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Heatmap: Cluster_123 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.16 -0.18 -0.09 0.02 0.09 -0.2 -0.03 0.04 0.12 0.12 0.07 0.13
-0.37 -0.21 -0.24 -0.05 0.11 -0.3 0.06 0.06 0.23 0.28 0.08 0.18
-0.69 -0.27 -0.08 -0.1 -0.05 -0.11 0.02 0.14 0.25 0.28 0.23 0.12
-0.4 -0.15 -0.04 -0.18 0.03 -0.13 -0.02 0.11 0.08 0.18 0.15 0.24
-0.17 -0.24 -0.13 -0.18 -0.03 -0.05 0.02 0.06 0.1 0.17 0.19 0.19
-0.1 -0.27 -0.19 -0.08 0.02 -0.11 0.04 0.06 0.1 0.12 0.12 0.21
-0.18 -0.46 -0.23 -0.13 0.01 -0.13 0.07 0.01 0.16 0.29 0.23 0.19
-0.2 -0.32 -0.13 -0.04 0.01 -0.17 -0.02 0.08 0.23 0.12 0.16 0.17
-0.21 -0.37 -0.11 -0.32 0.05 -0.03 0.16 -0.03 0.3 0.19 0.11 0.11
-0.35 -0.52 -0.25 -0.18 0.07 -0.25 -0.02 0.16 0.23 0.29 0.2 0.33
-0.18 -0.11 -0.01 -0.15 0.01 -0.12 -0.06 -0.05 0.16 0.13 0.17 0.16
-0.24 -0.2 -0.39 -0.16 0.01 -0.07 -0.05 0.04 0.23 0.16 0.32 0.18
-0.17 -0.13 -0.19 -0.31 -0.01 -0.17 -0.13 -0.0 0.17 0.22 0.21 0.36
-0.33 -0.38 -0.22 -0.14 -0.19 -0.09 -0.01 0.04 0.2 0.25 0.3 0.34
-0.32 -0.39 -0.07 -0.06 0.03 -0.15 -0.07 0.1 0.19 0.21 0.08 0.27
-0.58 -0.86 -0.59 0.25 0.28 -0.82 0.06 -0.51 0.01 0.66 0.27 0.68
-0.12 -0.3 -0.09 -0.26 -0.0 -0.09 0.2 0.06 0.02 0.1 0.22 0.15
-0.27 -0.31 -0.17 -0.13 -0.06 -0.24 0.01 0.1 0.25 0.12 0.24 0.28
-0.17 -0.25 -0.14 -0.07 0.18 -0.29 0.14 0.05 0.07 0.13 0.14 0.09
-0.3 -0.29 -0.26 -0.19 0.04 -0.13 -0.03 -0.02 0.22 0.21 0.34 0.22
-0.23 -0.23 -0.16 0.1 0.18 -0.47 0.04 0.14 0.19 -0.06 0.22 0.1
-0.21 -0.33 -0.18 -0.31 -0.03 -0.2 -0.03 -0.06 0.34 0.39 0.23 0.14
-0.77 -0.21 -0.17 -0.17 0.07 -0.16 0.12 0.13 0.27 0.27 0.29 0.0
-0.35 -0.43 -0.45 -0.43 -0.13 -0.26 -0.1 0.12 0.26 0.39 0.42 0.47
-0.14 -0.55 -0.39 -0.55 -0.12 -0.19 -0.2 -0.06 0.3 0.43 0.36 0.56
-0.19 0.01 -0.05 0.06 0.07 -0.24 0.06 -0.02 0.04 0.04 0.04 0.14
-0.4 -0.37 -0.22 -0.28 0.06 -0.04 -0.06 0.05 0.24 0.25 0.27 0.26
-0.2 -0.28 -0.19 0.03 -0.01 -0.12 -0.01 0.09 0.21 0.09 0.13 0.17
-0.33 -0.23 -0.08 0.08 0.01 -0.16 -0.06 0.05 0.15 0.03 0.25 0.16
-0.34 -0.43 -0.35 -0.3 0.07 -0.04 -0.03 0.06 0.23 0.17 0.3 0.38
-0.27 -0.23 -0.27 -0.26 -0.07 -0.33 -0.16 -0.18 0.35 0.19 0.33 0.55
-0.35 -0.28 -0.01 -0.29 0.0 0.03 0.08 0.09 0.24 0.13 0.08 0.15
-0.27 -0.02 -0.24 -0.06 -0.08 -0.29 -0.07 0.14 0.27 0.1 0.12 0.27
-0.11 0.22 -1.76 -1.84 -1.61 -0.57 -0.48 -1.44 0.71 0.23 0.91 1.35
-0.4 -0.39 -0.14 -0.05 0.23 -0.12 -0.02 -0.11 0.2 0.19 0.03 0.37
-0.36 -0.23 -0.31 0.09 0.07 -0.61 -0.03 -0.01 0.17 0.33 0.21 0.35
-0.45 -0.22 -0.05 -0.23 0.04 -0.18 -0.1 0.06 0.33 0.16 0.22 0.22
-0.15 -0.16 -0.05 -0.1 0.04 -0.26 -0.06 0.08 0.1 0.17 0.13 0.18
-0.08 -0.13 -0.25 -0.42 -0.11 -0.19 -0.16 -0.07 0.23 0.2 0.26 0.46
-0.31 -0.44 -0.3 -0.08 0.46 -0.28 -0.31 -0.9 0.23 0.14 0.41 0.63
-0.16 -0.29 -0.14 -0.13 -0.04 -0.25 -0.05 0.08 0.15 0.18 0.27 0.23
-0.34 -0.27 -0.19 -0.1 -0.01 -0.2 -0.01 -0.03 0.24 0.28 0.27 0.18
-0.17 -0.16 -0.1 -0.05 -0.02 -0.05 0.03 0.08 0.2 -0.01 0.07 0.13
-0.63 -0.23 -0.33 -0.04 -0.07 -0.3 -0.1 -0.13 0.28 0.29 0.41 0.43
-0.44 -0.36 -0.3 -0.37 -0.33 -0.21 0.11 -0.1 0.21 0.19 0.65 0.45
-0.24 -0.21 -0.12 -0.2 -0.07 -0.14 0.03 -0.01 0.21 0.18 0.22 0.23
-0.77 -0.39 -0.23 -0.17 -0.03 -0.04 0.18 0.1 0.23 0.43 0.28 0.04
-0.34 -0.22 -0.12 -0.05 0.01 -0.14 0.01 0.0 0.11 0.25 0.27 0.09
-0.3 -0.24 -0.13 -0.2 0.01 -0.07 -0.01 -0.0 0.28 0.23 0.18 0.13
-0.53 -0.14 -0.25 -0.16 -0.25 -0.06 0.1 0.07 0.29 0.27 0.2 0.23
-0.13 -0.13 -0.16 -0.2 -0.12 -0.08 0.07 0.06 0.14 0.18 0.15 0.13
-0.26 -0.28 -0.1 -0.02 0.06 -0.19 -0.04 -0.02 0.21 0.2 0.16 0.16
-0.23 -0.74 -0.14 -0.18 -0.08 -0.03 0.19 0.0 0.22 0.27 0.16 0.26
-0.18 -0.32 -0.42 -0.18 -0.05 -0.11 -0.07 -0.12 0.18 0.36 0.42 0.21
-0.3 -0.29 -0.32 -0.17 0.15 -0.34 -0.01 0.06 0.31 0.14 0.15 0.37
-0.22 -0.2 -0.06 -0.19 0.04 -0.11 -0.01 -0.02 0.19 0.18 0.17 0.15
-0.27 -0.24 -0.32 0.03 0.21 -0.1 -0.09 -0.17 0.07 0.13 0.2 0.37
-0.42 -0.2 -0.23 -0.2 0.17 -0.13 0.03 -0.03 0.17 0.24 0.21 0.21

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.