Heatmap: Cluster_144 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
1.17 0.94 1.64 0.66 0.89 1.47 1.53 1.49 2.27 1.72 0.99 1.09
0.04 0.02 0.09 0.02 0.02 0.04 0.05 0.07 0.09 0.07 0.02 0.0
0.14 0.0 0.0 0.08 0.06 0.08 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.15 0.04 0.15 0.03 0.23 0.03 0.18 0.0 0.0
0.28 0.02 0.17 0.32 0.09 0.37 0.29 0.55 0.11 0.2 0.13 0.03
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.03 0.05 0.0
7.03 8.7 10.18 10.02 10.2 9.2 8.2 8.46 7.83 8.32 7.97 8.42
70.09 78.62 89.89 107.44 96.02 108.3 88.32 75.67 93.81 110.15 107.86 91.91
0.69 1.89 2.35 2.04 2.31 1.33 1.92 1.79 1.51 1.33 1.15 1.31
0.0 0.32 0.3 0.0 0.17 0.0 0.09 0.0 0.04 0.09 0.13 0.05
7.12 6.51 7.96 8.16 7.96 7.17 8.59 8.96 8.6 6.61 8.19 7.87
1.78 1.48 1.76 1.33 1.75 1.58 1.87 2.09 2.01 1.84 2.0 1.53
0.0 0.0 0.11 0.04 0.17 0.0 0.03 0.0 0.07 0.15 0.0 0.04
8.49 9.25 10.15 10.96 8.52 8.18 8.79 10.19 9.85 9.08 8.83 7.45
0.0 0.0 0.15 0.16 0.29 0.17 0.11 0.51 0.61 0.15 0.34 0.04
0.0 0.0 0.08 0.17 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.16 5.15 5.73 5.15 6.48 3.48 4.09 6.18 5.07 3.44 3.9 2.77
0.0 0.0 0.07 0.15 0.03 0.0 0.0 0.09 0.03 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.07 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.39 0.47 0.4 0.65 0.56 0.79 1.7 1.54 0.82 1.11 0.0 0.37
0.37 0.0 0.27 0.3 0.11 0.04 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.0 1.01 0.49 1.68 0.4 1.05 0.61 1.64 0.8 1.18 0.0 0.48
9.48 8.98 16.72 8.5 5.61 5.27 6.83 8.54 5.88 7.05 4.5 2.37
0.29 0.32 0.49 0.41 0.33 0.26 0.38 0.58 0.45 0.38 0.33 0.31
0.32 0.0 0.79 0.36 0.46 0.3 0.41 0.89 0.37 0.83 0.26 0.0
0.21 0.71 1.48 0.25 1.0 0.25 0.48 0.13 0.1 0.58 0.25 0.23
0.0 0.35 0.79 1.84 0.16 0.0 0.16 0.91 0.62 0.28 0.28 0.0
0.0 0.0 0.0 0.23 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.07 0.0 0.0
0.0 0.0 0.36 0.29 0.11 0.0 0.14 0.07 0.03 0.02 0.02 0.0
0.21 0.09 0.88 1.41 1.09 0.0 0.09 0.13 0.05 1.11 0.1 0.42
0.0 0.02 0.02 0.08 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.19 0.0 0.14 0.04 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
2.9 2.18 3.0 2.27 3.13 2.63 2.73 3.91 3.85 2.42 3.48 2.55
2.12 2.49 4.39 2.17 2.12 1.49 2.13 2.51 0.78 0.87 0.61 0.52
37.99 34.32 38.55 42.33 36.15 34.02 38.43 37.43 36.13 32.99 28.39 28.97
0.0 0.0 0.06 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.35 0.29 0.14 0.91 0.0 0.19 0.43 0.66 0.34 0.77 0.2 0.18
0.0 0.0 0.32 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.22 0.3 0.22 0.64 0.2 0.06 0.19 0.42 0.13 0.14 0.14 0.0
0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.08 0.23 0.11 0.09 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.96 0.72 0.46 0.09 0.08 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0
0.0 0.0 0.06 0.06 0.0 0.02 0.0 0.12 0.0 0.04 0.0 0.0
4.04 6.97 6.03 5.51 7.1 6.64 7.61 8.11 6.72 7.76 7.74 2.35
0.0 0.0 0.38 0.0 0.16 0.0 0.06 0.96 0.11 0.06 0.28 0.0
1.36 1.22 1.87 2.18 2.0 2.12 2.06 1.91 2.14 2.21 2.23 1.87
0.0 0.0 0.08 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.05 0.09 0.0 0.0
7.41 10.39 12.76 11.45 10.63 7.71 9.19 9.83 8.74 6.77 5.4 6.27
0.11 0.21 0.23 0.19 0.23 0.03 0.17 0.3 0.27 0.18 0.25 0.05
3.38 1.84 4.28 3.57 3.84 2.59 2.61 3.75 3.81 2.89 2.4 1.86
0.48 1.38 1.88 2.39 2.02 1.64 2.03 1.6 2.48 2.13 1.98 1.52
1.8 1.32 1.79 1.64 1.74 1.5 1.53 1.27 1.67 1.9 1.71 1.72
0.0 0.0 0.0 0.34 0.22 0.2 0.44 0.4 0.05 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.0 0.6 0.46 0.68 0.13 0.28 0.07 0.5 0.14 0.14 0.11
0.07 0.0 0.12 0.27 0.3 0.2 0.32 0.37 0.24 0.25 0.23 0.05
1.25 1.17 1.79 1.74 1.2 1.26 1.48 1.44 1.5 1.62 1.43 1.13
0.0 0.07 0.17 0.0 0.12 0.02 0.08 0.33 0.03 0.05 0.13 0.02
0.64 0.44 2.02 1.08 1.44 0.7 1.19 1.76 1.52 1.71 0.73 0.37
0.0 0.0 0.03 0.06 0.03 0.05 0.0 0.07 0.0 0.0 0.04 0.0
0.92 0.32 0.38 0.35 0.35 0.13 0.08 0.11 0.11 0.06 0.15 0.05
1.11 1.63 1.22 1.79 0.84 1.01 0.99 1.28 1.46 0.91 0.68 0.74
18.23 16.62 17.94 17.53 17.65 17.19 19.46 17.6 17.77 17.83 18.95 18.17
0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.13 0.0 0.17 0.0 0.0 0.07 0.0
0.04 0.02 0.23 0.1 0.05 0.0 0.24 0.14 0.13 0.04 0.08 0.05
3.64 4.19 4.71 6.22 4.44 3.72 4.69 4.45 5.51 5.0 5.01 4.05
0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.22 0.07 0.1 0.05 0.0 0.05
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.09 0.17 0.18 0.08 0.14 0.06 0.31 0.14 0.15 0.13 0.02
4.14 4.82 6.29 6.29 4.4 4.18 4.05 6.18 5.12 4.41 4.69 4.46
97.35 101.78 111.26 112.13 97.76 93.11 95.88 104.3 102.66 92.83 74.94 82.46
0.0 0.0 0.13 0.27 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.08 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0
0.96 0.2 0.41 0.31 0.28 0.16 0.09 0.21 0.16 0.1 0.26 0.17
1.26 1.64 1.8 2.1 1.53 0.87 1.59 2.34 1.59 1.26 0.78 1.33
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)