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Heatmap: Cluster_19 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-1.86 -0.05 -0.45 -2.62 0.24 -0.35 -0.04 0.95 0.15 0.35 0.38 0.38
-0.48 -0.07 0.05 -0.09 -0.06 0.11 -0.14 0.25 0.15 0.13 0.21 -0.21
- - - - -0.59 -0.85 -0.72 0.77 -0.63 0.46 1.38 1.94
-0.44 - -1.42 1.13 1.19 -2.27 -0.19 -0.01 0.21 -0.84 0.92 -0.44
- - 0.17 - -0.17 1.79 - 1.88 0.97 -0.55 -2.35 -
0.22 -0.07 -0.2 -0.44 0.17 -0.07 -0.09 0.37 -0.08 0.06 0.02 -0.06
0.11 0.05 -0.12 0.1 -0.04 0.13 0.07 -0.04 -0.08 -0.08 0.0 -0.13
-0.07 -0.2 -0.01 -0.01 0.07 -0.14 -0.0 0.07 0.09 0.17 -0.06 0.04
0.36 -0.01 0.24 0.2 -0.1 0.1 0.16 -0.07 -0.07 -0.35 -0.19 -0.51
-0.5 -0.11 0.03 -0.1 -0.05 0.15 0.21 0.02 -0.22 0.1 0.38 -0.09
- - -0.63 - - 1.75 -0.44 2.7 -0.37 - - -
- - 0.14 - 0.3 2.27 0.33 1.85 - - - -
0.05 0.1 -0.21 -0.22 0.11 0.17 0.07 0.2 -0.06 -0.01 -0.49 0.14
-0.07 -0.05 -0.03 -0.15 -0.01 0.19 0.06 0.25 -0.1 0.03 0.09 -0.3
-0.17 0.06 -0.05 -0.17 -0.12 -0.01 0.26 0.11 -0.15 0.07 -0.05 0.15
-0.03 -0.3 0.07 -0.04 -0.07 0.0 -0.28 -0.19 0.26 0.27 0.24 -0.08
-0.12 -0.63 -0.08 0.23 -0.01 -0.26 0.06 0.25 0.26 0.28 -0.0 -0.25
- - - - 1.52 2.64 1.54 - - - - -
-0.33 -0.26 0.12 0.16 0.16 0.33 0.06 0.01 -0.06 -0.01 -0.13 -0.19
- -0.29 -1.0 - -0.24 1.21 - 1.73 0.26 1.1 -0.56 -2.43
-1.02 -1.0 -0.45 -0.21 -0.06 0.42 0.51 0.37 -0.28 0.59 0.11 0.01
- -0.48 0.91 - 1.26 1.12 -1.8 0.58 -0.91 0.91 - -0.66
0.05 -0.77 -0.21 -0.33 0.09 -0.45 -0.21 0.35 -0.07 0.04 0.16 0.76
-0.19 -0.14 - - -0.58 -0.05 -0.26 0.65 1.08 0.33 0.39 0.58
0.44 1.31 0.5 -0.97 -0.24 - -0.69 1.65 -0.57 -2.81 - -0.3
- -0.73 -0.14 -0.29 0.23 0.39 -0.26 0.81 -0.39 0.32 -0.03 0.69
0.07 -0.15 -0.14 -0.35 -0.04 0.07 -0.13 0.29 -0.0 0.19 0.05 0.04
-0.47 -0.01 -0.11 0.04 0.09 0.32 -0.12 0.15 0.13 0.36 0.02 -0.74
- - - - 2.32 2.22 - - - 1.24 - -
-0.04 -0.95 -0.49 0.84 0.85 0.09 -0.52 0.58 -0.55 0.01 -0.4 -1.01
-1.1 -0.59 -0.15 0.47 0.21 0.37 0.39 0.06 -0.04 -0.12 -0.24 0.06
0.09 -1.08 0.01 0.27 -0.25 -0.47 -0.48 0.71 0.28 0.21 0.4 -0.63
-0.16 -0.37 -0.12 -0.04 0.12 -0.14 0.11 0.32 0.03 0.13 -0.01 0.02
0.08 -0.34 -0.12 -0.03 0.05 -0.03 0.07 0.14 -0.0 0.05 -0.03 0.11
1.31 - -1.34 0.87 1.56 - - 0.97 -0.27 - 0.1 -1.01
-0.23 -0.05 -0.17 -0.45 0.17 0.0 -0.33 0.1 0.07 0.09 0.52 0.03
-0.46 -0.82 0.15 -2.06 0.29 -0.74 -0.79 0.7 -0.36 0.41 0.88 0.48
-0.33 -0.01 -0.01 -0.24 -0.1 -0.25 -0.22 0.29 0.09 0.02 0.3 0.27
-0.03 -0.04 0.04 0.04 -0.15 -0.25 0.11 0.03 -0.33 0.1 0.2 0.18
-0.14 -0.06 0.12 -0.41 -0.07 0.42 0.14 -0.97 0.34 0.07 0.34 -0.31
- - -0.56 - -0.54 1.3 0.45 1.65 -0.79 -1.75 1.48 -
-0.22 0.23 -0.08 -0.21 -0.18 0.01 0.09 0.35 -0.11 0.13 0.06 -0.21
0.14 0.11 -0.03 0.09 -0.17 0.08 0.14 -0.07 0.01 -0.11 -0.12 -0.13
-0.55 - - - 1.56 -1.45 - -1.3 1.18 -0.82 2.05 -0.65
- 0.57 0.36 -1.15 0.91 1.33 -0.76 1.33 -1.75 -0.83 - -1.27
0.95 -0.39 -0.27 -1.49 -1.32 0.32 1.15 1.06 -1.53 0.15 -0.48 -
-0.13 -0.37 -0.16 -0.26 -0.1 -0.05 0.49 0.39 -0.21 0.22 0.08 -0.2
- -0.27 0.41 - -0.15 -1.7 1.57 1.31 - -0.9 -1.71 1.23
-0.3 -0.01 0.12 -0.18 -0.01 0.24 0.08 0.12 -0.06 0.04 0.09 -0.22
- - -1.92 0.71 1.56 - 0.27 0.05 0.34 - 1.75 -1.77
-0.04 -0.0 -0.06 -0.12 0.01 0.07 -0.11 0.15 0.04 -0.09 -0.05 0.17
- -0.75 -1.32 - -0.97 0.59 -0.74 1.76 -1.04 - 0.42 1.66
- - - - 2.07 2.97 - - - - - -
- - - - - - 1.13 1.96 -0.55 - - 2.39
-0.28 -1.34 -0.37 -1.17 -0.39 0.97 -1.44 1.1 0.1 -1.51 1.32 -1.3
-0.02 0.05 -0.18 0.02 -0.03 -0.12 0.03 0.29 0.01 -0.06 -0.05 0.01
-0.22 -0.33 -0.06 0.14 0.11 0.24 0.2 -0.03 -0.07 -0.08 -0.03 0.02
-0.06 0.13 -0.03 -0.06 -0.17 -0.04 0.15 0.12 -0.08 0.06 0.09 -0.16
- - - - 0.77 2.67 - - - 1.98 - -
-0.1 -0.12 0.08 -0.11 -0.0 0.09 0.04 0.05 0.04 0.15 -0.11 -0.05
-0.48 -0.14 0.11 -0.02 -0.02 0.02 -0.05 0.11 0.09 0.04 0.2 0.02
-0.56 0.16 -0.04 0.06 0.07 0.24 0.1 0.17 -0.49 -0.06 -0.01 0.12
-0.19 -0.83 -0.75 -0.5 0.55 0.79 -2.35 0.81 0.44 0.57 0.1 -2.21
-0.24 -0.28 -0.24 0.03 -0.14 -0.09 0.12 0.06 0.17 -0.04 0.2 0.3
-2.09 0.18 -0.21 -0.16 0.46 -0.43 0.09 0.51 -0.36 0.3 -0.16 0.45
0.58 -1.35 0.25 - 0.12 -0.43 -2.66 0.54 0.02 -0.96 0.5 1.34
-0.03 0.09 0.03 0.23 -0.18 0.13 0.06 -0.06 -0.04 -0.16 -0.19 0.05
0.03 -0.16 0.23 -0.06 0.03 0.25 0.13 0.15 0.08 -0.22 -0.26 -0.34
-2.12 - 0.73 0.55 -0.34 -0.19 -0.83 0.9 -0.29 0.16 1.08 -0.96
- - - - 1.58 - - - 1.78 - 2.21 -0.07
-1.67 0.2 -1.44 - 0.55 0.13 -0.45 0.54 -0.22 0.2 0.92 0.61
- 1.38 0.11 1.25 0.67 -0.59 -1.85 1.77 - - - -
-1.92 -1.02 0.12 -0.13 0.06 0.02 0.37 0.27 -0.33 0.61 0.25 0.24
0.05 -0.17 -0.19 0.01 -0.06 0.07 0.02 0.24 -0.09 -0.07 0.09 0.05
-3.06 0.01 -0.03 -0.73 0.12 0.89 -0.13 1.05 -0.31 0.09 0.58 -
- -0.39 0.08 1.32 - - -0.05 1.61 -1.71 -0.87 1.11 -0.63
- - -1.19 - -2.35 0.6 0.72 1.12 1.22 -0.08 1.46 -
-0.2 -0.03 0.03 0.05 -0.03 0.09 0.08 0.12 -0.05 -0.05 -0.01 -0.01
-0.03 0.07 -0.15 0.05 -0.06 0.07 0.17 0.02 -0.06 0.13 0.06 -0.34
-0.14 0.04 0.08 -0.07 -0.02 0.14 0.07 0.12 -0.06 -0.01 -0.07 -0.11
0.17 -0.33 0.49 -0.66 -0.24 -0.6 -0.39 0.32 -0.59 0.04 0.47 0.53
- - -0.01 - 0.89 1.79 - 0.5 0.8 1.35 - -
-0.05 -0.09 -0.08 -0.04 -0.02 0.03 0.17 0.15 -0.02 -0.07 0.03 -0.05
-0.23 -0.87 -0.93 1.51 0.3 -0.93 0.2 1.23 -0.73 -0.92 - -0.25
-1.8 -2.44 0.66 0.36 -0.42 0.03 -1.09 0.55 -1.42 0.38 0.57 0.85
-0.3 -0.13 -0.16 -1.1 0.45 -0.39 -0.2 0.41 -0.07 0.46 0.29 0.05
- - - - 2.23 2.87 - - - - - -
0.2 -0.06 -0.06 0.24 -0.06 0.14 0.05 0.23 -0.06 -0.25 -0.23 -0.26
- 0.83 0.13 - 0.45 1.26 0.84 1.28 - 0.21 - -
-0.32 -0.26 0.08 -0.4 -0.4 -0.63 0.18 0.32 0.31 0.16 0.2 0.34
0.24 -0.36 -0.04 0.16 0.09 0.26 0.02 0.06 -0.06 -0.21 -0.15 -0.15
-0.13 0.06 -0.12 0.0 -0.13 -0.1 -0.07 0.07 0.09 0.01 0.05 0.23
-1.99 - -0.25 0.09 0.16 1.62 -0.34 1.94 -0.76 -1.25 - -
-0.04 -0.01 0.08 -0.03 0.03 0.06 0.04 0.09 -0.05 0.04 0.07 -0.32
-1.94 1.53 0.67 -0.42 -0.18 -0.11 0.1 0.5 -0.3 -0.74 -1.21 -1.42
- - 0.07 -1.34 0.43 -1.61 0.19 -0.45 1.85 -0.78 1.41 -2.54
-0.12 -0.09 -0.01 0.11 0.05 0.12 0.12 0.03 -0.03 0.07 -0.04 -0.26
0.23 0.08 0.14 0.23 -0.34 0.15 0.15 -0.21 -0.07 -0.17 0.03 -0.41
- - - 0.27 - 1.91 -0.71 2.2 -0.23 -1.22 -0.86 -
-0.1 -0.16 -0.03 0.04 0.08 0.1 0.26 -0.07 0.09 0.11 -0.09 -0.33
- - - - 1.34 3.24 - - - - - -
-1.08 -1.86 -1.26 - 0.5 1.04 - 2.2 -0.14 -0.62 -0.04 -2.1
- 1.39 0.64 -0.81 -1.27 1.29 0.34 1.45 - - - -1.28
0.08 -0.1 0.02 0.07 -0.07 0.16 -0.0 0.02 -0.01 0.08 0.09 -0.41
0.12 -0.19 -0.01 -0.06 0.07 -0.09 0.03 0.02 -0.03 -0.12 0.27 -0.08
- 0.57 -0.16 1.93 -0.79 -0.13 0.12 0.93 -0.91 -1.71 -1.85 -2.26
-0.44 0.1 -0.06 -0.1 0.01 0.42 0.46 0.02 0.08 -0.15 -0.18 -0.48
1.01 - - - 1.46 2.18 - 1.43 - - - -
0.58 0.29 -0.1 0.03 -0.12 0.26 0.0 -0.31 -0.16 -0.02 -0.13 -0.73
-0.28 0.15 0.06 -0.05 -0.09 0.03 -0.05 0.12 -0.17 0.05 0.17 0.0
- -1.59 -1.54 -0.71 0.66 -0.65 -1.53 0.41 -1.44 0.39 1.42 1.31
-0.06 -0.08 -0.08 -0.3 0.11 0.1 0.05 0.28 -0.05 0.04 0.1 -0.2
-0.08 -0.29 -0.09 0.15 0.11 0.13 0.22 0.17 0.04 0.05 -0.13 -0.42
-0.19 -0.06 -0.06 -0.33 -0.06 0.25 0.16 0.15 -0.0 0.08 0.06 -0.09
-1.19 -0.33 -0.12 -1.45 0.18 0.26 0.27 0.71 -0.06 0.48 0.48 -0.84
-0.27 -0.78 0.2 -1.09 0.03 -0.29 0.22 0.54 0.56 0.04 0.41 -0.55
-0.1 -0.2 0.21 -0.04 0.05 0.27 0.12 -0.06 0.07 -0.14 -0.02 -0.27
- - -2.27 -2.07 -1.36 0.44 - 1.61 -0.11 -0.85 1.34 1.46
-0.01 0.05 -0.18 0.09 -0.26 0.56 0.14 -0.2 0.15 -0.26 0.16 -0.55
-0.11 0.05 -0.16 0.1 -0.0 0.15 -0.21 0.27 0.08 0.09 -0.1 -0.25
-0.1 -0.37 0.01 -0.53 0.22 -0.08 0.25 0.0 0.05 0.25 0.48 -0.57
-0.17 0.17 -0.0 -0.1 -0.12 0.18 0.1 0.14 -0.06 0.04 -0.01 -0.22

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.