Heatmap: Cluster_201 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.28 -0.24 -0.26 -0.16 -0.02 -0.1 0.09 0.16 0.12 0.18 0.28 0.08
-0.53 0.7 -2.37 0.58 0.26 -2.4 -0.21 -0.84 0.32 0.47 0.06 0.59
-0.08 -0.14 -0.13 -0.23 -0.05 -0.16 0.13 0.25 0.18 0.12 0.03 -0.01
-0.08 -0.05 -0.03 -0.04 -0.05 -0.08 -0.03 0.02 -0.11 0.21 0.21 -0.0
-0.12 -0.06 -0.07 -0.01 0.05 -0.01 0.01 -0.0 0.13 0.09 0.09 -0.13
-0.34 -0.08 -0.06 0.03 0.07 0.07 0.08 0.13 0.16 -0.0 -0.06 -0.05
0.07 -0.14 -0.1 -0.27 -0.05 -0.29 0.29 0.03 0.25 0.11 0.14 -0.18
-0.07 0.08 0.17 0.33 -0.08 -0.13 0.21 0.23 -0.08 0.07 -0.31 -0.71
-0.25 -0.05 -0.05 0.02 -0.1 0.02 0.01 -0.02 0.12 0.09 0.08 0.07
-0.12 -0.12 -0.02 0.05 -0.01 -0.17 -0.03 0.06 0.13 0.19 0.12 -0.12
0.93 -0.5 -0.42 -0.19 -0.86 1.04 0.63 -0.5 0.59 -0.94 -0.67 -1.93
-0.18 -0.17 -0.16 -0.83 0.1 -0.07 0.18 0.15 0.35 0.32 0.23 -0.32
-0.27 -0.41 -0.06 0.02 0.06 0.06 0.17 0.14 0.29 0.14 0.02 -0.32
-0.1 -0.12 -0.03 -0.11 -0.0 0.03 0.14 0.2 0.14 -0.07 0.02 -0.16
0.17 -0.04 -0.05 -0.11 -0.05 0.24 0.1 0.05 -0.22 -0.01 0.18 -0.38
0.2 -0.13 -0.05 0.02 -0.05 -0.02 -0.03 -0.13 -0.03 0.12 0.12 -0.06
-0.35 -0.23 -0.04 0.1 -0.03 -1.32 0.31 -0.47 0.42 0.31 0.07 0.43
0.18 0.07 0.01 -0.17 0.15 -0.13 -0.15 0.07 0.07 -0.07 -0.04 -0.04
-0.14 -0.3 -0.05 -0.41 -0.27 -0.24 0.29 0.34 0.44 0.21 0.11 -0.29
0.13 -2.52 -2.05 -0.14 0.49 -1.78 0.46 0.92 0.33 -0.88 0.38 0.6
-0.42 -0.11 -0.08 -0.32 0.19 -0.2 0.03 -0.09 0.1 0.21 0.17 0.34
-0.15 0.39 -0.0 -0.67 -0.57 0.69 -0.22 -0.26 -0.13 0.51 0.32 -0.77
-0.38 0.28 0.41 -0.52 -0.33 0.64 0.1 -0.01 -0.22 -0.34 0.47 -0.88
-0.25 0.06 -0.06 0.1 -0.01 -0.07 -0.09 0.05 0.17 0.04 0.01 -0.0
-0.15 -0.1 -0.07 -0.06 -0.15 -0.35 0.06 0.05 0.08 0.2 0.24 0.14
0.09 -0.45 -0.4 0.02 -0.07 0.06 0.04 -0.35 0.42 0.41 0.18 -0.29
-0.14 -0.04 -0.0 -0.04 -0.14 -0.05 0.02 0.11 0.15 0.13 0.03 -0.05
-0.51 -0.17 -0.16 -0.0 0.0 0.07 0.04 0.1 0.22 0.27 0.13 -0.14
0.02 -0.6 0.2 -0.2 0.25 -1.0 0.19 0.55 -0.3 0.28 0.33 -0.45
-0.08 -0.3 -0.05 0.04 0.01 -0.01 0.15 0.25 0.12 0.01 -0.1 -0.13
-0.5 -0.24 -0.1 0.7 -0.86 -0.06 0.07 1.0 -0.67 0.15 0.45 -2.06
-0.5 0.18 -0.13 -0.68 -0.04 0.31 0.43 0.27 -0.02 0.04 0.2 -0.53
-0.13 0.05 -0.11 0.0 0.08 -0.19 0.04 -0.33 0.3 0.33 0.09 -0.3
0.75 0.13 0.1 -1.49 -0.21 0.45 0.09 0.85 -0.86 0.12 -0.37 -1.86
-0.2 0.07 -0.04 0.04 0.02 -0.21 -0.14 0.06 0.15 0.06 0.23 -0.11
-0.12 -0.27 -0.19 0.1 -0.01 0.05 0.13 0.05 0.02 0.09 0.07 0.02
-0.36 -0.25 -0.13 0.04 -0.03 0.07 0.06 0.13 0.09 0.12 0.12 0.05
-0.1 -0.48 0.41 0.3 0.01 -1.17 -0.09 0.54 0.01 0.21 0.06 -0.45
0.26 -0.06 -0.15 -0.07 -0.05 0.13 -0.19 -0.42 -0.01 0.2 0.29 -0.08
-0.07 -0.1 -0.1 -0.05 0.02 -0.27 -0.03 -0.22 0.35 0.54 0.24 -0.68
0.85 -0.16 -0.66 -3.1 -0.92 0.11 0.14 -0.64 0.75 0.54 1.04 -
0.32 -0.55 -0.08 -1.01 0.14 -0.12 0.37 0.12 0.23 0.09 0.51 -0.82
-0.26 -0.13 0.14 -0.27 -0.12 0.03 0.13 0.17 0.21 0.18 -0.04 -0.16
0.02 0.27 0.03 -0.04 0.14 0.03 -0.06 0.02 0.02 -0.08 -0.39 -0.05
0.09 0.03 -0.04 -0.14 0.04 0.08 -0.02 0.09 0.04 -0.02 0.13 -0.32
-0.26 -0.16 -0.16 -0.17 -0.04 -0.23 0.14 -0.08 0.24 0.1 0.19 0.29
-0.33 0.3 0.15 -0.18 -0.02 0.46 0.21 -0.63 -1.09 0.06 0.62 -0.37
-0.22 -0.05 -0.04 -0.01 0.12 -0.15 -0.06 0.08 0.04 0.12 0.12 0.02
-0.64 -0.31 -0.15 0.2 0.1 -0.05 0.06 0.18 0.12 0.09 0.22 -0.05
0.54 -0.0 -0.32 -0.02 0.58 -0.49 -0.19 -0.88 0.68 -0.34 0.45 -1.43
-0.13 -0.09 0.06 -0.03 -0.02 -0.13 0.04 0.05 0.06 0.07 0.06 0.04
-0.28 -0.26 0.07 0.01 0.01 -0.01 0.35 0.15 0.19 -0.05 -0.12 -0.19
0.06 -0.16 0.05 -0.27 0.1 -0.1 0.0 0.19 0.15 0.02 0.06 -0.18
-0.15 0.01 -0.08 -0.07 0.03 -0.12 -0.03 0.07 0.16 0.11 0.2 -0.21
0.31 -0.06 -1.3 -0.25 -0.09 -0.16 -0.46 -0.47 -0.19 0.29 1.1 0.05
-0.12 -0.21 -0.12 0.02 -0.02 -0.13 0.09 0.22 0.07 0.09 0.04 0.02
0.52 -1.02 -1.72 0.66 0.63 - -0.14 0.59 0.78 -1.64 1.13 -
0.59 0.55 -0.37 0.2 -0.13 -1.1 -0.61 -0.74 0.3 0.42 0.21 -0.41
-0.42 -0.72 -0.38 0.17 -0.17 0.01 0.35 0.41 0.1 0.22 0.15 -0.14
-0.29 -0.2 -0.02 0.12 -0.03 -0.05 0.06 0.05 0.2 0.13 0.04 -0.08
0.18 0.27 -0.11 -0.42 0.02 0.08 -0.07 0.17 0.16 -0.02 -0.13 -0.27

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.