Heatmap: Cluster_143 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.33 -0.01 -0.17 -0.32 -0.25 -0.18 -0.06 0.01 0.01 0.13 0.25 0.12
0.56 -0.1 -0.22 -0.06 0.06 0.05 -0.09 -0.12 -0.13 -0.18 0.01 0.05
0.22 0.06 -0.15 -0.24 -0.1 -0.11 0.1 -0.05 -0.06 -0.02 0.15 0.12
0.36 0.06 -0.11 -0.11 -0.23 -0.23 -0.03 0.06 -0.09 0.01 0.07 0.15
0.49 0.06 -0.26 -0.19 -0.04 -0.18 -0.1 -0.0 -0.17 -0.11 0.01 0.31
0.33 0.07 -0.16 -0.24 -0.22 -0.13 -0.21 -0.1 0.03 0.13 0.16 0.19
0.18 0.26 -0.11 -0.93 -0.17 -0.34 -0.09 -0.08 -0.02 0.26 0.46 0.14
0.14 -0.06 -0.14 -0.04 -0.16 -0.14 -0.14 -0.04 0.08 0.12 0.08 0.22
0.06 0.1 -0.13 0.03 0.05 -0.19 -0.0 -0.09 -0.11 0.0 0.14 0.09
0.26 0.06 -0.02 -0.23 -0.09 -0.17 -0.1 -0.01 -0.02 0.03 0.01 0.19
0.17 0.26 -0.04 -0.29 -0.14 -0.06 -0.0 -0.08 -0.04 0.12 -0.0 0.02
0.67 0.07 -0.31 -0.25 0.17 -1.29 -0.58 -0.9 -0.0 0.06 0.68 0.4
0.36 0.25 -0.01 -0.22 -0.4 -0.38 -0.26 -0.09 -0.13 0.03 0.23 0.35
0.16 0.05 0.06 0.03 0.14 -0.05 -0.01 -0.11 -0.13 -0.13 -0.03 -0.03
1.06 0.59 -0.28 -0.67 -1.45 -0.92 -0.18 -0.38 0.29 -0.42 0.21 0.35
0.14 0.06 -0.01 0.01 -0.09 -0.11 0.08 0.05 -0.01 -0.09 -0.07 0.03
0.88 -0.45 -0.39 -1.27 -0.04 -0.56 0.39 -0.26 -0.1 0.03 0.27 0.37
0.54 0.04 -0.23 -0.24 -0.31 -0.2 -0.18 0.01 -0.09 0.01 0.08 0.32
0.31 0.01 -0.25 -0.17 -0.2 -0.25 -0.08 -0.01 0.12 0.09 0.09 0.2
0.36 0.12 -0.21 -0.27 -0.22 -0.35 -0.18 -0.01 0.1 0.17 0.13 0.17
0.2 0.01 -0.11 -0.22 -0.07 -0.07 -0.12 -0.06 0.06 0.06 0.13 0.13
-0.12 -0.19 -0.2 0.17 0.04 -0.14 0.06 -0.17 0.04 0.01 0.07 0.33
0.26 -0.01 -0.09 -0.05 -0.04 -0.11 -0.1 0.01 -0.06 -0.09 0.09 0.13
0.29 -0.04 -0.22 -0.33 -0.27 -0.2 -0.11 0.1 0.04 0.09 0.26 0.22
0.26 -0.05 -0.06 -0.23 -0.03 -0.24 -0.16 -0.05 0.03 0.05 0.06 0.3
0.26 0.01 -0.14 -0.16 -0.06 -0.16 -0.09 0.03 -0.0 -0.05 0.11 0.17
0.41 0.05 -0.19 -0.52 -0.21 -0.27 -0.03 -0.01 0.06 0.14 0.03 0.3
0.84 0.16 0.05 -0.16 -0.32 -0.4 0.08 -0.66 -0.14 -0.16 0.21 -0.07
0.01 0.37 -0.03 -0.68 0.54 -0.14 -0.09 0.29 0.01 0.04 -0.89 -0.0
0.42 0.07 -0.13 -0.35 -0.02 -0.24 -0.13 -0.1 -0.03 -0.01 0.16 0.2
-0.07 0.36 -0.1 -0.52 0.05 0.1 0.17 -0.09 0.16 0.09 -0.33 -0.02
1.25 0.61 -0.59 -1.63 -1.58 -0.77 -0.61 -0.55 -0.07 0.36 0.51 0.24
0.29 0.17 0.01 -0.28 -0.19 -0.26 -0.22 -0.07 -0.08 0.05 0.14 0.28
0.21 0.04 -0.13 -0.2 -0.22 -0.13 -0.17 0.05 -0.01 0.06 0.18 0.23
0.23 -0.1 0.48 -1.19 0.4 -1.85 0.79 -3.02 0.52 0.24 -0.94 0.56
0.18 0.04 0.02 -0.23 -0.21 -0.14 -0.16 -0.03 0.11 0.08 -0.05 0.29
0.17 -0.0 -0.09 -0.17 -0.16 -0.14 -0.12 0.03 0.0 0.04 0.12 0.25
0.68 0.3 -0.34 -0.53 -0.66 -0.27 -0.3 -0.01 0.03 0.05 0.23 0.25
0.55 0.23 -0.03 -0.26 -0.29 -0.45 -0.28 -0.13 -0.06 -0.01 0.15 0.27
0.48 0.2 -0.04 -0.07 -0.34 -0.39 -0.09 -0.16 -0.11 -0.05 0.03 0.31
0.21 0.06 -0.25 -0.16 -0.06 -0.25 0.06 -0.0 -0.1 -0.03 0.26 0.17
0.45 0.02 -0.23 -0.27 -0.22 -0.17 -0.17 -0.06 0.08 0.11 0.12 0.16
1.16 -0.47 -0.93 -2.53 -0.73 -1.2 -0.01 -0.14 -0.17 -0.65 0.37 1.37
0.41 -0.19 -0.57 -0.43 -0.37 -0.18 0.0 0.09 -0.03 0.12 0.32 0.42
- - - - 1.96 - - - - - 1.35 2.48
0.25 0.18 -0.03 -0.18 -0.18 -0.15 -0.06 -0.09 0.01 -0.06 0.05 0.18
0.12 0.04 -0.05 -0.1 -0.06 -0.1 -0.04 -0.02 -0.01 -0.04 0.05 0.18
0.13 -0.01 -0.07 -0.16 0.06 -0.2 -0.02 0.01 -0.06 0.02 0.14 0.1
1.4 -1.19 - - - -2.65 -1.7 -0.02 -1.63 1.18 1.33 1.25
0.4 0.08 -0.15 -0.27 -0.25 -0.25 -0.12 -0.04 -0.06 -0.02 0.17 0.32
0.52 0.12 -0.44 -0.19 -0.4 -0.49 -0.14 0.02 -0.02 0.13 0.2 0.31
0.34 0.07 -0.08 -0.49 -0.03 -0.45 -0.03 0.09 0.01 -0.0 0.1 0.25
0.55 0.05 -0.33 -0.42 -0.33 -0.11 -0.13 0.03 -0.17 0.16 0.16 0.24
0.28 0.12 -0.12 -0.17 -0.12 -0.18 -0.09 0.01 -0.0 0.02 0.07 0.1
0.06 -0.02 -0.1 -0.13 0.07 -0.07 0.02 0.08 -0.05 0.01 0.06 0.05
0.33 0.17 0.05 -0.25 -0.23 -0.3 -0.17 -0.03 -0.09 0.01 0.2 0.15
0.25 -0.07 -0.19 -0.15 -0.23 -0.17 0.07 -0.13 0.02 0.05 0.15 0.29
0.39 0.15 -0.1 -0.2 -0.14 -0.16 -0.08 -0.18 0.01 -0.13 0.0 0.3
0.02 -0.06 -0.21 -0.07 -0.01 -0.23 -0.15 0.06 0.15 0.14 0.03 0.24
0.3 0.18 -0.14 -0.19 -0.12 -0.25 0.1 0.05 -0.01 -0.07 0.09 -0.03
0.48 -0.26 -0.58 -0.65 -0.48 -0.36 -0.18 0.01 0.23 0.29 0.39 0.46
0.48 -0.02 -0.3 -0.18 -0.08 -0.11 -0.04 -0.19 -0.06 0.06 0.09 0.18
0.42 0.09 -0.14 -0.4 -0.21 -0.32 -0.18 -0.13 0.11 0.08 0.14 0.3
0.35 0.01 -0.24 -0.22 -0.2 -0.17 -0.1 -0.0 0.09 0.04 0.13 0.2
0.26 0.13 -0.14 -0.34 -0.18 -0.15 -0.1 -0.0 0.07 0.06 0.06 0.2
0.71 0.31 -0.38 -0.62 -0.37 -0.38 -0.32 -0.2 -0.16 0.08 0.33 0.35
0.45 0.25 -0.26 -0.34 -0.43 -0.53 -0.23 -0.2 -0.04 0.22 0.34 0.33
-0.31 0.54 -2.41 -1.28 -0.32 -0.22 -0.63 -0.42 0.13 -0.24 1.39 0.6
0.28 -0.02 -0.13 -0.11 0.05 -0.03 -0.02 -0.05 -0.09 0.03 -0.03 0.1
0.34 0.04 -0.2 -0.3 -0.26 -0.26 -0.06 0.04 0.05 0.07 0.2 0.18
0.16 0.11 -0.05 -0.38 -0.09 -0.24 -0.05 -0.06 0.03 0.09 0.18 0.2
0.22 -0.03 -0.08 -0.16 -0.16 -0.12 0.01 -0.04 0.09 0.07 0.16 -0.02
0.58 -0.07 -1.34 -1.48 -0.26 -1.57 -0.27 -0.02 0.28 0.67 0.17 0.91
1.59 -1.02 -1.22 -0.84 -0.11 -1.29 0.55 -1.79 -0.77 -0.23 0.96 0.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.