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Heatmap: Cluster_158 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.18 -0.21 -0.22 -0.06 0.01 0.06 0.11 0.07 0.01 0.0 0.03 0.3
-0.88 -0.56 0.02 -0.46 0.29 -0.13 0.48 0.83 0.39 -0.03 -0.78 -0.2
- -0.71 0.29 0.99 0.08 -0.5 -0.08 1.05 0.1 0.3 -0.57 -1.27
-0.19 -0.05 -0.05 0.01 0.01 0.03 0.1 0.12 0.02 -0.02 0.01 -0.0
-0.32 -0.15 -0.12 -0.08 0.06 0.12 0.18 0.16 0.04 0.06 -0.04 0.01
-0.2 -0.33 -0.11 0.33 0.03 0.12 0.03 0.2 0.01 -0.03 -0.03 -0.16
-0.39 -0.25 -0.16 0.0 0.07 0.01 0.12 0.24 0.01 0.12 0.08 0.04
-0.17 -0.33 -0.06 -0.04 0.04 0.14 0.08 0.07 0.08 -0.03 -0.02 0.15
-0.78 0.25 0.11 0.07 0.14 -0.59 -0.02 0.31 -0.16 -0.23 -0.4 0.69
-0.62 -0.84 -0.03 0.39 -0.22 -0.02 0.2 0.66 -0.03 -0.12 0.03 0.01
-1.73 -0.65 -0.41 0.43 0.47 0.54 -0.12 0.57 -0.17 0.08 -0.08 -0.28
-0.34 -0.06 0.05 0.09 0.09 0.03 0.01 0.16 -0.04 -0.05 -0.03 0.04
- - -0.74 - -0.67 1.77 2.12 0.93 -0.71 -0.92 - -
-0.27 -0.23 -0.13 0.01 0.09 -0.05 0.12 0.17 0.07 -0.04 0.08 0.1
- - 1.82 -0.29 1.36 1.08 -0.09 - - 1.02 - -
-0.34 -0.4 -0.07 0.0 0.13 0.36 0.21 0.1 0.03 -0.02 -0.2 0.03
0.11 -1.35 -1.37 - -0.85 0.66 1.28 0.95 0.54 0.67 -2.93 -1.04
-1.09 -1.4 -0.49 0.11 -0.13 -0.19 1.22 1.01 0.32 -0.08 -0.39 -1.86
-0.05 -0.24 -0.2 0.05 0.08 0.1 0.09 0.08 0.1 -0.03 0.06 -0.08
-0.22 -0.1 0.04 0.05 0.11 0.14 0.05 0.01 -0.06 -0.21 0.04 0.08
-0.74 0.12 0.05 -0.02 0.14 -0.07 0.38 0.25 -0.03 -0.23 0.02 -0.15
-1.17 -0.76 -0.46 -0.09 0.25 0.29 0.32 0.34 -0.1 -0.2 0.11 0.57
-0.17 0.04 0.04 -0.01 0.02 0.03 0.03 0.04 -0.0 -0.14 0.04 0.05
-0.51 -0.61 -0.42 -0.3 0.37 -0.56 -0.04 0.38 0.08 0.23 0.24 0.5
-0.18 -0.11 -0.0 -0.04 0.03 0.03 -0.01 0.07 -0.05 -0.09 0.15 0.17
-0.68 -0.1 -0.07 -0.05 0.01 -0.06 0.17 0.3 -0.04 0.13 0.11 0.07
-0.13 -0.17 -0.09 -0.03 0.04 0.09 0.14 0.13 -0.02 -0.1 0.03 0.08
- - 0.86 - -0.08 2.28 1.35 - - 0.87 - -
- -0.3 0.22 -0.81 0.22 1.66 0.34 -0.65 0.1 0.32 -0.84 -1.57
-0.15 -0.63 0.53 0.92 0.6 0.15 -0.42 0.14 -0.08 -0.37 -0.72 -1.69
-0.93 -0.81 -0.04 -0.66 0.31 -0.14 -0.03 0.38 0.36 0.31 0.02 0.41
-0.44 -0.36 0.2 0.23 -0.1 -0.14 0.17 0.25 -0.08 -0.03 -0.03 0.13
-0.9 -0.58 -0.12 0.19 0.11 0.04 0.12 0.32 0.04 0.16 0.11 0.1
-0.47 -0.19 -0.34 -0.14 -0.17 0.01 0.1 0.36 0.1 0.08 0.11 0.31
-0.46 -0.18 0.07 0.26 0.03 0.13 -0.11 0.11 0.14 0.05 -0.12 -0.05
-0.4 -0.13 -0.04 0.1 0.09 0.03 0.05 0.19 0.06 0.05 0.0 -0.08
-0.23 -0.05 -0.08 -0.07 0.03 0.0 0.02 0.08 0.07 0.06 0.02 0.13
-0.34 -0.51 -0.06 0.02 0.15 -0.28 0.43 0.23 0.21 0.0 0.1 -0.23
-0.95 0.1 -0.17 -0.02 0.24 -0.23 0.41 0.25 0.17 -0.05 -0.04 -0.13
-0.18 -0.23 -0.17 0.11 0.03 0.02 0.23 0.27 0.01 -0.11 0.03 -0.1
-0.63 -0.58 -0.04 -0.16 0.27 0.17 0.08 0.15 0.08 0.0 0.05 0.3
-1.38 -0.56 -1.08 -0.32 -0.21 0.07 0.35 0.44 0.2 0.14 0.12 0.83
-0.27 -0.12 -0.09 0.08 -0.01 0.06 0.11 0.18 0.01 -0.11 0.03 0.07
- - 0.92 -0.46 0.59 2.27 0.82 - - 0.36 - -
-0.47 -0.42 -0.28 0.02 -0.0 -0.06 0.19 0.11 0.13 0.18 0.34 0.04
-3.42 -1.37 0.26 -0.42 0.09 0.29 -0.16 0.4 0.91 0.48 -0.21 -0.1
-0.8 -0.87 0.1 0.82 0.2 0.17 -0.22 -0.03 0.09 0.21 -0.36 -0.1
-0.11 -0.07 0.06 0.05 0.1 0.02 0.06 -0.01 -0.06 -0.07 -0.05 0.05
-1.15 -0.46 -0.07 0.16 0.05 -0.14 0.13 0.36 0.23 0.0 0.06 0.27
-1.82 -1.14 0.21 0.09 0.47 0.73 0.32 0.19 0.17 -0.13 -0.42 -0.27
-0.23 0.03 -0.08 -0.38 0.07 0.11 -0.1 0.07 0.06 0.1 0.05 0.2
-0.31 -0.33 -0.14 -0.05 0.19 -0.05 0.03 0.26 -0.02 0.06 0.06 0.18
-2.04 -1.15 0.74 0.72 0.58 0.48 -0.46 -0.41 0.29 0.31 -0.41 -1.29
-0.25 -0.37 -0.27 0.2 0.11 0.27 0.07 0.18 0.05 -0.1 -0.03 -0.01
-1.34 -0.34 -0.13 0.61 0.23 0.33 0.03 -0.0 0.15 0.14 -0.16 -0.29
-0.29 -0.36 0.22 0.25 -0.49 0.1 0.58 0.33 -1.04 -0.13 0.16 -0.0
- - - - - 2.35 1.88 - -0.01 - 1.15 -
-0.43 -0.04 -0.1 0.14 0.18 -0.03 0.16 0.11 0.03 -0.11 -0.02 0.02
0.02 -0.24 0.08 0.15 -0.03 -0.05 0.13 0.15 -0.16 -0.01 -0.14 0.06
-0.38 -0.13 -0.05 0.45 0.12 -0.22 0.12 0.26 0.19 0.01 -0.35 -0.28
-0.48 -0.36 -0.08 -0.14 0.13 0.06 0.11 0.23 0.17 0.19 0.17 -0.18
-0.42 -0.14 -0.07 -0.2 0.16 0.04 0.06 0.19 0.07 0.15 0.07 -0.03
-0.39 -0.24 0.09 0.19 0.18 0.24 0.02 0.08 -0.08 -0.13 -0.03 -0.05
- -1.54 0.65 -0.04 0.68 0.47 -0.48 1.02 -0.98 1.06 - -0.33

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.