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Heatmap: Cluster_124 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.05 -0.06 -0.03 -0.17 -0.07 0.14 0.01 0.04 -0.17 0.08 0.12 0.12
-0.02 -0.17 -0.09 -0.14 0.05 0.13 0.03 0.04 -0.09 0.13 0.02 0.08
1.28 -1.53 -0.29 -1.02 0.8 0.69 -1.78 -0.89 0.28 0.62 -1.57 -0.64
0.07 -0.29 -0.13 -0.02 0.17 0.2 -0.04 -0.04 0.02 0.1 -0.02 -0.08
0.27 -0.41 0.14 -0.03 0.07 0.61 -0.6 -0.5 -0.32 -0.44 -0.44 0.8
0.14 -1.41 -0.24 0.03 0.07 0.63 -0.05 0.07 0.1 0.09 -0.46 0.25
0.04 -0.38 -0.3 -0.13 0.14 0.18 0.15 0.07 -0.04 -0.02 -0.05 0.22
0.26 -0.55 -0.1 -0.1 0.35 0.51 -0.05 0.06 -0.06 -0.01 -0.38 -0.28
-0.07 -0.13 -0.13 0.09 0.19 0.2 -0.29 0.19 -0.08 -0.03 0.05 -0.06
-0.33 -0.08 -0.05 -0.45 0.02 0.16 -0.04 -0.22 -0.22 0.34 0.34 0.27
0.09 -0.53 -0.18 0.05 0.11 0.42 -0.05 -0.06 -0.27 0.06 -0.11 0.24
3.01 - - - 1.97 - - - - - - -
0.14 0.1 -0.05 -0.3 0.07 -0.47 0.19 0.08 0.08 -0.09 0.15 -0.04
- 0.29 -0.32 -1.33 0.42 1.19 0.18 -0.95 -0.6 -0.06 0.6 0.24
1.98 - 0.1 - 0.94 - 0.78 -0.4 - 0.1 0.6 -
0.32 -0.95 0.38 0.33 -0.28 0.79 -0.71 -0.84 -0.24 -0.31 -0.6 0.72
-1.09 0.15 0.09 -0.93 0.38 0.92 -0.22 -0.03 0.13 -0.1 0.16 -0.6
-0.15 -0.22 -0.31 -0.16 -0.06 -0.06 -0.22 0.08 0.17 0.3 0.17 0.28
0.26 - -0.63 0.91 -1.23 0.85 0.79 -0.06 -0.45 -0.93 -0.22 0.31
0.11 -0.19 0.25 -0.13 0.26 -0.26 0.14 -0.06 -0.23 -0.02 0.09 -0.09
0.12 -0.41 -0.29 0.25 0.3 0.41 -0.28 0.3 -0.24 -0.24 -0.22 -0.02
0.76 0.41 0.37 0.51 0.14 0.29 -0.04 -1.25 -0.46 -0.13 -1.19 -1.13
1.7 -1.12 -1.34 -0.56 1.13 -1.38 -2.22 -1.21 0.3 -0.16 0.43 -0.91
0.41 0.02 -0.08 -0.5 -0.02 0.26 -0.07 0.07 0.23 -0.3 -0.06 -0.19
1.14 -0.63 -1.7 0.31 -0.9 0.74 0.68 -2.19 -0.82 -0.53 -0.32 0.6
0.55 0.23 0.11 -0.23 0.35 0.38 0.07 0.3 -1.06 -0.55 -0.17 -0.89
0.24 -0.55 0.07 0.11 0.17 0.62 -0.02 -0.59 0.17 -0.19 -0.07 -0.46
0.84 -0.56 0.39 -0.54 -0.14 0.65 -0.42 -0.93 -0.38 -0.46 -0.89 0.81
0.24 -0.2 -0.02 -0.01 0.12 0.02 0.12 -0.15 -0.05 -0.09 -0.07 0.03
0.57 0.09 0.01 -0.1 -0.03 0.04 -0.16 -0.32 -0.2 -0.19 0.04 0.02
1.04 -3.95 -0.28 0.16 -0.22 0.91 0.03 -0.44 -0.82 0.29 -0.71 0.06
-0.16 -1.32 -0.03 -0.65 -0.79 0.81 -0.17 0.1 -0.28 0.33 -0.47 1.0
0.78 -0.07 -0.27 0.82 -0.51 0.62 -0.22 -0.51 -0.32 0.65 -1.84 -1.78
-0.16 -0.39 -0.15 0.15 0.22 0.06 0.18 -0.01 -0.03 0.06 -0.09 0.05
0.24 -0.27 -0.6 -0.64 -0.34 0.72 0.05 -0.12 -0.07 -0.59 0.47 0.37
- -0.96 -0.15 0.14 -0.9 1.24 0.08 - - 0.43 0.27 1.57
1.01 -0.58 0.1 -0.34 0.14 -0.8 -0.09 -0.09 -0.11 0.07 0.13 -0.27
-0.02 0.09 0.1 -2.16 0.54 -0.01 0.02 -0.3 0.3 0.11 -0.17 0.23
0.29 -1.1 -0.12 0.07 -0.53 0.53 -0.14 0.2 -0.17 0.19 -0.04 0.19
-0.21 -1.24 -0.69 0.63 -0.45 1.1 -0.05 -0.4 -0.37 -1.17 -0.66 1.07
-0.14 0.12 0.23 -0.27 0.11 -0.06 0.01 -0.1 -0.02 0.11 0.04 -0.1
0.14 -0.2 0.02 0.0 0.06 0.19 -0.16 0.13 -0.17 0.08 -0.01 -0.15
-0.38 -0.7 0.13 -0.04 -1.0 1.26 0.33 0.42 -1.24 -2.49 0.04 0.52
-0.1 -0.29 -0.07 -0.04 0.36 0.3 -0.13 0.0 -0.06 -0.27 0.03 0.1
0.3 -0.52 -0.01 -1.12 0.27 0.42 -0.17 0.06 0.11 -0.45 0.58 -0.24
-0.04 -0.02 -0.24 -0.2 -0.12 0.18 -0.11 0.13 0.18 0.21 0.08 -0.15
0.45 -0.19 -0.23 -0.05 0.44 0.27 -0.11 -0.51 -0.07 -0.11 -0.12 -0.06
0.04 -0.29 -0.07 -0.04 0.27 0.22 0.07 0.02 -0.06 -0.07 -0.2 0.02
-0.35 -0.39 -0.34 -0.55 -0.27 0.4 -0.36 0.02 0.13 0.52 0.33 0.33
0.25 -0.24 0.28 -2.48 0.48 0.89 -0.45 -0.68 -0.49 -0.63 -0.01 0.69
0.77 -0.46 -2.62 -0.49 0.03 1.34 0.9 -1.57 -1.49 -3.67 -0.46 0.83
0.09 -0.21 -0.2 -0.1 0.02 0.19 -0.03 -0.03 0.05 0.18 0.03 -0.06
-1.9 -0.75 -0.71 0.22 -1.21 0.78 -0.4 -0.59 -0.31 -0.28 0.83 1.25
-0.24 -1.46 0.35 -0.35 0.62 0.98 0.2 -0.07 -0.83 -0.18 0.04 -0.65
-0.21 -0.16 0.04 0.16 -0.03 0.08 0.14 0.01 0.15 -0.14 -0.06 -0.04
2.38 - - - 2.08 - - - - 0.22 - 0.48

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.