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Heatmap: Cluster_168 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.32 -0.24 -0.24 0.66 0.39 -0.31 0.48 -0.21 -0.35 -0.34 -0.53 0.36
-0.51 -0.29 -0.08 0.15 0.11 0.05 0.4 0.08 0.06 -0.09 -0.06 -0.0
-1.16 -0.81 0.35 0.83 -0.18 -2.06 0.11 0.14 0.14 -0.46 0.62 0.34
0.36 - -0.13 0.96 0.56 -0.43 0.45 -0.05 -3.83 0.38 -0.38 0.23
0.79 0.8 0.38 0.64 -0.11 -1.28 -0.29 -0.16 -1.04 -0.75 -0.9 -0.0
-1.32 0.16 0.53 -0.1 -0.25 -0.39 0.21 -1.1 -0.07 0.26 0.14 0.7
- - 2.5 - - - - - - 1.53 - 1.79
0.6 0.5 -0.67 0.6 -0.28 0.3 -0.7 -0.6 -0.06 -1.18 -0.57 0.6
0.66 -0.02 -0.86 -0.53 -0.17 -0.25 0.3 -1.07 -0.07 -0.2 0.37 0.72
0.06 0.25 0.1 0.08 -0.15 0.08 -0.07 -0.04 -0.15 -0.1 -0.09 -0.01
-1.99 -0.31 -0.17 0.83 0.54 -0.37 0.25 -0.15 -0.28 -0.32 -0.5 0.7
-1.76 0.37 0.21 0.22 0.22 0.02 0.44 -0.19 -0.03 -0.89 0.37 -0.21
-1.38 0.6 0.39 -0.46 0.15 -0.91 -0.18 -0.72 0.4 0.06 0.5 0.21
2.11 - 0.71 1.18 -2.09 -1.8 - - - -1.17 -1.81 1.34
-0.17 -0.49 -1.15 0.29 0.52 -0.85 0.67 -0.23 -0.24 -0.67 0.53 0.46
0.42 -1.5 0.05 0.93 0.4 -0.26 0.19 -1.38 -0.79 0.23 -0.4 0.25
0.2 -0.26 -0.06 0.19 -0.15 -0.12 -0.41 0.3 -0.19 -0.11 0.16 0.25
- - 2.71 - - - - 1.21 - 0.52 - 0.77
0.03 -0.05 -0.14 -0.05 -0.01 -0.27 0.06 0.02 0.05 0.01 0.13 0.17
- -2.58 -0.18 1.38 0.86 -1.0 -2.41 1.07 -0.9 -0.87 -0.13 0.81
0.13 -1.12 -1.31 0.06 -0.04 -0.51 0.41 0.18 -0.06 -0.68 0.35 1.01
-0.09 -0.11 0.02 0.13 -0.11 0.02 -0.03 -0.1 -0.21 0.04 0.16 0.21
-0.29 -0.24 -0.22 0.07 -0.18 0.01 -0.33 -0.15 0.16 0.11 0.06 0.68
- 0.64 1.18 - 0.65 - -0.62 - 0.27 - 0.71 1.64
1.13 -3.33 -1.58 0.67 0.56 -0.87 -1.29 -1.24 -0.15 -1.01 -0.99 1.6
0.04 0.23 0.03 0.26 -0.12 -0.03 -0.17 -0.13 -0.04 -0.18 -0.05 0.08
0.05 -0.07 -0.11 -0.03 -0.07 0.03 0.12 -0.01 -0.09 -0.37 -0.06 0.47
-0.66 - -0.04 -2.6 1.02 -1.56 0.23 -0.03 0.11 0.51 0.51 0.83
0.93 0.17 -0.02 1.4 0.09 -1.78 -1.46 -0.36 -0.96 -0.29 -0.67 -0.18
0.27 -0.48 0.02 0.08 0.18 -0.26 0.02 -0.34 -0.4 -0.63 0.55 0.46
0.3 -0.21 0.13 0.41 0.1 0.19 -0.16 -0.57 -0.32 -0.52 0.11 0.16
0.03 0.36 -0.07 0.32 -0.16 -0.3 -0.03 -0.3 0.02 -0.16 -0.06 0.18
0.74 -1.28 -0.23 0.4 0.38 -0.03 0.12 -0.96 -1.03 -0.41 -0.39 0.9
0.22 -0.34 -0.07 0.12 0.05 0.01 0.05 0.25 0.03 -0.05 -0.26 -0.14
0.22 -0.75 -0.22 0.17 0.45 0.66 -0.67 0.06 -0.54 0.14 -0.06 -0.16
-2.45 -1.24 -2.62 1.41 1.02 -0.24 0.5 -1.39 -0.25 -0.44 -0.72 0.77
1.08 0.03 -0.06 0.4 -1.35 -2.59 -0.38 -0.48 0.26 0.86 -1.62 0.28
-0.41 -0.3 -0.36 0.55 -0.29 -0.67 -0.15 0.28 -0.02 -0.2 0.3 0.63
-3.05 -0.39 -0.23 0.44 -1.02 0.5 0.11 -0.04 -0.39 -1.97 -0.16 1.6
0.09 -0.28 -0.2 0.04 0.02 -0.12 0.13 -0.08 -0.04 -0.05 0.06 0.33
-0.05 0.22 -0.18 -0.31 0.03 -0.12 0.24 -0.21 0.31 0.02 -0.41 0.25
0.21 -0.49 1.08 0.73 0.94 -1.36 -0.6 -0.88 -1.36 -0.7 -1.94 0.66
0.09 -0.01 0.06 -0.09 -0.03 0.03 -0.04 -0.07 -0.14 -0.08 0.04 0.2
0.89 1.09 0.97 -0.1 -0.19 -1.25 -0.63 -1.66 0.42 -1.43 0.05 -3.04
-0.49 -0.51 -0.2 -0.56 0.33 0.34 -0.36 -0.39 0.28 0.5 0.0 0.43
-2.62 -1.78 -1.0 0.4 0.76 -0.27 0.92 -0.45 0.48 0.0 0.02 0.22
0.86 -2.36 -1.93 0.54 -0.48 -2.01 - 0.64 0.66 0.85 -0.36 0.67
-1.51 -0.21 -0.19 0.4 -0.13 0.13 -0.16 0.3 0.66 0.14 0.08 -0.46
-0.05 -1.4 -0.03 0.04 0.14 0.22 0.25 -0.66 -0.2 0.02 0.19 0.63
-0.53 -0.18 0.17 0.45 0.05 0.25 0.41 -0.31 -0.11 -0.3 -0.4 0.1
-0.68 -0.68 -0.2 -0.41 0.78 -0.15 -0.28 -0.45 0.55 -0.03 0.46 0.18
-0.68 1.0 0.23 0.89 0.33 -0.24 -1.15 -0.71 -0.34 -0.5 -0.64 0.06
0.13 -0.09 -0.03 0.3 -0.11 0.06 -0.01 0.14 -0.14 -0.13 -0.13 -0.04
-0.31 0.77 0.09 -0.02 -0.32 0.3 -1.0 0.18 -0.24 0.0 0.09 -0.24
-0.31 -0.23 -0.02 0.71 0.67 -0.33 -0.77 0.15 -0.21 -0.29 -0.01 -0.07
-1.77 -1.45 -0.15 0.2 -0.12 0.77 -0.53 0.28 0.43 -0.47 0.18 0.64
-1.36 0.22 -0.1 -0.1 -0.09 0.52 0.44 -1.31 -1.03 -0.3 0.24 0.97
-0.85 0.2 0.06 0.29 -0.01 -0.23 0.01 0.42 -0.09 -0.06 -0.05 -0.05
-0.04 -0.31 -0.03 -0.04 -0.11 0.19 -0.21 -0.26 -0.15 -0.14 -0.08 0.8
0.16 -0.18 -0.1 -0.29 0.18 0.27 0.1 -0.14 -0.15 0.04 -0.26 0.23
-0.04 0.02 -0.28 -0.12 0.02 -0.44 0.01 -0.03 0.18 0.11 0.18 0.26
-0.21 -0.12 0.1 0.07 0.15 -0.07 0.11 -0.12 -0.07 -0.0 -0.09 0.19
- 0.77 1.42 0.31 -0.42 - 0.77 -1.46 0.45 -1.4 -2.32 0.7
0.08 0.06 -0.18 -0.11 -0.14 0.02 0.06 -0.04 -0.18 -0.18 0.28 0.23
-0.12 -0.1 -0.13 -0.08 0.08 -0.08 0.21 -0.07 0.05 0.02 0.02 0.15
0.06 -0.95 -0.21 0.65 -0.51 0.21 -0.66 0.14 0.23 0.3 -0.37 0.3
-0.27 -0.3 -0.12 0.11 0.03 0.07 -0.1 -0.07 0.03 0.02 0.26 0.22
- - 2.18 -0.76 - -0.57 - -0.63 - 0.7 -0.65 1.72
0.07 -0.13 -0.11 0.01 0.04 -0.02 0.09 0.15 -0.02 -0.02 -0.07 -0.03
0.33 -0.05 -0.37 -0.04 -0.17 -0.21 -0.07 -0.07 -0.01 0.23 -0.02 0.28
0.81 -0.98 0.17 0.5 0.68 -0.67 -1.25 -0.57 0.14 -0.5 -0.06 0.15
-0.82 -0.29 0.01 0.79 0.12 -0.18 0.62 -0.89 0.02 -0.11 -0.95 0.45
-0.18 -0.66 -0.46 -0.58 -0.46 0.11 -0.36 -0.42 0.34 0.38 0.44 0.87
-0.49 0.01 0.01 0.16 0.12 -0.01 0.04 -0.11 0.03 0.01 0.06 0.08
-0.18 0.09 0.32 0.69 0.35 -0.49 -0.07 -0.47 -0.7 -0.19 -0.19 0.21
0.1 0.02 0.02 -0.08 -0.05 0.05 0.05 -0.16 -0.12 -0.08 -0.03 0.24
0.38 1.16 0.55 0.25 -0.87 -0.67 0.22 0.24 -1.42 -0.37 -1.55 -0.35
1.17 1.77 0.28 0.84 0.54 - -0.5 -1.85 -2.17 -2.33 -2.01 -2.12
0.75 -1.51 -0.46 0.43 0.16 -0.36 0.11 -0.42 -0.09 0.54 -0.17 -0.16
0.1 -0.35 0.05 0.07 0.08 0.16 0.08 -0.15 -0.24 0.0 -0.17 0.25
-0.31 -0.46 0.48 0.19 -0.17 0.08 -0.32 -0.26 0.07 -0.08 0.34 0.13

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.