Heatmap: Cluster_255 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.19 -0.2 -0.18 -0.22 -0.16 0.01 0.06 0.17 0.37 0.09 0.18 -0.07
-0.27 -0.35 0.01 0.1 0.14 -0.04 -0.01 0.05 0.22 0.18 -0.05 -0.1
-0.42 -0.12 -0.18 0.1 0.1 -0.07 -0.07 0.17 0.29 0.1 0.08 -0.11
-0.13 -0.04 -0.06 -0.1 -0.03 0.02 0.01 0.17 0.18 0.04 0.01 -0.09
-0.03 -0.45 -0.21 -0.24 -0.16 0.07 0.14 0.11 0.16 0.32 0.19 -0.09
-0.5 -0.22 -0.51 -0.0 0.07 0.21 0.17 0.09 0.47 0.26 -0.01 -0.38
-0.16 -0.15 -0.11 0.01 -0.06 0.0 -0.01 0.13 0.17 0.06 0.13 -0.07
-0.06 -0.17 -0.18 -0.1 0.08 0.22 0.11 0.18 0.27 0.0 -0.11 -0.35
-0.41 -0.46 -0.25 -0.31 -0.19 0.1 0.17 0.26 0.51 0.29 0.07 -0.15
0.11 -0.04 -0.2 -0.14 0.04 0.16 0.08 0.08 0.18 -0.01 -0.12 -0.2
-0.02 -0.24 -0.2 -0.0 0.11 0.03 0.11 0.16 0.18 0.01 0.02 -0.23
-0.21 -0.28 -0.05 0.01 -0.11 0.06 -0.06 0.27 0.19 0.03 0.17 -0.13
-0.53 -0.36 0.1 0.08 0.01 -0.12 0.25 0.05 0.12 0.2 0.03 -0.0
-0.3 -0.27 0.07 -0.04 0.16 0.01 0.07 0.11 0.1 0.08 0.01 -0.07
-0.45 -0.05 0.11 0.02 0.18 0.21 -0.04 0.15 0.01 -0.12 0.02 -0.14
-0.13 -0.14 -0.17 -0.04 -0.03 -0.04 0.15 0.11 0.33 0.0 -0.0 -0.12
-0.51 -0.66 -0.18 0.23 -0.09 -0.24 0.15 0.24 0.23 0.25 0.28 -0.07
-0.25 -0.17 -0.11 -0.12 -0.09 0.04 0.0 0.18 0.1 0.13 0.23 -0.02
-0.88 -0.72 -0.64 0.11 0.43 0.9 -0.29 0.11 -0.43 -0.32 0.45 0.15
-0.43 -0.23 -0.01 0.14 0.1 -0.1 0.03 0.15 0.16 0.01 0.04 0.03
-0.42 -0.19 -0.05 0.02 0.16 0.0 0.02 0.11 0.14 0.15 0.08 -0.13
-0.27 -0.24 -0.06 -0.01 -0.02 0.1 0.11 0.23 0.29 0.13 -0.09 -0.3
0.06 -0.6 0.03 -0.17 0.07 -0.09 0.09 0.35 0.14 0.16 -0.11 -0.11
-0.33 -0.18 -0.12 0.04 -0.02 0.05 -0.03 0.12 0.15 0.11 0.23 -0.1
-0.13 -0.16 -0.15 -0.21 -0.03 0.19 -0.1 0.36 0.14 -0.02 0.25 -0.31
-0.72 -1.77 0.07 -0.41 0.09 0.06 0.89 0.71 0.47 -0.25 -0.72 -0.19
-0.6 -0.56 -0.52 0.11 0.63 0.33 0.21 -0.22 0.2 -0.02 0.01 -0.13
-0.14 -0.47 -0.12 -0.13 -0.08 0.01 0.07 0.25 0.38 0.23 0.11 -0.34
-0.08 -0.18 -0.03 -0.02 -0.03 0.06 0.06 0.15 0.15 0.04 -0.03 -0.13
-0.24 -0.13 -0.16 -0.17 0.13 0.1 0.07 0.16 0.08 0.11 0.06 -0.09
-0.12 -0.23 -0.05 0.05 -0.05 0.01 0.04 0.13 0.25 0.01 0.01 -0.09
-0.23 -0.16 -0.19 0.02 -0.04 -0.05 0.06 0.19 0.25 0.16 0.08 -0.18
-0.19 -0.02 0.08 -0.22 -0.03 -0.05 -0.01 0.05 0.13 0.16 0.06 -0.01
-0.26 -0.11 0.07 -0.06 0.12 0.14 0.07 -0.01 0.11 -0.02 0.04 -0.13
-0.03 -0.06 -0.01 -0.06 0.03 0.05 0.04 0.11 0.08 -0.04 -0.0 -0.12
-0.24 -0.19 -0.08 -0.01 -0.01 -0.05 0.13 0.18 0.05 0.07 0.06 0.06
-0.15 -0.21 -0.08 0.02 0.01 -0.09 0.04 0.13 0.2 0.16 0.07 -0.19
-0.73 -0.4 -0.07 0.13 0.29 -0.12 0.16 0.09 0.22 0.04 0.17 -0.06
-0.05 -0.11 -0.2 -0.19 0.12 0.17 0.16 0.19 0.08 -0.11 -0.01 -0.12
-0.37 -0.23 -0.16 0.18 0.08 -0.08 -0.02 0.06 0.25 0.12 0.04 0.01
-0.28 -0.54 0.03 -0.21 0.21 0.15 -0.05 0.12 0.33 0.19 0.06 -0.25
-0.08 -0.15 0.03 -0.28 0.07 0.14 -0.11 0.12 0.14 -0.04 0.1 -0.01
-0.21 -0.35 -0.12 -0.11 0.06 0.2 0.15 0.23 0.11 0.18 -0.04 -0.23
-0.76 -0.36 -0.03 0.13 0.02 -0.03 -0.06 0.35 0.18 0.13 0.12 0.01
-0.34 -0.09 0.03 0.1 0.09 0.09 0.19 -0.06 0.11 0.01 -0.09 -0.12
-0.2 -0.15 -0.1 -0.15 0.01 0.12 0.18 0.13 0.2 0.16 -0.09 -0.2
-0.15 -0.57 -0.1 -0.37 -0.04 0.11 0.01 0.15 0.15 0.3 0.2 0.09
-0.17 -0.15 -0.04 0.1 0.01 -0.12 0.02 -0.0 0.21 0.11 0.02 -0.02
-0.2 -0.42 -0.02 -0.26 0.03 0.13 0.0 0.29 0.22 0.09 0.01 -0.03
-0.15 -0.22 -0.2 0.13 -0.09 0.01 -0.14 0.19 0.24 0.06 0.12 -0.05
0.18 -0.86 0.25 - 0.56 -0.3 0.17 1.17 -0.05 0.18 -0.31 -0.81
0.04 -0.46 -0.35 -0.45 0.0 -0.16 -0.02 0.58 0.38 0.2 0.42 -0.82
-0.43 -0.24 -0.03 0.01 0.03 0.09 0.01 0.16 0.14 0.12 0.06 -0.04
-0.08 -0.12 -0.02 -0.07 0.11 0.08 0.07 0.04 0.09 0.06 -0.06 -0.13
-0.18 -0.14 -0.19 -0.04 -0.07 0.1 0.02 0.15 0.2 0.12 0.06 -0.09
0.45 -0.32 -0.44 -1.88 -0.11 -0.06 0.31 1.36 -0.7 0.05 -0.05 -0.99
-0.35 -0.51 -0.29 0.21 0.19 0.21 0.41 -0.17 -0.0 -0.06 -0.0 0.09
-0.16 -0.12 -0.07 -0.18 -0.06 0.03 0.1 0.24 0.17 -0.04 0.04 -0.01
-0.5 -0.37 -0.02 0.01 0.1 0.11 0.08 0.06 0.17 0.06 0.04 0.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.