Heatmap: Cluster_279 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
17.32 18.86 20.65 21.4 23.52 21.15 21.6 20.98 19.03 18.57 20.49 18.17
0.23 0.0 0.15 0.0 0.39 0.28 0.19 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0
0.08 0.11 0.03 0.15 0.02 0.06 0.05 0.41 0.03 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
1.13 2.85 1.99 0.0 1.16 0.45 0.66 1.67 1.96 0.59 1.74 0.43
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0
2.48 4.45 5.25 3.56 4.52 5.44 3.75 4.92 5.77 4.63 4.77 3.02
0.0 0.0 0.46 0.0 0.49 0.0 0.0 3.96 1.38 0.92 0.28 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
1.61 1.07 1.07 0.95 1.14 0.97 0.7 1.29 1.09 0.92 1.39 1.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 0.17 0.0 0.0
0.18 0.75 0.23 0.0 0.25 0.14 0.0 0.78 0.12 0.22 0.61 0.0
0.04 0.02 0.1 0.0 0.1 0.11 0.02 0.2 0.1 0.01 0.15 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
27.87 24.02 23.63 26.81 24.19 24.44 27.66 31.31 29.71 26.19 27.01 25.43
9.52 9.48 7.92 8.04 8.51 8.65 7.49 9.93 9.69 10.12 10.2 8.83
0.92 1.16 0.88 0.45 0.56 0.69 0.75 0.91 0.64 1.18 0.7 0.59
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.08 0.14 0.28 0.08 0.4 0.03 0.39 0.1 0.0 0.05 0.0
0.39 0.95 0.72 0.11 0.64 1.18 0.39 1.07 0.36 1.35 1.4 0.74
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0
6.86 6.13 5.75 6.76 6.48 5.4 6.94 7.84 6.53 6.38 6.59 5.17
13.37 13.62 12.42 13.94 13.52 13.28 13.22 15.06 13.37 13.46 12.72 12.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.08 0.06 0.02 0.02 0.02 0.11 0.03 0.0 0.1 0.0
0.36 0.0 0.74 0.0 0.26 0.47 0.22 0.41 0.29 0.52 0.0 0.81
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0
1.54 0.81 0.64 0.63 0.79 0.32 1.37 1.8 0.74 0.27 0.85 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.05
2.33 1.38 2.71 0.95 2.61 2.19 1.45 2.53 1.93 1.86 2.03 1.98
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.25 0.0 0.42 0.43 0.25 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0
0.46 0.0 0.0 0.69 0.21 0.0 0.62 1.12 0.17 0.09 0.82 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.04 0.05 0.0 0.0
0.11 0.0 0.04 0.0 0.05 0.0 0.16 0.55 0.0 0.15 0.0 0.05
0.14 1.42 1.08 0.08 0.3 0.08 0.4 0.26 0.6 0.49 1.59 0.14
0.59 0.54 0.31 0.1 0.4 0.29 0.41 0.39 0.4 0.24 0.53 0.36
11.28 9.4 10.43 8.56 8.99 9.47 9.96 10.82 9.66 11.44 12.4 9.32
0.0 0.36 0.0 0.54 0.35 0.47 0.06 1.09 0.4 0.12 0.0 0.07
20.95 15.57 18.01 15.48 19.98 15.08 19.65 19.26 14.69 13.81 17.77 15.89
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.04 0.03 0.0 0.08 0.0
0.0 0.1 0.39 0.36 0.49 0.78 0.26 0.87 0.0 0.34 0.46 0.37
0.07 0.14 0.06 0.09 0.03 0.21 0.08 0.63 0.5 0.22 0.18 0.04
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.05 0.35 0.05 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.19 0.91 0.0 0.09 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
1.52 1.4 1.29 1.77 1.63 1.14 1.72 2.18 1.27 1.52 1.89 1.3
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.13 0.0 0.13 0.13 0.03 0.02 0.03 0.07 0.04 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.11
0.0 0.99 0.55 0.0 0.21 0.29 0.0 0.72 0.25 0.87 0.62 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.11 0.0 0.13 0.06 0.03 0.21 0.09 0.04 0.19 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0
21.29 24.92 24.25 21.03 21.57 20.59 13.96 22.79 18.61 22.65 22.91 23.61
9.15 11.93 17.67 12.48 16.45 16.02 14.02 15.36 14.0 15.79 11.59 14.7
24.86 22.92 22.9 24.25 23.01 25.24 24.93 27.06 25.51 21.96 22.71 22.98
0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0
1.68 2.17 1.38 0.0 1.34 1.26 0.45 3.18 2.8 3.17 2.26 1.32
3.39 3.18 5.47 2.36 6.51 6.16 3.28 4.45 2.86 4.64 3.55 3.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.56 0.51 0.47 0.0 0.17 0.48 0.58 0.46 0.61 0.68 0.63 0.23
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.06 0.06 0.0 0.02 0.04 0.0 0.09 0.03 0.05 0.04 0.03
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.1 0.0 0.5 0.12 0.0 0.0 0.0
1.1 0.52 0.1 1.48 0.63 0.13 0.7 1.36 0.54 0.56 0.81 0.12
0.0 0.34 0.57 0.75 0.65 0.07 0.21 2.74 0.54 0.37 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.13 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0
3.84 8.36 5.4 3.5 5.12 5.09 6.16 6.59 4.57 5.14 7.54 4.75
0.07 0.23 0.06 0.11 0.06 0.0 0.04 0.33 0.13 0.17 0.17 0.0
0.25 0.21 0.08 0.13 0.3 0.15 0.14 0.64 0.26 0.3 0.12 0.02
0.46 0.77 1.21 0.89 0.89 0.93 0.93 1.08 1.01 0.66 0.99 0.76
0.04 0.17 0.25 0.0 0.08 0.12 0.0 0.07 0.13 0.2 0.18 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0
0.35 0.69 0.07 0.0 0.08 0.21 0.09 0.6 0.43 0.4 0.21 0.36
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.1 0.0
1.31 1.67 2.15 1.85 1.79 1.95 0.59 2.77 2.84 3.01 4.38 2.05
0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.06 0.06 0.02
16.52 16.81 14.77 14.4 14.24 13.46 14.88 16.94 16.1 16.5 13.73 14.93
1.35 2.23 2.51 1.56 2.17 1.96 1.12 1.39 1.53 2.39 1.96 2.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.39 0.0 0.7 0.0 0.38 0.57 0.15 0.21 0.64 0.0
2.48 1.81 1.18 1.73 1.84 2.08 1.41 2.69 2.43 1.61 1.83 1.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
1.52 0.66 0.9 0.19 0.41 0.49 0.92 0.83 0.59 0.68 1.32 0.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.29 0.0 0.13 0.0 0.32
0.21 0.76 2.03 1.42 1.81 1.35 1.47 1.59 1.25 0.49 0.84 1.54
172.35 170.2 185.2 174.33 195.04 186.04 174.57 195.22 186.81 183.76 183.45 181.19
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.0
2.31 2.85 5.02 3.42 4.95 4.31 4.56 5.26 3.51 2.94 4.02 2.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.13 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.18 0.16
0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.15 1.02 0.0 0.0 0.0 0.07
0.71 0.45 0.93 0.0 0.66 1.35 0.54 0.65 0.12 0.3 1.12 1.54
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.04

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)