Heatmap: Cluster_162 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.89 0.31 -0.11 -0.51 -0.23 -0.71 0.41 -0.29 0.28 -0.75 0.63 -1.66
0.66 0.31 0.25 -0.27 0.02 -0.63 0.04 -0.16 -0.28 0.04 0.19 -0.73
0.45 -0.02 0.2 0.17 0.16 -0.39 -0.03 -0.08 -0.02 -0.18 0.06 -0.62
- - 0.8 0.59 -0.55 - -0.28 - 0.85 0.52 0.87 1.13
-0.43 0.07 -0.75 -0.09 -0.94 -0.21 -0.01 -0.42 0.1 0.69 1.12 -0.53
-0.4 -1.17 0.84 -0.02 1.02 -4.01 0.52 0.44 0.26 -0.09 -0.11 -3.92
-0.4 -0.07 -0.05 -0.03 0.17 -0.04 0.22 -0.2 0.1 0.06 0.09 0.04
- 0.37 -0.08 - - 0.11 - 0.31 0.92 -0.26 1.89 -0.0
0.44 0.29 0.35 -0.19 0.03 -0.56 -0.21 0.31 -0.22 -0.31 0.21 -0.61
1.58 - -0.68 -0.48 0.33 -0.49 -0.74 - -0.09 0.19 1.24 -0.6
- 1.05 - - -0.12 - - 2.03 - 1.49 0.91 -2.08
0.15 -0.08 -0.04 -0.11 0.11 -0.05 0.14 0.19 0.05 0.06 -0.21 -0.29
-0.31 -0.05 -0.08 -0.33 -0.03 -0.31 0.02 0.01 0.25 0.35 0.07 0.23
0.97 0.82 -0.79 - 0.22 -2.24 0.74 0.91 -1.15 -1.62 1.0 -
-3.13 -0.38 -0.27 0.04 0.98 -1.02 -0.25 -0.42 0.26 0.48 0.72 -0.05
-1.15 -1.41 -0.12 0.34 0.62 -1.29 -0.31 -1.89 0.63 1.2 0.22 -0.08
0.4 0.09 0.03 -0.41 -0.29 -0.14 -0.36 0.47 -0.38 0.38 0.23 -0.49
0.45 0.49 0.19 -0.52 0.15 -0.48 0.3 0.02 0.08 -0.4 -0.33 -0.49
0.1 0.17 -0.08 0.07 0.16 -0.12 0.02 0.11 -0.08 -0.02 -0.04 -0.39
1.14 0.65 -0.3 -2.21 0.12 -0.17 -0.0 -0.04 -0.36 -0.53 0.15 -0.59
-1.28 1.21 -0.95 -2.24 0.13 -1.18 - 1.76 -0.01 0.84 -2.18 -0.71
0.89 0.38 -0.77 -0.18 -0.82 -0.76 0.31 -0.4 0.27 0.14 -0.1 -0.03
0.1 0.36 0.63 -0.04 -0.87 0.52 0.22 -0.92 0.27 -0.13 -0.23 -1.08
-2.45 -1.55 -1.69 -0.09 0.06 0.22 0.69 -1.08 0.72 0.6 1.21 -1.19
0.98 1.03 -0.81 -0.99 0.56 -3.42 -0.57 0.09 -1.29 -0.04 0.72 -0.79
-2.04 0.61 -0.65 -0.03 0.56 -0.63 -0.67 0.15 0.3 0.22 0.97 -1.3
0.1 0.09 0.0 -0.07 -0.11 -0.0 -0.01 -0.08 0.08 0.06 0.02 -0.1
0.58 0.54 -1.53 -0.25 -0.92 0.51 0.42 0.39 -0.55 0.06 0.21 -1.42
-0.04 0.04 0.02 -0.08 -0.08 -0.2 -0.03 0.13 0.07 0.11 0.03 -0.01
0.63 0.51 0.44 -0.84 0.14 -0.47 -0.05 -0.21 -0.01 -0.72 0.22 -0.52
0.71 0.12 0.05 -0.36 0.25 -0.3 0.08 0.1 -0.3 -0.24 -0.18 -0.33
0.67 -0.14 -0.01 -0.26 0.26 -0.09 0.04 -0.11 -0.01 -0.2 -0.3 -0.13
1.04 -0.26 -0.24 -1.41 0.26 -1.06 -0.2 -0.16 0.34 0.44 0.47 -1.2
-0.08 -0.33 -0.54 -0.38 -0.21 -0.46 0.08 0.23 0.56 0.09 0.3 0.29
1.29 0.57 -2.07 -2.54 -0.42 0.45 0.3 0.09 -0.74 -0.06 0.22 -0.96
0.8 0.78 -0.19 -0.44 -0.79 -0.31 -0.46 0.3 -0.04 0.43 -0.01 -1.87
0.38 0.3 0.14 -0.21 -0.07 0.16 -0.24 -0.03 0.02 0.31 -0.03 -1.4
- - - 0.67 -0.09 -2.34 -0.28 -1.64 -0.03 1.92 1.75 -
-0.62 0.2 0.36 0.81 0.65 - -1.78 - 1.2 -1.84 1.26 -1.63
-0.06 0.35 0.03 0.09 0.16 -0.06 -0.11 0.19 -0.14 -0.16 -0.15 -0.27
-0.18 -0.43 0.07 0.14 0.26 -0.02 -0.01 0.01 0.04 0.17 0.09 -0.27
-0.04 0.01 -0.05 0.07 -0.03 -0.22 0.03 -0.05 -0.04 0.06 0.18 0.05
0.25 0.56 -0.22 0.11 0.38 -0.22 -0.43 0.56 -0.35 0.21 -0.72 -1.07
-1.56 -0.92 -1.1 0.27 0.42 -0.03 0.02 -1.35 1.08 1.26 0.1 -2.58
-0.15 -0.27 -0.04 -0.04 0.22 -0.06 0.15 -0.2 0.02 -0.07 0.27 0.06
0.18 0.11 -0.03 -0.14 -0.12 -0.16 0.1 -0.02 0.08 0.06 -0.08 -0.04
0.45 0.32 0.46 -1.29 0.27 -0.86 0.48 -0.08 0.07 0.24 -0.36 -1.01
0.37 0.08 -0.09 -0.04 -0.19 -0.13 -0.03 -0.1 -0.1 0.27 0.11 -0.28
1.35 0.56 0.19 - -0.09 -2.26 0.62 0.29 0.35 -0.29 -1.19 -1.37
0.74 0.11 0.05 0.05 0.05 -0.54 0.03 -0.15 -0.09 -0.14 0.01 -0.55
0.63 0.26 -0.56 -0.13 0.2 -0.16 -0.16 -0.36 -0.12 -0.36 0.37 -0.08
-0.16 0.01 -0.08 -0.12 -0.12 -0.14 -0.03 -0.02 -0.11 0.67 0.18 -0.35
0.32 0.52 0.61 -1.72 0.81 -1.78 -0.02 -0.74 -0.25 -0.14 0.84 -1.66
0.97 0.64 -0.79 -0.63 -1.02 -0.28 0.01 -0.29 1.05 -0.19 -1.29 -0.38
- 1.08 0.38 - - - - - 1.38 1.76 1.38 -
-0.48 -0.26 -0.12 -0.06 0.01 -0.03 -0.06 -0.34 0.03 0.31 0.54 0.15
0.6 0.04 0.29 -0.05 -0.18 -0.14 0.02 -0.19 -0.25 -0.06 0.08 -0.44
0.81 0.07 0.35 -0.33 0.22 0.02 0.01 -0.31 -0.21 0.24 -0.18 -2.23
0.09 0.13 -0.0 0.16 -0.24 0.47 0.08 -0.21 -0.14 0.25 -0.23 -0.68
-1.24 -0.2 -0.49 -1.05 -0.48 -1.56 -0.16 0.37 0.92 1.1 0.15 0.16
0.46 1.05 -1.07 -1.62 - -1.8 1.41 0.8 0.68 -2.17 -0.02 -1.98
0.19 0.17 -0.11 0.21 0.11 -0.2 -0.11 0.14 -0.04 -0.18 -0.08 -0.2
0.24 0.08 -0.02 -0.1 -0.1 -0.11 -0.06 0.09 -0.02 -0.06 0.14 -0.12
-0.24 0.21 0.46 -0.04 0.11 -0.25 0.48 -0.86 -0.08 0.3 -0.07 -0.61
0.81 0.4 0.02 -1.24 -0.1 -1.31 0.37 -0.42 0.23 0.05 0.51 -1.05

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.