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Heatmap: Cluster_199 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
1.07 -0.21 -0.53 -0.79 -0.7 -0.27 -0.43 0.32 -0.56 0.35 0.34 0.16
0.24 0.27 0.07 -0.02 -0.15 -0.16 -0.22 -0.04 -0.06 -0.01 0.06 -0.06
0.16 0.42 0.05 0.11 -0.0 -0.07 -0.49 -0.03 0.01 0.02 -0.34 -0.04
1.54 -0.04 - - -0.8 0.05 -0.19 0.78 -0.93 0.04 0.38 0.08
0.15 0.3 0.14 0.09 -0.21 0.03 -0.0 -0.11 -0.12 -0.08 -0.16 -0.11
0.1 0.21 0.05 -0.17 -0.12 -0.13 -0.02 0.01 -0.11 -0.01 0.09 0.05
-0.32 1.83 -0.98 -1.21 -0.41 -2.36 -1.4 -2.2 0.48 0.54 0.01 0.37
1.13 0.7 0.46 -0.22 -1.12 -0.25 -0.58 -0.04 -1.47 -0.45 -0.21 0.07
0.62 1.13 0.56 -0.22 -1.97 -0.32 -1.05 -0.35 -1.37 -0.3 0.02 0.5
0.79 0.85 -0.52 -1.12 -0.89 -0.16 0.17 -0.87 -0.34 0.06 0.08 0.39
0.32 0.39 0.1 -0.08 -0.34 -0.05 -0.14 -0.09 -0.21 -0.03 0.08 -0.11
0.12 0.3 0.06 -0.05 -0.14 -0.09 -0.17 0.01 -0.16 0.03 -0.07 0.1
0.2 0.15 -0.17 -0.06 -0.19 0.0 0.02 0.23 -0.24 -0.05 -0.0 0.02
0.72 0.38 0.11 -0.2 -0.33 -0.75 -0.36 -0.23 -0.42 -0.25 0.23 0.41
-0.35 0.28 0.51 1.69 -0.85 -2.14 -2.4 -0.94 -0.08 0.49 -0.92 -0.04
-0.3 0.64 0.36 0.08 0.36 -0.22 -0.55 -0.09 -0.84 -0.4 0.16 0.12
0.04 0.02 0.43 0.04 -0.23 0.08 0.09 0.07 -0.02 -0.18 -0.12 -0.36
-0.37 1.13 -0.24 0.32 -1.29 -0.24 -0.13 -0.34 -1.76 0.2 0.31 0.37
0.51 0.65 -0.17 0.04 -0.17 -0.84 0.24 -0.06 -0.75 -0.74 0.08 0.32
-0.04 0.26 0.14 0.45 -0.22 -0.25 -0.06 -0.05 -0.09 -0.12 -0.29 0.07
0.59 1.55 0.31 -0.84 -1.75 -0.08 -0.05 -2.97 -0.58 0.32 0.24 -1.6
0.34 0.37 0.1 -0.19 -0.2 -0.15 -0.23 0.02 -0.15 -0.12 0.04 0.02
-1.0 0.67 0.09 1.12 -0.55 0.32 0.16 -0.24 -0.88 -1.26 0.52 -1.41
0.2 1.04 -0.58 -3.0 0.25 -0.35 0.33 -2.17 0.41 0.48 0.37 -0.9
1.54 0.14 0.87 -0.17 -0.89 - -0.72 0.77 -0.68 -0.82 -0.45 -0.97
0.03 0.16 0.17 -0.0 -0.0 0.03 -0.01 -0.02 -0.11 -0.09 -0.11 -0.09
0.11 0.05 -0.02 -0.09 -0.16 -0.06 -0.01 0.07 -0.11 0.04 0.07 0.08
0.13 0.18 0.09 0.17 -0.05 -0.15 -0.02 -0.08 -0.09 0.01 -0.02 -0.21
0.06 0.2 0.09 -0.12 -0.21 -0.18 -0.08 -0.01 -0.09 0.01 0.05 0.2
0.12 0.08 0.89 0.19 -0.0 -0.92 0.24 0.43 -0.93 0.41 -0.24 -3.12
0.9 0.89 0.23 0.4 -0.33 -0.99 -0.26 -0.44 -1.22 -1.13 -0.13 0.16
-0.95 0.8 -0.05 -0.78 0.13 -0.18 -1.22 -0.09 0.11 0.82 0.05 -0.05
1.58 0.6 -1.41 -0.21 -3.51 -1.78 0.0 0.42 -2.24 0.02 0.06 0.34
-0.91 0.28 -0.24 -0.06 0.13 -0.02 -0.09 0.4 -0.03 0.7 -0.46 -0.36
0.7 0.44 0.37 -0.16 -0.27 1.05 -0.15 -0.0 -0.69 -0.31 -0.86 -3.91
-0.03 0.55 0.48 -0.14 -0.9 0.93 -1.04 0.19 -0.41 0.08 -0.5 -0.58
0.46 0.2 -0.33 0.08 -0.63 -0.18 0.2 -0.12 -0.24 -0.39 0.18 0.36
0.4 0.55 0.59 0.4 -0.25 0.09 -0.07 -0.53 -0.66 -0.33 -0.68 -0.34
1.67 0.36 -0.37 -1.02 -1.41 -0.56 -0.58 0.41 -0.95 -0.33 0.66 -1.59
-0.15 1.06 -0.14 1.1 -0.14 -1.48 -0.19 0.24 0.06 -0.75 -0.43 -1.9
-0.31 0.94 0.58 0.17 0.16 -0.2 -0.82 -0.15 -0.15 -0.27 -0.02 -1.05
0.33 0.4 0.17 -0.09 -0.65 -0.35 -0.07 -0.33 -0.19 -0.05 0.04 0.4
0.35 0.66 0.34 0.07 -0.57 -0.28 -0.26 -0.05 -0.88 -0.22 0.06 0.12
0.32 0.63 0.73 0.83 0.02 -1.07 -0.13 -0.05 -0.68 -0.86 -1.19 -0.36
-0.36 0.49 0.45 -0.01 -0.29 0.07 -0.21 -0.19 -0.98 -0.0 0.09 0.36
0.07 0.17 0.47 0.5 -0.15 0.04 -0.46 0.05 -0.36 -0.75 -0.12 0.06
1.58 - -1.53 -1.16 0.37 -1.33 -1.33 0.87 0.18 -1.17 1.45 -
0.27 0.06 0.0 -0.02 -0.22 0.01 -0.19 0.06 -0.18 0.05 -0.17 0.23
1.41 -0.9 0.13 -3.59 -0.4 0.34 -0.26 0.11 -1.45 -0.57 0.39 0.44
0.05 0.26 -0.02 0.14 -0.06 -0.29 0.13 0.01 -0.13 -0.04 -0.17 0.05
0.1 0.39 0.24 0.43 -0.05 -0.09 -0.43 -0.01 -0.49 -0.09 -0.14 -0.16
0.31 1.04 0.4 -0.34 0.16 -0.34 -0.7 -1.51 0.91 -0.5 -0.06 -2.42
-0.08 0.15 0.13 0.1 0.04 -0.14 0.08 -0.03 -0.13 -0.12 -0.01 -0.03
0.31 0.27 0.15 -0.03 -0.18 -0.04 -0.11 -0.23 -0.23 -0.01 -0.04 -0.0
0.35 0.52 0.22 0.02 -0.39 -0.03 -0.23 -0.08 -0.61 -0.25 -0.09 0.19
0.01 0.19 0.17 0.11 -0.18 -0.06 -0.08 -0.0 -0.2 -0.07 0.01 0.04
2.39 0.6 - - - - - - - 1.42 0.48 0.22
-0.2 0.61 0.24 -0.48 -0.13 -0.07 -0.09 -0.05 -0.6 -0.01 -0.01 0.37
0.54 0.28 -0.07 -0.24 -0.3 -0.01 -0.27 -0.03 -0.21 -0.03 -0.35 0.36
0.15 0.17 0.22 -0.34 -0.32 0.35 0.06 -0.15 -0.39 -0.18 -0.71 0.62
0.17 0.22 0.04 -0.16 -0.21 -0.17 -0.2 -0.02 -0.07 -0.07 0.2 0.16
0.83 0.48 -0.6 -0.6 0.02 -0.61 -0.1 0.03 -0.15 -0.17 0.24 -0.13
0.27 0.29 0.09 0.42 -0.23 0.4 -0.39 0.1 -0.43 -0.29 -0.11 -0.59

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.