Heatmap: Cluster_166 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.12 -0.09 -0.27 -0.18 -0.08 0.17 0.05 -0.06 0.02 0.22 0.14 0.1
-0.33 -0.69 -0.64 -1.13 -1.14 0.22 0.08 -0.39 0.41 0.57 1.13 0.05
0.12 -0.41 -0.4 -0.07 0.02 0.38 0.12 0.16 0.06 0.15 -0.07 -0.26
-0.3 -0.21 -0.4 -0.08 -0.02 0.06 0.05 -0.08 0.36 0.22 0.24 -0.03
-0.21 -0.14 -0.16 -0.12 -0.06 0.02 0.1 0.01 0.09 0.11 0.28 0.02
-0.24 -0.38 -0.34 -0.46 -0.09 0.19 0.29 0.07 0.34 0.26 0.1 -0.02
-0.19 -0.17 -0.08 0.11 0.08 -0.05 0.08 0.09 0.15 -0.02 -0.06 0.02
-0.56 -0.44 -0.03 -0.34 0.3 0.25 0.14 0.11 0.11 0.01 0.26 -0.1
-0.13 -0.62 -0.55 -0.4 -0.11 0.16 0.12 0.16 0.33 0.32 0.31 0.01
-0.31 -0.59 -0.44 -0.36 0.09 0.26 0.24 0.35 0.32 -0.0 0.05 0.03
-1.36 -0.77 -0.42 -0.28 -0.4 -0.02 0.05 -0.39 0.39 0.63 1.06 -0.06
-0.91 -0.15 -0.11 0.01 -0.03 -0.14 0.14 0.12 0.26 0.25 0.19 0.03
-1.05 -0.89 -0.61 -0.8 -0.1 0.18 0.4 -0.09 0.43 0.5 0.63 0.15
0.08 -0.3 -0.46 -0.48 -0.2 -0.1 0.02 -0.18 0.24 0.38 0.49 0.14
0.03 -0.13 -0.08 -0.07 -0.03 0.06 -0.0 0.17 -0.07 -0.07 0.11 0.05
-0.11 -0.2 -0.15 -0.17 0.03 0.01 0.1 0.09 0.12 0.11 0.07 0.05
0.14 -0.29 -0.51 -1.13 -0.57 -0.08 -0.41 -0.71 0.4 0.72 0.73 0.4
-0.17 -0.23 -0.1 -0.02 0.01 -0.17 0.14 0.15 0.11 0.07 0.11 0.03
-0.09 -0.17 -0.31 -0.18 -0.24 -0.12 0.08 0.21 0.32 0.11 0.27 -0.04
0.02 -0.21 -0.02 -0.11 0.09 0.12 -0.02 0.13 -0.03 0.11 0.04 -0.18
-0.19 -0.23 -0.25 -0.24 -0.1 0.25 0.22 0.1 0.17 0.16 0.17 -0.21
-0.15 -0.09 -0.07 -0.04 -0.1 -0.02 0.02 0.04 0.16 0.1 0.05 0.06
-0.29 -0.17 -0.27 0.05 -0.07 -0.07 0.07 0.13 0.32 0.15 0.19 -0.19
-0.02 -0.12 -0.31 -0.25 -0.04 0.06 -0.03 0.28 0.16 0.21 0.13 -0.2
-0.22 -0.31 -0.13 -0.13 0.05 -0.04 0.18 0.17 0.14 0.06 0.15 -0.03
-0.11 -0.18 -0.24 -0.21 -0.03 0.14 0.12 0.14 0.13 0.16 0.12 -0.13
-0.04 -0.2 -0.23 -0.21 -0.01 -0.04 0.09 0.1 0.15 0.13 0.11 0.08
0.05 -0.27 -0.11 -0.37 -0.08 -0.13 0.24 0.1 0.11 0.24 0.13 -0.06
-0.3 -0.27 -0.28 -0.08 -0.0 0.06 0.18 0.12 0.13 0.13 0.16 0.04
0.09 -0.32 -0.24 -0.11 -0.14 0.08 0.18 0.18 -0.02 0.11 0.2 -0.12
-0.72 -0.38 -0.24 -0.04 0.07 0.13 0.17 0.16 0.13 0.09 0.2 0.16
0.06 -0.29 -0.25 -0.22 -0.08 -0.01 0.0 0.18 0.07 0.15 0.23 0.06
-0.24 -0.35 -0.1 0.0 0.03 0.14 0.06 0.26 0.29 0.14 0.2 -0.73
-0.27 -0.2 -0.17 -0.06 -0.03 0.03 0.08 0.23 0.07 -0.0 0.07 0.15
-0.3 -0.26 -0.1 -0.1 -0.03 0.2 0.2 0.07 0.1 0.15 0.1 -0.15
-0.26 -0.6 -0.15 -0.33 0.01 -0.21 0.1 0.26 0.18 0.17 0.39 0.13
-0.0 -0.19 -0.09 -0.04 -0.1 -0.01 0.03 0.08 0.02 0.09 0.07 0.1
-0.03 -0.07 -0.16 -0.02 -0.04 -0.03 -0.04 -0.04 0.18 0.12 0.09 0.01
-0.13 -0.06 -0.08 -0.02 -0.05 0.01 -0.05 0.13 0.12 0.14 0.13 -0.17
-0.0 -0.11 -0.27 -0.27 -0.15 0.13 -0.16 0.05 0.1 0.14 0.19 0.23
-0.24 -0.31 -0.34 -0.29 -0.4 0.03 0.02 0.11 0.44 0.28 0.39 -0.04
-0.21 -0.18 -0.16 -0.32 -0.17 -0.01 0.01 0.0 0.21 0.29 0.16 0.24
-0.3 -1.17 -0.11 -0.42 0.22 0.45 0.5 -0.03 -0.16 -0.13 0.5 -0.13
-0.31 -0.26 -0.27 -0.13 -0.05 0.02 0.16 0.33 0.18 0.07 0.16 -0.03
0.04 -0.16 -0.21 -0.11 -0.17 -0.07 -0.01 0.06 0.24 0.26 0.17 -0.14
-0.09 -0.23 -0.12 -0.07 -0.05 0.04 -0.16 0.12 0.01 0.14 0.18 0.17
-0.2 -0.46 -0.22 -0.26 -0.09 0.07 0.0 0.23 0.18 0.22 0.25 0.09
-0.18 -0.19 -0.19 -0.18 -0.16 -0.07 0.06 0.09 0.38 0.11 0.08 0.13
-0.28 -0.28 -0.13 0.07 0.09 0.04 -0.02 0.07 0.16 0.19 0.14 -0.16
0.04 -0.35 -0.28 -0.39 -0.26 0.1 0.04 -0.06 0.18 0.17 0.32 0.26
-0.34 -0.23 -0.38 -0.0 0.09 0.24 0.06 0.2 -0.01 0.3 0.22 -0.41
-0.26 -1.06 -1.02 -0.61 -0.25 0.27 0.53 -0.0 0.37 0.68 0.31 -0.13
-0.53 -0.08 -0.34 -0.1 -0.22 0.03 0.01 -0.07 0.3 0.39 0.26 0.07
-1.16 -0.94 -0.33 -0.32 -0.38 0.03 -0.04 -0.07 0.33 0.63 0.91 0.05
-0.2 -0.2 -0.08 0.15 -0.02 -0.02 0.04 0.01 0.03 0.05 0.12 0.08
-0.47 -0.2 -0.12 0.07 0.12 0.06 0.07 0.11 0.06 0.15 0.01 0.02
-0.15 -0.23 -0.08 -0.08 0.11 0.11 0.1 0.02 0.04 0.03 0.18 -0.11
-0.1 -0.21 -0.1 -0.18 0.02 -0.07 -0.01 -0.07 0.23 0.18 0.13 0.12
-0.16 -0.39 -0.19 0.04 0.02 -0.04 0.1 0.07 0.24 0.1 0.05 0.05
0.13 -0.05 -0.22 0.1 -0.0 0.09 -0.07 0.09 0.05 -0.05 -0.04 -0.06
-0.35 -0.6 -1.1 -1.39 -0.83 0.61 0.21 -0.07 0.21 0.53 0.83 0.19
-0.17 -0.18 -0.17 -0.1 -0.08 -0.02 0.1 0.21 0.21 0.06 0.06 0.02
-0.64 -0.88 -0.2 -0.72 -0.42 0.02 0.46 -0.23 0.46 0.35 0.59 0.26
0.09 -0.22 -0.24 -0.11 -0.09 -0.03 -0.08 0.02 0.13 0.18 0.27 -0.02
-0.39 -0.58 -0.3 -0.02 -0.05 0.22 0.24 0.02 0.34 0.41 0.12 -0.4
-0.17 -0.07 -0.31 -0.11 -0.23 0.06 0.06 -0.02 0.41 0.24 0.15 -0.2
-0.43 -0.74 -0.37 -0.65 -0.23 0.14 0.06 -0.08 0.29 0.43 0.81 -0.03
0.07 -0.04 -0.04 -0.12 -0.16 0.02 0.06 0.14 0.01 0.05 0.1 -0.14
-0.03 -1.38 -1.49 -0.31 0.06 0.59 0.43 0.48 0.33 0.16 0.13 -0.48
-0.27 -0.31 -0.19 -0.1 -0.17 0.05 0.04 0.27 0.25 0.18 0.17 -0.09
-0.18 -0.11 -0.09 -0.14 0.06 0.1 0.05 0.04 0.11 0.05 0.04 0.03

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.