Heatmap: Cluster_127 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.29 0.36 -0.36 -0.27 -0.54 -0.58 -0.49 -0.09 0.2 0.25 0.16 0.5
0.07 -0.18 -0.13 0.09 -0.05 -0.23 -0.03 0.19 0.11 0.07 0.06 -0.03
-0.01 0.03 -0.22 -0.07 -0.18 -0.03 0.05 0.2 0.09 0.06 -0.01 0.04
-0.22 0.15 0.15 0.51 0.18 -0.79 -0.58 0.74 -1.36 -0.23 0.05 0.22
0.15 -0.14 -0.19 -0.13 -0.03 -0.42 0.13 0.15 0.03 0.05 0.01 0.26
-0.36 -0.36 -0.01 0.1 0.21 -1.09 0.52 0.59 0.12 -0.4 0.2 -0.29
-0.87 -1.13 -0.73 0.49 -0.25 -1.11 0.33 0.97 -0.44 -0.2 -0.28 1.03
0.14 -0.68 -0.09 -0.21 0.02 -0.38 -0.12 0.14 0.07 0.17 -0.02 0.58
1.03 0.32 -0.62 0.24 -0.44 -1.42 -0.77 -0.4 -0.47 0.72 -0.72 0.53
-0.11 -0.33 -0.26 0.07 0.04 -0.07 -0.03 0.31 0.04 0.17 0.07 -0.01
0.18 -0.16 -0.26 -0.09 -0.09 -0.43 0.09 0.15 0.18 0.1 0.04 0.15
-0.29 -0.26 -0.09 -0.24 0.13 0.04 0.24 0.2 0.04 0.03 -0.04 0.12
-0.06 -0.15 -0.31 -0.23 0.0 -0.03 0.15 -0.02 -0.09 0.18 0.18 0.26
0.03 0.01 -0.06 -0.09 -0.03 -0.05 0.04 0.08 -0.0 -0.05 0.04 0.06
-0.0 0.05 -0.22 -0.24 -0.14 0.04 0.11 0.28 0.09 0.18 -0.24 -0.02
0.29 -0.99 -0.3 -0.85 -0.08 -0.43 0.09 0.59 0.04 0.12 0.09 0.56
-0.02 -0.13 -0.17 -0.05 0.03 -0.11 0.22 0.12 0.01 0.07 -0.12 0.09
0.03 -0.22 0.0 -0.03 -0.04 -0.14 -0.11 0.07 0.05 0.02 0.14 0.17
-0.35 0.0 -0.26 -0.4 -0.21 0.15 0.11 0.38 0.21 -0.08 -0.05 0.25
-0.01 -0.55 -0.16 0.09 0.02 -0.26 0.14 0.03 0.19 0.19 -0.01 0.17
-0.05 -0.51 -0.02 0.16 -0.02 -0.29 0.04 0.07 0.14 0.24 0.23 -0.15
- - -1.04 - - 0.46 0.46 1.64 0.29 - - 2.15
0.22 0.02 -0.24 0.01 -0.03 -0.28 0.03 0.04 0.17 0.0 0.04 -0.07
0.56 0.22 -0.44 -1.2 -1.12 -0.64 0.09 0.08 0.9 -0.01 0.15 -0.0
-0.04 -0.09 -0.18 -0.09 0.04 -0.26 -0.38 -0.29 0.24 0.15 0.22 0.44
0.3 -0.39 -0.28 -0.43 0.16 -0.45 -0.13 0.42 0.12 0.19 0.25 -0.11
0.24 -0.76 -0.34 -0.14 0.21 -1.39 0.48 -0.66 0.28 0.8 -2.07 0.82
-0.15 -0.55 -1.24 -0.42 0.46 -2.71 -1.24 1.38 0.5 -0.19 0.73 -0.44
-0.13 0.12 -0.02 -0.32 0.17 -0.21 -0.38 0.17 0.2 0.1 -0.39 0.43
-0.38 -1.1 -1.19 -1.28 0.06 -0.1 -1.94 0.58 -0.05 1.07 -0.21 1.17
0.08 -0.64 -0.03 -0.43 0.31 -0.51 0.01 0.4 0.04 0.07 0.14 0.18
- - 0.04 - -1.06 - 1.17 0.24 -2.02 1.77 - 1.77
-0.14 -0.05 -0.03 -0.18 -0.08 -0.26 0.09 0.26 0.22 0.08 0.13 -0.14
-1.17 -0.94 -0.11 -0.54 -0.43 -1.58 0.43 0.83 -0.3 0.78 -1.09 1.15
-0.36 -0.23 -0.41 0.31 -0.07 -0.43 0.02 0.22 0.39 0.32 -0.13 0.02
-0.19 -0.23 -0.28 0.11 0.02 -0.39 -0.07 0.29 0.18 0.17 0.16 0.05
-0.15 -0.16 -0.16 -0.03 0.04 -0.02 -0.11 -0.09 0.06 0.08 0.2 0.27
-0.99 -0.74 0.2 -0.39 0.26 -2.28 -1.25 -0.74 -0.17 0.81 -0.5 1.68
0.06 -0.29 -0.21 -0.28 -0.11 -0.23 0.14 0.18 0.12 -0.16 0.09 0.47
-0.04 -0.28 -0.34 -0.18 -0.22 -0.3 0.16 0.26 0.24 0.36 0.22 -0.12
-0.05 -0.42 -0.53 0.19 -0.04 -0.29 -0.1 0.25 0.09 0.29 0.2 0.14
-0.26 -0.06 -0.12 0.08 -0.01 0.01 -0.02 0.18 0.08 -0.01 0.05 0.05
-0.18 -0.15 -0.18 -0.08 -0.01 0.03 -0.02 0.29 0.04 0.11 -0.08 0.15
0.13 0.03 -0.12 -0.17 -0.1 -0.12 -0.03 0.1 0.04 0.04 0.05 0.12
-0.2 -0.02 -0.15 -0.14 -0.07 -0.16 0.06 0.2 0.17 0.1 0.04 0.11
-0.02 -0.87 -0.15 -0.15 -0.4 -0.93 0.33 0.25 0.22 0.12 0.48 0.36
-0.02 0.08 -0.1 -0.1 -0.12 -0.17 -0.01 0.15 0.04 -0.09 0.1 0.19
-0.5 - -2.05 -2.43 -1.22 0.63 0.71 0.55 -0.62 0.83 0.12 1.18
0.08 0.05 -0.24 -0.13 -0.25 -0.39 -0.08 0.06 0.31 0.29 0.17 -0.04
-0.19 -0.17 0.1 -0.74 -0.01 -0.31 -0.14 0.33 0.41 0.27 0.29 -0.23
-0.12 -0.82 -1.38 -2.06 -0.47 -0.36 0.04 1.11 0.81 0.7 0.32 -0.81
0.13 0.08 -0.14 -0.11 -0.08 -0.3 -0.02 0.16 0.18 0.1 0.01 -0.07
0.51 -0.33 -0.37 -0.47 -0.21 -0.49 -0.19 0.17 0.27 0.18 0.23 0.26
0.06 -0.72 -0.36 0.17 0.06 -1.12 0.1 0.41 0.29 0.32 0.21 -0.11
0.19 0.05 -0.26 -0.29 -0.02 -0.12 0.13 -0.11 0.1 0.23 -0.04 0.04
0.25 -0.15 -0.16 -0.28 -0.1 -0.38 0.13 0.26 0.07 0.18 -0.06 0.09
- - - - 1.56 - - - - 2.63 - 1.51
0.2 0.07 -0.08 -0.04 -0.07 -0.14 -0.11 -0.07 -0.02 0.06 0.07 0.09
0.48 -0.39 -0.07 -0.31 0.3 -0.68 0.25 0.46 -0.05 -0.05 -0.69 0.15
0.17 0.27 -0.23 -0.36 -0.1 -0.54 -0.04 -0.02 0.05 0.24 0.1 0.21
0.15 -0.18 -0.37 -0.07 -0.04 -0.26 -0.05 -0.02 0.23 0.19 0.12 0.17
-0.28 -0.22 0.27 -0.65 0.29 -0.35 0.05 0.85 0.0 -0.06 -0.37 -0.16
-0.18 -0.1 -0.04 -0.06 -0.06 -0.09 -0.02 -0.04 0.04 0.08 0.14 0.28
-0.04 0.03 -0.22 -0.34 -0.14 -0.36 -0.02 0.31 0.22 0.22 0.23 -0.08
0.04 -0.02 -0.13 -0.33 -0.09 -0.25 -0.01 0.12 -0.04 0.31 0.0 0.26
-0.13 -0.09 -0.21 -0.1 0.05 0.02 0.07 0.01 0.22 0.02 -0.03 0.12
0.1 -0.05 -0.14 0.0 -0.04 -0.15 -0.11 0.05 -0.03 0.09 0.06 0.18
0.51 -1.7 -0.85 -1.27 -0.43 0.42 -0.48 0.56 -0.29 0.14 0.17 0.98
0.19 0.18 -0.04 -0.55 -0.44 -0.72 -0.2 0.13 0.46 0.31 0.25 -0.07
0.01 -0.07 -0.15 -0.08 -0.04 -0.13 0.05 -0.0 0.09 0.2 0.12 -0.05
0.54 -0.1 -0.33 -0.5 -0.23 -0.4 -0.04 0.15 0.02 0.2 -0.0 0.33
0.12 -0.13 -0.14 0.01 -0.1 -0.16 -0.0 0.16 0.17 -0.12 -0.05 0.18
-0.11 0.02 -0.13 -0.3 0.11 -0.2 0.13 0.25 0.08 -0.05 -0.0 0.11
-0.48 0.05 -0.32 -0.11 0.08 -0.21 -0.05 0.29 0.17 0.14 0.1 0.15
0.05 -0.03 -0.3 -0.06 -0.13 -0.19 -0.13 0.06 0.23 0.05 0.19 0.16
0.09 -0.11 -0.04 0.01 -0.06 -0.07 0.04 -0.01 0.06 -0.01 0.17 -0.07
0.32 -0.74 0.31 -0.87 -0.01 -1.22 -0.1 0.4 0.15 0.06 0.34 0.35
0.0 -0.58 -0.11 0.1 -0.24 -0.22 0.12 0.01 0.07 0.32 0.41 -0.14
0.06 -0.15 -0.16 0.01 0.01 -0.14 -0.15 0.04 0.15 0.01 0.09 0.19
-0.3 -0.33 -0.4 -0.09 0.07 0.03 0.02 0.26 0.23 0.14 -0.2 0.34
- - 0.89 -0.09 -0.33 -2.19 0.9 1.64 -1.21 -2.02 0.77 -0.3
-0.11 -0.1 0.03 -0.0 -0.08 -0.04 -0.02 0.32 0.05 -0.09 -0.01 -0.0
0.06 0.03 -0.03 -0.0 -0.06 -0.13 -0.15 0.03 0.05 0.03 0.12 0.03
-0.39 -0.08 -0.4 -0.27 -0.01 0.26 -0.04 0.26 0.17 0.2 0.12 -0.02
-0.09 0.04 -0.11 -0.13 0.01 -0.12 -0.02 0.14 0.0 0.05 0.07 0.13
-0.03 -0.05 -2.13 -1.28 -0.37 -1.28 -0.72 -1.35 -0.37 0.48 1.51 1.14

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.