Heatmap: Cluster_25 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
1.24 1.7 2.26 1.43 1.7 2.32 1.16 2.32 1.78 1.83 0.83 3.73
0.07 0.2 0.51 0.6 0.0 1.48 0.56 0.34 0.24 0.19 0.27 0.37
0.0 0.37 0.27 0.21 0.16 0.72 0.04 0.19 0.43 0.07 0.29 0.0
0.93 0.23 1.18 1.31 0.22 0.86 0.48 0.91 0.56 0.78 0.5 1.32
0.0 0.0 0.29 0.17 0.14 1.37 0.75 0.25 0.3 0.0 0.0 0.0
8.83 12.57 11.35 11.2 11.93 14.8 12.87 13.15 12.35 12.13 16.09 14.16
0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.27 0.02 0.0 0.06 0.01 0.02 0.17
8.44 6.94 5.52 5.75 7.45 7.45 8.61 5.78 7.1 6.76 7.75 9.08
26.95 27.62 24.68 44.16 34.04 37.84 24.74 21.78 28.83 39.18 42.27 37.64
90.71 92.83 91.09 85.33 88.06 95.59 91.66 85.28 87.38 91.43 87.99 92.78
0.07 0.0 0.66 1.13 0.45 1.13 0.75 0.44 1.02 0.88 0.91 1.76
0.57 3.17 2.49 2.91 2.22 5.6 1.51 2.1 3.12 2.87 2.79 3.81
0.24 0.6 0.28 0.49 0.54 1.31 0.57 0.22 0.62 0.73 0.2 0.79
0.18 0.25 0.82 1.05 1.21 1.37 1.66 0.48 0.64 0.93 0.55 1.27
0.21 0.14 0.27 0.15 0.13 0.23 0.19 0.2 0.22 0.16 0.23 0.35
0.0 0.0 0.19 0.79 0.37 2.15 0.81 0.09 0.28 0.19 0.37 0.32
1.68 1.56 1.95 1.86 2.26 2.49 2.1 1.94 2.3 2.65 2.52 2.95
1.23 1.52 1.39 1.71 1.78 4.55 1.66 1.13 1.82 0.66 1.9 1.66
0.34 0.38 0.17 0.44 0.32 0.67 0.33 0.35 0.36 0.44 0.37 0.2
16.6 17.94 17.39 16.21 16.42 22.35 18.2 18.35 16.5 16.9 18.06 17.16
0.11 0.09 0.18 0.25 0.4 0.34 0.35 0.15 0.28 0.08 0.13 0.24
35.88 35.29 34.26 37.97 38.54 37.76 33.78 36.33 39.1 39.52 40.78 38.84
0.46 0.18 0.19 0.13 0.47 0.63 0.33 0.36 0.27 0.27 0.24 0.18
55.25 60.94 56.0 63.36 52.19 74.84 65.27 59.06 58.51 62.26 62.62 64.76
0.6 1.22 0.62 0.21 0.22 1.69 0.88 0.67 0.33 0.31 0.65 1.38
1.92 3.14 2.25 2.13 1.63 3.03 1.99 1.2 1.72 1.7 1.57 2.47
24.22 21.01 18.09 30.99 23.69 22.83 25.74 19.53 27.73 23.3 26.3 30.18
0.0 0.66 0.74 1.32 0.74 1.8 1.11 0.47 0.49 0.94 0.42 1.5
3.79 2.57 3.57 2.43 2.2 5.06 4.3 3.16 3.0 4.82 4.28 6.26
1.44 1.76 2.07 0.36 2.68 7.65 1.44 3.06 2.37 3.3 2.64 5.37
18.59 22.49 23.31 19.71 20.77 22.11 18.83 19.57 21.43 21.75 21.25 21.84
2.81 3.84 4.22 5.32 6.32 8.79 4.67 4.26 3.63 5.12 3.6 7.39
0.41 0.95 1.19 1.47 2.3 2.5 1.56 1.3 1.37 1.04 0.64 1.85
1.2 1.29 1.18 1.49 1.16 1.73 1.45 1.43 1.63 1.52 1.5 1.67
0.99 1.66 1.37 0.85 1.78 2.87 1.76 1.47 1.29 0.99 0.94 1.06
0.25 1.29 0.49 0.66 0.49 0.96 1.29 0.46 0.52 0.49 0.2 1.47
0.3 2.83 1.41 0.55 1.63 0.84 0.97 2.07 1.44 1.12 0.2 1.25
3.29 4.72 4.38 4.03 4.06 6.55 5.34 2.79 3.14 4.35 4.23 3.66
7.88 11.04 13.9 4.13 9.17 18.78 8.51 12.71 12.76 10.62 9.66 17.16
0.25 0.43 0.39 0.88 0.38 1.87 0.97 0.22 0.47 0.52 1.0 0.64
0.19 0.17 0.03 0.04 0.33 0.59 0.18 0.0 0.25 0.06 0.08 0.1
0.48 0.98 0.46 1.12 0.72 2.3 0.99 0.23 0.59 0.57 1.4 1.56
0.02 0.15 0.04 0.02 0.28 1.24 0.36 0.37 0.35 0.61 0.7 0.99
151.98 170.99 154.46 156.81 152.94 172.84 158.04 167.53 154.53 157.02 154.58 171.46
5.17 6.77 7.23 7.41 7.81 8.99 6.95 8.68 8.83 9.62 7.39 7.85
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
2.74 3.15 3.11 1.81 3.23 4.76 1.78 0.94 3.96 3.23 1.97 3.95
0.35 0.04 0.24 0.29 0.2 0.33 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.63
8.52 9.91 9.01 14.2 12.36 12.96 11.71 8.82 12.97 12.94 11.59 12.09
1.55 1.39 1.63 1.89 1.9 2.8 2.14 1.86 2.0 2.22 1.94 2.83
4.69 4.71 5.97 6.14 6.02 6.2 5.38 6.41 6.47 5.98 4.71 6.42
54.19 57.33 54.74 52.89 44.94 56.15 46.14 49.81 42.89 45.88 47.51 56.89
0.04 0.05 0.02 0.02 0.02 0.09 0.0 0.0 0.02 0.0 0.06 0.1
0.74 1.7 1.42 1.27 2.06 3.77 2.12 1.49 0.54 0.99 0.86 0.96
0.28 0.04 0.56 1.17 0.11 1.49 0.35 0.33 1.1 0.54 0.37 0.09
0.0 0.02 0.07 0.24 0.05 0.71 0.05 0.15 0.03 0.27 0.19 0.09
1.23 1.95 1.19 1.32 3.8 6.39 2.88 2.25 2.46 2.45 4.25 3.9
0.11 0.31 0.39 0.42 0.43 1.15 0.73 0.35 0.44 0.41 0.53 0.67
1.42 0.71 0.69 0.94 1.11 3.28 1.08 1.25 0.45 0.36 1.38 0.28
15.76 12.22 13.97 13.09 15.48 18.76 15.42 15.16 13.5 15.39 16.39 15.07
2.69 0.85 1.97 0.62 3.24 3.04 1.55 1.14 2.11 0.92 2.39 2.08
0.31 3.28 0.48 1.28 1.52 1.82 1.0 1.91 1.2 1.31 1.05 1.62
2.36 2.18 3.64 2.49 4.44 5.6 4.39 2.97 3.71 4.06 3.39 3.89
0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.07 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.14 1.01 0.46 1.61 0.27 0.0 0.08 0.77 0.0 0.09
0.07 0.14 0.14 0.09 0.03 0.46 0.18 0.16 0.31 0.19 0.18 0.34
0.0 0.02 0.0 0.09 0.07 0.29 0.05 0.0 0.17 0.03 0.08 0.07
1.22 1.24 0.92 0.77 0.91 1.52 1.27 1.17 0.9 0.9 1.08 1.53
3.03 2.89 3.34 4.1 3.3 4.35 3.87 1.81 3.94 3.29 3.53 4.12
22.07 21.33 24.52 28.13 27.77 29.35 26.38 26.3 27.73 27.68 28.29 26.54
0.11 0.37 0.24 0.0 1.02 1.19 0.27 0.07 0.09 0.26 0.41 0.34
0.86 0.54 0.3 0.16 0.13 0.53 0.15 0.18 0.33 0.19 0.31 0.67
0.11 1.2 0.29 0.34 1.07 0.57 0.56 0.36 0.19 0.78 0.26 0.55
0.04 0.02 0.14 0.19 0.22 0.72 0.2 0.09 0.24 0.06 0.2 0.48
0.73 0.3 0.23 0.56 0.1 0.73 0.27 0.29 0.2 0.52 0.46 0.14
0.89 0.76 1.26 1.96 1.2 1.7 1.12 0.99 1.78 1.97 1.71 1.71
0.0 0.0 1.32 0.79 1.15 2.32 1.33 1.13 0.5 0.86 0.65 0.88
24.24 29.76 31.34 32.96 31.22 33.04 30.49 33.59 32.78 35.97 40.4 33.39
5.12 5.55 5.62 5.93 2.83 5.55 5.29 4.29 2.59 2.84 4.69 6.16
10.97 30.87 17.81 14.6 20.52 25.79 22.2 15.93 24.67 21.69 16.51 20.44
2.88 0.99 2.48 4.28 2.77 4.42 2.04 2.28 3.46 3.06 2.23 4.19

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)