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Heatmap: Cluster_116 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.18 -0.31 0.07 0.1 0.06 0.06 -0.05 -0.15 -0.07 0.08 -0.0 0.28
-1.18 0.56 -0.36 -0.41 0.66 - 0.88 0.12 -1.46 0.1 -0.94 1.06
-0.75 -0.78 0.08 0.41 -0.73 0.07 0.17 -0.05 0.01 0.11 0.33 0.44
-0.32 -0.17 -0.01 0.01 0.05 -0.14 -0.07 0.08 0.11 0.14 0.13 0.11
-0.12 -0.12 0.5 0.4 0.2 -0.11 0.1 0.11 -0.12 -0.25 -0.36 -0.58
-0.27 0.01 0.26 0.51 0.2 -0.8 -0.23 0.36 -0.16 -0.02 -0.06 -0.24
-0.41 0.06 0.22 0.19 0.2 -0.19 -0.29 -0.3 -0.22 -0.08 0.18 0.38
-0.5 -0.1 0.01 0.5 -0.36 -0.32 -0.25 -0.2 0.09 0.2 0.22 0.33
-0.27 -0.73 -0.04 0.07 0.51 0.12 -0.14 -0.26 -0.09 -0.12 0.01 0.51
-0.14 -0.13 -0.01 -0.05 -0.16 -0.16 -0.2 -0.05 0.14 0.07 0.25 0.33
-1.26 0.7 0.37 1.34 -0.05 -1.01 0.16 -0.82 -0.83 -0.22 0.11 -1.0
- 0.25 0.38 0.5 0.31 0.18 0.14 -0.49 0.46 -1.52 - 1.13
0.01 -0.22 0.09 0.42 0.06 -0.39 -0.27 -0.08 0.23 -0.03 -0.04 0.05
-0.36 -0.58 0.09 0.36 0.12 -0.15 -0.12 -0.27 0.29 0.0 0.08 0.24
0.05 -2.95 0.39 0.48 0.27 -1.86 0.19 -0.31 0.09 0.02 -0.57 0.96
-0.07 -0.03 -0.15 0.14 -0.1 -0.16 -0.2 -0.1 0.16 0.16 0.17 0.1
-0.75 -0.35 -0.08 0.8 -0.17 -0.63 0.3 0.07 -0.5 0.26 0.03 0.25
-2.74 -0.8 -0.18 0.95 0.17 -0.19 -0.4 -0.09 0.04 0.38 0.1 0.44
-0.37 -0.19 -0.06 0.21 -0.13 0.2 -0.07 0.03 0.04 0.29 0.04 -0.14
0.21 0.26 -0.42 0.89 -1.26 0.17 -0.37 -1.16 -0.52 -0.49 -0.25 1.02
-0.08 -0.12 -0.01 0.1 -0.19 0.19 0.02 -0.44 0.25 0.11 -0.14 0.17
-0.83 -0.3 0.63 0.53 0.45 -0.12 0.0 0.04 -0.05 -0.32 -0.27 -0.47
-0.3 -0.07 0.02 0.15 -0.09 -0.14 -0.05 0.1 0.02 0.16 0.05 0.08
-0.49 -0.12 1.19 1.08 -0.52 -1.4 0.0 -0.91 -0.51 -0.26 -0.19 -0.08
-0.71 -0.42 0.87 - -0.58 -1.19 0.84 -2.04 0.23 -1.21 -0.06 1.64
0.26 -0.17 -0.85 0.34 -0.12 -0.76 0.28 0.05 -0.28 -0.27 -0.81 1.07
-0.71 0.18 0.26 1.03 -0.02 -0.64 -0.22 -0.81 0.07 -0.13 0.18 -0.22
-0.47 0.21 0.28 0.78 0.21 -0.61 0.02 0.14 -0.21 -0.34 -0.45 -0.19
-0.19 0.14 0.25 0.13 -0.09 0.14 -0.2 0.01 -0.15 0.01 -0.11 -0.02
-2.09 0.32 -0.07 1.41 -0.19 0.18 -1.56 0.51 -0.02 -0.1 -0.23 -1.42
-0.69 -0.29 0.41 1.04 -0.09 -0.22 0.19 -0.5 -0.14 -0.13 -0.21 -0.26
-0.44 -0.18 0.1 0.15 0.15 0.05 -0.11 -0.15 -0.01 0.05 0.23 0.03
-0.25 0.03 0.17 0.26 0.11 -0.16 -0.05 -0.01 0.0 -0.0 -0.11 -0.07
-1.22 -0.55 -0.45 0.52 0.3 -0.64 0.23 -0.13 -0.28 0.37 0.58 0.2
-0.28 -0.12 0.01 0.0 -0.02 -0.06 -0.04 0.01 0.09 0.06 0.04 0.25
-0.58 -0.22 0.55 -3.1 -1.7 - 1.4 -2.95 0.11 -0.54 -0.22 1.67
-1.25 -0.32 0.01 0.15 0.49 -0.71 0.44 -0.65 0.18 -0.4 -0.08 0.86
-0.56 -0.17 0.01 0.06 -0.02 0.18 -0.33 -0.05 0.12 -0.02 0.07 0.46
-0.13 -0.08 -0.0 -0.09 -0.02 -0.04 0.02 0.1 0.09 0.21 -0.08 -0.02
0.25 -0.36 1.11 1.43 0.37 -0.04 -0.43 -0.85 -1.83 -1.63 -1.82 -0.45
-0.9 0.05 0.45 0.39 0.17 0.29 -0.09 -0.21 -0.29 -0.39 -0.05 0.07
- -0.19 -1.4 1.66 -0.91 -0.91 -2.05 -0.81 -0.33 0.49 -0.34 1.44
0.06 0.06 -0.47 0.94 0.32 -0.59 -1.29 -2.51 0.01 0.96 0.04 -0.32
0.02 0.2 0.24 0.53 -0.04 -0.45 0.04 0.04 -0.21 -0.21 -0.5 0.03
0.25 -0.01 0.09 0.49 0.05 -0.51 -0.27 -0.26 0.04 -0.07 -0.07 0.04
-0.21 -0.1 -0.04 0.04 -0.06 0.03 -0.0 -0.03 0.06 0.13 -0.02 0.16
- 0.53 0.41 1.08 0.05 -1.5 0.43 -1.91 -0.13 -1.44 -0.82 1.17
- 0.99 0.12 1.08 -0.11 0.48 -0.36 -1.5 -2.17 -0.79 0.28 0.42
-0.07 0.2 -0.01 1.08 -0.35 -1.15 -0.56 -0.27 0.26 -0.07 -0.71 0.36
-0.2 -0.17 0.08 0.12 0.15 -0.06 -0.01 -0.21 0.12 0.0 0.0 0.1
-1.9 -0.39 -0.41 1.15 0.44 -0.64 -0.48 -1.68 -0.13 0.15 0.43 0.69
0.26 -0.1 0.05 0.41 0.08 -0.26 -0.58 -0.02 -0.17 -0.49 0.01 0.43
-1.5 - -0.12 1.31 -0.16 -3.4 0.0 -0.07 -1.26 -1.8 0.34 1.74
- -2.42 -0.1 1.02 -0.31 -2.94 -0.48 0.44 0.11 -2.92 0.18 1.81
-1.37 -0.06 0.28 1.44 -0.77 -0.09 0.18 -0.0 0.13 -0.0 -0.88 -1.16
-1.22 0.09 0.39 0.79 0.35 -0.14 -0.45 -0.38 -0.53 0.01 0.19 -0.08
-0.11 -0.15 0.24 0.25 -0.04 -0.2 -0.09 0.02 0.02 0.07 -0.06 -0.04
-0.23 0.5 0.34 -0.06 -0.53 0.23 -0.09 -0.55 -0.34 -0.0 -0.0 0.3
-0.26 -0.18 0.05 0.05 0.21 -0.05 -0.0 -0.21 -0.17 0.05 0.19 0.23
-2.0 -2.77 -1.01 1.78 -0.09 -1.09 0.09 1.11 -2.07 -2.24 -2.9 1.29
-0.31 -0.98 0.1 1.47 -0.32 0.41 0.26 -0.37 0.39 -0.93 -0.98 -1.33
-0.41 -0.53 0.65 0.65 0.52 -0.13 0.12 0.08 -0.26 -0.46 -0.87 -0.27
-0.05 -0.57 -0.17 0.29 -0.19 -0.8 0.09 0.18 -0.89 0.11 0.01 0.99
-0.16 -0.09 -0.05 0.14 -0.05 -0.34 -0.13 0.04 0.16 0.11 0.03 0.25
-0.45 -0.05 0.27 0.41 0.04 -0.11 -0.16 -0.28 -0.09 0.04 0.05 0.12
-1.32 0.43 0.58 0.59 -0.21 -0.88 -0.98 -1.88 0.43 -0.01 -0.76 1.09
-0.18 -0.14 0.44 0.35 0.27 -0.13 0.14 0.22 -0.33 -0.01 -0.48 -0.55
0.21 0.8 -0.06 -0.65 0.86 - -0.35 - -0.38 -2.06 -0.4 1.65
- -0.77 -0.43 0.67 -0.64 0.23 0.35 - -1.73 -0.91 0.91 1.71
- 0.69 -0.54 0.24 0.1 -1.29 0.62 -0.5 -0.67 1.09 -2.15 0.86
-1.86 -0.12 -0.07 1.11 -0.27 0.13 -0.52 0.49 -0.34 0.37 -0.34 -0.32
-0.08 -0.55 -0.12 0.02 0.12 0.12 -0.19 -0.19 0.25 0.1 0.0 0.31
-1.23 0.49 0.06 0.61 0.13 -0.65 -0.44 -0.72 0.23 0.35 0.17 -0.07
-0.67 -0.46 -0.27 0.7 0.02 -0.57 -0.35 -0.0 0.07 0.2 0.25 0.42
- - 0.53 2.18 - - 1.21 0.04 0.28 0.56 - -
-0.65 0.08 0.26 0.95 0.19 -0.8 -0.1 -1.07 -0.17 -0.14 0.43 -0.14
- -0.55 0.52 1.84 - -2.13 0.82 -1.43 -0.59 - - 1.71
-0.17 0.02 0.23 0.24 0.22 -0.14 -0.1 -0.03 -0.05 -0.23 -0.03 -0.06
0.43 -0.66 -0.76 -0.57 -1.08 -0.68 0.33 0.02 0.16 -0.0 -0.14 1.24
-1.28 0.17 -0.39 0.11 1.06 0.35 -1.27 -0.6 -0.07 -0.99 -1.5 1.25
-1.47 -2.33 0.71 1.79 0.54 -0.6 0.42 -0.55 -0.56 -1.23 -1.63 -0.36
-1.83 -0.11 0.05 0.84 0.07 -0.31 -0.38 0.14 0.28 0.02 -0.07 0.09

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.