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Heatmap: Cluster_36 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.41 -0.1 -0.17 -0.24 -0.17 -0.21 -0.06 -0.28 -0.05 -0.07 -0.15 0.72
- - - - 1.2 1.48 1.22 - 2.2 - - -
-0.62 -1.39 0.1 -0.34 0.62 -1.52 -1.78 -1.32 1.68 0.68 -1.52 0.44
0.28 0.25 -0.23 -0.39 -0.02 0.09 -0.24 -0.31 -0.0 0.08 -0.1 0.35
- - - - 1.08 - 1.5 - 2.34 1.0 - -
- - - - - - - - 3.58 - - -
0.16 0.02 -0.11 -0.12 -0.09 -0.16 0.04 0.04 0.14 -0.02 -0.12 0.16
- - - - 2.09 - 2.12 - 1.77 - - -
0.36 -0.52 0.14 -1.24 0.14 -0.23 0.44 -0.54 0.6 0.49 -0.14 -0.58
0.82 -1.14 -0.21 -0.1 0.24 -0.96 -0.24 -3.83 1.26 0.69 -2.25 0.2
0.31 -0.06 -0.19 -0.01 -0.17 -0.38 -0.2 -0.03 0.23 0.24 0.07 0.02
- - - - - - - - - 3.16 - 1.61
2.02 - 0.77 - - - - - 1.83 - 1.42 -
0.01 0.53 0.38 -0.27 -0.14 -0.64 -0.18 -0.02 -0.12 0.24 -0.12 -0.04
- - - - 0.97 - 2.0 - 1.65 - 1.55 -
- - - - - - - - 2.92 2.16 - -
0.09 0.03 0.03 -0.06 0.05 -0.13 -0.04 -0.0 0.01 0.02 -0.11 0.1
- - - - - - - - 2.62 - - 2.55
- - 1.37 - 2.04 - - - 2.41 - - -
1.19 - -0.16 - 1.17 - - - -0.32 1.09 - 1.87
-0.02 -0.06 -0.21 -0.19 0.07 0.04 0.0 0.09 0.21 -0.03 0.07 -0.01
0.17 0.08 -0.23 -0.47 -0.24 0.03 0.01 -0.13 -0.04 0.12 0.18 0.32
- - - - - - 2.75 - 2.4 - - -
2.33 - - - - - - - 1.25 1.06 - 1.32
- - - - - - - - - 2.45 - 2.71
- - - - - - - - 2.46 2.7 - -
0.0 -0.01 -0.06 -0.32 -0.08 -0.08 0.02 0.2 0.16 -0.05 0.04 0.11
- - - - - 1.17 - - - 1.8 - 2.64
0.14 0.01 -0.15 -0.6 0.01 -0.09 0.03 0.04 0.21 0.21 -0.1 0.11
- - - - - - - - 2.14 0.57 - 2.61
0.04 -0.1 0.09 -0.07 0.05 -0.29 0.01 0.05 0.1 0.12 -0.01 -0.03
-0.02 -0.05 -0.07 -0.12 -0.11 -0.07 0.17 -0.03 0.28 0.01 -0.09 0.04
- - - - - - 2.75 - 2.4 - - -
0.03 0.02 -0.06 -0.0 0.07 -0.02 -0.01 -0.06 0.06 -0.02 0.01 -0.02
- - - - - - - - 3.11 1.76 - -
0.1 -0.13 0.01 -0.14 -0.07 -0.16 -0.13 0.01 0.22 0.16 0.04 0.01
1.14 -1.58 -2.31 -1.92 -0.68 -1.81 -0.53 -2.03 0.63 1.17 -0.13 1.29
1.16 -1.75 -2.37 -2.31 -0.85 -1.89 -0.75 -2.72 0.7 1.24 -0.26 1.42
0.9 -1.24 -1.24 -1.05 -0.01 -0.68 0.06 -1.2 0.57 0.64 -0.09 0.79
-0.04 -0.31 0.04 0.2 0.01 -0.1 -0.08 -0.04 0.23 0.07 -0.05 0.0
0.42 -1.02 -1.53 -3.2 -0.88 -2.92 -0.49 -1.78 0.54 0.82 0.1 1.91
1.76 - 0.99 - - -0.88 1.74 - -1.04 - 0.34 -0.02
1.16 0.2 0.11 -0.05 0.03 -0.25 0.13 -1.32 -0.04 0.0 -1.45 -0.19
0.13 -0.01 -0.01 -0.04 -0.02 -0.07 -0.14 -0.06 0.09 0.03 0.02 0.07
0.58 0.05 -0.21 -0.22 -0.17 -0.22 0.03 -0.08 0.1 -0.04 -0.03 0.01
- - - - - - - - 3.58 - - -
0.28 0.14 -0.0 0.01 -0.04 -0.23 -0.03 0.01 0.01 -0.03 -0.31 0.11
0.47 -0.98 -2.44 -0.61 -0.05 0.2 0.25 -1.56 0.55 0.71 -1.01 1.01
0.6 -0.92 -0.66 -0.59 0.01 -0.61 0.27 -0.85 0.96 0.51 -0.66 0.3
0.69 -0.35 -0.28 0.11 -0.09 -0.24 -0.13 -0.19 0.33 0.23 -0.38 -0.12
1.04 -0.73 -0.75 -0.54 -0.04 -0.65 0.3 -0.77 0.64 0.17 -0.61 0.37
1.0 -1.55 -0.8 -0.26 0.17 -0.36 0.04 -1.01 0.73 0.35 -0.69 0.34
0.45 -0.63 -0.47 -1.88 0.05 -1.24 -0.01 -0.86 0.93 0.2 -0.06 0.99
-0.01 -0.45 -0.3 -0.05 -0.16 -0.62 -0.02 0.11 0.2 0.05 0.18 0.65
-0.2 -1.26 0.61 -1.16 -1.23 -0.49 0.32 0.05 -0.47 0.85 0.59 0.37
-0.01 -0.08 -0.15 -0.03 0.0 -0.03 0.02 0.05 0.07 0.05 0.01 0.08
-0.13 0.05 -0.09 -0.34 -0.04 0.1 0.08 -0.14 0.18 0.15 -0.24 0.3
1.75 -0.9 0.29 -0.99 0.28 -2.41 -1.24 -0.6 -0.21 0.03 0.12 -0.13
2.51 - - - - 1.22 - - 2.0 - - -
0.17 0.06 -0.03 -0.02 -0.08 -0.01 0.01 -0.16 0.15 -0.08 -0.05 0.01
-0.03 -0.32 0.08 0.09 0.15 0.0 0.12 -0.13 0.13 0.17 -0.02 -0.36
2.16 - 0.9 - - - 1.0 - 0.65 - - 1.07
1.22 -0.65 -0.47 0.07 0.24 -0.48 0.49 -1.05 0.7 -0.18 -1.21 -0.89
1.51 -0.23 -0.11 0.08 -0.44 -1.42 0.34 -0.37 0.4 -0.03 -1.16 -1.27
1.43 -0.38 -0.24 -0.39 -0.1 -0.89 0.08 -0.55 0.8 -0.32 -1.03 -0.55
1.07 -0.88 -0.63 -0.63 0.02 -0.62 0.16 -0.41 0.56 0.06 -0.51 0.39
0.08 -0.08 -0.17 -0.05 -0.05 -0.11 0.0 0.04 0.11 0.06 -0.06 0.2
- - - - 2.02 - 1.05 - 1.94 - - 1.02
0.16 -0.01 -0.18 -0.2 -0.11 -0.01 0.01 0.03 0.07 -0.06 0.1 0.15
- - - - 1.82 - - - 3.08 - - -
0.15 0.11 -0.27 -0.44 -0.15 -0.14 -0.16 0.13 0.09 -0.1 0.16 0.41
0.34 0.05 0.0 -0.11 -0.11 -0.07 -0.1 -0.1 -0.03 0.04 0.05 -0.04
- - 0.64 - 0.99 - - - 2.07 0.72 1.38 -
-0.3 -0.51 -0.04 0.12 0.23 -0.05 0.17 -0.2 0.5 0.23 -0.25 -0.22
- - - - 1.47 - - - - 2.61 - 1.64
1.31 -0.58 -0.29 -0.42 0.16 -2.02 0.17 -2.5 1.1 0.53 -0.81 -1.14
1.74 0.09 1.87 - - - 1.34 - - 0.49 - -
0.11 0.02 -0.05 -0.1 -0.03 -0.07 -0.05 -0.04 0.07 0.02 0.01 0.08
2.76 1.12 - - - - 1.6 - - - - -
1.64 -1.85 -0.21 0.4 -0.94 -0.27 0.33 -1.75 0.61 0.03 -1.46 -0.73
- - - - - - 2.78 - 0.84 - 1.75 -
-0.04 -0.19 -0.14 -0.19 -0.0 0.01 0.06 -0.02 0.17 0.14 0.02 0.12
-0.04 -0.35 0.05 -0.13 0.09 -0.17 0.09 0.01 0.04 0.3 0.18 -0.19
- - - - 1.41 - - - 2.67 - - 1.58
- - - - - - - - - 2.91 - 2.16
- - - - - - - - 1.26 1.5 - 2.76
0.04 0.06 -0.05 -0.21 -0.07 -0.16 0.06 0.09 0.08 0.01 0.03 0.1
-0.04 -0.05 -0.03 -0.09 0.02 0.0 -0.01 0.04 0.06 0.0 -0.02 0.09
- - - - 2.17 - - - 2.5 0.87 - -
1.33 - 1.12 - - - - 0.75 - 1.65 - 1.32
0.16 0.04 -0.01 -0.01 -0.01 -0.14 -0.07 -0.2 0.06 0.11 0.02 0.01
0.0 -0.35 0.25 -0.6 0.17 -1.35 0.13 -0.3 0.61 0.28 0.5 -0.36
0.15 0.05 -0.12 -0.35 -0.03 -0.05 0.01 0.01 0.19 0.02 -0.11 0.15
1.88 - 0.53 - 1.47 - - - 2.04 - - -
0.2 0.11 -0.22 -0.1 0.01 0.09 -0.02 -0.01 0.14 -0.17 -0.09 0.0
-0.47 -0.24 -0.2 -0.09 0.15 -0.19 0.25 -0.27 0.57 0.19 -0.29 0.23
0.38 -0.05 -0.19 -0.18 -0.08 -0.23 -0.03 0.04 0.09 0.01 0.11 0.02
-0.1 0.12 0.17 -0.14 -0.0 -0.24 0.16 -0.08 0.01 0.09 0.02 -0.07
0.03 -0.12 -0.09 0.03 0.03 -0.11 0.02 -0.11 0.21 0.04 -0.16 0.18
- - 1.02 - - - -0.23 - 0.76 1.5 0.07 1.83
0.16 -0.09 -0.02 -0.06 0.09 -0.34 0.0 -0.19 0.2 0.08 -0.2 0.25
-0.06 -0.02 -0.03 -0.43 -0.15 -0.18 0.1 0.0 0.23 0.21 0.14 0.07
-0.25 -0.45 0.0 0.18 0.08 -0.03 -0.12 0.09 0.27 0.09 -0.13 0.13
- - - - - - - - 3.15 1.65 - -
0.03 0.04 -0.03 -0.22 -0.11 -0.07 0.09 0.01 0.1 -0.0 -0.0 0.13
0.11 -0.35 -0.15 -0.23 0.5 -0.16 0.18 -0.52 0.45 -0.12 -0.23 0.14
-0.02 -0.03 -0.12 -0.22 -0.05 -0.0 0.12 0.13 0.09 0.0 0.09 -0.02
-0.13 -0.35 -0.39 -0.23 0.04 0.05 0.09 0.1 0.25 0.26 0.01 0.12
- - - - - - - - 2.32 - - 2.81
-0.01 0.06 -0.02 -0.24 -0.06 -0.15 0.12 0.03 0.09 0.09 -0.01 0.05
-0.11 -0.19 -0.08 0.09 0.11 0.02 -0.04 -0.09 0.15 0.06 -0.05 0.08
-0.03 -0.09 -0.13 -0.03 -0.05 0.03 0.03 -0.09 0.14 0.03 -0.01 0.18
- - - - - - - - 2.07 2.31 - 1.51
1.17 - - - 1.75 - - 0.58 0.66 0.43 - 0.97
- - - - - - - 1.3 - 1.77 - 2.61
0.93 -1.53 -1.97 -2.12 -0.77 -1.94 -0.41 -2.11 0.61 1.04 0.34 1.36
- - - - 1.59 - - - - 3.17 - -
- - - - 1.96 - - - - 3.02 - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.