Heatmap: Cluster_102 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.35 -0.49 -0.05 -0.0 0.23 0.09 0.05 0.2 0.25 0.04 -0.03 -0.12
-2.58 -1.54 -0.24 0.24 1.04 0.15 -0.16 -0.82 0.9 0.06 -0.22 0.1
-0.22 -0.23 0.02 -0.13 -0.0 -0.13 -0.06 -0.25 0.03 0.16 0.38 0.27
-0.42 -0.32 0.08 0.25 0.24 0.2 0.02 0.12 -0.08 0.02 -0.14 -0.14
- - - - 2.61 - - - 2.55 - - -
-0.38 -0.47 0.07 0.21 0.3 0.03 0.15 0.2 0.25 -0.04 -0.3 -0.29
-0.51 -0.16 0.03 0.24 0.45 0.11 0.24 0.15 -0.03 -0.13 -0.3 -0.39
-0.99 -0.34 0.03 0.11 0.25 -0.26 -0.1 -0.42 0.05 0.35 0.4 0.35
-0.85 -0.17 0.0 -0.09 0.18 0.02 0.03 -0.25 0.25 0.31 0.15 0.09
-1.32 -0.56 0.18 0.49 0.25 -0.01 -0.14 -0.16 0.08 0.44 0.07 -0.07
-2.02 -0.51 -0.0 0.35 0.54 0.38 0.16 0.08 0.13 0.07 -0.23 -0.23
-0.57 -0.38 0.27 0.24 0.4 0.21 0.11 0.25 0.03 -0.27 -0.33 -0.35
-0.48 -0.58 0.05 -0.1 0.21 -0.07 -0.0 0.03 0.15 0.23 0.09 0.22
-0.24 -0.05 0.0 -0.09 -0.03 -0.09 -0.1 -0.18 0.08 0.22 0.25 0.13
-0.51 -0.47 -0.06 0.15 0.38 0.14 0.23 -0.09 0.01 0.06 -0.05 -0.03
-0.33 -0.2 -0.04 -0.03 0.22 0.11 0.01 -0.17 0.18 0.06 0.0 0.07
-0.93 -0.54 -0.01 0.37 0.32 0.21 0.17 -0.15 0.11 -0.06 -0.04 0.07
0.88 -0.74 -1.44 - 0.54 -1.0 -1.26 1.57 0.36 0.31 0.41 -
-0.6 -0.56 -0.05 0.15 0.46 0.28 0.12 -0.16 -0.0 0.03 -0.16 0.14
-0.15 -0.06 -0.01 -0.02 0.08 -0.08 -0.1 -0.16 0.07 0.15 0.16 0.08
- - - - 2.32 1.58 - - 2.0 - - -
-0.26 -0.2 0.02 -0.07 0.17 0.03 -0.03 -0.04 0.05 0.09 0.1 0.1
-0.44 -0.19 -0.2 -0.24 -0.25 -0.27 0.0 -0.4 0.09 0.17 0.34 0.84
-0.43 -0.14 -0.0 0.13 0.16 0.12 0.04 0.07 0.13 -0.09 -0.09 -0.0
-0.14 -0.28 0.1 0.03 0.23 -0.06 0.15 -0.08 0.27 -0.03 -0.31 -0.01
-0.55 -0.33 -0.16 -0.0 0.19 -0.04 0.06 -0.2 0.18 0.31 0.23 0.09
-0.63 -0.14 0.01 0.15 0.22 0.13 0.01 -0.07 0.01 0.08 0.04 0.04
-0.56 -0.43 -0.07 0.24 0.24 -0.08 0.03 -0.0 0.15 0.19 0.06 0.01
- - -0.54 - 2.11 - - - 2.11 -0.41 0.21 -0.38
- - 0.72 - -1.29 - - 1.95 1.33 - 0.78 0.88
-0.71 -0.42 -0.16 0.09 0.2 0.26 0.01 -0.05 0.14 0.15 -0.0 0.21
-0.36 -0.4 -0.07 0.21 0.18 0.02 0.16 0.01 0.19 0.06 -0.19 0.03
-0.87 -0.27 0.14 0.09 0.26 -0.0 -0.1 -0.11 0.1 0.19 0.17 0.1
-0.27 -0.07 -0.17 -0.05 0.13 -0.03 -0.04 -0.08 0.18 0.08 0.11 0.14
-0.13 0.02 -0.17 -0.06 0.02 -0.12 -0.15 -0.1 0.13 0.08 0.17 0.23
-0.29 -0.2 0.05 0.15 0.22 0.09 -0.06 0.07 0.11 0.07 -0.08 -0.24
-0.98 -0.43 0.05 0.31 0.15 0.27 0.11 -0.16 0.16 0.2 -0.05 -0.08
-0.24 -0.3 -0.14 -0.0 0.13 0.13 0.05 0.12 0.13 0.07 -0.01 -0.01
-0.61 -0.56 -0.21 0.11 0.48 0.26 0.07 -0.15 0.07 0.1 0.02 0.06
-0.48 -0.12 0.13 0.16 0.21 0.07 -0.04 0.0 0.06 -0.11 -0.03 0.02
- - - - 2.61 - - - 2.55 - - -
-0.67 -0.71 0.12 0.07 0.44 0.21 0.17 0.04 0.02 0.0 -0.09 -0.01
-0.59 -0.24 -0.06 0.09 0.25 0.18 -0.01 -0.16 0.11 0.19 0.02 0.03
-0.72 -0.42 0.04 0.37 0.19 0.14 -0.1 0.12 -0.02 0.01 0.01 0.09
- - - - 1.92 - - 2.2 1.86 - - -
-1.4 -0.67 -0.07 0.42 0.47 0.29 -0.02 -0.62 0.45 0.04 0.02 0.07
-1.19 -0.57 -0.14 0.27 0.35 0.34 0.21 0.16 0.23 -0.14 -0.17 -0.02
-0.62 -0.08 -0.02 0.16 0.28 0.08 0.01 -0.03 0.13 0.07 -0.01 -0.12
-0.26 -0.03 0.0 -0.02 0.11 0.09 -0.07 -0.1 0.0 0.15 0.04 0.04
-1.44 -1.12 -0.19 0.3 0.54 0.4 0.09 -0.2 0.1 0.22 0.1 0.06
-1.09 -0.0 0.25 0.23 0.31 0.13 -0.13 -0.29 -0.0 0.11 -0.03 0.07
-2.02 -1.34 -0.17 0.54 0.69 0.53 0.55 0.38 0.1 -0.25 -0.51 -0.77
-0.53 -0.31 0.17 0.18 0.3 -0.01 -0.09 -0.18 0.25 0.08 0.02 -0.09
-0.58 -0.24 -0.02 0.19 0.14 0.22 0.08 0.11 0.16 -0.03 -0.11 -0.11
-1.42 -1.21 -0.12 0.46 0.87 0.5 0.23 -0.03 -0.05 -0.05 -0.51 -0.21
-0.24 -0.22 -0.04 -0.12 -0.02 0.13 -0.04 0.19 0.22 0.13 -0.0 -0.08
-0.95 -0.35 0.05 0.17 0.34 0.14 0.06 -0.08 0.14 0.1 -0.04 0.05
-0.56 -0.65 -0.11 0.29 0.41 0.32 0.13 -0.11 0.2 0.19 -0.29 -0.26
-0.66 -0.49 -0.01 0.29 0.32 0.09 0.22 -0.03 0.21 0.06 -0.27 -0.06
-0.5 -0.24 0.06 -0.13 0.17 0.06 0.12 0.17 0.27 -0.01 -0.02 -0.13
-0.85 -0.24 0.22 0.24 0.6 0.35 0.02 -0.08 0.39 0.12 -0.92 -0.8
-1.62 -0.38 0.05 0.03 0.41 0.13 -0.1 -0.1 0.07 0.28 -0.03 0.4
-0.54 -0.55 -0.12 0.1 0.25 0.28 0.15 -0.13 0.12 0.13 0.03 0.02
-1.02 -0.45 0.06 0.23 0.41 0.15 0.07 -0.22 0.16 0.11 -0.04 0.05
-0.38 -0.24 0.12 0.15 0.37 0.19 0.1 -0.11 -0.03 -0.05 -0.19 -0.1
-0.34 -0.1 -0.08 -0.06 0.01 -0.08 -0.05 -0.05 0.22 0.19 0.12 0.14
-0.78 -0.29 0.08 0.14 0.19 0.17 -0.06 0.12 -0.01 0.22 -0.08 0.05
-0.42 -0.44 -0.04 0.18 0.26 -0.02 0.05 0.0 0.04 0.1 0.09 0.03
-0.55 -0.2 0.1 0.22 0.39 0.11 0.2 0.14 0.02 -0.13 -0.4 -0.18
-0.46 -0.18 0.12 0.04 0.16 0.09 0.07 -0.02 0.08 0.09 -0.09 0.0
-0.42 -0.42 -0.07 0.33 0.31 0.27 0.16 -0.16 0.18 0.06 -0.27 -0.26
-0.54 -0.28 0.08 0.14 0.14 0.04 -0.04 -0.06 0.29 0.15 -0.15 0.06
-0.88 -0.81 0.42 0.75 0.67 0.3 0.01 -0.29 -0.02 -0.16 -0.37 -0.83
-0.89 -0.95 -0.37 0.5 0.55 0.19 0.15 -0.32 0.22 0.28 0.04 -0.28
-0.64 -0.38 0.01 0.19 0.22 0.17 0.08 0.07 0.11 0.09 -0.08 -0.04
-0.64 -0.33 0.03 0.13 0.33 0.15 0.01 0.0 0.11 0.11 -0.08 -0.03
-1.04 -0.46 0.23 0.21 0.43 0.3 -0.01 0.05 -0.11 0.01 0.0 -0.13
-0.56 -0.09 0.09 0.15 0.22 0.15 0.17 0.08 0.13 0.05 -0.27 -0.33
- - - - - - - 2.74 2.41 - - -
-0.4 -0.47 0.03 -0.0 0.32 0.11 0.12 0.0 0.45 -0.08 -0.16 -0.19
-2.02 -0.84 -0.19 0.63 0.57 0.65 0.23 -0.03 -0.01 0.17 -0.2 -0.81
-0.46 -0.23 0.12 0.15 0.27 -0.01 0.08 0.08 0.14 -0.08 -0.13 -0.08
-0.34 -0.15 0.08 0.09 0.19 -0.03 0.08 0.05 0.11 -0.01 -0.03 -0.13
-0.24 -0.17 0.07 0.05 0.05 0.08 0.01 -0.02 0.07 0.07 -0.03 0.02
-2.05 -0.82 0.04 0.17 0.58 0.41 -0.17 -0.28 0.34 0.47 -0.3 0.07
-1.3 -0.68 0.02 0.26 0.39 0.15 -0.04 -0.33 0.19 0.31 0.13 0.13

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.