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Heatmap: Cluster_171 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.1 -0.05 0.04 -0.09 0.11 0.24 -0.44 -0.13 -0.04 0.07 0.47 -0.31
-0.24 0.12 -0.08 0.05 -0.05 0.1 -0.0 0.06 0.07 -0.09 -0.01 0.05
-0.23 -0.07 -0.09 -0.19 -0.02 0.02 0.16 0.19 -0.05 0.09 0.16 -0.05
-0.14 0.05 -0.1 0.06 -0.08 -0.05 0.04 0.02 -0.07 -0.0 0.09 0.16
-0.4 -0.04 -0.11 0.01 -0.09 0.25 0.01 -0.03 -0.19 0.03 0.02 0.39
0.29 -1.5 -0.11 - -1.5 0.93 0.02 -0.37 0.43 0.53 0.54 0.25
-0.28 -0.04 -0.11 -0.01 0.01 0.17 0.14 0.08 0.03 -0.04 -0.09 0.07
-0.13 -0.06 -0.09 -0.08 -0.0 0.11 -0.05 0.01 0.11 0.01 0.12 0.03
0.01 -0.07 -0.25 -0.44 -0.23 -0.02 0.07 0.02 -0.02 0.2 0.0 0.51
-0.13 -0.19 -0.14 0.03 0.04 0.12 -0.01 0.2 0.03 -0.07 -0.02 0.09
-0.58 -0.14 -0.1 -0.04 -0.08 0.19 0.19 0.08 -0.1 0.06 0.19 0.14
-0.1 -0.32 -0.18 -0.07 0.12 -0.05 0.03 -0.07 0.1 0.07 0.24 0.13
-0.72 0.04 -0.7 -0.25 -0.06 -0.16 -0.09 -0.33 0.43 0.15 0.24 0.74
0.04 -0.63 -0.33 -0.07 -0.17 0.27 0.18 -0.21 0.36 0.46 -0.38 0.08
-0.2 -0.01 0.0 -0.02 0.01 -0.01 0.19 0.06 -0.04 0.15 -0.05 -0.11
-0.47 -0.32 0.03 -0.07 0.04 0.28 0.16 0.18 0.19 -0.15 -0.05 0.01
0.12 -0.07 -0.15 -0.06 -0.18 0.06 0.12 0.01 -0.12 0.15 0.06 -0.0
-0.21 0.01 -0.18 -0.12 -0.13 0.07 0.09 0.05 0.07 0.05 0.19 0.04
-0.18 0.11 -0.12 -0.11 0.0 0.04 0.16 -0.09 -0.25 -0.13 -0.06 0.48
-0.02 -0.25 -0.11 -0.02 -0.0 -0.03 0.07 0.02 0.1 0.05 0.04 0.1
0.13 0.04 -0.11 -0.06 -0.18 0.07 -0.05 -0.09 -0.03 0.09 -0.02 0.17
-0.57 0.19 -0.1 -0.01 -0.15 0.22 -0.02 -0.02 0.12 0.06 -0.06 0.18
-0.46 -0.1 -0.11 -0.07 0.03 0.1 -0.05 0.04 0.18 0.14 0.12 0.07
-0.31 0.0 -0.01 0.08 -0.07 -0.03 0.17 0.21 -0.04 -0.06 0.06 -0.07
-0.14 -0.07 -0.11 0.1 -0.07 0.07 0.04 -0.01 0.04 -0.03 0.13 0.02
-0.43 -0.18 -0.09 0.19 0.13 0.01 -0.06 -0.09 0.17 0.24 -0.06 0.04
-0.21 0.16 0.15 0.2 -0.11 0.34 -0.26 -0.44 -0.14 -0.1 0.36 -0.21
-0.18 -0.07 0.02 0.04 -0.04 0.09 0.07 0.05 0.03 -0.01 -0.0 -0.01
-0.2 -0.23 -0.16 -0.16 -0.11 0.09 0.04 0.12 0.01 0.17 0.23 0.08
-0.06 0.06 0.0 0.05 -0.03 -0.1 -0.01 0.02 -0.38 -0.11 -0.13 0.51
- 0.8 -0.31 -0.47 0.11 - - -0.5 0.49 -0.42 1.62 0.79
-0.21 -0.14 -0.1 -0.12 -0.0 0.12 0.1 0.07 -0.02 0.14 0.15 -0.04
-0.06 0.04 0.11 -0.04 -0.19 0.07 0.02 0.1 -0.02 -0.01 -0.08 0.03
-0.13 0.02 0.04 -0.02 -0.09 -0.04 -0.02 0.03 -0.1 0.02 0.13 0.13
- - - - - 1.75 - 1.45 0.53 - 1.28 1.02
-0.28 -0.0 0.03 0.07 -0.03 -0.02 0.15 0.3 -0.03 0.03 -0.45 0.1
-0.04 -0.0 -0.04 -0.07 -0.1 -0.08 -0.05 0.03 0.09 -0.02 0.05 0.2
-0.62 -0.02 -0.1 0.08 -0.17 -0.02 -0.07 0.11 0.01 0.17 0.28 0.17
-0.01 -0.02 -0.03 -0.04 -0.12 -0.14 -0.09 -0.0 0.0 0.18 0.16 0.07
-0.41 -0.28 -0.21 -0.14 0.12 -0.09 -0.02 0.29 0.06 0.14 0.24 0.12
-0.15 0.05 -0.05 -0.14 -0.01 0.23 -0.14 -0.1 -0.02 -0.03 0.23 0.06
-0.05 0.02 0.05 0.08 -0.01 0.09 -0.03 -0.09 -0.02 -0.07 0.0 -0.0
-0.36 0.07 -0.13 -0.14 0.11 0.26 -0.39 -0.32 0.02 0.04 0.6 -0.07
- - - - - 1.38 - - 0.91 1.22 1.68 0.98
-1.91 -0.68 -3.0 -0.81 -0.24 0.89 -1.49 0.21 0.09 1.08 0.58 0.61
-1.89 -0.47 -0.87 -0.0 -0.19 0.05 0.55 0.85 -1.95 0.49 0.6 0.13
-1.23 -0.39 -0.34 -0.1 0.06 0.27 0.46 0.22 -0.0 -0.05 0.44 -0.04
-0.16 0.12 -0.03 0.12 -0.1 0.2 -0.02 -0.07 -0.05 -0.11 0.01 0.05
-0.28 0.04 -0.08 -0.16 0.01 0.1 -0.24 -0.08 0.05 0.09 0.27 0.18
-0.69 -0.02 -0.19 -0.07 0.18 0.2 -0.03 -0.04 0.16 -0.1 0.17 0.21
- 1.07 0.71 -0.49 -2.12 -1.05 - - 1.27 0.52 1.59 -
-0.15 -0.17 -0.05 -0.15 -0.09 -0.09 0.15 0.13 0.06 0.09 -0.0 0.21
-0.25 0.09 0.02 -0.02 -0.03 0.05 0.07 -0.14 -0.01 0.02 0.09 0.07
-0.08 0.01 -0.04 0.1 0.01 -0.02 -0.02 0.25 -0.3 0.01 0.07 -0.03
0.09 -0.11 -0.31 -0.31 -0.11 0.07 0.06 0.0 0.08 0.26 0.23 -0.08
0.31 0.32 -0.59 -0.31 -0.2 0.22 -0.34 -0.38 -0.57 0.26 0.07 0.62
-0.02 0.06 -0.06 0.05 -0.03 0.09 -0.0 -0.06 -0.01 -0.05 0.02 0.0
-0.19 -0.12 -0.25 -0.09 -0.09 0.03 0.11 0.14 0.02 0.11 0.01 0.23
-0.08 -0.18 -0.17 -0.16 -0.07 0.06 0.16 -0.12 0.05 0.11 0.12 0.19
-0.17 -0.01 -0.15 -0.1 0.0 -0.05 -0.0 0.05 -0.04 0.11 0.21 0.11
-0.48 -0.06 -0.43 -0.13 -0.19 0.17 0.14 -0.17 0.15 0.23 0.29 0.23
-0.34 -0.04 -0.17 0.02 -0.04 -0.03 0.08 0.17 -0.06 0.15 0.16 0.02
-0.14 -0.11 -0.13 0.06 -0.06 0.0 0.06 0.08 0.04 0.03 0.1 0.04
-0.06 -0.11 -0.05 0.0 0.0 0.0 0.07 0.08 0.1 0.01 -0.11 0.05
-0.47 -0.29 -0.08 -0.07 0.02 0.09 -0.03 0.2 0.06 0.12 0.24 0.07
-0.09 -0.09 -0.11 -0.0 -0.06 0.03 0.1 0.06 0.08 0.03 -0.06 0.09
-0.21 0.06 0.02 0.2 -0.09 -0.02 -0.05 0.18 -0.03 0.02 0.01 -0.14
-0.56 0.19 -0.58 -0.17 0.04 0.5 0.05 -0.63 0.08 -0.07 0.12 0.49
-0.62 -0.19 0.07 -0.12 -0.12 0.06 0.05 0.28 0.06 -0.03 0.02 0.32
- - -0.31 -1.44 0.18 -0.12 0.06 -0.47 1.22 0.54 1.55 -1.74
-0.41 -0.17 -0.05 -0.14 -0.05 -0.0 0.19 0.24 -0.18 0.11 0.1 0.22
-0.79 0.08 -0.15 0.19 -0.11 -0.06 0.26 0.19 -0.07 -0.04 0.12 0.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.