Heatmap: Cluster_141 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.26 -0.29 -0.13 -0.31 -0.13 -0.58 -0.39 -0.38 0.46 0.49 0.37 0.52
0.49 -0.17 -0.32 -1.27 -0.49 -0.82 -0.54 -0.2 -0.11 0.59 0.47 0.88
0.24 0.14 -0.2 -0.3 -0.18 -0.29 -0.29 -0.2 0.01 0.02 0.2 0.56
0.1 -0.07 -0.19 -0.27 -0.11 -0.15 -0.03 -0.04 -0.01 0.03 0.23 0.37
-0.28 -0.26 -0.37 -0.19 -0.2 -0.03 -0.17 -0.11 0.17 0.34 0.43 0.37
-0.2 -0.14 -0.28 -0.16 -0.58 -0.66 -0.24 -0.44 0.26 0.53 0.32 0.79
0.22 -0.17 -0.24 -0.41 -0.19 -0.26 -0.35 -0.35 0.2 0.38 0.39 0.39
0.06 -0.08 -0.26 -0.2 -0.17 -0.25 -0.26 -0.31 0.05 0.29 0.42 0.41
0.31 -0.04 -0.11 -0.39 -0.17 -0.13 -0.18 -0.38 0.05 0.32 0.2 0.27
0.18 -0.15 -0.5 -0.57 -0.49 -0.3 -0.28 -0.19 0.2 0.43 0.46 0.56
-0.02 -0.22 -0.11 -0.17 -0.12 -0.01 -0.0 -0.05 0.11 0.06 0.2 0.25
-0.02 -0.39 -0.29 -0.3 -0.1 -0.18 0.01 -0.02 0.21 0.24 0.14 0.46
0.15 -0.07 -0.17 -0.14 -0.12 -0.42 -0.37 -0.41 0.03 0.38 0.3 0.47
0.17 -0.08 -0.32 -0.1 -0.25 -0.31 -0.36 -0.32 0.03 0.24 0.37 0.55
0.08 -0.27 -0.23 -0.19 -0.05 -0.04 -0.01 0.03 0.04 0.09 0.24 0.21
0.35 0.11 -0.17 -0.32 -0.33 -0.27 -0.35 -0.26 0.05 0.13 0.33 0.42
-0.24 -0.53 -0.7 -0.5 -0.49 -0.55 -0.86 -0.71 -0.15 0.46 0.9 1.29
0.04 -0.15 -0.3 -0.27 -0.15 -0.15 -0.11 -0.17 0.23 0.2 0.3 0.32
-0.2 -0.16 -0.06 -0.09 -0.03 -0.19 -0.17 -0.31 0.1 0.19 0.27 0.46
0.27 0.06 -0.1 -0.33 -0.23 -0.34 -0.13 -0.2 -0.04 0.21 0.26 0.34
0.18 -0.38 -0.61 -0.36 0.04 -0.1 -0.18 -0.45 -0.06 0.27 0.33 0.74
0.01 0.07 -0.31 -0.22 -0.33 -0.25 -0.07 -0.28 -0.02 0.31 0.32 0.48
0.25 -1.03 -1.28 -1.52 -1.06 -0.36 -0.35 -0.43 0.17 0.66 0.25 1.53
0.34 -0.28 -0.46 -0.52 -0.12 -0.53 -0.25 -0.19 0.2 0.29 0.25 0.67
0.06 -0.01 0.04 -0.37 -0.33 -0.51 -0.48 -0.63 0.17 0.33 0.38 0.71
0.2 -0.36 -0.74 -1.58 -0.88 -0.85 -0.45 -0.57 -0.34 -0.08 0.94 1.58
3.03 - - - - - - - - - - 1.94
0.33 0.22 -0.09 -0.29 -0.21 -0.38 -0.28 -0.18 0.02 0.14 0.18 0.31
-0.06 -0.17 -0.07 -0.57 -0.36 -0.38 -0.28 -0.25 -0.12 0.22 0.53 0.83
1.75 - - -1.84 -2.14 - -2.11 -0.37 -0.08 0.39 0.39 1.83
0.12 -0.19 -0.18 -0.16 0.03 -0.15 -0.07 -0.13 0.1 0.09 0.18 0.26
0.71 -0.32 -0.49 -0.26 0.02 -0.26 -0.36 -0.25 -0.25 -0.15 0.09 0.79
0.5 -0.09 -0.39 -0.4 -0.29 -0.59 -0.59 -0.45 -0.05 0.3 0.44 0.75
-0.3 -0.4 -0.93 -2.06 0.48 -0.41 -0.4 -0.55 0.29 0.04 0.84 1.02
0.39 -0.75 0.48 -0.67 -1.6 -0.3 0.27 0.19 -0.03 -0.93 0.03 1.05
0.44 0.1 -2.0 -2.12 -3.74 -0.29 -1.71 -0.77 -0.09 0.92 0.74 1.49
0.3 -0.8 -0.94 -0.5 0.04 -0.21 -0.39 -0.97 0.14 0.4 0.69 0.81
0.1 0.03 -0.43 -0.36 -0.23 -0.19 -0.41 -0.65 -0.15 0.34 0.59 0.68
0.5 0.01 -0.41 -0.33 -0.27 -0.26 -0.24 -0.26 -0.01 0.27 0.25 0.39
1.26 -1.1 -1.42 - 0.91 - - -0.03 0.28 - 0.76 1.59
0.55 -0.1 -0.48 -0.53 -0.34 -0.61 -0.49 -0.18 -0.2 0.17 0.6 0.72
0.08 0.05 -0.12 -0.37 -0.19 -0.27 -0.13 -0.13 -0.01 0.19 0.3 0.39
0.35 -0.04 -0.14 -0.13 -0.01 -0.2 -0.19 -0.23 0.03 0.21 0.12 0.1
-0.01 -0.18 -0.25 -0.16 -0.03 0.0 -0.07 -0.03 0.07 0.09 0.2 0.28
0.51 -0.03 -0.52 -0.36 -0.46 -0.41 -0.15 -0.06 0.14 0.36 0.12 0.38
0.4 -0.28 -0.66 -0.42 -0.18 -0.48 -0.28 -0.28 0.13 0.2 0.33 0.8
0.63 -0.21 -1.33 -1.13 -0.85 -0.58 -0.71 -0.77 0.07 0.5 0.84 1.05
0.12 -0.26 -0.3 -0.3 -0.21 -0.2 -0.06 -0.04 0.13 0.25 0.2 0.43
0.15 -0.11 -0.48 -0.48 -0.31 -0.22 -0.18 -0.25 0.12 0.27 0.48 0.55
-0.16 -0.74 -0.73 -0.21 -0.39 -0.03 -0.12 -0.15 0.29 0.24 0.28 0.89
0.25 -0.07 -0.32 -0.1 -0.18 -0.22 -0.19 -0.13 0.19 0.2 0.18 0.23
0.2 -0.08 -0.35 -0.27 -0.32 -0.1 -0.13 -0.2 -0.09 0.17 0.38 0.5
0.01 -0.24 -0.42 -0.13 -0.05 -0.07 -0.08 0.06 0.09 0.11 0.19 0.38
0.05 -0.56 -0.67 -0.53 -0.14 -0.12 -0.09 -0.05 0.05 0.19 0.52 0.69
0.29 -0.16 -3.19 -0.11 -3.03 0.22 -1.87 -1.42 0.08 -0.19 0.98 1.59
0.45 -0.08 -0.43 -0.6 -0.42 -0.49 -0.28 -0.28 0.23 0.26 0.44 0.54
0.23 -0.01 -0.17 -0.2 -0.07 -0.02 0.0 0.02 0.04 0.01 0.03 0.09
-0.08 -0.09 -0.12 -0.08 -0.16 -0.26 -0.16 -0.08 0.1 0.12 0.23 0.43
0.16 -0.11 -0.35 -0.27 -0.12 -0.1 -0.02 0.04 0.21 0.16 0.16 0.13
0.45 -0.52 -0.52 -0.75 -0.42 -0.07 -0.36 -0.34 -0.23 0.16 0.51 0.99
-0.0 -0.12 -0.13 -0.13 -0.02 -0.02 -0.08 -0.14 0.01 0.11 0.18 0.28
0.35 -0.38 -0.53 -0.22 -0.12 -0.13 -0.29 -0.31 0.01 0.2 0.34 0.62
0.41 0.04 -0.45 -0.56 -0.68 -0.51 -0.6 -0.36 -0.25 0.27 0.68 0.87
0.44 -0.47 -0.56 -0.5 -0.05 -0.4 -0.27 -0.48 0.07 0.26 0.46 0.72
-0.06 -0.22 -0.16 -0.09 -0.04 -0.25 -0.21 -0.1 0.04 0.22 0.3 0.39
0.92 -0.75 -0.99 -0.46 0.02 -0.82 -0.48 -0.1 -0.51 -0.15 0.52 1.01
-0.13 -0.07 -0.26 -0.26 -0.16 -0.13 -0.1 -0.18 -0.05 0.12 0.39 0.56
0.18 -0.57 -0.5 -0.28 -0.01 -0.65 -0.55 -0.45 0.31 0.13 0.64 0.79
0.43 -0.17 -0.45 -0.42 -0.32 -0.5 -0.43 -0.2 0.07 -0.01 0.44 0.81
0.31 -0.03 -0.1 -0.15 -0.12 -0.21 -0.19 -0.12 -0.02 -0.02 0.1 0.39
0.19 -0.26 -0.42 -0.25 -0.08 -0.05 -0.02 -0.08 0.12 0.08 0.21 0.38
1.18 -0.29 -1.09 -0.96 -1.29 -0.93 -0.53 -0.59 0.21 0.53 0.64 0.57
0.37 -0.19 -0.08 -0.27 -0.19 -0.29 -0.12 0.0 0.05 0.16 0.16 0.23
0.26 0.03 -0.26 -0.63 -0.41 -0.29 -0.25 -0.35 0.06 0.3 0.49 0.52
0.08 0.01 -0.31 -0.25 -0.39 -0.69 -0.46 -0.38 0.14 0.31 0.49 0.74
0.77 -0.06 -0.3 -0.72 -0.45 -0.62 -0.02 -0.36 -0.23 0.29 0.39 0.48
-0.01 -0.28 -0.25 -0.06 0.03 -0.06 -0.09 -0.12 0.06 0.11 0.26 0.3
-0.07 -0.23 -0.18 -0.2 -0.08 -0.02 -0.09 -0.14 0.11 0.09 0.3 0.38
-0.01 -0.12 -0.2 -0.13 -0.07 -0.36 -0.07 -0.21 0.07 0.21 0.26 0.43
0.39 -0.41 -1.42 -1.98 -0.03 -0.65 -1.63 -0.61 0.73 0.08 0.95 1.04
0.06 -0.32 -0.25 -0.51 -0.12 -0.06 -0.05 -0.11 0.03 0.17 0.36 0.5
-0.16 -0.78 -1.2 -0.85 -0.58 -0.66 -0.45 0.04 0.57 0.66 0.76 0.76
0.12 0.01 -0.13 -0.27 -0.13 -0.27 -0.18 -0.21 0.06 0.18 0.27 0.37
-0.26 -0.25 -0.04 -0.11 0.02 0.08 -0.03 -0.24 0.08 0.13 0.2 0.29
-0.24 -0.17 -0.19 -0.07 -0.03 0.01 -0.17 -0.13 0.19 0.08 0.25 0.33
-0.13 -0.29 -0.34 -0.13 0.01 -0.01 0.04 -0.23 0.05 0.19 0.26 0.38
-0.04 -0.03 -0.19 -0.12 -0.05 -0.03 -0.09 0.06 -0.02 0.08 0.18 0.19
0.1 -0.04 -0.27 -0.2 -0.18 -0.13 -0.15 -0.16 0.21 0.21 0.15 0.32
-0.17 -0.12 -0.11 -0.12 -0.06 -0.09 -0.12 -0.13 0.07 0.23 0.21 0.29
-1.16 -0.21 -0.11 -0.63 -0.4 -0.51 -0.78 -0.48 0.36 0.55 0.66 1.02
0.01 -0.32 -0.25 -0.85 -0.12 -0.52 -0.44 -0.09 0.28 0.36 0.22 0.87
-0.1 -0.26 -0.4 -0.15 -0.12 -0.34 -0.42 -0.51 0.22 0.26 0.36 0.82
0.25 -0.05 -0.31 -0.34 -0.21 -0.34 -0.15 -0.14 -0.02 0.23 0.31 0.47
0.07 -0.19 -0.2 -0.25 -0.28 -0.16 -0.12 -0.08 0.21 0.14 0.23 0.43
0.1 -0.37 -0.79 -0.6 -0.27 -0.27 -0.24 -0.17 0.03 0.11 0.67 0.88
-0.67 -0.61 0.06 -0.13 0.09 -1.25 -0.16 -0.54 0.2 0.19 0.56 0.94
0.34 0.02 -0.12 -0.21 -0.13 -0.37 -0.38 -0.49 0.08 0.1 0.27 0.52
0.69 -0.32 -0.61 -0.69 -0.09 -0.54 -0.48 -0.27 0.11 -0.03 0.46 0.76
0.03 -0.32 -0.45 -0.22 -0.0 -0.06 -0.04 0.01 0.11 0.12 0.3 0.31
-0.07 -0.19 -0.23 -0.09 0.02 -0.07 -0.11 0.02 0.07 0.14 0.17 0.27
-0.01 0.01 -0.32 -0.3 -0.18 -0.16 -0.13 -0.19 0.04 0.21 0.42 0.37
0.36 0.07 -0.2 -0.19 -0.28 -0.26 -0.24 -0.35 -0.02 0.21 0.26 0.36
0.02 -0.23 -0.19 -0.12 -0.02 -0.11 -0.01 -0.13 0.12 0.05 0.14 0.37
0.32 0.11 -0.76 -0.96 -0.18 0.01 -0.22 -0.46 -0.06 0.35 0.24 0.76
0.18 0.04 -0.42 -0.35 -0.2 0.01 -0.06 -0.18 0.08 0.24 0.22 0.23
0.07 -0.12 -0.25 -0.22 -0.13 -0.26 -0.23 -0.11 0.03 0.1 0.37 0.5
0.25 0.04 -0.21 -0.4 -0.32 -0.49 -0.32 -0.35 0.03 0.38 0.39 0.52
-0.2 -0.36 -0.42 -0.21 -0.15 -0.11 -0.03 -0.04 0.03 0.22 0.41 0.52
0.36 -0.05 -0.27 -0.21 -0.26 -0.49 -0.34 -0.2 0.21 0.1 0.16 0.6
0.27 -1.09 -0.86 -1.11 -1.39 -0.93 -0.36 -0.78 0.35 0.48 0.81 1.39
0.03 -0.33 -1.01 -0.89 -0.89 -0.81 -0.24 0.14 0.38 0.39 0.65 0.93
0.09 -0.38 -0.33 -0.36 -0.03 -0.3 -0.13 -0.11 0.02 0.13 0.38 0.63
0.03 -0.13 -0.17 -0.14 -0.12 -0.12 -0.08 -0.02 0.08 0.1 0.19 0.3
0.07 -0.14 -0.34 -0.19 -0.06 -0.18 -0.16 -0.06 0.09 0.08 0.34 0.36
0.13 -0.41 -0.78 -0.67 -0.12 -0.53 -0.28 0.01 0.2 0.16 0.65 0.73
-0.07 -0.25 -0.32 -0.36 -0.22 -0.17 -0.18 -0.16 0.04 0.34 0.43 0.54
-0.21 -0.17 -0.19 -0.17 -0.04 0.01 -0.02 0.03 -0.06 0.1 0.28 0.31
-0.47 -0.19 -0.3 -0.3 -0.15 -0.18 -0.23 -0.2 0.13 0.23 0.48 0.69
0.34 -0.63 -2.66 -0.58 -0.87 -0.1 -1.94 -1.38 0.33 0.71 0.88 1.26
-0.25 -0.34 -0.45 -0.37 0.22 0.14 0.13 -0.47 0.04 0.12 0.31 0.5
0.04 -0.15 -0.26 -0.27 -0.11 -0.09 -0.13 -0.13 -0.04 0.09 0.26 0.55
0.26 -0.05 -0.45 -0.41 -0.5 -0.27 -0.19 -0.23 -0.1 0.26 0.49 0.63
0.08 -0.22 -0.27 -0.21 -0.18 -0.07 -0.08 0.03 0.05 0.18 0.25 0.3
0.19 -0.25 -0.47 -0.53 -0.36 -0.48 -0.13 -0.28 0.17 0.25 0.46 0.74
0.37 -0.41 -0.52 -0.52 -0.1 -0.3 -0.09 -0.31 0.12 -0.04 0.31 0.82
0.12 -0.03 -0.19 -0.2 -0.14 -0.16 -0.17 -0.15 0.11 0.12 0.17 0.38
-0.14 -0.27 -0.22 -0.31 -0.08 0.0 -0.11 -0.3 0.21 0.32 0.32 0.33
0.04 -0.14 -0.16 -0.14 -0.04 -0.03 -0.04 -0.15 0.08 0.07 0.18 0.26
0.34 -0.11 -0.14 -0.18 -0.21 -0.46 -0.05 0.08 -0.56 -0.03 0.07 0.78
-0.03 -0.09 -0.14 -0.24 -0.05 -0.1 -0.12 -0.23 0.15 0.28 0.2 0.25
0.32 -0.03 -0.14 -0.3 -0.24 -0.15 -0.22 -0.19 -0.07 0.23 0.28 0.29
0.03 -0.13 -0.18 -0.14 -0.04 -0.09 -0.08 0.01 0.07 0.07 0.15 0.27
0.27 0.04 -0.35 -0.57 -0.33 -0.28 -0.08 -0.03 0.14 0.13 0.24 0.48
-0.22 0.13 -0.2 -0.69 -0.19 -0.18 -0.33 -0.5 0.21 0.2 0.36 0.77
0.29 0.12 -0.16 -0.45 -0.27 -0.49 -0.55 -0.59 -0.28 0.12 0.59 0.81
-0.03 -0.19 -0.23 -0.18 -0.24 -0.33 -0.33 -0.43 0.12 0.39 0.46 0.54
0.09 -0.1 -0.23 -0.19 -0.13 -0.22 -0.1 -0.15 0.07 0.15 0.28 0.37
0.21 -0.48 -0.41 -0.44 -0.19 -0.21 -0.26 -0.22 0.25 0.28 0.34 0.62
0.36 0.31 -0.26 -0.42 -0.61 -0.19 -0.65 -0.57 -0.13 0.19 0.46 0.69
-0.55 -0.55 -0.67 -0.47 -0.35 0.01 -0.31 -0.03 0.07 0.45 0.55 0.87
0.0 -0.11 -0.05 -0.04 -0.07 -0.18 -0.16 -0.12 0.18 0.11 0.11 0.25
0.14 -0.23 -0.2 -0.2 -0.14 -0.21 -0.08 -0.1 0.12 0.11 0.28 0.35
0.1 -0.23 -0.19 -0.12 -0.03 -0.1 -0.09 -0.06 0.08 0.05 0.26 0.24
0.07 -0.03 -0.15 -0.41 -0.46 -0.35 -0.44 -0.47 0.11 0.26 0.53 0.7
0.2 -0.12 -0.25 -0.23 -0.25 -0.12 -0.08 -0.01 -0.02 0.22 0.25 0.27
0.19 0.06 -0.26 -0.21 -0.19 -0.14 -0.16 -0.15 0.05 0.11 0.24 0.33
0.62 -0.15 -0.38 -0.84 -0.28 -0.47 -0.33 -0.65 -0.13 0.02 0.52 0.92

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.