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Heatmap: Cluster_283 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.25 0.08 -0.66 -0.56 0.51 -0.3 -0.16 0.24 0.27 0.25 0.13 -0.02
0.57 -0.84 0.01 0.27 0.52 -0.77 -1.35 -0.81 0.71 -0.36 0.74 -0.59
0.17 0.31 -1.03 - 1.55 -0.21 -0.37 0.55 -0.01 -1.14 -0.87 0.17
-0.21 0.01 0.03 -0.02 0.05 -0.05 0.12 -0.01 0.09 0.11 -0.03 -0.13
0.98 0.33 - - 1.5 0.07 0.75 -1.05 1.44 - - -
0.49 0.17 -0.97 -1.87 -0.59 -1.21 0.11 0.42 -0.01 0.32 0.32 0.75
0.21 -0.09 -0.02 -0.07 -0.09 -0.15 0.06 -0.02 0.03 0.04 0.12 -0.07
-2.38 0.55 0.33 -1.52 -0.1 - 0.97 0.39 0.46 0.35 0.5 -1.11
0.17 0.09 -0.08 -0.09 0.08 -0.14 0.23 -0.05 0.26 -0.1 -0.08 -0.43
-0.24 -0.13 0.1 -0.07 0.17 -0.09 0.15 -0.1 0.08 0.06 -0.11 0.12
-0.11 -0.54 0.15 -0.07 0.02 -0.15 0.19 0.09 0.21 -0.03 0.0 0.09
0.1 -0.51 0.43 0.05 0.44 -0.35 -0.01 -0.29 0.33 0.08 -0.32 -0.34
-0.29 -0.11 -0.57 -0.06 0.41 -1.28 0.37 0.45 0.85 -0.01 0.03 -1.28
-0.78 -0.32 0.27 0.22 -0.1 0.16 0.16 0.13 0.22 0.16 0.1 -0.68
-0.11 0.04 0.1 -0.34 0.14 -0.16 -0.02 0.11 0.27 0.06 0.02 -0.2
0.09 0.0 0.04 -0.03 0.09 -0.09 -0.04 -0.07 -0.1 0.02 0.01 0.05
0.39 1.08 0.27 0.04 0.28 -0.59 0.05 -1.7 -0.15 0.42 -0.93 -1.51
0.13 0.1 0.04 -0.09 -0.07 -0.16 -0.03 0.0 0.03 -0.04 0.05 0.01
0.87 1.34 -0.22 - - - -0.29 1.24 1.85 - - -
-0.73 0.3 0.09 -0.56 -0.12 0.38 0.8 -1.35 -0.08 -0.2 0.51 -0.27
0.19 -0.63 -0.15 0.43 0.47 -0.84 0.66 -0.67 0.55 0.25 -0.21 -1.74
- -1.11 - -1.37 0.43 - 0.68 -1.06 1.81 1.26 -0.38 0.08
0.42 0.7 -0.23 0.49 0.8 -2.89 0.1 0.28 -0.53 0.16 -0.55 -2.91
-0.39 0.96 -0.55 -1.7 0.57 -1.68 0.42 0.48 -0.75 1.02 -0.85 -0.78
0.04 -0.01 -0.0 0.13 0.13 -0.05 0.05 -0.04 0.02 -0.05 -0.01 -0.22
0.09 0.25 -0.01 -0.32 -0.01 -0.32 -0.01 0.06 -0.02 -0.05 0.14 0.11
0.07 0.39 -0.03 -0.19 -0.14 -2.91 -0.08 -0.47 0.56 0.74 0.35 -0.6
-0.0 0.04 0.36 -0.11 0.13 -0.41 -0.15 -0.33 0.22 0.16 -0.02 -0.07
-2.65 0.66 -0.02 0.11 0.41 -2.08 -0.84 0.18 0.58 0.66 -0.28 0.04
-0.16 0.78 0.62 -0.26 -0.08 -0.82 -0.06 -0.32 0.63 0.0 -0.61 -0.89
- 1.12 1.53 - -0.42 - 1.91 - - 0.5 0.01 -
1.19 -1.12 -0.83 -0.78 -0.25 -0.66 -0.11 0.36 0.44 -0.01 0.31 -0.25
-0.02 0.19 0.0 0.1 -0.07 -0.18 0.13 -0.06 0.05 0.13 -0.12 -0.22
0.1 0.06 -0.17 -0.37 0.1 -0.29 0.15 0.23 0.31 -0.16 -0.32 0.15
- 1.33 1.63 - 1.93 - - - -0.09 0.71 - -
-2.0 0.3 0.15 -1.67 1.45 -1.27 -0.15 -2.58 1.15 0.41 -1.12 -0.19
0.5 -0.35 0.68 - 0.56 0.39 -0.44 -1.35 0.57 0.56 -1.54 -0.02
0.64 -0.25 -0.1 -1.31 1.53 -1.05 0.03 0.7 -0.13 -1.17 -3.73 -0.31
-1.81 0.97 -0.8 -0.45 1.09 -1.49 0.66 0.38 0.07 -0.16 -0.44 -1.3
0.21 -0.08 0.16 0.19 0.0 -0.16 0.24 -0.12 0.01 0.06 -0.03 -0.68
0.64 0.6 0.27 0.09 -0.56 -0.64 -0.7 -0.26 0.31 0.08 0.5 -2.42
0.02 0.02 0.02 -0.07 0.02 -0.02 0.01 -0.11 0.1 0.04 -0.02 -0.02
0.39 0.96 -0.75 -1.83 -1.21 - 1.45 -0.09 0.18 1.04 -0.85 -
-0.12 0.56 -0.11 -1.24 -0.05 0.78 0.24 0.47 0.48 -0.96 -0.36 -1.68
- 2.58 - - - - 2.24 - 0.35 - - -
1.4 - 1.21 -0.49 -0.79 0.84 - - 0.63 0.13 -0.5 -0.68
-1.67 0.01 0.4 0.71 1.44 -0.63 -0.15 -1.39 -0.15 0.64 -2.57 -1.15
-0.08 0.35 1.0 -2.81 0.02 0.78 0.03 0.33 -0.95 -0.93 -0.27 -0.4
0.07 0.19 0.01 -0.11 -0.0 -0.12 0.01 -0.06 0.19 -0.0 -0.06 -0.15
0.19 0.05 0.01 -0.95 -0.16 -0.0 -0.19 -0.32 0.19 -0.05 0.58 0.18
-0.03 0.01 -0.03 -0.03 0.05 -0.12 -0.03 -0.11 0.16 0.14 0.26 -0.35
-0.07 0.34 -0.38 -0.44 0.45 -0.55 0.26 -0.44 0.62 -0.35 0.15 -0.23
0.09 0.31 0.15 0.24 0.11 -0.74 -0.05 -0.04 -0.05 0.16 -0.18 -0.28
-1.75 0.54 0.36 -1.05 -0.1 -0.95 0.12 0.54 0.57 0.2 0.37 -0.86
0.03 -0.04 -0.15 -0.15 0.22 -0.04 0.09 0.03 0.1 0.02 -0.06 -0.1
- -1.26 -1.88 - 1.83 -0.32 0.1 1.19 0.06 0.5 -0.66 -0.98
-0.2 -0.35 0.25 0.0 0.56 -0.29 0.1 -0.54 -0.27 0.33 -0.25 0.22
0.13 0.17 0.07 -0.14 -0.01 -0.35 -0.09 -0.02 0.07 -0.08 0.11 0.05
0.12 -0.08 -0.1 -0.3 0.03 -0.41 0.23 0.2 0.13 0.05 0.06 -0.07
-0.09 -0.19 0.05 -0.04 0.07 -0.18 0.04 0.04 0.09 0.06 -0.06 0.17
0.42 0.33 0.25 0.12 -0.38 -0.79 -0.38 -0.31 0.52 0.25 0.16 -1.1
- 2.21 0.25 - -0.53 - 2.02 -0.24 - -0.8 - -
0.66 1.16 -1.3 0.94 0.85 -0.56 -1.82 -0.82 -0.35 0.51 - -1.67
0.22 -0.13 -0.05 -0.01 -0.08 -0.01 -0.03 0.06 0.04 -0.06 0.07 -0.05
0.43 0.77 0.5 -1.26 -0.1 -2.32 -1.45 -0.12 0.49 0.55 -0.33 0.03
0.12 -0.15 -0.05 -0.06 -0.05 0.0 0.01 -0.04 -0.04 0.0 0.1 0.12
-0.51 0.67 0.16 -0.84 0.06 -0.02 0.35 0.21 -0.22 0.1 -0.2 -0.36
-0.73 0.04 -0.15 -0.21 -0.48 0.25 -1.16 -2.31 1.23 0.67 0.03 0.13
-0.6 0.26 1.05 -0.44 0.69 -0.31 -0.64 -0.97 -0.3 0.27 -0.3 -0.1

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.