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Heatmap: Cluster_149 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.13 0.09 -0.05 -0.11 -0.17 -0.19 0.06 0.04 -0.1 0.04 0.38 0.04
0.49 0.34 -0.09 -0.08 -0.12 -0.17 -0.26 0.15 -0.32 -0.4 0.12 0.06
-0.09 0.02 0.08 0.07 0.07 -0.06 -0.05 -0.22 0.02 0.04 0.11 -0.02
0.72 - -0.83 -2.01 1.1 -0.03 0.28 0.83 0.5 -1.67 -1.64 0.45
0.57 0.23 -0.48 -0.11 -0.02 -0.25 -0.09 -0.09 0.34 0.08 0.2 -0.9
1.73 -1.94 -0.16 - -0.71 -0.59 -0.05 -0.43 0.23 0.45 -0.27 0.24
0.34 -0.14 -0.53 0.23 -0.07 -0.09 -0.27 -0.07 0.12 -0.14 0.01 0.37
1.6 -0.36 -0.8 -0.08 -0.25 -0.61 -0.35 -1.09 0.19 -0.34 0.43 -0.65
0.38 0.08 0.04 -0.65 -0.12 -0.23 -0.12 0.31 -0.1 0.15 -0.16 0.15
0.67 0.34 0.25 0.13 -0.1 -0.25 -0.41 -0.71 -0.13 -0.36 -0.16 0.19
-0.02 0.12 0.04 -0.02 0.15 -0.4 -0.23 -0.41 -0.05 -0.04 0.29 0.36
0.62 0.25 0.41 0.09 0.14 -0.24 0.01 -0.35 -0.16 -0.84 -0.12 -0.4
0.57 0.24 0.01 -0.14 -0.31 0.03 -0.12 -0.05 -0.03 -0.02 -0.02 -0.41
1.26 0.45 -0.17 -1.26 0.01 0.43 -0.21 -0.89 -0.0 -0.46 -0.35 -0.6
1.62 -0.34 -1.32 -2.04 -0.64 -0.03 -0.72 0.54 0.98 -0.26 -0.83 -1.16
-0.02 -0.12 0.01 -0.03 0.05 -0.2 0.04 -0.19 0.1 -0.08 0.16 0.23
1.71 -1.4 -0.47 -2.12 0.06 -0.12 -0.19 -0.63 -0.97 0.49 -1.71 0.74
1.03 0.89 -0.01 0.13 -0.49 -1.41 0.09 -0.53 -0.55 -0.89 -0.66 0.41
-0.35 0.05 0.03 0.25 0.01 -0.14 -0.2 -0.22 0.14 -0.11 0.26 0.13
0.83 0.37 -0.06 0.02 -0.2 0.03 -0.37 -3.66 -1.1 -0.03 0.11 0.76
0.68 -0.34 -0.38 -0.17 0.28 -0.62 0.36 -0.25 -0.0 0.28 -0.43 0.0
0.04 0.33 0.24 0.17 0.17 -0.29 -0.38 -0.15 0.08 -0.56 -0.2 0.24
1.3 0.44 -1.21 -1.18 -0.46 -0.52 1.0 -0.51 -1.04 -0.45 -0.51 0.32
0.23 -0.24 -0.35 0.06 -0.12 0.06 -0.15 -0.28 -0.19 0.18 0.29 0.3
0.11 -0.0 -0.04 -0.03 0.04 -0.08 -0.14 -0.06 -0.1 -0.04 0.12 0.19
0.62 -0.25 0.21 -0.14 -0.6 0.01 -0.37 0.66 -0.09 -0.77 -0.96 0.58
0.99 -0.69 0.59 0.21 -0.37 -1.0 -0.32 -0.35 0.03 -0.34 -0.46 0.42
0.84 -0.61 -0.18 -1.36 0.17 -0.31 0.84 -0.24 -0.03 -0.21 -2.46 0.75
0.49 0.33 0.16 -0.51 -0.07 0.12 -0.22 -0.23 -0.15 -0.06 -0.09 -0.04
0.53 -0.59 -0.42 -0.16 0.16 -0.22 -0.45 0.08 -0.09 0.06 0.04 0.56
1.3 -0.62 0.53 -0.74 0.2 -0.71 -0.15 -0.65 -0.06 -0.07 -0.55 -0.06
0.52 -0.18 -0.32 -0.19 -0.17 -0.63 -0.35 -0.45 -0.45 0.21 0.63 0.6
-0.63 0.22 0.11 -0.28 -0.78 0.17 -0.12 0.89 -0.66 0.04 -0.48 0.51
-0.06 -0.36 0.11 -0.23 0.13 -0.1 -0.18 -0.08 -0.08 0.15 0.16 0.37
0.28 -0.22 0.12 0.0 -0.01 -0.07 0.12 0.12 0.02 0.07 -0.5 -0.09
-0.03 0.18 0.13 0.06 -0.01 -0.23 -0.14 -0.17 0.06 -0.16 0.1 0.13
-0.3 -0.2 -0.36 -0.13 -0.04 0.09 -0.07 -0.13 0.06 0.27 0.35 0.27
0.61 -0.28 -0.29 -0.34 -0.14 -0.21 -0.41 0.08 -0.28 0.21 0.36 0.27
0.3 -0.13 -0.08 -0.36 0.02 -0.09 -0.12 -0.08 0.0 0.18 0.17 0.08
1.06 0.88 -0.31 -2.33 -1.32 -0.83 -0.59 -0.04 0.02 -0.38 -0.26 0.88
1.23 -0.49 -2.03 -0.1 0.25 -0.27 -0.64 -0.65 0.04 -0.26 0.54 0.2
1.64 -0.19 -0.72 -1.06 -1.19 -2.13 -0.11 -0.63 -0.62 0.19 0.16 0.82
-0.24 -0.13 -0.68 -0.47 -0.03 0.21 -0.15 -0.45 0.03 0.28 0.48 0.58
0.04 -0.2 -0.16 0.01 0.04 -0.07 -0.17 -0.03 -0.07 -0.01 0.2 0.34
1.41 -0.16 0.21 -1.09 -0.64 -1.85 -0.35 -0.08 -0.46 -0.18 -0.02 0.66
0.06 -0.21 -0.1 0.02 0.07 0.03 -0.05 0.13 -0.07 -0.05 0.05 0.07
0.39 0.21 0.41 0.21 0.07 -0.75 -0.44 -0.62 -0.21 -0.29 -0.14 0.51
0.14 -0.01 -0.02 -0.11 -0.03 -0.14 -0.0 0.08 -0.14 0.03 0.07 0.1
1.04 -1.23 0.36 -2.43 -1.11 -0.28 0.19 0.61 -0.13 0.7 0.32 -1.68
0.22 -0.15 -0.08 -0.05 0.04 -0.18 0.05 0.12 -0.3 -0.1 0.1 0.24
1.28 -0.34 -0.96 -0.35 -0.06 -0.29 -0.45 -0.29 0.1 -0.24 0.6 -0.49
0.1 0.08 -0.04 -0.05 0.05 0.03 -0.08 -0.09 -0.02 -0.0 -0.06 0.07
0.19 -1.07 0.3 0.43 0.28 -0.36 0.49 -0.92 0.09 -0.17 -0.3 0.15
1.22 -0.45 -0.42 -0.98 0.03 -2.71 -0.92 -0.81 0.34 0.1 0.16 0.96
0.03 -0.21 -0.03 -0.11 0.01 -0.1 -0.17 0.08 -0.06 -0.07 0.18 0.34
-0.13 0.82 0.12 -0.26 -0.0 -0.38 -0.46 0.49 -0.29 -0.16 -0.83 0.31
0.26 0.17 -0.14 0.04 -0.12 0.01 -0.02 -0.05 0.1 -0.11 -0.09 -0.1
-0.44 -0.45 -0.22 -0.04 0.1 0.08 0.01 -0.06 0.14 0.19 0.28 0.2
0.48 -0.06 0.03 0.09 -0.57 -0.37 0.18 0.29 -0.02 0.06 -0.37 -0.07
0.84 0.44 0.08 -0.29 -0.35 -0.21 -0.31 0.05 -0.16 0.02 -0.45 -0.26
0.39 0.3 0.0 0.07 0.06 -0.14 -0.26 -0.08 -0.4 -0.18 0.01 0.03
-0.06 0.05 -0.08 0.0 -0.04 -0.19 -0.0 0.04 -0.12 0.05 0.18 0.14
1.66 1.12 0.34 -3.45 -1.97 0.15 -3.71 0.33 -0.84 -0.54 -0.21 -0.98
0.56 0.26 0.06 -0.48 -0.48 -0.68 -0.11 0.26 -0.14 0.18 0.21 -0.13
0.11 -0.16 -0.15 0.04 0.02 -0.05 0.23 0.11 0.04 0.16 -0.25 -0.18
0.06 0.07 0.15 0.03 0.06 -0.27 0.01 -0.42 -0.08 0.05 0.01 0.22
0.46 -1.09 -0.17 0.03 0.07 -0.39 0.04 -0.01 0.11 -0.11 0.1 0.41
1.37 -0.41 0.43 -1.72 0.13 -1.29 -0.86 0.12 -0.28 0.14 -0.02 -0.07
0.26 -0.21 -0.03 -0.05 -0.12 -0.25 -0.13 0.09 -0.1 0.09 0.21 0.14
0.21 0.15 0.21 0.07 0.01 -0.41 -0.28 -0.17 -0.19 -0.14 0.06 0.3
0.73 -0.28 -0.4 -0.23 -0.23 -0.29 -0.19 -0.12 0.13 -0.08 0.27 0.25
0.01 0.21 0.11 0.0 -0.05 -0.53 -0.4 -0.24 0.25 0.11 -0.23 0.45
0.48 0.16 0.04 -0.25 -0.11 -0.24 -0.23 -0.14 -0.51 -0.41 0.25 0.53
0.22 0.04 -0.05 -0.17 -0.08 -0.06 -0.16 0.09 -0.12 -0.0 0.1 0.13

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.