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Heatmap: Cluster_32 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.52 0.37 0.2 -0.13 -0.26 -0.37 -0.02 -0.04 -0.06 -0.14 -0.15 -0.2
0.56 0.26 0.25 -0.29 0.0 -0.18 -0.06 0.03 -0.29 -0.15 -0.21 -0.18
0.53 0.39 0.12 -0.04 -0.11 -0.17 -0.2 -0.08 -0.15 -0.24 -0.23 -0.07
0.72 0.9 0.97 0.11 -0.02 -0.44 -0.36 -0.26 -1.05 -0.88 -1.1 -0.72
1.19 0.99 0.99 0.09 -0.45 -2.02 -0.63 0.05 -0.92 -0.82 -0.99 -1.24
0.69 0.47 0.46 -0.06 -0.25 -0.8 -0.36 -0.18 -0.08 -0.26 -0.26 -0.06
0.3 0.39 0.12 -0.27 -0.2 -0.35 -0.12 -0.08 -0.03 -0.0 -0.04 0.1
0.64 0.32 -0.09 -0.64 -0.4 -0.42 -0.2 -0.07 -0.08 0.09 0.13 0.24
0.26 0.38 0.09 -0.09 -0.19 -0.17 0.03 0.09 -0.16 -0.2 -0.06 -0.11
0.18 0.39 0.17 -0.36 -0.24 -0.28 -0.19 0.07 0.01 0.07 0.05 -0.06
1.35 0.97 0.25 -0.78 -0.54 -1.53 -1.04 -0.67 -0.02 -0.22 -0.57 0.07
0.67 0.52 0.29 -0.17 -0.31 -0.37 -0.14 0.04 -0.42 -0.44 -0.22 0.01
0.29 0.4 0.19 -0.05 -0.13 -0.05 -0.0 0.1 -0.11 -0.29 -0.29 -0.28
0.67 0.55 0.17 -0.37 -0.33 -0.42 -0.44 -0.14 -0.37 -0.12 0.12 0.11
0.71 0.58 0.45 -0.52 -0.16 -0.4 -0.35 -0.05 -0.0 -0.04 -0.45 -0.52
0.81 0.81 0.89 0.19 -0.26 -0.59 -0.56 -0.31 -0.44 -0.7 -0.82 -0.74
0.78 1.15 0.73 -0.62 -0.7 -0.72 -0.4 0.26 -0.76 -0.55 -0.72 -0.55
0.23 0.41 0.08 -0.02 -0.1 -0.32 -0.1 -0.06 0.02 -0.05 -0.22 -0.01
0.27 0.35 0.25 -0.04 -0.07 -0.2 -0.06 0.07 -0.24 -0.19 -0.14 -0.17
0.6 1.67 0.13 - 0.48 -0.46 - -0.66 -1.65 -1.62 -1.01 1.21
0.82 0.45 0.38 -0.1 -0.1 -0.55 -0.43 -0.03 -0.29 -0.28 -0.33 -0.21
0.7 0.68 0.87 0.39 -0.23 -0.48 -0.5 -0.34 -0.56 -0.63 -0.79 -0.59
0.59 0.64 0.8 -0.25 -0.2 -0.51 -0.42 0.01 -0.36 -0.19 -0.64 -0.44
0.83 0.41 0.36 -0.15 -0.02 -0.24 -0.22 -0.09 -0.22 -0.26 -0.57 -0.47
0.61 0.95 0.95 0.11 -0.18 -0.68 -0.34 -0.16 -0.44 -0.76 -1.2 -0.77
0.31 0.55 0.39 -0.31 -0.33 -0.5 -0.19 -0.01 -0.12 -0.11 -0.11 0.05
0.35 0.37 0.28 -0.34 -0.15 -0.45 -0.29 -0.17 0.0 0.12 -0.03 0.05
0.08 0.74 0.51 -0.63 -0.41 -0.64 -0.31 -0.12 0.1 0.25 -0.23 -0.05
1.07 0.8 0.59 -0.61 -0.92 -1.76 -0.73 -0.13 -0.58 -0.32 -0.1 0.32
0.47 0.31 0.12 -0.04 -0.16 -0.1 -0.0 -0.07 -0.03 -0.16 -0.29 -0.24
0.53 0.7 0.51 -0.44 0.02 -0.47 -0.47 -0.52 -0.25 0.13 -0.29 -0.2
0.46 0.83 0.55 -0.5 -0.24 -0.69 -0.35 -0.03 -0.47 0.08 -0.24 -0.28
0.51 0.46 0.18 -0.05 -0.03 -0.27 -0.17 -0.1 -0.06 -0.31 -0.36 -0.1
0.79 0.75 0.55 -0.7 -0.25 -0.63 -0.28 0.17 -0.66 -0.32 -0.25 -0.32
1.01 0.78 0.33 -0.44 -0.59 -0.85 -0.62 -0.47 -0.16 -0.2 -0.3 0.14
0.86 1.14 0.79 -0.29 -0.29 -0.58 -0.51 -0.17 -0.76 -0.91 -0.73 -0.65
0.95 0.88 0.79 -0.03 -0.23 -0.65 -0.45 -0.25 -0.39 -0.7 -0.93 -0.85
0.4 0.31 0.2 -0.03 -0.01 -0.15 -0.36 -0.11 -0.15 -0.29 -0.21 0.16
1.01 0.52 0.33 -0.72 -0.42 -0.8 -0.94 -0.27 -0.23 -0.04 0.08 0.18
0.43 0.22 0.11 -0.31 -0.2 -0.21 -0.1 -0.01 -0.08 -0.03 -0.07 0.08
0.31 0.48 0.41 -0.65 -0.31 -0.58 -0.25 -0.09 -0.03 0.09 -0.02 0.15
0.31 0.44 0.27 -0.04 -0.18 -0.22 -0.11 0.12 -0.23 -0.27 -0.15 -0.17
0.34 0.66 0.8 -0.68 -0.16 -0.73 -0.25 -0.08 -0.35 0.08 -0.4 -0.14
0.39 0.61 0.32 -0.01 -0.24 -0.38 -0.21 -0.04 -0.11 -0.24 -0.22 -0.23
0.58 0.56 0.25 -0.21 -0.38 -0.54 -0.13 0.02 -0.04 -0.23 -0.19 -0.17
0.73 0.58 0.3 -0.43 -0.26 -0.5 -0.27 -0.2 -0.21 -0.2 0.05 -0.21
0.27 0.28 0.11 -0.19 -0.16 -0.22 -0.05 -0.09 -0.06 -0.02 0.02 -0.0
0.66 0.85 0.66 -0.48 -0.18 -0.56 -0.45 -0.11 -0.55 -0.18 -0.5 -0.25
0.5 0.52 0.16 -0.26 -0.22 -0.22 -0.08 -0.16 -0.21 -0.19 -0.03 -0.12
1.05 0.95 0.14 -0.41 -0.55 -0.69 -0.39 -0.36 -0.36 -0.31 -0.26 -0.18
0.84 0.69 0.27 -0.31 -0.4 -0.62 -0.14 0.1 -0.07 -0.21 -0.56 -0.5
0.63 0.48 0.35 -0.11 -0.17 -0.4 -0.19 0.1 -0.38 -0.35 -0.31 -0.17
0.73 1.22 1.22 0.04 -0.44 -1.09 -0.93 -0.68 -1.0 -0.62 -0.96 -0.68
1.0 0.63 0.28 -0.2 -0.71 -0.55 -0.48 -0.36 -0.0 -0.02 -0.3 -0.37
0.68 0.53 0.29 -0.53 -0.53 -0.78 -0.24 -0.14 0.28 -0.07 -0.38 0.1
1.07 0.53 0.75 -0.13 -0.19 -0.92 -0.24 -0.13 -0.6 -0.51 -0.46 -0.74
0.7 0.54 0.13 0.01 -0.2 -0.38 -0.29 -0.18 -0.14 -0.35 -0.13 -0.18
0.54 0.8 0.67 -0.87 -0.13 -1.04 -0.63 -0.54 -0.24 0.39 -0.63 0.18
0.7 0.66 0.7 -0.04 0.15 -0.33 -0.49 -0.59 -0.72 -0.52 -0.54 -0.11
0.18 0.24 0.13 -0.07 -0.05 -0.18 -0.16 -0.1 -0.1 -0.08 -0.1 0.19
0.23 1.11 0.72 -0.28 -0.53 -0.93 -0.34 -0.07 -0.56 -0.4 -0.25 -0.06
0.4 0.51 0.32 -0.1 -0.29 -0.33 -0.1 -0.01 -0.18 -0.25 -0.14 -0.16
0.84 0.73 0.27 -0.25 -0.68 -0.64 -0.35 0.12 -0.15 -0.16 -0.31 -0.38
0.97 0.81 0.37 -0.85 -0.96 -1.08 -0.43 0.12 -0.39 -0.16 -0.05 0.02
0.28 0.33 0.24 -0.23 -0.28 -0.41 -0.2 -0.08 0.07 0.08 -0.0 -0.01
0.85 0.65 0.63 -0.34 -0.29 -0.66 -0.36 -0.07 -0.35 -0.17 -0.5 -0.46
0.51 0.63 0.55 0.1 -0.21 -0.37 -0.39 -0.32 -0.43 -0.32 -0.25 -0.14
0.4 0.47 0.17 -0.33 -0.34 -0.31 -0.19 0.05 0.0 -0.16 -0.04 0.01
0.29 0.28 0.32 -0.16 -0.15 -0.22 -0.15 -0.07 -0.04 -0.03 -0.15 -0.09
0.58 0.38 0.12 -0.11 -0.25 -0.26 -0.2 -0.07 -0.23 -0.19 -0.06 0.0
0.51 0.3 0.3 -0.12 -0.23 -0.35 -0.14 -0.1 -0.01 -0.18 -0.19 -0.05
0.81 0.7 0.53 -0.57 -0.34 -0.78 -0.44 0.18 -0.67 -0.21 -0.14 -0.19
0.88 0.53 0.19 -0.43 -0.44 -0.42 -0.3 -0.11 -0.06 -0.22 -0.19 -0.12
0.49 0.87 0.8 -0.52 -0.31 -0.93 -0.37 0.07 -0.05 -0.07 -0.83 -0.51
0.72 0.31 0.03 -0.33 -0.42 -0.78 -0.45 -0.24 -0.13 0.19 0.28 0.17
0.09 0.21 0.3 -0.18 -0.09 -0.28 -0.14 0.03 -0.0 -0.06 -0.13 0.15
0.37 0.27 0.13 -0.11 -0.12 -0.14 -0.05 -0.02 -0.03 -0.18 -0.14 -0.12
0.37 0.29 0.28 -0.07 -0.09 -0.22 -0.01 0.04 -0.08 -0.21 -0.2 -0.31
0.63 0.42 0.08 -0.23 -0.3 -0.36 -0.15 0.02 0.04 -0.25 -0.1 -0.15
0.43 0.59 0.37 -0.39 -0.45 -0.68 -0.18 0.09 -0.02 -0.01 -0.21 -0.06
1.01 0.85 0.29 -0.42 -0.68 -0.81 -0.28 0.13 -0.43 -0.45 -0.42 -0.2
1.05 0.81 0.41 -0.48 -0.64 -0.82 -0.43 -0.08 -0.72 -0.26 -0.14 -0.19
0.78 0.59 0.37 -0.09 -0.31 -0.53 -0.34 0.05 -0.0 -0.27 -0.58 -0.47

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.