Heatmap: Cluster_175 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.69 0.13 0.4 0.58 -0.55 -0.21 0.13 -0.72 0.46 -0.15 0.5 -0.88
0.79 0.24 0.02 0.46 0.02 -0.21 0.03 0.2 -0.56 -0.47 -0.38 -1.08
-0.2 0.29 0.1 -0.05 0.16 0.44 -0.75 0.42 -0.31 -0.54 -0.56 0.37
0.21 0.37 0.18 0.61 0.58 -0.82 -0.31 0.61 -0.05 -0.43 -0.83 -2.07
0.21 0.19 0.13 0.06 0.12 0.13 0.08 -0.14 -0.29 -0.31 -0.3 -0.03
-0.08 0.71 0.58 1.58 -1.97 0.81 0.16 - - -0.53 -0.52 -1.25
0.09 0.44 0.46 0.55 0.47 -0.16 -0.39 -0.4 -0.46 -0.63 -0.16 -0.58
- 0.82 0.6 0.8 -0.55 0.04 -2.22 -0.81 -0.82 0.24 1.2 -1.17
-0.41 0.24 0.48 0.4 0.13 0.05 -0.06 0.02 -0.09 -0.03 -0.39 -0.81
-0.18 1.52 - 1.9 -1.37 - 1.38 - -1.26 - 0.14 -
- - 1.74 1.24 0.93 1.06 - - - - 1.2 -
0.92 -0.03 0.24 0.09 0.17 0.05 -0.14 -0.19 -0.16 -0.7 -0.56 -0.38
0.6 0.19 0.39 -0.49 -0.0 0.12 0.06 -0.14 0.02 -0.24 -0.71 -0.29
-0.23 0.5 0.92 1.42 0.57 -2.19 0.21 -0.7 -0.91 -1.89 -0.5 -2.53
- - - - - - - - 1.95 1.75 2.26 -
- - - 2.79 - - - - -0.14 -0.34 1.76 -
0.08 0.12 1.47 1.04 0.77 - -0.39 - - -0.5 0.16 -0.43
-0.04 -0.06 0.39 0.25 0.16 -0.05 -0.05 0.1 -0.23 -0.17 -0.19 -0.26
1.32 - 0.24 1.03 1.23 -0.47 0.7 - 0.04 -0.84 - -
0.49 0.27 0.17 -0.02 -0.14 0.0 -0.04 -0.01 -0.23 -0.27 -0.22 -0.21
1.12 0.73 -0.47 0.81 -0.65 -0.6 -0.08 -0.43 -0.77 -0.33 -0.55 -0.64
- -1.23 1.29 1.82 -1.65 - - 1.12 0.79 0.48 - -
0.51 2.11 0.58 0.95 - - - - 0.17 - 0.77 -
0.55 0.19 0.48 0.12 0.23 -0.56 -0.31 -0.07 -0.17 -0.3 -0.07 -0.62
- - - - - - - - 2.07 - 2.96 -
0.24 0.6 0.79 0.84 0.12 -1.1 -0.02 -0.47 -0.47 -0.43 -1.15 -0.73
0.72 0.3 0.23 0.26 0.26 -0.32 -0.33 0.01 -0.06 -0.38 -0.61 -0.82
- 2.48 1.91 1.4 - - - - - - - -
- - - - 0.89 -0.05 - 0.15 1.01 - 2.6 -
0.44 0.1 0.2 -0.03 0.15 0.21 -0.09 -0.33 -0.18 -0.03 -0.33 -0.37
0.32 0.2 0.16 -0.04 -0.01 0.01 -0.03 -0.05 -0.1 -0.25 -0.2 -0.11
0.72 0.12 0.22 0.21 0.19 0.03 -0.24 -0.11 -0.09 -0.31 -0.4 -1.01
- 0.94 0.56 1.93 -1.29 - - - 0.97 - 1.28 -
- - 0.77 1.95 0.34 -0.55 0.19 - -0.71 -0.92 1.13 -
0.42 0.24 0.51 0.21 0.18 -0.22 -0.37 -0.34 -0.24 -0.28 -0.05 -0.49
- 0.17 1.04 2.13 - - -0.73 -1.83 - 0.44 0.0 0.25
- 1.15 -1.69 0.8 -1.53 1.07 - - 0.47 -0.39 1.22 -0.32
0.43 -0.07 0.22 -0.06 0.19 -0.07 -0.21 0.27 -0.03 -0.13 -0.18 -0.66
0.54 0.17 0.02 0.18 0.09 0.15 -0.07 -0.23 -0.33 -0.28 -0.3 -0.23
0.81 0.15 0.02 0.37 -0.07 -0.66 -0.12 0.15 -0.15 0.14 -0.5 -0.99
1.19 0.49 0.91 -1.34 0.06 -0.66 -0.89 -1.03 -0.27 -0.12 0.11 -0.99
-0.55 -0.02 0.56 0.55 0.32 -0.33 0.15 0.1 -0.09 -0.16 -0.43 -0.77
0.31 0.25 0.11 -0.03 -0.07 0.22 -0.27 0.13 -0.09 -0.04 -0.21 -0.55
0.21 0.36 0.24 0.23 -0.02 -0.24 -0.1 -0.16 -0.1 -0.09 -0.23 -0.28
0.3 0.23 0.38 -0.04 0.04 -0.09 -0.03 -0.24 0.03 -0.33 -0.37 -0.11
0.11 0.13 0.08 0.08 -0.1 0.19 -0.31 0.08 0.1 -0.1 -0.24 -0.13
- 1.11 1.9 0.82 -1.26 - - 0.37 0.06 0.12 -1.77 -2.17
- -0.8 1.29 0.44 -0.7 -0.45 -0.55 1.5 1.08 -1.43 -1.77 -
0.78 1.3 -0.03 0.96 0.15 -0.3 -0.22 -0.23 -1.49 -0.83 -2.96 -2.16
- - 0.88 1.51 0.69 1.34 -0.34 - -1.86 -1.57 -0.18 -0.19
-1.13 -0.15 -0.79 1.65 0.58 -3.62 -0.05 -0.22 -2.11 -0.77 1.13 -0.96
0.37 0.16 0.26 0.05 -0.0 -0.05 -0.06 0.13 -0.05 -0.31 -0.28 -0.47
- - - 2.09 0.14 -1.06 -0.93 0.23 -1.04 1.17 0.79 -
0.38 -0.04 0.09 0.11 0.16 0.07 -0.07 -0.05 0.0 -0.13 -0.35 -0.32
-1.18 -1.82 -0.57 1.1 0.19 - - 0.83 0.84 - 1.71 -1.03
1.09 0.8 1.39 1.57 0.19 -1.15 -1.37 -3.46 -4.06 -2.77 -6.08 -1.99
0.73 -0.34 0.09 1.31 1.14 - -1.86 -1.45 -0.32 0.99 -1.46 -
-0.2 1.1 0.59 1.57 1.29 - - 0.36 -1.26 -1.47 - -
0.44 0.48 0.69 0.44 0.32 -0.66 -0.21 -0.23 -0.3 -0.55 -0.51 -1.05
- - 0.25 - - - - - 2.03 - 2.75 -
0.27 0.63 - -0.45 0.08 -0.63 -0.89 - 1.43 0.6 1.05 -
-1.92 1.12 -0.79 1.16 0.2 -2.82 0.46 0.58 0.35 -1.39 -0.56 -1.97
0.32 -0.31 0.11 0.18 0.03 -0.08 -0.09 0.29 0.03 -0.12 -0.22 -0.3
0.94 0.88 0.18 1.8 -1.25 1.04 0.18 - - - - -
0.3 0.23 0.19 0.05 0.14 0.07 -0.13 -0.01 -0.22 -0.25 -0.17 -0.38
- - - 2.2 - 1.18 - - - - 2.36 -
0.69 0.41 0.28 0.48 -0.01 -0.06 -0.17 -0.41 -0.38 -0.46 -0.4 -0.75
0.71 1.32 1.0 -1.34 0.09 -2.22 0.07 -0.49 -0.35 -1.82 0.03 -1.55
0.88 0.0 0.41 -0.05 -0.13 -0.36 -0.35 -0.29 -0.19 -0.22 -0.06 -0.19
0.36 0.0 0.02 -0.18 -0.08 0.03 -0.12 -0.0 0.08 0.14 0.25 -0.78
-0.29 1.59 -0.61 0.51 0.06 -1.97 0.11 0.9 0.08 -1.81 -2.46 -1.7
-1.5 - -1.09 1.15 1.24 -2.4 0.76 1.52 -2.59 -0.76 0.12 -
1.23 -1.97 -0.47 0.83 -0.73 -1.16 -0.78 -0.14 1.1 -0.17 -0.0 -1.69
1.13 0.71 -0.21 - -0.24 2.17 -2.47 0.43 -1.16 - - -
- - - 2.54 1.23 - - - - -0.01 1.51 -
0.67 1.22 0.58 1.57 -0.7 -0.92 - -0.0 -0.19 -1.49 -2.13 -
0.24 -0.02 0.02 0.25 0.24 -0.1 0.03 -0.05 0.14 -0.1 -0.38 -0.47
- 2.54 - 2.16 - - - 0.02 - -0.5 - -
0.07 0.2 0.17 0.21 -0.07 -0.08 0.02 -0.07 -0.06 -0.16 -0.04 -0.28
-0.08 0.03 0.59 0.38 0.05 -0.39 -0.5 -0.08 -0.07 -0.14 -0.11 -0.01
-1.17 -0.59 0.19 -0.16 -0.57 -2.07 0.02 0.84 -0.5 0.76 1.45 -
0.15 0.27 0.18 0.1 -0.02 -0.18 -0.09 0.04 -0.13 -0.07 -0.12 -0.24
-1.36 -0.87 1.35 1.05 0.04 - 0.36 0.48 0.35 -0.94 -0.35 -2.56
0.72 0.84 0.34 0.38 -0.15 -0.96 0.11 -0.64 -0.3 -0.62 -0.3 -0.8
-0.37 0.03 0.21 -0.26 -0.4 1.02 0.03 0.49 -0.6 -0.39 -0.8 -0.01
1.08 -1.03 0.59 0.65 0.68 -0.25 -0.22 0.04 -0.63 -0.42 -3.29 -1.04
- 0.63 - - - - - 0.69 1.34 - 2.65 -
1.56 1.91 - 1.83 - - 0.79 - - - - -
-0.21 1.25 -1.55 0.5 0.01 -1.4 0.1 -0.24 -0.22 0.4 -0.08 -0.77
- 0.65 -0.01 1.81 0.1 -1.48 0.39 - 0.88 - 0.44 -
-2.94 -0.93 0.42 1.41 0.47 -1.26 -2.1 -0.18 0.43 -0.09 0.31 -0.14
-0.24 0.04 0.12 -0.66 0.18 0.17 -0.97 -0.27 0.19 0.11 0.23 0.5
-0.11 0.01 -0.0 0.24 0.18 0.06 0.04 0.23 -0.3 -0.25 -0.14 -0.08
- 0.56 - - 0.11 - - - 2.12 1.64 0.98 -
0.59 0.77 1.04 0.65 0.53 -1.07 -0.66 -0.97 -0.45 -0.81 -3.18 -0.51
- 0.49 1.13 1.37 0.13 -0.47 -0.58 0.04 -0.11 -0.65 -1.06 -1.9
0.87 -0.21 0.69 0.84 0.35 -0.28 -0.39 -1.83 0.23 -0.82 -1.28 -0.71
0.08 0.06 0.33 0.14 0.04 -0.1 0.0 -0.09 -0.25 -0.1 -0.21 -0.0
- 2.34 0.96 1.59 -0.01 - - - - - - -0.03
1.19 0.67 0.21 0.55 -0.24 0.58 -0.58 -1.14 -0.45 -0.24 -2.26 -1.99
-0.26 0.15 0.71 1.0 0.38 -0.69 0.2 -1.06 0.03 0.33 -1.08 -3.07
1.44 -1.09 -0.33 0.94 1.12 - -0.77 -0.11 -0.33 0.05 -1.05 -3.46
1.18 0.65 -0.08 -1.46 0.28 0.79 0.27 -0.42 -0.9 -1.17 -0.62 -1.55
1.71 1.47 0.14 0.82 -0.36 -0.56 -0.82 - -0.48 -2.55 - -2.34
-1.21 1.21 0.0 1.17 0.04 -2.11 -2.37 - 0.76 0.34 0.45 -2.22

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.