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Heatmap: Cluster_250 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.22 0.05 0.03 0.05 -0.64 -0.19 -0.32 0.02 0.41 0.04 0.26 0.2
0.14 0.13 -0.06 -0.45 -0.02 -0.25 -0.21 0.13 0.04 0.19 0.02 0.21
-0.04 -0.02 0.08 -0.21 0.03 -0.31 -0.07 -0.06 0.22 -0.0 0.03 0.26
-1.92 -0.08 1.21 0.56 -0.49 -0.79 -0.96 0.34 0.79 -0.05 -0.91 -0.51
0.06 -0.01 -0.03 0.06 -0.14 -0.1 -0.09 0.08 0.04 -0.02 0.07 0.07
0.07 -0.13 -0.17 -0.13 -0.17 -0.29 0.21 -0.05 0.42 0.31 -0.09 -0.18
0.04 -0.02 -0.05 0.0 -0.11 -0.08 -0.02 0.08 0.03 0.08 0.03 0.02
0.52 0.1 -0.22 0.06 -0.31 -0.48 -0.22 0.04 0.1 0.14 -0.0 0.0
- - - - 0.55 - - - 1.66 - 2.52 0.72
0.12 -0.3 -0.26 0.05 0.0 -0.16 0.08 -0.1 0.16 0.15 0.08 0.09
0.06 -0.04 -0.1 -0.15 -0.04 -0.13 0.04 0.13 -0.03 0.03 0.11 0.07
-0.08 0.07 0.04 -0.25 -0.05 0.1 0.02 0.02 0.1 0.09 -0.07 -0.02
0.04 -0.16 -0.18 -0.16 -0.01 -0.18 0.07 -0.08 0.25 0.21 0.01 0.1
-0.21 0.14 -0.11 -0.29 0.03 0.04 0.0 -0.02 0.15 0.09 0.06 0.05
0.1 -0.17 -0.11 -0.02 -0.02 0.02 0.03 0.01 0.22 -0.05 -0.07 0.02
0.26 -0.05 -0.15 -0.12 -0.03 -0.17 0.0 0.0 0.05 -0.06 0.12 0.09
-0.38 -0.16 0.37 -0.16 0.09 -0.13 -0.18 0.45 0.32 -0.15 -0.45 0.06
0.34 -0.37 -0.4 -0.55 0.14 -0.4 0.06 0.25 0.09 -0.09 0.28 0.29
-0.46 -0.16 -0.02 -0.12 0.19 -0.08 -0.02 0.35 0.0 0.15 -0.09 0.09
-0.1 0.11 -0.19 -0.16 0.14 -0.28 -0.59 0.44 0.4 -0.15 -0.33 0.33
0.12 -0.45 -0.11 -0.58 0.02 -0.14 0.15 0.02 0.2 0.18 0.22 0.14
0.41 -0.47 -0.43 -0.3 0.18 -0.26 0.11 -0.21 0.22 0.28 0.12 0.01
-1.92 -2.98 -0.72 -1.08 0.51 -2.82 0.25 -0.28 0.96 0.8 1.34 -0.45
0.2 -1.31 0.89 -2.02 0.25 -3.03 -2.02 1.14 -0.5 -0.38 -0.56 1.28
-0.05 -0.64 -0.44 -0.31 0.16 -0.52 0.46 0.04 0.19 0.24 0.26 0.14
-0.14 -0.05 0.03 -0.03 0.05 -0.18 -0.15 -0.09 0.18 0.08 0.07 0.17
0.02 -0.03 0.04 -0.16 0.1 -0.04 0.02 0.02 -0.0 -0.16 0.02 0.13
0.15 -0.07 -0.17 -0.08 -0.01 -0.19 0.01 -0.05 0.14 0.1 0.11 0.02
-0.11 0.19 0.05 -0.38 -0.06 -0.09 -0.23 -0.04 0.12 0.1 0.26 0.06
0.15 -0.05 -0.06 0.01 -0.07 -0.14 -0.1 -0.03 0.09 0.06 0.05 0.06
0.19 -0.2 0.04 -0.21 0.02 -0.2 -0.05 -0.02 0.1 0.17 0.0 0.07
0.1 -0.13 -0.06 -0.1 0.05 -0.12 -0.03 -0.1 0.18 0.0 0.01 0.15
0.06 -0.01 -0.18 -0.08 -0.02 -0.09 -0.25 0.11 0.17 0.11 -0.05 0.15
-0.15 -0.64 0.19 -1.1 0.21 -0.37 0.39 0.47 -0.2 -0.06 0.12 0.38
0.29 0.0 -0.08 -0.17 -0.24 -0.26 -0.12 -0.06 0.2 0.15 0.12 0.04
0.04 0.05 -0.12 -0.12 -0.02 -0.08 -0.02 0.03 0.02 0.13 0.05 0.04
0.25 0.09 -0.22 -0.06 -0.18 -0.55 -0.15 0.37 0.14 0.08 0.01 0.01
0.14 -0.02 -0.06 -0.29 0.07 -0.2 -0.0 0.11 0.03 0.0 0.0 0.17
0.06 0.11 0.02 -0.22 -0.03 -0.05 -0.02 -0.04 0.11 -0.02 -0.06 0.11
- - 0.04 - -0.94 -0.65 - - 0.63 1.12 2.24 0.46
-2.18 -0.3 -0.07 0.19 0.16 -3.08 -2.2 1.32 0.24 0.61 0.87 -1.32
0.22 -0.1 -0.19 -0.14 -0.06 -0.24 0.06 0.04 0.11 0.06 0.08 0.08
0.02 0.04 -0.11 -0.14 -0.1 -0.11 -0.07 0.18 0.07 0.06 0.04 0.09
0.29 -0.37 -0.1 -0.13 0.02 -0.24 0.09 -0.2 0.35 0.06 0.02 0.03
0.21 -0.46 0.24 0.02 0.15 -0.44 0.17 0.03 0.19 -0.42 -0.11 0.15
-0.03 0.16 0.04 -0.2 -0.02 -0.17 -0.04 0.04 0.13 -0.07 -0.03 0.14
-0.18 0.16 -0.05 -0.36 -0.04 -0.23 0.12 0.15 0.02 0.05 0.14 0.11
-0.01 0.03 -0.07 -0.1 -0.02 -0.02 -0.03 0.04 -0.0 0.07 0.07 0.04
0.09 0.06 -0.04 -0.07 0.03 -0.16 -0.09 0.06 0.06 -0.02 0.01 0.04

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.