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Heatmap: Cluster_7 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-1.45 1.44 0.11 0.26 -0.5 0.15 -0.42 0.34 -1.26 -0.08 -0.63 -0.32
0.0 0.27 0.12 0.32 -0.17 0.22 -0.07 0.09 -0.65 -0.27 0.03 -0.16
-0.0 0.15 0.04 0.1 -0.03 0.13 -0.13 -0.07 -0.19 -0.09 -0.01 0.06
-0.1 0.46 0.13 0.16 -0.24 0.21 -0.01 -0.01 -0.44 -0.28 -0.16 0.06
-0.14 0.39 0.09 0.18 -0.04 0.23 -0.09 0.03 -0.37 -0.21 -0.07 -0.17
0.05 0.27 -0.04 0.13 -0.15 0.15 -0.0 0.19 -0.16 -0.21 -0.15 -0.19
-0.15 0.16 -0.09 0.06 -0.14 0.07 -0.03 0.05 -0.11 0.11 0.04 -0.0
-0.68 0.25 -0.04 0.13 -0.26 0.25 -0.02 0.25 -0.31 0.34 -0.16 -0.08
0.24 0.3 0.12 0.22 -0.1 0.06 -0.13 -0.08 -0.33 -0.24 -0.14 -0.09
-0.0 0.53 0.02 0.45 -0.36 0.6 0.02 -0.1 -0.72 -0.38 -0.52 -0.21
0.41 0.48 0.21 0.31 -0.42 0.09 0.13 -0.05 -1.09 -0.13 -0.34 -0.26
0.09 0.37 0.27 0.09 -0.31 0.16 -0.32 0.09 -0.37 -0.15 -0.07 -0.06
0.31 0.61 -0.01 0.27 -0.2 0.11 -0.04 -0.42 -0.62 -1.03 0.1 0.21
-0.06 0.24 -0.12 0.57 -0.28 -0.4 0.07 0.15 -0.26 -0.3 -0.18 0.25
0.04 0.11 0.02 0.19 -0.13 -0.04 -0.02 0.21 -0.29 -0.08 0.01 -0.09
-0.06 0.1 -0.01 0.01 -0.13 0.12 0.0 0.05 -0.06 -0.01 0.01 -0.05
-0.44 0.51 -0.0 -0.23 0.01 0.2 0.27 0.09 -0.64 0.01 0.18 -0.36
-0.19 0.35 -0.17 0.09 -0.17 0.38 -0.16 0.08 -0.25 -0.02 -0.23 0.11
-0.26 0.49 -0.44 -0.05 -0.49 0.7 -0.14 0.13 -0.52 -0.22 0.08 0.12
0.47 1.26 0.63 0.02 -1.07 -0.21 -0.66 -0.66 -1.4 -0.58 -0.31 0.26
0.06 0.29 0.02 0.18 -0.11 -0.11 -0.1 -0.15 -0.26 -0.05 0.08 0.05
0.21 0.62 0.27 -0.06 -0.34 0.24 -0.08 0.05 -0.25 -0.32 -0.43 -0.3
-0.1 0.53 0.27 0.41 -0.61 0.53 -0.28 -0.11 -0.96 -0.33 -0.1 -0.01
0.18 0.07 0.03 0.16 -0.08 -0.03 -0.03 0.04 -0.12 -0.03 -0.07 -0.15
-0.29 0.19 0.43 0.56 -0.25 0.81 -0.06 -0.37 -0.91 -0.83 -0.07 -0.26
-0.13 0.13 0.2 0.11 -0.07 0.25 0.0 0.19 -0.25 -0.2 -0.09 -0.28
-0.07 0.17 -0.03 0.02 -0.14 -0.07 0.01 0.22 0.01 -0.03 -0.1 -0.04
-0.59 0.99 0.39 0.5 -0.38 0.64 -0.42 -0.38 -0.92 -1.1 -0.45 0.07
-0.0 0.27 0.11 0.29 -0.21 0.36 0.05 0.29 -0.34 -0.42 -0.41 -0.33
-0.76 0.29 -0.01 0.23 -0.29 0.45 -0.06 0.04 -0.3 -0.2 -0.01 0.25
0.13 0.2 0.08 0.23 -0.19 0.19 -0.02 0.12 -0.35 -0.21 -0.29 -0.03
0.04 0.4 0.17 0.0 -0.13 0.02 -0.2 -0.0 -0.23 -0.24 0.05 -0.0
-0.19 0.25 0.03 0.28 -0.26 0.15 0.07 0.17 -0.35 -0.1 -0.06 -0.16
0.23 0.52 0.12 0.28 -0.57 0.81 -0.38 -0.1 -0.6 -0.58 -0.57 -0.07
-0.32 0.34 0.7 -0.35 0.27 -0.02 -0.59 -0.11 -0.6 0.89 -0.89 -0.55
0.1 1.31 0.17 0.18 -0.87 0.55 -0.67 -0.25 -0.91 -0.94 -0.77 0.1
0.09 0.14 0.05 -0.05 -0.07 -0.15 0.05 -0.04 -0.2 0.0 0.09 0.06
-0.04 0.2 0.03 -0.31 -0.07 -0.04 0.07 -0.08 -0.27 0.19 -0.03 0.22
0.22 0.21 0.06 0.2 -0.11 0.05 -0.13 -0.07 -0.24 -0.22 -0.07 -0.01
0.32 1.16 0.32 0.61 -0.25 -0.36 -0.2 -0.42 -1.19 -0.71 -0.93 -0.1
0.09 0.21 0.11 0.21 -0.11 0.21 -0.14 -0.07 -0.33 -0.21 0.0 -0.11
0.13 0.25 0.03 0.03 -0.07 0.07 -0.12 -0.03 -0.19 -0.2 -0.08 0.12
-0.17 0.96 0.18 0.22 -0.29 0.21 -0.51 -0.12 -0.65 -0.4 -0.42 0.16
0.11 0.37 -0.0 0.22 -0.13 0.03 -0.13 0.01 -0.43 -0.29 -0.04 0.1
0.03 0.27 0.03 0.14 -0.14 0.07 0.03 0.12 -0.4 -0.06 -0.03 -0.18
-0.23 0.25 0.06 -0.05 -0.39 0.32 0.1 -0.53 -0.93 0.14 0.32 0.37
-0.6 0.58 0.48 -0.42 0.16 -0.56 -0.28 -0.08 -0.19 0.13 0.02 0.2
-0.09 0.24 0.07 -0.16 -0.16 0.08 0.01 0.18 -0.23 -0.11 0.09 -0.0
-0.11 -0.02 0.01 0.03 -0.05 0.18 0.03 0.24 -0.11 -0.06 0.04 -0.25
-0.02 0.04 0.05 -0.18 -0.18 0.32 -0.06 0.26 -0.22 0.05 -0.03 -0.15
0.25 0.15 -0.09 0.07 -0.17 0.14 0.02 0.06 -0.33 -0.25 0.09 -0.07
-0.0 0.55 0.32 0.29 -0.28 0.05 -0.13 0.01 -0.52 -0.17 -0.22 -0.23
-0.13 0.41 0.56 0.49 -0.55 0.87 -0.09 -0.21 -1.02 -0.85 -0.55 -0.26
-0.45 0.11 -0.05 0.77 -0.46 0.2 -0.11 0.22 -0.83 -0.43 0.14 0.2
0.12 0.09 0.03 0.13 -0.11 0.15 -0.04 -0.06 -0.22 -0.18 0.02 0.01
-0.03 0.08 -0.07 0.01 -0.1 0.14 0.0 0.13 -0.07 -0.07 0.01 -0.06
0.14 0.2 0.06 0.13 -0.15 0.07 -0.15 -0.04 -0.25 -0.18 -0.02 0.1
0.11 0.35 0.14 0.24 -0.23 0.15 -0.13 -0.05 -0.52 -0.22 -0.02 -0.04
-0.0 0.14 0.06 0.12 -0.11 0.12 -0.12 -0.07 -0.25 -0.09 0.06 0.09
0.02 0.28 -0.04 0.12 -0.14 0.08 0.06 0.14 -0.32 -0.08 -0.13 -0.09
-0.35 0.2 0.06 -0.04 -0.08 -0.1 0.1 0.12 -0.02 0.04 -0.06 0.06
0.23 0.28 0.05 0.32 -0.21 0.2 -0.14 -0.09 -0.46 -0.3 -0.06 -0.05
-0.33 0.82 0.1 -0.2 -0.32 0.12 0.12 -0.14 -0.74 -0.32 -0.11 0.36
0.3 0.43 0.14 0.15 -0.32 0.19 -0.23 -0.14 -0.55 -0.07 -0.19 -0.01
0.24 0.23 0.04 0.11 -0.09 -0.02 -0.11 -0.05 -0.2 -0.15 -0.09 0.0
0.08 1.12 0.33 0.28 -0.87 0.77 -0.39 -0.39 -1.48 -0.98 -0.77 0.1
0.22 0.81 0.32 0.42 -0.36 0.18 -0.18 -0.12 -1.01 -0.77 -0.5 -0.02
0.08 0.03 0.01 0.21 -0.15 0.14 -0.06 -0.04 -0.34 -0.09 0.11 0.02
0.21 0.35 0.15 0.08 -0.1 0.03 -0.14 -0.12 -0.26 -0.25 -0.07 0.01
-0.2 0.2 -0.06 0.18 -0.05 0.08 0.01 0.05 -0.25 0.0 0.06 -0.09
-0.11 0.04 -0.05 0.24 -0.22 0.32 0.14 0.06 -0.34 -0.12 -0.06 -0.04
0.08 0.19 0.02 0.03 -0.07 0.07 -0.01 -0.08 -0.21 -0.11 -0.04 0.06
-0.06 0.27 -0.13 0.07 -0.09 0.23 -0.15 -0.01 -0.1 -0.14 -0.0 0.05
0.08 0.21 0.03 0.14 -0.07 0.11 -0.12 -0.02 -0.22 -0.18 0.04 -0.09
0.01 0.13 0.05 -0.01 -0.07 0.16 0.02 -0.01 -0.28 -0.06 0.03 -0.03
- 2.8 0.76 - -1.18 - -1.15 - 0.27 -0.72 -0.59 -
0.02 0.38 0.05 -0.03 -0.17 0.16 -0.02 0.18 -0.27 -0.1 -0.19 -0.13
-0.26 0.71 0.3 0.62 -0.51 -0.3 -0.09 0.5 -0.94 -0.52 -0.58 0.01
-0.5 0.53 0.46 0.62 -0.36 0.72 -0.06 -0.44 -1.36 -0.82 -0.55 0.24
-0.58 0.43 0.52 0.41 -0.34 0.73 -0.31 -0.37 -1.32 -0.6 -0.23 0.36
- 1.98 0.87 0.3 -1.19 0.15 -1.32 -0.55 -0.56 -1.05 -0.41 -1.16
0.03 0.21 -0.1 0.2 -0.24 -0.02 0.13 0.17 -0.43 -0.13 0.0 0.02
-1.82 0.85 0.23 0.52 -0.86 0.57 0.31 0.35 -1.4 -0.04 -0.27 -0.77
-0.43 0.58 0.05 -0.09 -0.21 0.37 -0.06 0.03 -0.67 -0.36 0.04 0.28
-0.09 0.26 0.05 -0.02 -0.13 0.07 0.12 0.12 -0.26 0.03 0.02 -0.25
0.13 0.19 0.01 0.12 -0.04 0.01 -0.09 -0.05 -0.23 -0.05 0.02 -0.07
-0.23 -0.11 -0.06 0.26 -0.2 0.39 0.16 0.31 -0.49 -0.14 -0.06 -0.09
0.22 0.49 0.01 0.23 -0.33 0.31 -0.41 -0.03 -0.6 -0.49 -0.13 0.26
1.73 2.1 1.46 0.04 -2.97 - -4.16 -4.84 -3.21 -4.12 - -2.09
1.37 1.75 0.98 0.4 -0.87 -2.91 -1.41 -1.66 -3.35 -1.25 -2.1 -0.68
0.09 0.08 0.08 0.19 -0.12 0.06 -0.11 0.04 -0.13 -0.1 -0.02 -0.1
-0.13 0.22 -0.04 0.17 -0.21 0.27 0.1 0.33 -0.79 -0.26 0.04 -0.03
-0.03 0.16 0.06 0.11 0.03 0.1 0.02 0.08 -0.22 -0.15 -0.12 -0.11
0.11 0.14 0.0 0.09 -0.08 0.04 -0.09 0.01 -0.13 -0.05 0.04 -0.09
-0.09 0.3 0.06 0.05 -0.04 0.06 -0.05 0.08 -0.08 -0.23 -0.08 -0.05
-0.26 0.17 0.09 0.07 0.03 0.1 0.03 0.02 -0.04 -0.09 -0.17 -0.0
-0.07 -0.02 -0.02 -0.07 -0.06 0.16 0.04 0.11 -0.08 -0.0 -0.03 0.02
-0.01 0.09 -0.27 0.33 -0.03 0.04 0.08 -0.03 -0.3 -0.02 0.07 -0.06
0.11 0.16 0.04 0.42 -0.14 -0.06 -0.04 0.18 -0.32 -0.12 -0.14 -0.25
-0.16 0.14 -0.09 0.26 -0.1 0.16 -0.08 0.1 -0.19 -0.08 -0.01 -0.03
0.25 1.16 0.43 0.39 -1.27 0.92 -0.53 -0.38 -1.73 -1.24 -0.76 -0.25
0.2 0.18 -0.02 0.1 -0.11 0.03 -0.05 0.01 -0.19 -0.15 -0.07 0.02
0.05 0.07 -0.06 0.1 -0.17 0.14 -0.05 -0.08 -0.19 -0.05 0.1 0.08
0.22 0.16 -0.02 0.18 -0.12 0.05 -0.07 -0.07 -0.22 -0.11 -0.07 0.01
0.1 0.21 0.03 -0.11 -0.18 0.09 0.02 0.13 -0.13 -0.01 -0.08 -0.13
-0.58 0.74 0.39 -0.12 -0.67 0.11 -0.26 0.19 -0.95 0.17 0.07 0.08
0.18 0.09 0.02 0.13 -0.04 0.04 -0.07 -0.09 -0.15 -0.1 0.02 -0.07
-0.14 0.82 0.22 0.35 -0.58 0.65 -0.21 -0.16 -1.33 -0.53 -0.54 0.16
-0.16 0.31 0.55 0.57 -0.15 0.46 -0.29 -0.38 -1.36 -0.6 -0.36 0.29
0.04 0.08 -0.02 0.05 -0.08 0.05 -0.11 -0.0 -0.1 0.01 0.05 0.03
0.14 0.99 0.33 0.26 -0.72 0.61 -0.38 -0.39 -1.07 -0.51 -0.53 -0.12
-0.16 1.0 0.34 0.02 -0.71 0.2 -0.64 0.01 -0.7 -0.74 -0.12 0.35
-0.36 0.04 -0.06 0.49 -0.18 0.27 0.03 0.33 -0.31 -0.32 -0.11 -0.09
-0.09 0.29 0.01 0.07 0.04 0.07 -0.07 -0.01 -0.05 -0.13 -0.08 -0.1
-0.07 0.3 0.06 -0.08 -0.1 0.21 -0.01 0.22 -0.22 -0.12 -0.23 -0.05
-0.12 0.37 0.27 -0.02 -0.15 0.32 0.18 0.07 -0.69 -0.22 -0.31 -0.06
0.14 0.12 0.02 0.12 -0.09 0.08 -0.05 -0.07 -0.14 -0.08 -0.05 -0.05
0.05 0.44 -0.0 0.29 -0.25 0.04 -0.01 0.15 -0.42 -0.1 -0.04 -0.38
-0.21 0.1 0.11 0.14 -0.07 0.13 -0.01 0.02 -0.15 0.01 -0.01 -0.1
0.08 0.13 0.05 0.16 -0.06 0.11 -0.07 -0.03 -0.2 -0.18 -0.04 0.0
0.27 0.77 0.23 0.4 -0.82 0.65 -0.26 -0.1 -1.28 -0.84 -0.35 -0.11
0.1 0.24 0.08 0.15 -0.13 0.07 -0.06 0.0 -0.32 -0.14 -0.12 0.03
0.14 1.04 0.15 -0.05 -0.9 -0.03 -0.35 -0.36 -0.82 -0.82 -0.11 0.71
-0.22 0.43 0.05 -0.16 -0.11 -0.09 0.05 0.11 -0.19 0.16 -0.08 -0.08
0.14 0.12 -0.03 0.12 -0.12 0.14 -0.16 -0.02 -0.17 -0.04 0.08 -0.11
0.17 0.09 0.06 0.08 -0.13 0.09 -0.08 -0.07 -0.17 -0.15 -0.04 0.1
0.09 0.15 0.02 0.09 -0.06 0.19 -0.18 -0.05 -0.12 -0.09 -0.04 -0.03
0.01 0.28 0.15 0.25 -0.12 -0.08 -0.1 -0.11 -0.27 -0.11 0.02 -0.02
-0.04 0.17 -0.04 0.15 0.05 0.15 -0.01 0.08 -0.3 -0.08 -0.03 -0.17
0.09 0.09 0.06 0.14 -0.07 0.11 -0.05 0.05 -0.18 -0.15 0.0 -0.13
0.15 0.2 0.04 0.07 -0.11 -0.02 -0.04 -0.07 -0.19 -0.12 0.0 0.04
-0.16 0.11 -0.09 0.07 -0.09 0.15 -0.06 0.16 -0.12 -0.01 -0.07 0.05
-0.19 0.18 0.02 0.08 0.0 0.15 -0.0 0.12 -0.2 -0.17 -0.12 0.06
-0.03 0.12 0.01 0.06 0.02 0.12 -0.05 0.14 -0.14 -0.1 -0.07 -0.1
-0.01 0.14 -0.04 0.25 -0.13 0.02 -0.01 0.11 -0.34 -0.32 0.09 0.12
0.18 0.09 0.06 0.09 -0.05 0.05 -0.05 -0.04 -0.12 -0.05 -0.06 -0.12
0.47 1.79 0.21 -0.89 -0.86 -0.44 -1.27 -0.27 -1.73 -0.35 -0.54 0.21
0.23 0.14 -0.02 0.22 -0.06 -0.03 -0.13 -0.07 -0.22 -0.06 -0.07 -0.02
-0.19 0.65 0.33 0.39 -0.62 0.84 -0.46 -0.29 -1.16 -0.47 -0.37 0.07
0.12 0.3 0.12 0.23 -0.17 0.23 -0.05 0.04 -0.57 -0.3 -0.09 -0.08
0.1 0.35 0.19 0.2 -0.18 0.08 -0.06 -0.04 -0.47 -0.27 -0.02 -0.08
0.16 0.14 0.11 0.02 -0.16 0.09 -0.04 0.12 -0.24 0.0 -0.02 -0.25
0.07 0.35 0.05 -0.13 -0.1 0.21 -0.13 0.22 -0.32 -0.25 -0.14 0.01
0.14 0.05 -0.01 0.11 -0.12 0.09 -0.08 -0.05 -0.17 -0.05 0.02 0.05
-0.04 0.01 -0.03 0.03 0.03 0.06 0.05 0.09 -0.15 0.02 -0.02 -0.07
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-0.28 0.7 0.18 0.13 -0.28 0.27 -0.27 0.04 -1.09 -0.26 -0.25 0.36
0.1 0.34 0.15 0.31 -0.19 0.09 -0.11 0.06 -0.59 -0.25 -0.05 -0.11
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-0.21 -0.07 -0.02 0.29 -0.66 0.73 -0.73 -0.08 -1.19 0.23 0.31 0.36
0.01 0.6 0.14 0.08 -0.41 0.22 -0.21 -0.08 -0.54 -0.3 -0.19 0.28
-0.09 0.01 -0.07 0.02 0.02 0.01 -0.07 0.12 -0.02 0.03 -0.01 0.03

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.