Heatmap: Cluster_86 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.5 0.01 0.27 -0.3 -0.03 -0.16 -0.04 0.25 0.2 0.18 0.08 -0.15
-0.09 0.34 0.43 -0.08 -0.11 -0.19 -0.06 0.1 0.02 0.01 -0.2 -0.37
0.65 0.19 0.23 0.19 0.13 0.02 -0.03 0.04 0.2 -0.4 -1.04 -1.13
-1.9 0.05 0.62 0.37 0.13 -0.07 -0.16 -0.36 -0.23 0.37 0.03 -0.02
-0.35 0.55 0.57 -0.01 0.06 -0.47 -0.19 -0.37 0.18 0.31 -0.64 -0.23
-0.09 -0.04 -0.08 -0.46 0.32 0.15 0.11 0.44 -0.02 -0.2 -0.62 0.15
-0.24 0.19 0.29 -0.26 -0.11 -0.22 -0.16 0.04 0.04 0.18 0.06 0.06
0.27 0.6 0.79 -0.03 -0.36 -0.33 -0.41 -0.38 -0.38 -0.09 -0.05 -0.33
0.63 0.19 0.29 -0.61 0.34 -0.3 -0.23 -0.15 0.33 0.07 -0.59 -0.67
0.04 0.41 0.64 -0.11 -0.32 -0.5 -0.18 -0.15 -0.28 0.1 -0.03 -0.01
-0.46 0.75 0.77 -0.28 -0.54 -0.88 -0.11 -0.3 -0.26 0.22 -0.26 0.32
0.48 0.41 0.38 -0.01 0.08 -0.22 -0.09 0.27 -0.25 -0.38 -0.54 -0.68
-0.18 0.19 0.52 0.03 0.48 -0.09 -0.43 -0.35 -0.47 0.04 0.01 -0.14
-0.62 0.4 0.64 -0.73 0.16 0.2 0.02 0.38 -0.34 -0.11 -0.37 -0.34
0.21 0.76 1.02 0.12 0.03 -0.35 -0.08 0.24 -0.09 -0.86 -1.66 -1.73
0.09 0.5 0.58 -0.18 -0.28 -0.52 -0.07 -0.01 -0.17 0.03 -0.07 -0.3
0.12 0.58 0.52 0.0 -0.11 -0.23 -0.19 -0.03 -0.4 -0.28 -0.34 -0.04
0.25 0.24 0.26 -0.41 -0.09 -0.36 -0.29 0.33 -0.08 -0.01 -0.04 -0.03
-0.09 0.11 0.3 0.1 0.06 -0.21 -0.04 0.07 0.03 0.06 -0.2 -0.29
0.81 0.9 0.94 -1.08 0.36 -1.12 -0.83 -0.31 -1.59 -0.45 -0.7 0.26
0.38 0.67 1.25 -0.56 -0.22 -0.22 -0.76 -0.35 -1.48 -0.17 -0.75 0.15
-0.33 0.32 0.41 -0.25 0.01 -0.32 -0.17 -0.06 -0.01 0.2 -0.13 0.1
-1.3 -0.0 0.87 -0.17 0.75 0.08 0.04 -0.47 -0.43 0.4 -0.77 -0.43
0.3 -2.05 -2.43 -0.49 0.4 -2.2 0.36 1.33 0.11 0.63 -0.64 0.02
-0.05 -0.15 0.31 0.02 0.32 -0.12 -0.02 0.04 0.09 0.09 -0.36 -0.34
0.58 0.21 0.25 -0.07 0.1 -0.03 -0.11 0.04 -0.07 -0.5 -0.29 -0.48
0.03 0.04 0.07 -0.24 0.02 -0.27 -0.08 -0.06 -0.0 0.21 0.13 0.08
-0.03 0.62 0.71 -0.1 -0.02 -0.61 -0.23 0.07 -0.05 0.02 -0.72 -0.36
0.26 0.2 0.3 0.12 0.03 -0.23 0.07 -0.05 -0.08 -0.16 -0.26 -0.36
0.02 0.07 0.27 -0.11 -0.03 0.03 0.01 0.25 -0.2 -0.11 -0.09 -0.23
0.07 0.7 0.93 -0.59 -0.49 -1.03 -0.25 -0.16 -0.61 0.22 -0.04 0.04
0.37 0.3 0.28 -0.04 -0.03 -0.15 -0.01 0.18 -0.07 -0.32 -0.36 -0.42
-0.17 1.12 1.33 -0.31 -0.32 -0.83 -0.6 0.08 -0.8 -0.3 -1.11 -0.51
0.28 0.42 0.12 -0.09 -0.11 0.01 -0.12 0.0 -0.29 -0.29 -0.02 -0.06
-0.01 0.53 0.66 0.13 -0.33 -0.12 -0.16 0.47 -0.32 -0.35 -0.57 -0.67
0.02 0.14 0.24 -0.12 -0.06 -0.03 -0.03 -0.01 -0.09 -0.06 -0.04 -0.01
0.22 0.41 0.57 0.08 0.02 -0.29 -0.18 -0.01 -0.34 -0.3 -0.24 -0.29
-0.09 -0.1 0.36 -0.28 0.07 -0.13 0.18 0.21 -0.16 0.11 -0.09 -0.24
-0.56 0.14 0.31 -0.21 0.01 -0.0 0.08 0.04 -0.05 0.26 -0.01 -0.2
0.48 0.06 0.3 0.34 0.34 0.25 0.04 -0.21 -0.46 -0.49 -0.69 -0.6
0.43 0.41 0.31 0.09 0.19 -0.09 0.03 0.22 -0.72 -0.27 -0.82 -0.4
0.34 0.4 0.34 -0.08 -0.12 -0.13 -0.13 0.26 -0.36 -0.35 -0.08 -0.41
0.52 -0.13 0.4 -0.38 0.13 -0.48 -0.3 0.71 0.17 -0.01 -0.63 -0.9
0.68 0.63 0.77 -0.07 0.11 -0.51 -0.43 0.02 -0.07 -0.5 -1.05 -0.95
0.34 0.58 0.74 -0.2 -0.31 -0.43 0.06 0.34 -0.77 -0.53 -0.32 -0.41
-0.25 0.14 0.46 -0.11 0.0 -0.12 -0.04 -0.1 -0.16 0.15 -0.09 -0.02
-0.18 0.03 0.33 -0.05 0.01 -0.28 -0.18 0.09 0.1 0.13 -0.08 -0.02
-0.89 -0.03 1.05 0.1 0.08 -0.65 -0.18 -0.44 0.44 0.3 -0.87 -0.18
0.48 0.24 0.45 -0.25 0.14 -0.25 -0.13 0.06 -0.08 -0.07 -0.5 -0.48
0.33 1.03 1.24 -0.22 -0.49 -1.12 -0.34 -0.12 -0.73 -0.05 -1.24 -0.71
-1.42 0.19 0.96 0.45 0.35 -0.82 0.1 -0.41 -0.33 0.42 -0.64 -0.46
0.22 0.37 0.43 0.02 -0.04 -0.21 0.01 0.12 -0.12 -0.32 -0.23 -0.54
0.01 0.8 1.03 -0.18 -0.18 -0.53 -0.01 0.63 -0.56 -0.77 -1.06 -1.09
-0.99 0.01 0.22 0.08 0.47 -0.1 -0.13 -0.53 -0.33 0.52 -0.29 0.37
-0.24 0.17 0.32 -0.15 0.02 -0.12 -0.11 0.08 -0.04 0.15 -0.1 -0.06
0.64 0.34 0.18 -0.44 -0.07 -0.21 -0.02 0.06 0.06 0.12 -0.4 -0.81
-1.13 0.28 0.71 0.03 0.12 -0.25 -0.08 -0.48 -0.06 0.35 -0.18 -0.04
-0.09 0.53 0.52 -0.25 -0.31 -0.43 -0.28 0.18 -0.59 0.06 0.07 0.12
-0.33 0.11 0.48 -0.32 0.01 -0.07 -0.0 0.34 -0.19 -0.02 -0.14 -0.08
0.28 0.16 0.38 0.16 0.15 -0.07 -0.09 0.04 -0.19 -0.37 -0.49 -0.23
0.32 0.29 0.19 -0.25 -0.12 -0.14 -0.24 -0.13 -0.18 0.11 0.04 -0.04
0.52 0.97 0.56 0.07 -0.52 -0.5 0.12 0.34 -0.74 -1.02 -0.59 -0.79
-0.45 0.3 0.66 0.06 0.15 -0.2 0.02 -0.02 -0.05 -0.1 -0.44 -0.33
-1.95 -0.14 0.67 0.38 0.62 0.36 0.09 -0.32 -0.83 0.15 -0.65 -0.09
0.54 0.73 0.76 -1.11 0.27 -0.44 -0.56 0.58 -0.95 -0.31 -0.52 -0.76
-0.09 0.05 0.21 -0.23 0.04 -0.28 0.16 0.05 -0.02 0.17 -0.13 -0.03
-0.58 0.51 0.85 -0.87 -0.04 -0.89 -0.18 -0.12 -0.19 0.56 -0.24 0.06
0.23 0.37 0.53 0.17 0.05 -0.19 -0.08 0.14 -0.2 -0.51 -0.39 -0.57
0.48 0.3 0.46 0.11 0.12 -0.22 -0.27 0.09 -0.11 -0.35 -0.49 -0.61
0.25 0.6 0.63 -0.31 0.12 -0.51 -0.15 -0.11 -0.26 -0.11 -0.28 -0.42
0.1 0.11 0.01 -0.1 -0.08 -0.45 -0.38 0.19 0.11 0.33 0.18 -0.23
0.58 0.89 0.65 -0.88 0.14 -0.5 -0.32 -0.4 -0.61 -0.21 -0.57 -0.03
0.11 0.55 0.77 0.18 0.04 -0.46 -0.39 0.02 -0.27 -0.27 -0.47 -0.51
0.59 0.9 1.02 -0.05 0.07 -0.76 -0.15 0.58 -1.09 -0.99 -1.8 -1.55
-0.0 0.12 0.28 0.14 0.13 -0.05 -0.03 0.08 -0.03 -0.3 -0.22 -0.23
-0.27 0.42 0.58 -0.22 -0.51 -0.05 0.15 0.21 -0.63 0.33 -0.43 -0.16
-0.04 0.03 0.38 -0.05 0.18 -0.1 0.12 0.12 0.1 -0.12 -0.47 -0.36
1.08 2.18 2.42 - - - - - - - - -
-0.11 -0.08 0.28 -0.08 0.01 -0.17 -0.03 -0.19 0.07 0.12 0.04 0.07
0.23 0.15 0.3 0.02 -0.06 0.01 -0.09 0.22 -0.18 -0.3 -0.24 -0.2
0.05 0.26 0.55 -0.06 0.34 -0.25 -0.24 -0.37 -0.46 0.04 -0.29 0.06
0.05 0.25 0.34 0.06 -0.0 -0.07 0.04 0.1 0.2 -0.15 -0.39 -0.72
0.54 0.22 0.19 -0.29 -0.11 -0.4 0.01 0.41 -0.16 0.06 -0.33 -0.58
0.05 0.38 0.36 -0.11 -0.2 -0.2 -0.04 0.19 0.08 -0.15 -0.31 -0.26
-0.09 0.59 0.82 -0.04 0.01 -0.61 -0.79 -0.68 -0.41 0.23 -0.16 0.19
0.19 0.28 0.3 0.21 0.08 -0.21 0.04 0.05 -0.17 -0.23 -0.28 -0.5
0.07 0.19 0.44 -0.06 0.05 -0.08 -0.03 -0.0 -0.05 0.01 -0.22 -0.5
0.79 0.94 1.11 0.17 0.07 -0.86 -0.59 -0.03 -1.1 -1.07 -1.22 -1.13
0.17 0.13 0.35 -0.09 -0.07 -0.25 -0.19 -0.01 -0.09 -0.06 -0.01 -0.0
-0.3 0.19 0.7 -0.17 0.12 -0.35 -0.16 -0.15 0.05 0.3 -0.26 -0.39
-0.35 0.15 0.43 0.17 0.07 -0.24 -0.15 -0.17 -0.09 0.18 0.07 -0.28
-2.58 0.07 0.9 0.19 0.12 -0.39 -0.04 -0.16 0.04 0.39 -0.25 -0.19
-0.34 0.69 0.64 0.15 -0.18 -0.15 -0.14 0.13 -0.64 -0.24 -0.15 -0.42
-0.16 0.08 0.21 -0.06 0.03 -0.08 0.01 0.26 0.05 0.05 -0.23 -0.26
-0.5 0.55 0.75 -0.25 0.21 -0.15 -0.51 -0.16 -0.46 0.28 -0.31 -0.15
0.2 0.94 0.81 -0.06 -0.55 -0.94 -0.53 -0.63 -0.33 0.18 -0.37 -0.05
0.27 0.49 0.86 -0.98 0.53 -0.6 -0.09 0.24 -0.49 -0.05 -0.73 -0.82
0.96 0.15 0.38 -1.12 0.47 -0.63 -0.29 0.65 -0.23 -0.25 -0.67 -1.15
-0.36 0.04 0.5 -0.01 -0.15 -0.37 -0.32 -0.46 0.01 0.42 0.04 0.27
-2.0 -0.28 0.56 0.52 0.44 0.12 -0.01 -0.29 -0.13 0.28 -0.36 -0.23
0.22 0.73 0.85 -0.48 0.19 0.01 -0.62 -0.21 -0.58 -0.17 -0.87 -0.17
0.66 0.6 0.61 -0.67 0.09 -0.38 -0.09 -0.07 -0.06 -0.27 -0.87 -0.54
-0.07 0.16 0.55 0.05 0.11 -0.11 -0.1 -0.11 0.02 -0.02 -0.34 -0.38
0.74 0.3 0.05 -0.46 0.19 -0.35 -0.44 0.13 -0.08 -0.16 -0.16 -0.23
0.47 0.97 1.04 -0.17 -0.56 0.04 -0.68 -0.42 -1.45 0.25 -1.46 -0.49
0.3 0.38 0.28 -0.22 -0.1 -0.15 -0.03 0.24 -0.13 -0.13 -0.24 -0.45
0.45 0.56 0.54 -1.04 -0.13 -0.79 -0.5 0.4 -0.34 0.17 -0.26 -0.07
0.38 0.54 0.67 -0.66 0.22 -0.45 -0.61 -0.21 -0.77 0.28 -0.59 0.19
0.02 0.4 0.79 -0.12 0.41 -0.12 -0.17 -0.2 -0.03 -0.12 -0.94 -0.78
0.47 0.45 1.23 -0.1 -0.09 -1.96 0.13 0.35 -0.79 -0.51 -1.59 -0.34
0.17 0.44 0.44 -0.2 -0.08 -0.22 -0.06 0.02 -0.07 -0.07 -0.31 -0.34
-0.12 0.3 0.63 0.01 0.12 -0.07 -0.04 0.25 -0.2 -0.22 -0.4 -0.68
0.04 0.04 0.17 0.13 0.07 0.02 -0.02 0.04 0.03 -0.14 -0.15 -0.29
2.01 1.24 0.92 - 1.28 -0.47 - - - -0.84 - -
-0.35 0.24 0.59 -0.02 0.11 0.02 0.1 0.05 -0.08 -0.05 -0.47 -0.49
-0.14 0.74 1.1 -0.8 0.3 -0.8 -0.65 0.34 -1.28 -0.08 -0.61 -0.03
-0.57 0.96 0.95 -0.74 -0.38 -1.18 -0.46 -0.64 -0.18 0.42 -0.4 0.36
-0.75 0.04 0.32 -0.06 -0.01 -0.03 -0.03 -0.17 0.11 0.23 0.01 0.09
0.51 0.1 0.42 0.1 0.26 -0.01 -0.03 0.07 -0.22 -0.51 -0.59 -0.64
0.38 0.34 0.28 -0.05 -0.3 -0.5 0.03 0.17 -0.19 0.08 -0.22 -0.32
-0.1 0.29 0.32 -0.06 -0.15 -0.25 -0.16 -0.14 0.01 0.15 -0.16 0.11
0.14 0.32 0.21 -0.33 -0.06 0.07 -0.26 -0.04 -0.1 0.07 -0.1 -0.04
-0.29 0.2 0.46 0.11 0.1 -0.2 -0.34 -0.23 -0.27 0.1 0.02 0.1
-1.61 0.03 0.58 0.39 -0.02 0.3 0.16 -0.08 -0.63 -0.04 0.06 -0.16
0.27 0.18 0.45 0.13 0.27 -0.08 -0.09 -0.04 -0.05 -0.32 -0.57 -0.5
0.93 0.5 0.58 0.35 0.28 -0.14 -0.39 -0.11 0.03 -0.93 -1.72 -1.94
0.19 0.18 0.05 -0.1 -0.05 -0.08 -0.03 0.12 -0.11 -0.14 -0.05 -0.03
0.08 0.08 0.46 -0.55 0.03 -0.5 -0.01 0.0 -0.25 0.31 -0.09 0.1
0.38 0.29 0.49 -0.3 -0.02 -0.59 -0.22 0.18 -0.05 -0.28 -0.09 -0.18
-0.32 0.2 0.43 0.23 0.14 -0.21 -0.09 -0.15 -0.06 -0.05 -0.22 -0.11
0.34 0.25 0.42 -0.27 -0.18 -0.45 -0.13 0.21 0.06 0.1 -0.25 -0.43
-0.15 0.19 0.47 -0.11 -0.11 -0.28 -0.04 0.18 -0.22 0.0 -0.19 0.09
0.76 0.72 1.11 -1.01 -0.22 -1.41 -0.03 0.13 -1.44 -0.13 -0.51 -0.52
0.09 0.4 0.63 -0.33 -0.34 -1.31 0.09 -0.22 -1.25 0.43 0.04 0.45
-0.15 0.3 0.48 0.15 0.04 -0.15 0.13 0.3 -0.43 -0.36 -0.3 -0.34
-1.42 0.28 0.84 0.04 0.14 -0.44 -0.11 -0.0 -0.04 0.25 -0.25 -0.28
-0.12 0.39 0.39 -0.31 -0.04 -0.12 -0.3 0.14 -0.04 0.11 -0.06 -0.27
0.52 0.38 0.14 -0.23 0.01 -0.13 0.08 -0.07 -0.32 -0.26 -0.36 -0.05
-2.52 -0.05 0.47 -0.26 0.26 -0.57 0.24 0.22 0.39 0.46 -0.5 0.04
-0.15 0.02 0.27 -0.26 0.06 -0.19 0.11 0.02 0.06 0.07 0.01 -0.11
0.05 0.37 0.42 -0.13 -0.08 -0.27 -0.28 -0.2 -0.22 0.08 0.01 0.04
-0.17 0.2 0.31 -0.1 0.03 -0.09 -0.07 -0.14 0.01 0.08 -0.07 -0.08
0.07 0.31 0.61 -0.26 0.03 -0.29 -0.54 -0.29 -0.2 0.06 0.1 0.02
-0.62 -0.38 0.93 0.04 0.34 -1.33 -0.28 0.14 -0.72 0.44 -1.1 0.7
-2.01 0.24 0.8 0.14 0.14 -0.51 -0.17 -0.36 0.1 0.48 -0.29 -0.03
-0.05 0.12 0.05 -0.08 0.04 0.02 -0.04 0.0 0.05 0.0 -0.05 -0.08
0.18 0.26 0.21 -0.38 -0.07 -0.45 -0.22 0.14 -0.17 0.12 -0.02 0.17
-0.24 0.44 0.5 -0.53 -0.31 -0.51 -0.23 -0.09 -0.02 0.44 -0.21 0.24
0.12 0.17 0.14 -0.27 0.02 -0.1 -0.08 -0.1 -0.04 0.06 0.04 -0.02
-0.3 0.0 0.88 -0.55 0.18 -0.44 -0.11 -0.14 0.01 0.26 -0.87 0.27
0.18 0.4 0.32 0.08 0.02 -0.2 -0.15 0.04 -0.09 -0.14 -0.37 -0.33
-0.11 -0.29 0.35 -0.1 0.11 -0.23 -0.07 0.18 0.16 0.11 -0.08 -0.17

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.