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Heatmap: Cluster_189 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.13 0.33 -0.04 -0.15 -0.26 -0.29 -0.4 -0.07 -0.12 0.18 0.22 0.26
0.49 0.34 0.01 -0.44 -0.29 -0.5 -0.11 -0.1 0.01 0.07 0.13 0.08
0.12 0.03 -0.12 -0.01 -0.2 -0.19 -0.08 0.05 0.16 0.07 -0.09 0.19
-0.45 -0.49 -0.41 -0.21 -0.52 -0.4 -0.12 -0.1 0.24 0.39 0.62 0.68
0.42 0.18 -0.15 -0.37 -0.36 -0.28 -0.12 -0.06 0.11 0.1 0.3 -0.02
0.56 -0.07 -0.37 -0.44 -0.34 -0.92 -0.85 -0.89 0.59 0.38 0.1 0.83
0.53 -0.03 -0.19 -0.17 -0.16 -0.36 -0.39 -0.44 -0.05 0.13 0.35 0.37
-0.12 -0.02 -0.12 -0.24 -0.17 -0.17 0.01 -0.06 0.05 0.16 0.32 0.25
0.14 0.18 -0.25 -0.38 -0.42 -0.23 -0.0 0.03 0.2 0.12 0.19 0.21
0.46 0.33 0.0 -0.43 -0.39 -0.28 -0.04 0.03 -0.16 -0.14 0.16 0.18
0.24 -0.11 -0.18 -0.25 -0.24 -0.36 -0.06 -0.13 0.14 0.09 0.34 0.31
0.22 0.0 -0.14 -0.33 -0.19 -0.06 -0.08 0.01 -0.02 0.15 0.2 0.13
0.31 0.01 -0.01 -0.14 -0.12 -0.29 -0.21 0.11 0.01 0.02 0.08 0.12
-0.48 0.13 -0.14 -0.36 -0.03 -0.06 -0.04 -0.14 0.17 0.27 0.07 0.38
-0.31 0.09 0.03 -0.15 -0.04 -0.08 -0.08 -0.15 0.1 0.13 0.15 0.22
0.25 0.13 -0.09 -0.21 -0.25 -0.12 -0.02 -0.04 0.08 0.03 0.07 0.11
0.25 0.05 -0.13 -0.19 -0.24 -0.32 -0.1 -0.08 0.15 0.05 0.08 0.33
0.47 0.24 -0.16 -0.31 -0.27 -0.13 0.01 0.05 -0.05 -0.05 0.0 0.03
0.59 0.36 -0.05 -0.53 -0.46 -0.6 -0.05 0.11 -0.06 -0.11 0.13 0.19
0.16 0.18 -0.52 -0.67 -0.52 -0.44 -0.24 -0.1 0.23 0.33 0.5 0.44
0.38 -0.17 -0.4 -0.36 -0.16 -0.22 -0.22 -0.19 0.06 0.13 0.42 0.39
-0.21 0.03 0.03 -0.14 0.02 -0.05 -0.13 -0.18 0.0 0.17 0.14 0.24
0.2 0.04 -0.02 -0.13 -0.12 -0.22 0.0 0.01 0.03 0.04 0.07 0.07
0.12 0.06 -0.14 -0.16 -0.14 -0.12 -0.1 -0.01 0.04 0.12 0.14 0.14
-0.06 0.18 0.02 -0.12 -0.15 -0.17 -0.06 -0.04 0.0 0.07 0.11 0.17
0.52 0.22 -0.18 -0.34 -0.42 -0.42 -0.05 0.06 0.06 0.02 0.14 0.1
0.39 -0.05 -0.06 -0.11 -0.13 -0.03 -0.17 -0.06 -0.13 0.06 0.06 0.13
0.04 -0.07 -0.17 -0.59 -0.62 -0.54 -0.19 0.05 0.15 0.38 0.46 0.52
0.17 -0.03 -0.1 -0.13 -0.12 -0.16 -0.08 -0.04 0.06 0.07 0.15 0.16
0.14 -0.04 -0.29 -0.32 -0.29 -0.06 0.04 0.08 0.02 0.15 0.23 0.2
0.16 -0.11 -0.21 -0.19 -0.16 -0.08 -0.11 -0.19 0.03 0.04 0.24 0.41
0.01 -0.06 -0.01 -0.12 -0.08 -0.22 -0.21 0.02 0.1 0.13 0.16 0.2
0.07 0.08 -0.18 -0.21 -0.26 -0.11 -0.02 -0.06 -0.04 0.19 0.23 0.21
0.2 0.14 -0.14 -0.5 -0.5 -0.39 -0.09 0.03 0.14 0.26 0.3 0.24
0.27 0.17 -0.35 -0.4 -0.56 -0.41 -0.27 -0.15 0.29 0.28 0.29 0.38
-0.17 0.2 0.17 -0.29 -0.09 -0.22 -0.25 -0.04 0.02 0.06 0.11 0.34
0.15 -0.01 -0.13 -0.15 -0.12 -0.13 -0.06 -0.0 0.1 0.07 0.11 0.13
0.06 -0.01 -0.21 -0.4 -0.18 -0.08 -0.01 -0.09 0.14 0.16 0.25 0.23
0.14 -0.07 -0.05 -0.09 -0.1 -0.17 -0.09 0.08 0.15 0.05 0.03 0.07
0.4 0.11 0.04 -0.14 -0.19 -0.33 -0.13 -0.04 -0.03 0.01 0.23 -0.07
0.17 0.06 -0.25 -0.18 -0.24 -0.13 -0.1 -0.18 0.04 -0.03 0.26 0.41
0.14 0.04 -0.05 -0.13 -0.12 -0.27 -0.05 -0.0 -0.06 0.12 0.17 0.14
-0.17 0.04 0.03 -0.22 -0.12 -0.11 -0.1 -0.12 -0.01 0.15 0.24 0.29
-0.2 0.64 -0.05 -0.35 -0.22 -0.29 -0.52 -0.12 -0.27 0.26 0.36 0.29
-0.03 -0.05 -0.01 -0.02 -0.13 -0.14 0.03 0.12 0.14 0.0 -0.02 0.07
0.21 0.03 -0.19 -0.28 -0.24 -0.34 -0.07 -0.09 0.11 0.03 0.27 0.36
0.21 -0.1 -0.18 -0.2 -0.06 -0.21 -0.03 -0.1 -0.02 0.15 0.18 0.26
1.01 0.35 -0.55 -0.79 -0.59 -0.75 -0.12 -0.32 -0.1 0.51 0.01 0.14
0.38 0.01 0.11 -0.22 -0.28 -0.45 -0.1 0.02 0.04 0.03 0.21 0.06
0.2 0.05 -0.21 -0.17 -0.23 -0.41 -0.07 0.05 0.19 0.07 0.14 0.23
0.31 0.16 -0.06 -0.25 -0.43 -0.51 -0.32 -0.12 0.1 0.18 0.26 0.35
0.38 -0.01 -0.34 -0.4 -0.54 -0.28 -0.24 -0.02 0.25 0.18 0.28 0.36
0.31 -0.01 -0.18 -0.4 -0.14 -0.32 -0.13 -0.11 0.14 0.23 0.23 0.17
0.11 0.29 0.2 -0.18 -0.07 -0.56 -0.28 -0.03 0.06 0.07 0.07 0.12
0.29 0.07 0.0 -0.36 -0.28 -0.56 -0.04 0.16 -0.0 0.13 0.21 0.15
-0.24 -0.22 -0.17 -0.13 -0.1 -0.08 -0.04 0.01 0.11 0.19 0.2 0.33
0.44 0.37 -0.35 -0.2 -0.47 -0.66 -0.35 -0.28 0.22 0.13 0.26 0.37
0.32 0.06 -0.23 -0.38 -0.39 -0.41 -0.03 0.09 0.21 0.11 0.17 0.22
0.64 0.19 -0.35 -0.29 -0.57 -0.13 -0.25 0.12 -0.14 0.15 0.08 0.15
0.12 0.03 -0.21 -0.31 -0.29 -0.17 0.02 -0.04 0.1 0.19 0.19 0.22
0.57 -0.06 -0.52 -0.66 -0.39 -0.39 -0.46 -0.36 -0.21 0.18 0.5 0.84
0.42 -0.01 -0.22 -0.34 -0.09 -0.36 -0.27 -0.08 0.03 0.25 0.17 0.25
0.22 0.12 0.03 -0.07 -0.06 -0.19 0.02 -0.14 -0.01 -0.06 0.03 0.07
0.2 0.07 -0.08 -0.16 -0.23 -0.16 -0.05 0.04 -0.0 -0.02 0.19 0.13
0.04 0.11 -0.23 -0.25 -0.25 -0.14 -0.03 -0.04 0.26 0.14 0.01 0.26
0.59 -0.0 -0.37 -0.86 -0.37 -0.4 -0.3 -0.13 0.13 0.2 0.33 0.5
0.24 0.16 -0.18 -0.18 -0.29 -0.26 -0.21 -0.08 0.18 0.15 0.15 0.17
0.19 0.14 -0.03 -0.12 -0.04 -0.19 -0.3 -0.19 0.02 0.05 0.09 0.26
0.05 0.06 -0.14 -0.32 -0.33 -0.3 -0.14 -0.1 0.1 0.31 0.38 0.2
0.41 -0.01 -0.15 -0.65 -0.73 -0.44 -0.35 0.02 -0.04 0.24 0.53 0.49
0.07 -0.01 -0.17 -0.3 -0.27 -0.13 -0.0 -0.02 0.05 0.19 0.26 0.21
0.17 0.01 -0.08 -0.24 -0.09 -0.27 -0.15 -0.19 0.21 0.2 0.09 0.22
0.27 0.03 -0.11 -0.38 -0.33 -0.62 -0.27 -0.02 0.12 0.39 0.2 0.34
0.48 -0.11 -0.31 -0.16 -0.21 -0.26 0.03 -0.1 -0.04 0.14 0.17 0.17
0.29 0.1 -0.48 -0.57 -0.52 -0.23 -0.18 -0.03 0.32 0.3 0.23 0.32

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.