Heatmap: Cluster_30 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9.05 8.25 8.2 9.23 8.87 9.01 8.7 9.3 9.25 9.45 9.72 9.37
0.0 0.29 0.2 0.41 0.38 0.13 0.06 0.3 0.58 0.19 0.17 1.11
0.0 0.1 0.29 0.34 0.07 0.04 0.2 0.0 0.0 0.0 0.29 0.54
0.35 0.49 0.22 0.58 0.65 0.27 0.6 0.18 0.79 0.39 0.57 0.92
0.5 0.56 1.31 1.04 0.63 0.67 1.0 0.39 0.75 1.08 1.0 0.14
0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.15 0.42 0.0 0.0 0.1 0.04 0.0 0.04 0.0 0.61
19.29 20.82 22.7 22.85 22.77 22.49 23.64 24.85 23.62 24.05 24.03 22.67
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.07 0.0 0.18
0.0 0.02 0.13 0.2 0.0 0.03 0.06 0.0 0.03 0.03 0.0 0.2
10.22 11.35 11.25 12.55 10.87 12.42 10.69 10.39 11.14 13.47 13.72 13.95
0.0 0.04 0.01 0.06 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.07 0.0 0.19
7.61 7.5 7.63 8.05 8.04 8.13 6.54 6.07 6.03 7.66 7.64 8.77
15.35 14.79 14.5 15.5 15.12 15.59 15.63 15.85 16.04 15.53 16.63 16.05
3.38 1.84 4.85 6.1 3.82 5.78 6.19 6.96 6.23 4.37 8.17 6.48
0.0 0.0 0.79 0.6 0.21 0.06 0.15 0.09 0.32 0.64 0.42 0.75
5.84 3.91 5.34 4.62 4.62 4.96 6.74 6.41 5.45 6.77 5.38 4.92
12.34 8.13 9.12 11.94 8.64 12.13 12.35 9.46 10.22 11.86 13.03 16.91
2.45 1.84 2.76 2.41 2.73 2.06 4.79 3.83 3.29 2.04 2.73 3.58
63.76 54.03 62.56 63.48 59.63 68.49 66.34 70.42 61.43 63.62 64.59 68.74
0.0 0.18 0.19 0.21 0.1 0.2 0.24 0.13 0.1 0.03 0.16 0.16
0.0 0.02 0.16 0.6 0.06 0.0 0.24 0.59 0.07 0.18 0.46 0.69
0.66 0.91 0.74 0.7 1.64 0.88 0.97 0.62 1.43 0.65 0.51 1.65
25.85 23.66 23.4 26.7 25.16 25.76 25.55 27.38 26.3 26.05 29.01 26.6
0.18 0.34 0.11 0.79 0.52 0.09 0.25 0.2 0.47 0.51 0.15 0.96
0.23 0.79 0.75 0.61 0.75 0.86 0.76 0.08 0.95 1.07 1.04 0.52
23.42 24.52 25.41 28.59 28.19 24.75 29.24 30.35 29.48 29.25 29.19 28.61
4.86 1.98 3.28 3.65 1.43 2.27 2.76 3.11 3.06 2.63 2.59 7.15
3.62 2.02 2.68 3.42 3.74 3.81 5.11 5.06 4.99 4.27 5.33 4.37
0.51 0.79 0.68 1.1 0.63 1.39 0.72 0.84 0.56 0.82 1.14 0.8
0.38 0.44 0.51 0.45 0.61 0.6 0.09 0.25 0.53 0.9 1.28 0.75
0.0 0.0 0.1 0.13 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.11 0.1 0.17
41.3 43.84 49.26 42.89 48.16 49.94 51.44 50.92 50.61 53.84 53.91 55.49
0.0 0.16 0.38 0.6 0.24 0.13 0.69 0.3 0.34 0.21 0.33 0.63
0.32 0.0 0.13 0.48 0.61 0.3 0.22 0.28 0.0 0.2 0.08 0.76
0.0 0.0 0.0 0.45 0.05 0.11 0.05 0.28 0.29 0.22 0.07 0.6
1.41 1.11 1.3 1.5 1.23 1.11 1.41 1.65 1.47 1.33 1.62 1.55
1.93 1.07 2.19 3.12 2.23 4.02 3.57 1.97 1.41 1.94 2.6 5.26
9.51 3.25 12.75 10.75 6.4 16.13 13.48 12.13 11.11 9.57 9.04 13.16
0.28 0.43 0.36 0.92 0.27 0.12 0.21 0.0 0.17 0.06 0.24 1.14
0.04 0.07 0.21 0.04 0.2 0.27 0.19 0.24 0.35 0.18 0.41 0.36
37.49 34.35 35.51 37.7 35.32 37.2 37.52 41.31 38.19 39.77 40.0 38.05
0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.08
0.07 0.0 0.2 0.04 0.16 0.0 0.56 0.28 0.07 0.12 0.1 0.2
0.52 0.58 0.9 0.74 0.42 0.42 0.72 0.67 0.73 0.82 1.02 0.31
0.0 0.0 0.05 0.0 0.21 0.04 0.06 0.15 0.05 0.01 0.07 0.02
1.61 1.1 0.81 1.36 0.6 0.13 0.4 2.61 0.48 0.54 2.69 2.68
4.27 4.56 5.04 4.97 5.03 5.05 4.97 4.41 4.73 4.95 4.76 4.97
31.38 28.44 31.48 31.53 31.57 32.67 32.68 35.56 33.99 31.98 33.21 34.23
0.0 0.33 0.03 0.63 0.1 0.3 0.07 0.0 0.12 0.29 0.3 0.8
0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.31 0.58 0.88 0.08 0.0 0.35 0.0
0.0 0.15 0.09 0.48 0.08 0.29 0.07 0.04 0.38 0.12 0.09 0.59
13.25 13.39 13.48 15.18 14.35 14.59 14.78 15.3 14.8 15.42 15.59 14.84
0.46 0.47 0.44 0.46 0.67 0.71 0.77 0.88 0.55 0.79 0.85 0.58
0.33 0.0 0.1 0.36 0.07 0.04 0.03 0.27 0.06 0.1 0.13 0.37
0.54 1.17 2.2 1.09 1.78 1.91 2.09 1.97 1.38 1.57 0.9 2.68
11.74 10.27 9.53 9.73 10.83 8.66 10.72 12.71 12.52 12.97 11.88 11.57
0.07 0.0 0.0 0.09 0.0 0.06 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.08
0.78 0.69 0.88 1.43 1.06 1.61 1.33 0.97 1.24 1.12 1.38 1.66
0.0 0.0 0.06 0.51 0.0 0.2 0.08 0.09 0.0 0.0 0.18 0.58
0.26 0.17 0.1 0.09 0.13 0.07 0.25 0.42 0.5 0.48 0.39 0.33
1.23 1.1 0.9 1.8 1.33 0.85 1.29 1.24 1.96 1.69 1.78 1.82
0.29 1.49 0.47 1.4 1.49 0.8 1.09 0.97 1.46 1.18 0.72 2.85
0.0 0.08 0.24 0.34 0.3 0.04 0.14 0.59 0.14 0.09 0.28 0.49

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)