.16	0.11	-0.03	-0.15	-0.33
Pp1s2_476V6	-0.83	-0.55	-0.41	-0.1	0.36	0.16	0.28	0.38	0.23	0.27	-0.03	-0.34
Pp1s30_303V6	-0.48	-0.28	-0.18	-0.15	0.17	0.16	0.27	0.18	0.21	0.09	-0.02	-0.17
Pp1s30_305V6	-1.12	-1.37	-0.93	-0.14	0.26	0.39	0.42	0.46	0.36	0.24	0.13	-0.11
Pp1s30_345V6	-0.39	-0.33	-0.24	-0.12	0.08	0.25	0.26	0.18	0.25	0.12	-0.07	-0.2
Pp1s322_41V6	-0.29	-0.43	-0.13	0.07	0.14	0.13	0.13	0.13	0.28	0.02	-0.05	-0.15
Pp1s32_324V6	-0.56	-0.15	-0.01	0.09	0.03	0.07	0.09	0.25	0.27	0.02	0.03	-0.3
Pp1s333_15V6	-0.32	-0.27	0.01	0.02	0.11	0.1	0.11	0.13	0.18	-0.03	-0.11	-0.04
Pp1s333_16V6	-0.83	-0.35	0.26	0.34	0.23	-0.09	0.23	0.38	-0.07	-0.04	-0.12	-0.4
Pp1s355_39V6	-0.2	-0.32	-0.07	0.01	0.16	0.15	0.11	0.04	0.12	-0.01	-0.04	-0.03
Pp1s35_178V6	-0.5	-0.88	-0.53	-0.07	0.22	0.23	0.39	0.35	0.33	0.05	-0.03	-0.13
Pp1s36_286V6	-0.7	-0.29	-0.09	0.14	0.29	0.19	0.15	-0.01	0.1	-0.02	-0.05	0.06
Pp1s37_249V6	-0.56	-0.29	-0.08	-0.02	0.1	-0.05	0.19	0.03	0.53	0.21	-0.12	-0.22
Pp1s38_96V6	-0.91	-0.52	-0.09	0.23	0.31	0.35	0.14	0.24	0.11	-0.01	-0.28	-0.05
Pp1s390_21V6	-0.79	-0.24	0.04	0.17	-0.0	0.16	0.18	0.23	0.2	0.08	-0.05	-0.26
Pp1s39_174V6	-0.91	-0.4	0.09	0.4	0.3	0.05	0.11	0.24	0.09	0.04	-0.24	-0.21
Pp1s403_36V6	-0.76	-0.42	-0.26	0.12	0.17	0.17	0.11	0.07	0.31	0.17	0.05	-0.05
Pp1s407_48V6	-0.59	-0.54	-0.2	-0.05	0.27	0.21	0.28	0.13	0.32	0.13	-0.09	-0.22
Pp1s47_90V6	-0.96	-0.32	-0.18	0.18	0.15	0.28	0.11	0.13	0.18	-0.03	-0.04	0.12
Pp1s48_58V6	-0.56	-0.62	-0.2	0.08	0.21	0.2	0.24	0.3	0.37	0.06	-0.12	-0.36
Pp1s496_1V6	-0.3	-0.54	-0.28	-0.09	0.3	0.24	0.3	0.09	0.25	0.04	-0.19	-0.09
Pp1s4_121V6	-0.7	-0.49	-0.1	0.08	0.19	0.18	0.24	0.05	0.26	0.04	-0.05	0.01
Pp1s4_355V6	-0.49	-0.27	-0.13	0.17	0.1	0.26	0.21	0.2	0.15	0.06	-0.16	-0.34
Pp1s52_60V6	-0.98	-1.33	-0.82	-0.14	0.41	0.46	0.57	0.26	0.31	0.07	-0.01	-0.08
Pp1s568_5V6	-0.38	-0.35	0.02	0.18	0.2	0.1	0.06	0.07	0.13	0.07	-0.01	-0.24
Pp1s58_117V6	-0.61	-0.62	-0.32	-0.13	0.22	0.3	0.37	0.24	0.34	-0.1	-0.02	-0.11
Pp1s5_12V6	-0.46	-0.4	-0.1	0.16	0.17	0.23	0.17	-0.04	0.14	-0.04	0.12	-0.14
Pp1s60_191V6	-0.55	-0.26	-0.01	0.11	0.19	0.21	0.22	0.14	0.08	-0.03	-0.17	-0.1
Pp1s63_51V6	-0.35	-0.12	0.01	0.03	0.08	0.14	0.13	0.16	0.09	0.02	-0.07	-0.19
Pp1s63_80V6	-0.63	-0.19	0.02	0.17	0.05	0.11	0.03	0.26	0.17	0.05	-0.02	-0.2
Pp1s64_46V6	-0.55	-0.46	-0.09	0.04	0.43	0.17	0.16	0.01	0.28	0.0	-0.15	-0.13
Pp1s65_201V6	-0.93	-0.67	-0.18	0.12	0.21	0.28	0.31	0.19	0.31	0.11	-0.11	-0.18
Pp1s70_188V6	-0.39	-0.26	0.0	0.03	0.1	0.09	0.27	0.11	0.16	0.01	0.01	-0.28
Pp1s70_210V6	-0.28	-0.41	-0.14	0.1	0.19	0.11	0.12	0.12	0.22	0.04	-0.08	-0.12
Pp1s70_278V6	-0.57	-0.3	-0.06	0.25	0.23	0.15	0.13	0.1	0.07	0.02	-0.15	-0.06
Pp1s71_147V6	-0.97	-0.43	-0.09	0.1	0.15	0.31	0.32	0.38	0.26	-0.02	-0.2	-0.36
Pp1s71_149V6	-0.77	-0.26	0.03	0.14	0.18	0.23	0.25	0.25	0.02	-0.04	-0.12	-0.21
Pp1s71_162V6	-0.57	-0.23	0.07	0.22	0.13	0.2	0.12	0.3	0.25	-0.03	-0.28	-0.52
Pp1s74_33V6	-0.98	-0.45	-0.06	0.1	0.23	0.29	0.12	0.09	0.28	0.06	0.03	-0.15
Pp1s76_8V6	-0.38	-0.43	-0.06	0.08	0.18	0.3	0.32	0.17	0.21	-0.05	-0.21	-0.41
Pp1s78_128V6	-0.89	-0.9	-0.14	0.24	0.14	0.28	0.38	0.36	0.42	0.11	-0.23	-0.58
Pp1s79_5V6	-0.86	-0.34	0.14	0.2	0.07	0.15	0.22	0.37	0.15	-0.1	-0.05	-0.34
Pp1s7_163V6	-0.84	-0.6	-0.33	-0.0	0.09	0.26	0.33	0.34	0.29	0.1	0.01	-0.12
Pp1s7_334V6	-0.59	-0.23	-0.07	-0.06	-0.01	0.13	0.29	0.4	0.3	0.04	-0.23	-0.26
Pp1s85_27V6	-0.22	-0.12	-0.29	-0.07	0.03	0.12	0.17	0.13	0.27	0.12	-0.04	-0.2
Pp1s89_30V6	-0.69	-0.86	-0.35	0.13	0.43	0.13	0.34	0.28	0.26	0.13	-0.25	-0.17
Pp1s91_96V6	-1.03	-0.5	0.06	0.34	0.3	0.15	0.25	0.14	0.38	0.01	-0.37	-0.38
Pp1s96_83V6	-0.47	-0.2	-0.03	0.06	0.01	0.18	0.18	0.18	0.01	-0.0	0.03	-0.09
Pp1s99_113V6	-0.26	-0.28	0.03	0.01	0.03	0.04	0.15	0.12	0.16	0.01	0.07	-0.15

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.