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Heatmap: Cluster_8 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.19 0.34 -0.1 0.4 0.31 -0.85 -0.01 -1.46 0.25 0.05 -0.15 0.09
-0.29 -0.13 0.26 -0.0 0.03 0.41 0.14 -0.63 -0.01 -0.35 0.36 -0.14
1.53 -1.55 0.61 -0.09 -1.97 - - -1.53 -1.29 - 2.05 0.19
- - - - - - -0.08 - - 1.53 3.03 -
-0.04 0.0 -0.11 -0.04 -0.01 -0.11 0.03 -0.06 0.01 0.12 0.26 -0.1
0.36 -2.87 -0.93 0.61 -0.22 1.45 -0.06 -2.85 0.37 -0.65 0.49 -1.0
1.45 -1.29 -0.64 -1.82 0.15 -0.15 0.36 0.37 0.69 -0.86 -0.18 -1.68
0.3 0.11 0.08 -0.11 0.08 0.01 0.09 0.06 -0.23 -0.31 -0.08 -0.11
0.14 -0.47 0.09 -0.71 0.65 -0.51 -0.06 0.58 -0.09 0.22 0.15 -0.8
-1.19 1.3 -0.1 -2.81 0.5 -0.71 -0.19 0.25 -1.47 0.65 0.73 -1.56
0.34 0.54 0.22 -2.35 -0.22 -1.88 -0.65 -0.91 -0.05 0.37 1.24 0.0
- - - - 1.41 - - - - 1.33 2.77 -
-0.94 1.11 -0.51 - 0.38 -1.41 1.34 -0.08 0.28 -0.16 0.09 -1.78
-0.05 0.19 -0.04 -0.43 -0.11 -0.66 0.31 0.25 0.18 -0.42 0.04 0.36
0.51 -1.01 -1.01 -1.43 0.23 -1.0 0.32 0.07 0.22 0.2 0.59 0.5
-0.51 - - - 1.23 - -1.28 - -2.02 1.3 2.36 -0.53
-0.23 0.41 0.07 0.12 0.17 -0.12 -0.0 -0.47 -0.15 0.13 0.05 -0.2
-0.97 0.14 -0.13 0.4 0.44 -0.59 0.73 -0.02 -0.04 0.09 -0.1 -0.94
1.0 -1.25 -0.09 -0.26 1.08 - -0.31 -0.27 0.39 0.12 0.04 -0.67
-0.08 -0.21 0.15 0.21 0.05 -0.29 0.02 0.13 -0.04 -0.01 -0.09 0.08
-0.27 0.82 -0.76 -0.67 0.95 -1.6 0.56 -1.04 0.23 -0.46 0.9 -2.32
1.02 0.29 0.32 -1.06 0.77 0.04 -0.12 -0.33 -0.58 -0.74 -0.23 -1.14
0.48 0.88 -0.58 0.3 0.58 -1.01 0.61 -1.25 -1.63 -0.36 0.48 -1.22
-0.12 -0.09 -0.07 0.31 0.12 -0.16 -0.01 -0.05 0.07 0.02 0.08 -0.18
-0.21 -0.14 0.07 -0.0 0.08 -0.05 0.12 0.09 0.11 -0.0 0.03 -0.15
-0.18 0.04 -0.08 -0.26 -0.05 -0.16 0.1 0.12 0.03 0.19 0.28 -0.13
-1.21 -0.22 -0.42 -0.25 -0.8 -0.85 0.93 1.38 0.06 0.06 -0.23 -0.87
-0.31 -0.14 -0.18 -0.34 0.18 -0.12 0.07 0.27 0.21 0.06 0.29 -0.16
-1.19 0.1 -0.22 0.21 -0.01 0.02 0.07 0.11 -0.27 0.18 0.71 -0.45
-0.07 0.12 0.02 -0.31 0.14 -0.08 -0.08 0.02 0.12 -0.12 -0.06 0.23
0.14 0.01 -0.07 -0.22 0.02 0.11 0.11 -0.17 -0.04 -0.05 0.05 0.08
- - - - - - - - - - 3.58 -
-0.59 0.08 -0.21 -0.7 0.24 -1.38 0.47 -0.7 -0.49 0.39 1.26 -0.29
0.48 -0.02 0.19 -1.52 0.15 -0.35 -0.18 -0.08 0.65 -0.14 0.14 -0.27
-0.16 -0.21 -0.34 0.55 0.22 -0.64 0.17 -0.4 0.36 0.41 -0.25 -0.25
- 1.47 - 1.39 1.92 - - - - - 1.5 -
0.02 -0.01 0.03 -0.12 -0.1 -0.17 -0.03 -0.06 0.07 0.15 0.07 0.09
0.14 0.17 0.12 0.06 0.04 -0.32 -0.11 -0.06 -0.08 0.06 -0.09 0.01
- 0.19 -0.1 - 1.06 - 2.97 - - - - -
-0.01 0.26 -0.07 -0.02 -0.06 -0.35 0.04 0.25 -0.09 -0.11 0.09 -0.02
-0.54 -0.18 -0.84 - -0.57 0.38 - - -0.61 1.56 1.85 -0.55
0.36 0.5 0.92 -0.88 -0.3 -0.44 -0.18 -0.16 -0.16 -0.81 0.5 -0.59
0.26 -0.2 -0.84 -0.09 0.1 0.51 -0.17 -0.65 0.29 0.15 0.38 -0.34
- 0.77 0.26 -0.49 -0.56 -0.82 0.31 -0.11 0.41 -0.8 1.26 -0.54
0.19 -0.45 -0.01 -0.3 0.16 -0.8 -0.04 0.22 0.41 0.24 0.24 -0.33
0.38 -0.02 -0.4 -0.41 0.26 -0.83 0.11 -0.37 -0.1 0.0 0.6 0.18
-0.28 -0.92 -0.63 -1.18 - -0.18 -0.44 - 0.64 0.06 2.42 -
0.15 -0.05 -0.17 -0.18 0.06 -0.18 0.13 0.15 0.19 0.1 0.09 -0.42
1.23 0.29 0.86 0.68 0.16 -0.8 -0.58 -0.21 -1.46 -1.76 -0.45 -1.35
-0.04 0.25 -0.14 -0.22 0.1 -0.18 0.23 0.07 0.11 -0.13 0.01 -0.15
0.04 0.03 -0.1 -0.11 0.01 0.02 0.08 -0.15 0.08 0.06 0.15 -0.15
-0.21 1.05 -1.61 - 1.52 -2.72 0.57 -0.4 -0.02 - 0.94 -0.84
0.33 0.12 0.27 -0.09 -0.13 -0.29 0.38 -0.3 0.64 0.13 -1.37 -0.68
0.11 0.16 -0.2 -0.01 -0.01 -0.15 0.09 -0.07 0.19 -0.01 0.07 -0.26
0.14 0.02 0.08 -0.41 -0.1 -0.28 -0.07 -0.2 0.19 0.17 0.26 0.05
-0.65 -0.07 -0.16 0.26 -0.29 0.19 0.36 0.55 -0.08 -0.05 -0.34 -0.13
0.79 - 0.46 -0.6 0.97 0.15 0.54 0.01 -1.05 -0.77 0.07 -0.78
0.06 0.06 -0.03 -0.18 -0.01 -0.2 0.04 -0.03 0.04 0.05 0.26 -0.1
-0.72 0.65 -0.06 -0.78 0.26 -0.51 -0.49 0.16 -0.12 0.46 0.51 -0.26
0.18 -1.28 -1.92 0.04 -0.37 -1.32 -0.35 -0.51 0.13 0.75 1.43 0.05
0.14 -0.43 -0.23 -0.23 -0.03 -0.19 0.11 -0.01 0.22 0.13 0.26 0.09
0.16 0.27 0.1 -0.17 0.1 -0.63 0.2 -0.09 -0.04 0.08 0.0 -0.19
0.34 0.11 -0.21 0.63 0.38 -0.12 -2.4 0.03 0.59 -0.54 0.49 -2.26
1.37 -0.01 -0.63 -0.1 -0.51 0.41 0.89 0.47 -0.15 -1.61 -2.38 -2.67
-0.87 -1.08 -0.45 0.22 -0.36 1.18 0.62 0.46 -0.51 -1.54 0.25 -0.14
0.02 0.05 0.01 -0.32 -0.09 -0.07 0.05 -0.05 0.02 0.09 0.15 0.08
-0.03 -0.1 0.06 -0.03 0.11 -0.03 0.02 0.08 -0.12 -0.05 0.21 -0.16
0.15 0.12 -0.21 -0.29 0.07 -0.33 0.24 0.07 -0.14 -0.09 0.39 -0.19
0.63 0.29 -0.21 -0.93 -0.13 -0.07 -0.06 -0.19 0.11 -0.1 -0.14 0.28
-0.66 0.52 0.0 -0.01 0.27 -0.64 0.12 0.04 0.22 0.22 -0.09 -0.52
0.02 -0.01 -0.08 -0.61 0.09 -0.56 -0.41 0.8 0.18 -0.19 0.54 -0.56
-0.36 -0.13 0.02 0.09 0.14 -0.35 0.26 0.15 -0.39 -0.15 0.24 0.26
1.32 -0.17 -0.13 -0.41 0.06 0.24 -1.59 -0.71 0.21 -0.24 -2.94 0.72
1.51 - 0.34 - - - - - -0.9 0.53 2.56 -
-1.88 1.19 0.23 -0.85 0.04 -1.17 0.57 0.25 0.56 0.31 -1.64 -0.9
-0.85 - 0.68 0.25 0.08 -0.13 -0.46 -2.55 0.36 -0.78 1.26 0.62
1.18 0.61 -1.3 - 1.5 0.6 -0.55 -1.51 -0.17 - 0.06 -1.04
2.15 - -0.34 - -0.14 0.37 1.06 - -0.91 -0.31 0.19 -
-1.51 -1.55 0.11 0.49 0.06 0.42 -0.2 0.24 0.03 -0.26 -0.0 0.62
0.12 -0.42 -0.12 -0.26 0.05 -0.16 0.19 0.04 0.2 0.03 0.13 0.06
-0.32 0.39 -0.02 -0.03 0.36 -0.2 -0.04 -0.15 -0.22 -0.05 0.23 -0.18
-0.44 -0.04 0.01 0.1 0.6 -0.47 0.16 0.14 -0.16 -0.14 0.03 -0.11
- -1.19 0.55 -1.02 0.77 - 1.86 -0.87 0.48 -0.1 -1.03 -0.14
0.15 -0.03 -0.2 -0.07 0.03 -0.77 0.09 0.24 0.13 -0.07 0.31 -0.08
- -0.21 -3.3 1.19 1.09 -0.48 -3.2 -0.34 0.05 0.82 1.07 -3.06
0.01 0.94 -0.2 0.11 0.64 -3.22 -0.04 -0.68 -0.55 0.35 0.14 -0.32
0.02 0.48 -0.74 -0.2 0.02 -0.83 0.38 0.55 -0.39 -0.34 0.88 -1.32
- 0.4 0.22 0.08 -0.74 -0.24 -1.58 - -0.19 0.57 1.81 -0.28
-1.91 0.47 -0.39 -0.43 0.92 -1.05 -0.08 -1.16 0.17 0.83 0.48 -0.35
-0.06 0.08 -0.13 -0.2 -0.13 -0.1 0.23 0.03 0.03 -0.16 0.21 0.13
-0.06 0.04 0.15 -0.86 -0.02 0.41 0.1 -0.35 0.43 0.07 0.51 -1.49
- 0.35 0.25 -2.41 0.76 -2.41 1.67 0.14 0.81 -1.17 -0.04 -
0.69 -0.35 -0.47 0.84 -0.07 -1.92 0.19 0.32 0.27 0.32 -0.15 -2.84
- - 0.96 - - 0.77 - - 1.66 - 2.38 -
0.05 -0.08 -0.06 0.02 -0.02 0.05 -0.11 0.03 0.03 0.02 0.11 -0.04
- - 0.7 - 0.77 - - - - - 3.12 -
0.13 1.38 0.07 - 1.53 - -1.28 -2.94 0.21 -1.43 0.73 -0.63
0.06 -0.02 -0.11 -0.38 0.05 -0.16 -0.32 0.47 -0.19 0.32 0.31 -0.31
1.41 0.37 -1.39 0.71 -0.47 - -0.81 -0.63 0.27 -0.3 0.21 -0.1
0.06 0.47 0.03 - 0.28 -0.18 -0.12 1.12 -0.72 -1.78 1.19 -2.55
0.32 0.26 -0.21 -0.75 0.18 -0.44 0.27 0.0 0.09 -0.07 0.37 -0.47
- - - - - - - - - 0.65 3.38 -
0.61 0.2 -0.13 -0.14 -0.34 -0.79 -0.8 -0.2 -0.18 0.16 0.58 0.26
0.07 1.23 0.57 -0.58 0.12 -2.84 0.1 -1.05 0.89 -1.18 -0.23 -0.95
0.53 -1.78 -0.43 -0.08 1.03 -1.2 -0.11 -0.11 -0.02 -0.2 0.62 -0.24
-0.37 0.42 -0.14 0.06 0.72 -0.87 0.11 -0.29 0.25 -0.02 0.22 -0.96

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.