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Heatmap: Cluster_139 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-1.2 0.17 -0.28 0.14 0.8 0.22 -0.49 0.12 0.13 -0.57 0.12 -0.05
-0.64 -0.08 0.14 0.19 0.18 0.01 0.04 -0.11 -0.11 0.15 0.14 -0.07
-0.17 -0.31 0.01 0.25 0.05 -0.12 -0.02 0.06 0.09 -0.02 0.1 0.0
-0.4 0.54 0.14 0.13 -0.62 0.06 0.12 0.01 0.51 0.09 -0.22 -1.12
-2.55 -0.71 -0.57 -0.01 0.82 0.25 0.08 -0.16 -0.32 0.36 0.29 0.43
-0.29 0.0 -0.09 -0.0 0.21 0.08 -0.01 -0.07 0.08 -0.06 0.14 -0.05
-0.17 -0.58 -0.13 1.27 -1.01 0.79 -0.64 -0.42 -1.19 -0.95 0.74 -0.22
-2.67 0.1 0.3 0.26 0.34 0.37 -0.33 -0.57 -0.37 0.47 0.4 -0.25
-0.08 0.06 -0.03 0.18 -0.05 0.01 -0.01 -0.06 0.07 -0.04 0.04 -0.13
-2.67 0.35 0.42 0.55 0.37 0.03 -0.18 -0.5 -0.47 0.19 0.23 -0.28
- 1.11 1.28 1.03 -0.27 - 0.59 - -0.32 0.3 -0.0 -
-0.66 0.26 0.22 0.33 0.07 0.06 0.09 -0.52 0.21 0.16 -0.19 -0.42
- - 0.62 1.9 -1.21 - 0.86 - -0.46 -1.45 1.56 -1.2
-0.4 -0.2 0.06 -0.3 0.01 0.17 0.03 0.26 0.22 0.24 -0.09 -0.19
-0.4 -0.08 0.02 -0.03 0.1 0.01 0.05 0.09 -0.01 0.22 0.07 -0.12
-0.45 0.03 -0.04 0.12 0.06 -0.0 0.05 -0.01 0.15 0.11 0.11 -0.22
0.01 -0.89 0.53 1.26 -1.67 -1.94 -1.81 0.26 -0.06 0.62 -0.15 0.23
-0.71 -0.15 -0.07 0.02 -0.06 -0.11 -0.52 0.08 0.5 0.18 -0.16 0.51
-2.63 -1.08 -0.07 0.61 -0.21 -0.14 -1.09 0.02 0.35 -0.28 1.12 0.44
- -0.22 1.71 1.81 1.01 - - 0.84 - -0.8 - -
- 0.17 0.27 1.26 0.71 -1.56 -1.18 0.8 -0.16 -0.06 -0.65 -0.65
-0.07 -0.19 -0.21 0.04 -0.07 0.09 -0.2 0.11 0.1 0.1 0.1 0.12
-0.29 -0.46 0.11 0.04 -0.06 -0.09 0.06 -0.08 0.08 0.12 0.35 0.06
-0.33 -0.2 -0.4 0.2 -0.15 -0.01 -0.45 0.22 0.04 0.24 0.45 0.09
-0.39 0.1 0.12 0.13 0.07 0.15 0.05 -0.16 0.01 0.01 0.03 -0.23
0.0 -0.08 0.87 0.97 0.42 -0.09 -0.95 -0.4 0.21 -0.33 -1.29 -1.5
- 1.65 0.27 0.97 0.49 - 0.35 -1.08 -0.57 -0.72 0.33 -
-0.27 0.02 0.11 0.04 0.12 0.02 -0.0 0.17 -0.02 -0.11 -0.08 -0.05
-0.05 -0.07 -0.03 -0.0 -0.05 0.17 -0.16 -0.08 0.16 0.04 0.01 0.02
-0.37 -2.69 -1.15 0.19 0.07 -0.44 -1.08 -0.09 0.45 0.77 0.22 1.03
-0.3 0.01 0.01 0.13 0.03 0.01 0.07 0.01 0.05 0.03 0.1 -0.22
-1.57 -0.94 -0.18 2.38 0.8 -2.48 -1.06 -2.32 -1.06 -2.8 0.87 -
0.6 -0.66 0.49 1.15 -2.91 -0.74 -1.91 0.37 -0.45 -0.31 0.8 -0.62
-0.38 0.02 0.13 0.17 0.23 -0.11 0.07 -0.08 -0.05 0.13 -0.08 -0.16
-0.7 -0.29 0.0 0.27 0.3 -0.18 0.13 0.12 0.24 0.28 -0.06 -0.47
-0.66 0.48 0.25 0.64 -0.48 -0.87 0.55 -0.62 0.32 0.07 -0.19 -0.58
-1.46 -0.4 -0.24 0.02 0.78 0.48 0.11 0.45 0.28 -0.19 -0.43 -0.69
-0.8 -0.46 -0.15 -0.94 -0.13 0.08 0.11 -0.04 0.93 -0.19 0.56 0.0
0.15 0.39 0.68 1.08 0.59 -1.05 -1.57 -1.28 -0.3 0.18 -0.04 -2.28
-0.21 -0.07 0.1 0.07 0.18 -0.1 -0.01 0.1 0.07 0.06 -0.11 -0.14
-0.55 0.17 0.29 0.46 -0.03 -0.1 0.05 0.24 -0.09 0.02 -0.6 -0.22
-0.08 -0.08 -0.16 -0.17 -0.13 0.09 -0.1 0.36 0.07 -0.18 0.07 0.2
-0.33 -1.04 -0.26 0.66 0.19 - -1.35 0.31 0.8 -0.58 0.12 1.03
-0.35 -0.01 0.18 0.07 0.18 0.05 -0.01 -0.01 -0.02 0.07 -0.03 -0.21
-0.06 -0.1 0.1 0.06 0.1 0.03 0.05 0.17 -0.02 -0.13 -0.12 -0.12
-0.25 1.1 -0.42 1.69 -0.25 -0.08 -3.0 - -0.91 -1.81 0.11 0.31
-0.86 0.07 -0.15 0.35 0.35 0.2 0.18 -0.04 0.18 -0.11 -0.04 -0.62
-0.36 0.04 0.06 0.31 0.12 -0.06 0.06 0.01 -0.05 0.06 0.02 -0.36
-1.31 -0.28 0.18 0.31 0.11 -0.2 0.38 0.22 0.13 0.53 0.02 -1.2
-0.22 -0.05 0.07 0.01 0.14 0.06 0.04 0.0 0.04 0.12 -0.05 -0.2
-1.46 -0.58 0.51 0.83 -0.33 -0.39 0.24 0.22 0.34 0.0 -0.33 -0.33
-1.28 0.94 0.84 0.54 0.31 -0.77 0.4 - 0.47 0.14 -2.19 -0.78
-0.11 -0.11 -0.07 -0.08 -0.03 0.0 -0.06 0.0 0.12 0.1 0.12 0.08
0.51 -0.98 0.68 0.86 -0.12 -0.84 0.3 -0.58 -0.26 -0.16 0.22 -1.43
-1.14 -0.24 -0.18 0.31 -0.0 -0.21 0.43 0.05 0.39 0.23 0.19 -0.51
-0.11 -0.04 -0.15 -0.16 0.05 0.02 0.12 0.11 0.06 0.24 0.04 -0.24
-0.91 -0.68 -0.12 -0.67 0.51 -0.6 0.16 0.64 0.44 0.09 0.13 0.04
-0.95 -0.59 0.23 0.05 0.47 -0.59 -1.02 0.24 0.9 0.59 0.21 -1.45
- -1.51 0.1 1.59 1.29 - - - -0.2 -2.14 1.91 -1.88
-0.12 -0.34 -0.13 0.08 -0.21 0.01 -0.23 0.13 0.1 0.26 0.36 -0.07
-0.24 0.08 0.1 -0.02 0.13 -0.0 0.1 -0.03 0.06 -0.09 -0.08 -0.06
-0.44 -0.43 -0.09 -0.46 0.32 0.13 0.02 -0.17 0.21 0.32 -0.0 0.27
0.14 -0.63 0.52 1.51 -1.67 - 0.56 -0.19 0.24 -0.39 0.06 -1.67
-0.22 -0.08 0.03 0.15 0.08 0.0 0.07 -0.07 -0.0 0.12 -0.11 -0.01
-0.32 0.02 0.15 0.01 -0.22 -0.18 0.16 -0.11 0.06 0.17 0.27 -0.14

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.