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Heatmap: Cluster_160 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.36 -0.03 -0.02 0.08 0.08 0.1 -0.06 0.07 -0.13 -0.01 0.09 0.11
0.12 -0.6 -0.53 - 0.5 1.16 -0.29 0.39 0.25 0.07 0.06 -1.0
-0.56 -0.42 -0.06 0.18 0.16 0.29 -0.07 0.27 -0.04 0.1 -0.29 0.17
- -0.65 0.4 0.32 - - 0.7 2.05 - 0.67 0.52 -
-0.26 -0.22 -0.13 -0.04 0.18 0.13 0.1 0.09 0.23 0.13 0.02 -0.35
-1.49 - - - 1.31 0.91 0.12 1.38 -0.49 0.16 0.67 -2.51
0.01 -0.92 -0.37 0.4 -0.26 0.61 -0.14 -0.34 -0.01 0.46 -0.03 -0.05
-0.34 -0.24 -0.02 0.01 0.09 0.32 0.02 0.04 0.05 -0.01 -0.13 0.09
-0.18 0.41 -0.45 0.3 -0.11 0.09 -0.27 0.82 -0.74 -0.55 0.07 -0.14
-1.71 -0.4 -0.11 0.04 0.18 0.77 0.55 -0.05 -0.09 -0.06 0.04 -0.34
-0.06 -0.04 -0.05 0.11 0.09 0.24 0.0 0.01 0.01 -0.16 -0.04 -0.18
-0.56 -0.44 0.02 -0.26 0.06 0.41 0.07 0.08 0.16 -0.04 -0.01 0.23
- -2.69 -3.16 -3.88 0.26 1.83 -1.11 1.17 -1.21 0.64 -0.29 0.5
-0.45 -0.74 0.11 -0.58 0.34 0.32 -0.14 0.23 -0.03 -0.02 -0.07 0.5
-0.05 -0.29 0.06 -0.36 0.13 0.27 -0.06 0.29 -0.14 -0.01 0.06 -0.04
-0.52 -0.35 0.27 -0.5 -0.09 1.11 -0.21 0.71 -0.23 -0.23 -0.65 -0.6
-1.71 -0.35 -1.44 - - 2.02 -0.01 0.86 0.76 0.24 -1.47 -1.22
-0.15 -0.17 0.05 0.01 -0.07 0.12 -0.08 0.06 -0.03 0.08 0.08 0.07
0.02 -0.12 -0.11 0.24 -0.09 -0.07 -0.47 -0.17 0.3 0.33 0.28 -0.43
-0.42 -0.25 -0.22 -0.1 0.36 0.4 0.07 0.03 -0.03 -0.07 -0.03 0.06
-0.31 -0.01 -0.1 -0.24 0.2 0.21 0.22 0.2 0.2 0.09 -0.18 -0.5
-0.69 -0.69 -0.12 -0.22 0.26 0.37 0.18 0.12 0.13 0.12 -0.05 0.17
- 0.23 -0.25 1.06 0.56 1.73 -0.32 1.09 - -2.52 - -
-0.35 -0.03 -0.27 -0.18 0.16 0.57 -0.21 0.11 -0.02 0.1 -0.12 -0.01
-0.56 -0.38 0.11 0.11 0.09 0.3 -0.04 0.03 0.06 0.03 -0.08 0.13
-0.44 0.22 0.33 0.05 -1.13 0.48 -0.22 0.58 -0.13 -0.08 -0.6 0.13
-0.1 -0.03 0.08 0.07 0.06 0.13 -0.04 0.02 0.02 -0.04 -0.07 -0.14
-0.45 0.11 0.06 -0.11 -0.06 0.39 -0.23 0.07 0.04 -0.07 0.08 0.02
-0.04 -0.39 -0.19 0.11 0.04 0.04 0.02 0.1 0.07 0.06 0.01 0.09
-0.09 -0.0 0.07 0.01 -0.02 -0.01 -0.12 0.0 0.22 0.09 -0.07 -0.12
-0.47 -0.34 0.0 0.29 -0.02 0.07 0.4 0.09 0.02 -0.02 -0.23 -0.02
-0.35 0.51 -0.09 -0.96 0.33 0.62 0.17 0.21 0.46 -0.27 -0.65 -1.28
-0.57 -0.31 0.03 -0.11 0.25 0.15 0.08 0.05 0.11 0.09 -0.04 0.08
-0.39 -0.05 0.19 -0.04 -0.01 0.14 0.03 0.24 0.14 -0.16 -0.13 -0.08
-0.32 -0.92 0.01 -0.57 0.24 0.44 -0.29 0.59 0.15 -0.3 0.15 0.14
- - 1.01 - 0.13 1.02 -0.2 1.31 -0.4 -1.0 0.47 -0.21
-0.14 -0.42 -1.6 0.08 0.25 -0.25 0.86 0.24 0.61 -0.61 0.39 -1.22
-0.2 -0.12 -0.07 0.18 0.08 0.0 -0.05 0.26 -0.02 0.03 -0.12 -0.04
-1.43 -3.21 -0.81 - -0.93 1.83 0.16 1.17 -0.84 -0.58 0.1 0.26
0.57 0.31 -0.94 -0.69 -0.29 0.85 -0.08 0.28 0.1 -0.45 -0.47 -0.28
-1.94 -1.09 -0.13 -0.55 0.28 0.72 0.25 0.75 -0.42 0.19 0.13 -0.07
- -0.31 -1.82 -1.19 0.81 1.67 -0.42 1.19 -0.09 -1.74 - 0.33
- -0.54 0.62 -0.14 1.08 -0.18 0.43 0.39 0.34 0.14 -0.8 -1.91
-0.51 -0.72 -0.02 0.04 0.03 0.31 -0.16 -0.26 -0.07 -0.08 0.41 0.55
-0.95 -0.57 -0.79 0.49 0.06 0.68 0.34 -0.05 0.04 -0.48 0.68 -0.75
-0.46 0.02 -0.1 0.4 0.02 0.41 0.17 -0.17 0.31 -0.04 -0.15 -0.89
-0.95 -0.58 -0.04 -0.02 0.15 0.51 -0.73 0.09 0.14 0.17 0.32 0.23
0.04 0.01 -0.07 -0.05 -0.07 0.06 0.04 0.07 0.08 0.02 -0.06 -0.08
-1.78 -1.35 -0.17 0.07 -0.27 0.65 0.71 0.2 -0.16 0.03 0.01 0.34
-0.49 -0.33 0.54 -0.24 0.23 0.69 -0.13 0.1 -0.25 0.12 -0.07 -0.9
-2.08 0.4 0.05 -1.05 0.62 1.39 -0.22 -0.32 0.13 0.32 -1.0 -1.99
-0.34 -0.39 0.06 -0.05 0.21 0.24 0.12 0.07 0.08 -0.17 0.0 0.03
-0.36 -0.09 0.15 -0.09 0.08 0.21 0.01 0.22 -0.07 -0.13 -0.0 -0.03
-0.05 -0.67 0.13 -0.1 -0.03 -0.02 0.06 -0.15 0.17 -0.01 0.35 0.09
-0.71 -0.08 0.07 0.09 -0.03 0.13 -0.06 0.26 -0.04 -0.01 -0.05 0.22
-0.25 0.06 0.09 0.09 0.04 -0.01 -0.15 -0.04 0.33 -0.05 0.18 -0.44
-0.07 -0.07 -0.06 0.07 -0.02 0.1 -0.03 0.01 0.0 -0.02 0.08 -0.0
-2.06 -1.7 0.01 0.08 -0.55 1.12 -0.5 0.26 0.56 -0.72 0.99 -0.82
-0.12 -0.27 -0.15 0.01 0.02 0.35 0.1 0.01 0.02 -0.09 0.06 -0.04
-0.28 -0.09 0.22 0.16 -0.24 -0.01 0.08 0.22 0.05 0.07 -0.27 -0.05
-0.36 0.13 0.21 -0.07 0.18 0.17 -0.12 0.24 -0.04 -0.1 -0.15 -0.23
-0.29 0.04 0.19 -0.12 0.25 0.45 -0.24 0.19 0.04 -0.13 -0.2 -0.44
-0.44 -0.19 -0.01 -0.03 0.12 0.17 0.0 -0.06 0.08 0.09 0.03 0.15
-3.7 -1.74 -0.16 0.35 0.23 1.18 0.55 -0.31 -0.29 -0.0 0.24 -0.45
-0.01 -0.24 -0.01 0.12 -0.24 -0.0 0.14 0.2 0.09 0.06 -0.08 -0.1
-0.78 -1.17 -0.08 0.86 -0.45 -0.24 0.69 0.11 0.58 0.13 -0.65 -0.5
-0.12 -0.11 -0.02 0.01 0.07 0.11 0.06 -0.01 -0.09 0.03 0.07 -0.01
0.1 0.19 -0.04 -0.12 -0.02 0.24 0.13 0.1 0.05 -0.22 -0.17 -0.35
-0.02 -0.35 -0.12 -0.04 -0.16 0.17 0.03 0.12 0.22 0.05 -0.06 0.07
-0.26 0.24 -0.06 0.1 0.19 0.29 0.01 0.44 -0.28 -0.18 -0.49 -0.3
-2.0 -3.22 0.03 -1.02 0.81 0.04 0.22 0.55 0.17 0.76 -0.64 0.34
- - - - - - - 2.54 - - 2.63 -
-0.23 0.28 0.33 -0.51 -0.12 0.76 -0.05 0.65 0.11 -0.72 -0.61 -1.04
- - - - 0.31 - 1.15 1.61 0.22 0.09 1.7 -
0.01 - 0.52 -1.59 -0.47 1.54 -1.23 1.0 - -2.08 0.54 0.56

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.