Heatmap: Cluster_219 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.21 0.24 0.16 0.03 -0.16 -1.61 0.27 -0.25 0.4 0.49 -0.07 -0.2
0.1 0.1 -0.01 -0.22 0.06 -0.11 -0.04 0.0 0.03 -0.07 0.01 0.11
0.3 -0.18 0.04 -0.44 0.47 -0.49 -0.0 -0.38 0.02 0.28 -0.18 0.2
0.59 -0.1 0.41 -0.02 -0.14 -1.17 0.04 0.17 -0.26 -0.34 0.14 0.02
- - - 1.81 - - 1.38 - - 2.56 - -
0.02 -0.16 0.09 0.15 0.28 -0.24 -0.09 -0.26 0.2 -0.16 0.06 -0.01
0.81 -0.6 -0.0 -0.62 -0.12 -0.21 0.11 0.6 0.11 -0.49 -0.13 -0.23
0.22 0.4 -0.04 0.23 0.14 -0.34 0.01 -0.45 0.11 0.01 -0.46 -0.11
-0.13 -0.26 -0.6 0.22 0.16 -0.39 -0.32 0.22 0.45 0.27 0.13 -0.13
0.53 -0.4 0.02 -0.05 0.09 -0.35 -0.15 -0.08 0.54 -0.28 -0.23 -0.0
-3.27 0.76 -0.12 0.68 0.02 -0.71 0.65 -0.87 0.65 -0.34 -1.06 0.13
0.28 0.1 -0.24 0.06 -0.09 -0.61 -0.19 0.53 -0.68 -0.27 0.04 0.52
-0.11 -0.0 -0.09 -0.22 -0.15 0.07 -0.08 0.16 0.04 0.26 -0.12 0.16
-0.1 -0.02 -0.05 -0.02 0.07 0.05 -0.05 0.06 0.03 0.13 -0.01 -0.11
0.28 -0.17 0.13 -0.25 0.07 -0.37 0.05 -0.21 0.04 0.07 0.05 0.17
0.04 0.17 -0.11 -0.26 -0.14 -0.11 0.05 0.19 0.04 -0.1 0.0 0.16
-0.23 -0.12 0.12 0.24 0.11 0.09 0.24 -0.03 0.14 -0.3 -0.85 0.26
1.02 0.34 0.51 -0.26 -0.04 -0.68 -0.2 -0.61 -0.52 0.24 -0.96 -0.11
-1.02 0.02 0.14 0.17 -0.02 -0.04 -0.12 -0.16 0.37 0.39 -0.13 -0.03
-0.04 0.32 0.06 -0.62 -0.91 0.34 -0.02 0.2 0.28 -0.21 0.17 -0.06
-0.15 0.08 0.04 0.17 0.12 -0.2 -0.33 -0.08 0.18 0.22 -0.1 -0.05
-0.09 0.02 -0.21 -0.29 -0.05 0.12 -0.15 0.0 0.12 0.19 -0.04 0.27
-0.26 0.41 0.38 0.36 0.19 -0.24 -0.13 -0.21 0.07 -0.26 -0.35 -0.27
0.02 -0.05 -0.03 0.1 0.06 0.02 -0.1 -0.13 0.1 0.15 -0.04 -0.12
- 0.84 - 0.78 0.54 0.23 0.2 0.85 -0.53 0.46 -0.28 -
-0.06 -0.11 0.11 0.12 -0.03 -0.13 0.09 -0.23 0.24 0.32 -0.28 -0.19
0.9 0.84 - 0.01 - 1.1 -0.12 0.32 0.71 -0.37 -0.71 -
0.02 -0.55 0.1 0.27 -0.02 -0.08 0.2 -0.26 0.15 0.13 -0.15 0.01
0.49 -1.03 1.49 0.27 -0.55 - -0.53 0.11 0.48 -0.48 -0.51 -0.29
0.17 -0.12 -0.05 0.04 -0.08 -0.26 -0.05 -0.0 0.12 -0.03 0.06 0.13
-0.45 0.4 0.3 -0.13 0.33 -0.32 -0.28 0.14 0.13 -0.01 -0.09 -0.36
- - - - 0.38 - 1.99 - 0.48 2.42 - -
0.43 0.02 -0.31 0.02 -0.28 -0.28 0.0 0.1 0.08 -0.03 0.18 -0.1
-0.06 -0.08 -0.01 0.01 -0.03 -0.08 -0.01 0.09 0.07 0.0 -0.0 0.09
0.39 -0.0 -0.39 0.27 0.05 0.27 -0.5 0.23 -0.05 -0.3 -0.18 -0.09
-0.16 0.1 -0.04 0.09 -0.03 -0.12 0.11 0.22 -0.2 -0.18 0.08 0.06
-0.55 0.18 0.05 -0.09 0.11 -0.1 0.0 0.08 0.06 0.13 0.11 -0.12
0.34 0.21 -0.22 -0.45 0.31 -0.26 -0.09 0.01 -0.03 -0.04 -0.1 0.13
1.29 0.26 0.11 -1.28 -0.18 -0.49 -0.01 0.13 -0.05 -0.65 -0.5 -0.19
-0.44 -0.22 -0.58 0.07 0.23 -0.91 0.1 0.08 0.77 0.12 -0.19 0.24
-0.21 -0.01 0.07 0.22 0.08 -0.27 -0.23 0.1 0.04 -0.07 -0.09 0.26
0.38 -0.24 -0.21 -0.1 -0.65 0.73 0.4 0.03 0.11 -1.31 -0.54 0.32
-0.13 -0.18 -0.11 0.05 0.12 -0.02 -0.01 0.21 0.18 -0.09 -0.06 -0.03
0.28 1.05 -1.48 0.27 0.01 0.17 -0.56 -0.38 -0.33 0.19 0.59 -2.92
-0.13 -0.03 -0.19 -0.37 -0.25 0.09 0.08 0.46 -0.1 0.04 0.27 -0.06
-1.03 0.44 0.11 -0.34 0.17 -0.65 0.07 0.29 0.12 0.38 -0.14 -0.07
0.21 0.25 0.1 -0.02 0.14 -0.71 -0.14 -0.01 -0.21 -0.05 0.12 0.07
0.41 -1.03 0.9 -0.14 0.13 0.22 0.28 -0.4 0.03 0.28 -0.81 -1.41
0.04 -0.16 0.11 -0.11 -0.06 -0.16 0.01 0.13 0.09 0.06 0.05 -0.04
0.72 -0.62 0.74 -0.59 0.83 -0.14 0.14 -0.96 -1.05 1.02 -1.58 -2.24
0.61 0.41 -1.26 -1.06 -0.22 0.52 -0.14 0.35 0.16 0.07 -0.75 0.02
0.46 0.21 0.08 -0.4 0.0 0.16 -1.12 0.52 -0.24 0.08 -0.78 0.21
-0.02 0.13 0.15 0.17 0.09 -0.29 -0.04 -0.06 0.17 -0.14 -0.13 -0.13
-0.02 -0.01 -0.11 -0.14 -0.01 -0.19 0.11 0.08 0.09 0.04 0.04 0.08
0.6 0.1 0.81 0.01 0.16 -1.04 -0.31 -0.13 -0.64 -0.59 0.09 -0.07
-0.35 -0.08 -0.35 -1.04 0.11 0.14 0.51 0.31 0.34 0.2 -0.72 0.17
-0.52 0.78 -0.76 0.01 0.36 -0.37 -0.35 0.09 -0.83 -0.2 0.65 0.1
0.74 -0.1 0.35 0.04 0.46 0.51 -0.94 0.06 -0.27 0.18 -0.75 -2.49
0.12 0.69 0.92 1.19 -0.04 -1.04 -0.82 -0.72 -0.3 -0.3 -1.29 -1.13
-0.47 0.06 -0.48 0.65 0.49 -0.93 0.08 -0.46 0.21 0.4 -0.05 -0.36
- - - - - - 1.87 - - 3.06 - -
0.06 0.23 -0.2 0.24 0.09 -0.25 -0.22 0.01 0.29 -0.1 -0.17 -0.12
0.18 -0.05 -0.19 -0.01 0.14 -0.39 0.15 0.06 0.11 0.05 -0.12 -0.02
- - -2.0 - - 1.04 - 1.56 0.74 1.65 -0.56 0.32
-2.13 -0.21 -0.3 -0.18 -0.65 0.03 -0.36 -0.38 0.7 0.97 0.05 0.47
1.14 0.16 0.31 0.17 0.02 -0.66 -0.38 -0.57 -0.08 -0.31 -2.18 0.31
-0.04 -0.12 -0.07 -0.05 -0.01 0.01 0.06 0.0 0.07 0.08 0.02 0.03
0.21 -0.0 0.24 -0.27 -0.08 -0.1 0.01 0.0 0.02 -0.14 -0.03 0.06
0.15 0.03 -0.33 -0.05 -0.03 0.03 -0.01 0.04 -0.16 0.08 0.11 0.08
0.68 - 1.39 - -0.65 -1.57 -2.21 -0.18 0.75 0.65 0.16 0.42
0.47 0.07 -0.54 0.57 -0.24 -0.37 0.0 0.05 0.1 -0.0 -0.26 -0.27
0.53 -0.48 -0.09 -3.61 0.07 -0.18 0.27 0.63 0.1 -0.46 -0.31 0.61
-0.0 0.0 -0.01 -0.23 -0.02 -0.13 -0.01 0.22 0.1 -0.04 0.06 0.03
-0.31 -0.18 0.03 -0.07 0.02 -0.52 0.27 -0.33 0.17 0.21 0.19 0.28
- 0.77 0.32 - - - 1.35 - - 2.39 - 0.33
0.65 -0.27 0.24 -0.82 0.44 -0.85 0.08 0.06 0.08 0.12 -0.1 -0.37
-1.02 -0.25 0.3 0.72 0.01 0.07 -0.58 0.51 -0.36 -0.07 0.03 -0.19
-0.09 -0.08 -0.02 -0.04 -0.01 -0.06 0.0 0.04 0.16 0.04 -0.06 0.11
- - - - - - 2.35 - - 2.78 - -
0.37 -0.05 -0.12 -0.26 0.02 -0.1 -0.01 -0.05 0.15 -0.04 0.02 -0.03
-0.01 0.23 -0.08 0.35 -0.16 -0.02 -0.04 -0.11 0.16 -0.09 -0.4 0.03
-0.4 0.24 -0.37 -0.01 0.29 -0.59 -0.18 0.19 -0.23 0.55 -0.16 0.23
0.41 -0.09 0.03 -0.18 0.42 -0.53 -0.24 -0.29 0.16 -0.19 -0.17 0.33
-0.04 -0.03 0.06 -0.0 -0.0 -0.15 0.16 0.19 -0.04 0.12 -0.24 -0.08
-1.37 0.41 -0.06 0.03 0.3 -0.16 -0.36 -0.7 0.39 0.71 -0.14 -0.13
-1.84 -0.64 -0.1 0.05 0.5 -0.74 0.34 -0.06 0.04 0.38 0.03 0.61
0.1 -0.29 0.05 -0.15 0.11 -0.4 0.1 0.07 0.33 0.14 -0.41 0.14
0.09 - -1.14 0.37 1.1 - -1.66 -0.57 0.56 0.71 0.16 0.86
0.27 0.01 0.07 -0.01 0.07 0.05 0.1 0.02 -0.29 -0.02 -0.23 -0.14
- -0.29 1.15 0.36 0.08 - 0.03 -1.67 -0.69 1.25 0.33 0.02
-0.2 0.12 0.28 0.51 0.42 0.17 -0.06 -0.35 -0.11 -0.19 -0.63 -0.41
0.82 -0.43 -1.04 -0.04 0.16 -0.52 -0.58 0.03 -0.13 0.4 0.19 0.22
0.47 -0.04 0.03 0.27 -0.34 -0.38 -0.3 0.07 -0.37 -0.01 0.18 0.14

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.