Heatmap: Cluster_185 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
- - - - 0.04 0.94 -1.31 0.87 0.69 -0.82 2.22 -
-0.05 0.02 -0.01 -0.03 0.03 0.05 0.11 -0.01 0.05 0.05 -0.04 -0.21
- 1.85 1.24 - - 0.43 0.56 1.69 - - - -
-0.07 -0.14 0.08 -0.06 0.12 0.01 0.03 0.15 0.17 0.03 -0.07 -0.32
-0.53 0.55 0.21 -0.17 -0.17 -0.21 -0.09 -0.08 0.07 0.16 0.26 -0.35
-0.36 0.99 0.59 -4.46 0.12 0.0 -0.49 0.65 -0.7 0.43 -0.62 -0.52
-0.08 -0.0 0.08 -0.04 0.03 0.09 -0.0 0.28 -0.02 -0.08 -0.13 -0.18
0.18 0.94 -1.66 -1.08 0.18 0.03 -0.73 0.68 0.34 0.16 0.32 -2.54
-0.02 -0.08 0.03 0.11 0.3 0.05 0.2 0.1 -0.03 -0.14 -0.23 -0.41
-0.15 -0.11 0.17 -0.18 -0.08 -0.16 0.03 0.39 0.15 0.19 -0.15 -0.25
- 2.5 - - - - - - 2.66 - - -
-0.12 -0.18 -0.12 0.07 0.01 0.14 0.15 0.02 0.2 -0.03 -0.04 -0.17
-0.39 0.2 0.19 -0.1 -0.21 -0.1 0.08 0.29 0.06 0.08 -0.06 -0.18
-0.08 -0.03 0.08 -0.15 0.09 -0.17 0.1 0.2 0.05 -0.08 0.03 -0.08
-0.18 -0.05 0.04 0.09 0.13 -0.26 0.14 0.19 -0.4 0.3 -0.01 -0.13
-0.19 -0.05 0.06 -0.16 0.16 -0.09 0.26 0.04 0.06 0.06 -0.1 -0.13
-0.28 0.01 0.11 0.01 -0.1 -0.02 -0.03 0.15 -0.03 0.17 0.06 -0.11
-0.3 0.19 -0.07 -0.05 0.19 0.02 -0.19 0.37 0.01 -0.0 -0.19 -0.12
-0.1 0.14 0.14 -0.19 -0.13 -0.05 -0.01 0.12 0.12 0.1 0.04 -0.24
-0.82 -0.05 0.33 -0.27 0.09 -0.2 -0.02 0.22 0.03 0.17 0.16 0.05
-0.1 -0.69 0.32 -1.91 0.43 -1.33 1.02 0.03 -0.01 -0.41 0.51 -0.05
-1.81 1.06 0.05 - 1.29 -0.15 -0.26 0.98 -0.03 -3.08 0.24 -2.83
-0.42 -0.23 0.11 -0.02 0.24 -0.08 0.06 0.23 0.32 -0.07 -0.22 -0.1
-0.83 -0.17 0.15 -0.06 -0.11 0.1 0.35 0.26 -0.26 0.34 0.11 -0.29
0.44 1.01 0.55 -0.62 -0.44 0.07 -0.88 0.45 -1.33 0.25 -0.6 -0.84
-0.09 0.95 0.34 -2.48 -1.1 -0.66 0.5 0.83 0.3 -0.49 -0.4 -0.54
-0.61 0.69 -0.96 -0.74 0.23 -0.55 -1.0 0.42 0.09 0.38 0.98 -0.79
-2.12 -0.42 -0.22 0.39 0.35 -0.64 -0.02 0.52 -0.04 -0.11 0.84 -0.28
-0.68 0.01 0.31 -0.49 -0.19 0.01 -0.1 0.38 -0.14 0.25 0.14 0.15
-1.2 0.28 0.34 0.05 0.09 -0.03 0.2 0.21 -0.21 0.06 0.34 -0.9
-0.92 0.79 0.31 -0.09 -0.66 -1.72 -0.12 0.86 -0.04 0.18 -0.13 -0.18
- 0.11 0.27 0.4 0.53 -0.31 -0.67 -0.88 0.8 0.59 -0.1 -0.33
-0.26 -0.11 -0.01 -0.09 0.16 0.24 0.14 0.1 -0.07 -0.11 0.1 -0.2
-0.16 -0.34 -0.05 -0.18 0.15 -0.03 0.09 0.25 0.12 0.03 0.09 -0.06
-0.18 -0.04 0.13 0.05 0.03 0.14 0.08 0.16 -0.0 -0.1 -0.08 -0.26
-0.4 -0.14 0.15 -0.1 0.31 -0.17 0.41 0.14 -0.31 0.07 0.12 -0.32
-0.65 0.29 -0.46 -0.89 -0.3 -0.85 0.33 0.35 0.46 -0.27 0.93 -0.2
- 1.07 1.52 -1.35 -0.01 -0.36 -1.62 1.07 0.81 -1.73 -1.36 -
- 1.72 - -0.54 - - - - 1.89 1.39 0.75 -
-1.41 -0.33 0.21 0.39 0.34 0.38 0.31 -0.21 0.16 -0.2 0.08 -0.66
- 1.89 -0.06 - 0.08 -1.35 - - 1.52 0.96 - 0.1
-0.22 -0.03 0.1 -0.19 -0.05 -0.06 0.2 0.18 -0.03 0.14 -0.06 -0.04
-2.04 0.66 -0.6 0.41 -0.33 -0.5 -0.03 0.64 0.14 0.51 -0.23 -0.38
-0.11 0.14 -0.06 -0.06 0.02 -0.2 0.04 0.41 0.1 -0.07 -0.04 -0.3
-0.43 0.02 0.17 -0.13 -0.04 -0.17 0.25 0.12 0.1 -0.07 0.05 0.01
0.42 0.12 -1.07 - 0.01 -0.41 -0.37 0.7 0.26 0.1 1.27 -1.99
-0.57 -0.02 -0.11 -0.07 0.06 -0.0 0.15 0.16 0.16 0.16 0.16 -0.24
-0.33 -1.24 0.1 -1.25 0.45 -1.48 1.0 0.47 0.55 -0.23 0.56 -1.41
-0.05 -0.09 -0.06 -0.79 0.16 0.16 0.1 0.13 0.07 0.03 -0.15 0.24
-0.59 -0.13 0.08 -0.11 -0.18 -0.02 0.15 0.25 0.14 0.18 0.08 -0.03
-0.04 0.09 0.12 -0.05 -0.05 -0.04 0.01 0.24 0.11 -0.11 -0.02 -0.34
-0.11 -0.08 0.03 -0.01 0.0 -0.04 0.08 0.06 0.09 -0.03 0.02 -0.02
0.01 0.23 -0.05 -0.4 -0.3 -0.09 0.17 0.27 0.21 0.02 -0.05 -0.2
-0.14 0.19 0.07 -0.01 0.05 -0.24 0.11 0.22 -0.0 -0.16 -0.04 -0.14
0.05 -0.2 -0.01 -0.33 -0.08 -0.13 -0.12 0.29 0.02 0.22 0.18 -0.01
- 2.53 0.76 - - - 1.09 1.27 - - - -
-0.93 0.88 -0.25 -1.65 -1.96 -1.01 0.34 - 0.32 1.48 0.16 0.38
-0.17 0.18 0.15 -0.13 -0.27 -0.11 0.11 0.22 0.07 -0.07 -0.03 -0.02
- 1.64 1.24 - 0.03 -2.28 0.1 0.51 -0.07 0.24 - -0.59
-0.99 0.49 0.34 -0.37 -0.21 -0.31 0.19 0.49 0.2 0.1 0.09 -0.87
- 1.44 -1.65 -1.28 -0.59 -1.46 0.48 0.69 -2.07 0.33 1.43 -1.57
-0.07 0.21 -0.15 -0.7 0.06 0.11 0.22 0.2 0.0 0.29 -0.04 -0.43
- 2.2 - - - -0.91 - 2.68 - - - -1.2
-0.78 -0.05 0.15 -0.23 -0.4 -0.11 0.15 0.52 0.4 0.32 -0.0 -0.52
-1.42 0.13 -0.35 -0.06 -1.23 0.34 - -0.13 -1.7 0.66 1.98 -1.52
-0.65 0.51 0.67 0.08 -0.26 -0.65 0.42 0.13 0.03 -0.03 -0.29 -0.83
0.05 0.19 -0.05 -0.29 -0.24 -0.15 0.27 0.27 0.16 0.04 -0.17 -0.23
-0.66 -0.28 -0.11 -0.2 0.04 0.21 0.1 0.28 0.14 0.11 0.17 -0.04
- 1.02 -0.38 -0.19 0.75 -0.29 0.08 0.41 -0.21 0.04 0.55 -3.54
-0.39 -0.16 -0.13 -0.31 -0.02 0.2 0.13 0.18 0.16 0.21 0.08 -0.11
-0.62 -0.16 0.21 -0.08 0.01 0.07 0.1 0.35 -0.13 0.21 -0.01 -0.16
-0.98 0.73 1.17 -0.28 0.11 -0.99 0.59 0.13 -0.89 -0.25 -0.32 -1.36
-1.51 0.83 0.19 0.13 -0.12 -0.07 0.7 0.59 -2.6 -0.56 0.84 -
-0.16 1.21 0.33 0.35 -0.26 -1.73 0.24 0.42 -0.44 -0.49 -0.15 -1.98
-0.02 -0.09 0.02 -0.08 0.13 -0.05 0.31 0.18 0.05 -0.02 -0.16 -0.4
-0.85 0.41 0.3 - 1.38 -0.16 - 0.83 1.06 -1.12 0.08 -
-0.08 0.08 -0.01 -0.13 0.06 0.09 0.1 0.18 -0.06 0.03 -0.05 -0.23
-0.35 -0.21 0.05 -0.14 0.17 -0.26 -0.11 0.24 0.14 0.08 0.53 -0.42
-0.07 -0.28 0.1 -0.31 0.14 0.06 0.11 0.19 0.03 -0.02 -0.16 0.09
- 1.2 -1.99 - -0.21 -0.64 -1.9 -1.44 1.2 1.46 -0.64 0.71
-0.28 -1.09 -0.06 -0.68 -0.06 0.06 0.33 0.3 0.38 0.51 0.23 -0.44
- -0.77 0.62 1.33 - -0.61 0.72 - 1.55 0.61 - -0.72
-0.79 -0.4 -0.26 -0.08 -0.14 0.03 0.28 0.3 0.34 0.11 0.28 -0.07
0.15 0.14 0.01 -0.34 -0.32 -0.09 0.02 0.23 0.14 0.13 -0.09 -0.12
-1.28 0.72 0.57 -0.15 0.4 0.17 0.39 -1.07 -0.93 0.27 -0.42 -0.24
-3.14 0.55 -0.07 -1.04 0.39 0.59 -0.45 -0.18 0.27 0.18 0.61 -0.54
-0.03 0.02 0.33 0.13 -0.03 -0.36 0.07 0.23 0.1 -0.0 -0.21 -0.43
-0.14 -0.16 0.04 0.04 0.14 -0.02 -0.06 0.2 0.17 -0.07 0.08 -0.29

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.