Heatmap: Cluster_242 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9.93 15.02 17.36 21.97 14.97 18.84 18.43 18.71 16.34 9.4 15.1 18.36
3.6 4.48 6.2 6.28 5.49 5.95 6.79 3.78 5.02 5.89 5.34 2.89
16.57 17.24 19.47 18.98 20.55 19.79 18.66 21.38 20.53 18.97 19.93 21.75
4.79 8.94 11.33 4.73 11.17 7.47 9.88 8.31 6.63 8.53 2.35 4.7
1.77 3.01 2.68 3.61 3.17 3.53 2.94 2.8 2.65 2.39 2.77 2.95
2.44 3.15 2.51 2.06 2.82 1.85 3.33 3.14 0.73 2.86 2.21 2.65
1.36 1.23 0.75 1.33 0.92 0.0 1.41 0.25 0.97 1.34 0.39 0.11
0.61 1.12 0.39 0.95 0.83 0.64 0.39 2.56 0.89 0.66 0.57 1.15
71.31 49.37 76.35 67.34 63.74 46.13 71.59 46.87 54.09 56.69 55.24 70.3
0.04 0.0 0.17 0.13 0.02 0.1 0.06 0.09 0.07 0.03 0.06 0.13
4.41 5.07 5.25 3.81 3.54 1.86 3.87 5.82 3.68 4.3 3.68 4.16
37.26 33.9 34.94 37.55 34.27 33.95 32.76 37.69 35.83 33.61 33.96 36.51
3.53 3.84 3.84 3.42 3.54 4.18 4.43 4.64 3.88 4.24 4.03 4.22
0.17 0.16 0.15 0.04 0.17 0.09 0.22 0.09 0.13 0.28 0.06 0.02
5.98 6.1 11.98 10.38 9.9 10.61 13.38 10.37 8.26 11.87 9.09 9.97
0.0 0.2 0.28 0.0 0.11 0.14 0.13 0.13 0.31 0.0 0.0 0.0
0.0 0.45 0.89 0.29 0.88 0.3 0.85 0.62 0.12 0.24 0.0 0.07
0.0 0.05 0.16 0.02 0.05 0.11 0.02 0.02 0.02 0.03 0.0 0.07
3.23 3.24 3.44 3.71 2.86 2.53 3.31 2.64 3.17 2.91 3.22 3.35
6.42 9.57 10.33 8.5 8.85 9.9 11.53 9.84 7.56 5.51 7.73 8.0
49.17 45.28 43.48 33.21 39.62 37.86 49.93 32.77 36.09 42.46 46.31 48.37
4.27 4.89 7.03 8.29 7.01 5.03 7.19 8.26 6.12 5.74 5.74 6.08
0.07 0.21 0.61 0.43 0.41 0.6 0.26 0.17 0.64 0.47 0.47 0.03
2.96 2.93 2.94 3.33 2.75 3.76 4.1 2.35 2.93 2.91 2.89 1.84
0.48 0.6 0.4 0.79 0.68 0.66 0.66 0.66 0.64 0.77 0.56 0.46
0.74 0.76 0.88 1.56 1.24 0.74 0.68 0.74 0.96 1.05 0.87 0.63
2.0 1.98 3.17 3.01 3.12 2.54 3.01 3.85 2.49 2.66 2.37 2.59
2.11 4.44 4.66 3.69 3.82 2.96 5.26 4.92 4.45 3.64 5.35 6.18
0.28 1.04 1.23 0.41 1.13 0.58 0.63 1.05 0.6 0.77 0.17 0.14
1.93 2.89 4.67 4.39 4.44 3.13 3.86 4.04 3.61 3.12 3.18 2.93
0.11 0.23 0.11 0.38 0.22 0.09 0.48 0.5 0.32 0.11 0.12 0.35
11.43 9.17 11.49 14.85 11.15 10.15 8.99 14.04 8.85 10.76 10.52 8.42
0.0 0.0 0.09 0.06 0.1 0.06 0.03 0.0 0.12 0.06 0.12 0.0
0.07 0.09 0.18 0.06 0.12 0.21 0.17 0.17 0.05 0.07 0.0 0.09
14.55 17.61 14.85 14.39 16.8 16.93 18.12 19.47 16.77 17.07 17.94 16.37
4.03 4.4 5.77 5.93 6.09 5.17 5.28 5.11 4.99 4.81 5.57 5.33
26.54 27.31 31.28 27.4 26.85 24.8 29.65 25.57 28.04 29.32 27.86 28.27
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0
0.7 0.58 0.55 0.56 0.58 0.35 0.63 0.87 0.77 0.71 0.36 0.89
0.39 0.09 0.29 0.18 0.12 0.02 0.18 0.07 0.15 0.37 0.08 0.0
29.38 24.82 26.69 30.92 26.81 26.66 24.16 33.72 20.68 25.9 29.15 27.91
0.0 0.09 0.46 0.17 0.31 0.42 0.31 0.6 0.48 0.25 0.08 0.36
51.34 56.79 60.07 60.73 54.57 52.92 60.62 61.82 56.89 52.76 59.38 57.02
1.52 2.71 4.37 4.79 3.32 4.36 2.31 2.84 2.99 4.26 2.69 3.64
1.55 0.99 2.02 1.72 2.0 2.49 2.37 1.97 1.0 1.72 1.89 2.33
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
9.22 11.4 9.4 9.83 8.07 6.6 9.43 8.75 8.15 6.6 8.7 8.42
2.19 1.56 2.43 2.38 2.48 2.2 2.12 1.13 2.33 2.22 1.84 2.68
2.09 1.94 3.12 3.34 1.01 1.3 2.96 1.88 1.58 2.33 1.32 1.81
11.64 7.39 14.91 15.93 10.99 8.85 11.64 14.76 13.6 11.46 12.39 11.26
15.4 14.98 13.74 15.88 14.03 13.87 15.71 15.27 14.11 15.86 14.76 13.26
0.0 0.23 0.74 0.44 0.3 1.0 0.32 0.88 0.08 0.17 0.0 0.19
1.02 1.07 1.37 1.71 1.15 1.37 1.26 2.33 2.5 2.19 1.72 2.19
14.21 25.03 29.65 24.48 24.32 28.29 23.61 23.16 23.0 25.57 22.7 15.3
0.29 0.21 0.89 0.53 1.03 0.57 0.18 1.1 0.54 0.78 0.08 0.19
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.02 0.01 0.04 0.0 0.0
14.47 12.05 14.38 14.44 12.91 14.83 16.23 17.09 15.07 18.31 17.6 15.04
0.0 0.07 0.04 0.0 0.04 0.04 0.02 0.0 0.05 0.02 0.02 0.02
3.04 3.12 3.0 1.54 2.12 2.17 3.77 3.31 1.96 1.85 2.35 4.05
0.59 1.28 3.33 2.1 1.6 2.41 1.95 2.56 1.65 1.39 1.17 1.4
0.28 0.17 0.56 0.45 0.84 0.67 0.06 0.52 0.88 0.36 0.4 0.27
6.94 7.71 6.59 6.01 6.67 6.28 7.74 11.85 9.74 7.2 5.81 10.52
2.74 2.53 3.1 2.81 3.45 3.32 4.61 5.57 3.33 4.27 3.18 2.47
3.28 3.57 3.75 2.68 2.93 3.73 3.4 4.46 3.58 3.02 3.21 3.71
0.84 0.7 1.52 1.27 0.59 0.94 0.65 0.88 0.68 0.82 1.06 1.42
0.32 0.73 1.02 0.98 0.89 0.25 0.57 0.65 0.81 0.7 0.85 0.3
0.0 0.06 0.08 0.02 0.02 0.04 0.13 0.14 0.02 0.07 0.02 0.02
0.07 0.1 0.0 0.0 0.19 0.0 0.05 0.38 0.05 0.14 0.0 0.22
0.53 7.11 2.63 1.5 5.16 0.7 7.14 6.91 5.19 5.92 6.04 2.93
2.08 1.76 2.96 1.69 3.17 2.78 2.2 2.79 2.56 2.19 2.7 1.82
0.0 0.1 0.31 0.0 0.23 0.16 0.28 0.23 0.12 0.32 0.13 0.11
1.06 1.36 2.2 0.9 1.61 1.21 1.68 0.77 0.89 1.3 1.05 1.2
0.8 0.87 0.87 1.09 0.48 1.63 0.99 2.46 0.71 0.76 0.8 1.04
16.69 17.18 18.35 22.35 21.55 17.77 21.74 21.69 19.17 20.18 17.7 19.33
0.81 1.07 1.57 1.3 1.12 1.02 1.58 0.99 1.13 1.02 0.96 0.98
0.56 0.37 0.86 1.02 0.7 0.69 1.04 0.85 1.01 1.01 0.69 0.5
0.0 0.15 0.07 1.22 0.13 0.0 0.06 0.64 0.15 0.0 0.21 0.58
2.17 7.22 8.12 4.18 8.08 8.0 9.79 7.49 5.4 6.11 4.66 4.39
2.56 5.0 6.28 3.29 6.53 4.68 5.3 5.7 4.75 3.45 3.85 2.42
0.21 0.07 0.7 0.06 0.05 0.4 0.21 0.13 0.18 0.05 0.0 0.11
0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.07 0.05 0.04 0.04 0.03 0.08 0.03
2.88 2.32 1.77 1.65 2.47 1.69 3.77 4.04 2.2 2.65 1.75 2.3
0.66 0.55 1.69 1.02 0.5 0.49 1.26 0.45 0.46 0.73 0.49 0.06
0.18 0.13 0.22 0.17 0.14 0.11 0.2 0.15 0.13 0.13 0.15 0.15
0.0 0.0 0.38 0.0 0.07 0.18 0.11 0.0 0.0 0.1 0.08 0.0
0.0 0.0 0.52 0.17 0.1 0.2 0.13 0.09 0.25 0.15 0.34 0.12
8.23 8.59 7.82 9.4 5.45 7.25 5.8 10.86 10.65 7.8 8.43 8.58
0.35 0.47 0.33 0.22 0.33 0.19 0.42 0.63 0.41 0.27 0.42 0.32
0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.14 0.08 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.45 1.6 1.14 1.28 1.2 1.34 1.08 1.47 1.32 1.03 0.47 0.69
0.23 0.09 0.48 0.19 0.5 0.41 0.29 0.6 0.25 0.16 0.06 0.18

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)