Heatmap: Cluster_111 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
7.53 5.85 7.25 5.87 7.38 5.16 9.68 7.02 8.52 8.67 8.67 7.64
0.19 0.3 0.33 0.16 0.28 0.13 0.18 0.45 0.36 0.23 0.19 0.16
0.58 0.55 0.56 0.62 0.82 0.67 0.82 0.64 0.73 0.79 0.83 0.57
1.42 0.58 1.19 2.0 1.88 0.59 1.17 1.48 1.48 0.96 2.19 0.82
8.93 7.88 9.3 9.88 8.82 8.52 10.06 8.08 9.65 8.93 10.13 8.58
33.28 33.0 35.21 33.52 34.21 29.8 34.76 36.88 35.17 32.69 37.63 32.68
0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.04 0.1 0.0 0.03 0.06 0.02 0.03
2.71 2.42 3.48 4.14 3.53 2.62 2.99 4.33 4.1 3.63 4.29 2.69
0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.3 0.11 0.08 0.0 0.21 0.0
21.61 16.79 18.9 21.2 19.92 21.13 22.54 23.21 21.09 19.94 21.56 18.93
5.37 4.64 5.79 5.73 5.87 5.62 5.97 6.45 7.4 6.84 7.09 7.48
0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.14 0.03 0.0 0.0
10.85 10.99 11.39 9.6 12.03 10.06 14.07 8.42 11.74 8.46 11.59 6.38
0.7 0.2 0.18 0.44 0.35 0.58 0.39 0.68 0.5 0.49 0.3 0.56
0.07 0.0 0.22 0.21 0.55 0.07 0.24 0.23 0.33 0.45 0.34 0.07
2.49 3.17 2.68 3.05 2.8 2.78 3.18 3.04 4.05 4.32 5.07 4.08
6.18 5.2 5.87 5.82 7.15 6.54 7.12 6.15 7.05 5.93 7.36 5.29
1.09 1.93 2.22 2.31 1.72 1.32 2.12 3.02 2.6 1.71 2.17 0.99
15.61 22.73 22.25 20.43 17.17 22.88 23.76 22.85 18.16 17.12 23.28 22.19
3.72 1.39 7.73 6.36 7.5 4.3 8.21 8.78 5.15 6.73 7.02 5.81
3.05 5.25 5.4 6.89 6.7 3.88 5.11 7.32 8.16 7.48 3.74 2.38
0.64 1.69 3.22 1.69 0.68 1.33 4.29 0.87 2.22 1.92 1.83 1.69
0.18 0.08 0.6 0.1 0.65 0.33 0.48 0.74 0.44 0.66 0.58 0.11
0.0 0.02 0.04 0.0 0.05 0.09 0.18 0.04 0.1 0.01 0.1 0.09
0.42 1.92 0.5 2.5 2.19 0.9 1.42 1.41 1.32 1.07 1.26 0.75
41.42 47.19 48.97 45.54 52.05 43.7 51.33 53.58 49.36 49.42 48.66 45.94
0.5 0.12 0.35 0.36 0.21 0.19 0.33 0.18 0.32 0.45 0.46 0.22
0.21 0.29 0.47 0.28 0.23 0.25 0.9 0.89 0.92 0.61 0.76 0.05
2.98 3.03 3.26 2.79 3.64 2.39 4.5 3.0 4.3 3.69 4.74 3.81
0.04 0.12 0.11 0.05 0.1 0.06 0.07 0.2 0.13 0.13 0.12 0.05
0.11 0.0 0.12 0.0 0.08 0.18 0.25 0.05 0.21 0.16 0.08 0.04
4.03 2.51 2.87 4.65 3.86 3.71 3.5 4.05 5.1 4.94 5.77 3.96
0.0 0.0 0.15 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.17 0.08 0.17 0.17
2.82 1.97 2.77 3.4 3.73 2.75 3.12 3.24 2.86 3.47 4.11 2.74
12.62 12.5 12.63 13.54 14.51 14.11 14.15 14.1 15.63 16.15 15.52 15.86
0.28 0.34 0.28 0.33 0.2 0.23 0.44 0.36 0.55 0.49 0.37 0.2
30.03 27.53 29.57 36.31 29.59 24.6 37.81 27.54 31.59 28.5 29.98 27.54
83.99 91.47 85.41 83.4 83.6 88.0 97.79 102.27 97.63 100.89 98.81 96.8
11.63 11.61 12.82 11.52 15.53 13.05 15.98 14.83 14.79 16.41 17.86 16.66
30.09 32.16 30.32 32.78 33.22 31.59 30.19 30.29 32.61 32.51 31.42 32.73
0.35 0.06 0.33 0.3 0.2 0.11 0.19 0.27 0.2 0.13 0.93 0.36
0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.09 0.0 0.0 0.03 0.09 0.0
0.33 0.23 0.12 0.21 0.13 0.21 0.36 0.26 0.43 0.26 0.3 0.19
5.46 2.6 4.79 4.29 6.28 3.99 6.68 5.87 6.66 5.23 5.55 6.09
0.0 0.13 0.14 0.15 0.43 0.16 0.26 0.3 0.34 0.43 0.29 0.44
3.3 4.48 4.27 4.53 4.97 4.68 4.19 4.21 4.28 4.51 4.44 4.62
15.41 6.78 11.48 10.99 7.0 8.79 11.0 11.6 11.47 13.64 13.78 6.23
0.23 0.04 0.25 0.15 0.17 0.14 0.26 0.26 0.3 0.11 0.45 0.07
2.06 1.55 1.57 1.43 1.3 1.83 1.78 2.35 1.7 1.56 1.91 1.55
3.4 4.25 4.09 2.82 4.66 4.53 4.88 6.51 5.69 6.72 5.23 5.1
19.45 18.99 19.81 18.48 20.28 18.51 19.84 21.68 22.52 19.97 22.24 20.69
5.89 6.44 6.4 5.86 7.45 6.43 7.47 7.88 7.37 8.3 7.53 7.7
7.12 6.93 7.42 7.71 7.61 7.71 7.59 8.76 9.23 9.54 8.43 8.04
0.0 0.0 0.08 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.05 0.18 0.31 0.24
0.54 0.13 0.54 0.06 0.87 0.79 0.74 0.69 0.79 0.52 0.54 0.76
0.41 0.28 0.49 0.13 0.3 0.06 0.84 0.57 0.68 0.49 1.19 0.41
24.81 20.42 22.22 21.3 21.86 20.07 21.56 26.81 24.53 22.4 24.69 24.04
2.42 2.94 3.19 2.22 2.63 2.51 2.79 3.45 2.66 2.66 2.63 1.93
1.65 2.41 2.06 1.37 2.36 1.55 2.38 3.23 3.03 2.97 2.58 2.93
4.48 2.56 4.03 5.79 6.0 6.18 7.53 9.0 6.62 6.23 4.96 4.84
2.77 0.32 0.93 1.84 2.14 3.2 3.48 3.93 2.84 2.34 4.16 1.66
0.06 0.0 0.19 0.19 0.32 0.01 0.48 0.26 0.27 0.46 0.34 0.13
6.18 5.88 5.06 5.59 5.84 6.49 4.78 6.63 9.69 7.19 9.57 7.45
22.37 21.81 21.4 22.22 23.38 21.83 22.48 23.29 24.12 25.38 25.23 24.53
36.78 35.72 38.82 37.55 41.12 40.31 40.2 43.38 41.73 40.21 42.82 41.83
155.18 133.86 143.68 134.09 138.37 142.07 151.02 146.57 144.45 144.12 154.92 129.53
12.54 14.56 16.95 14.84 15.55 15.68 15.41 16.54 16.76 17.57 15.37 14.55
0.0 0.0 0.12 0.15 0.1 0.04 0.25 0.16 0.17 0.19 0.02 0.12
0.0 0.0 0.03 0.0 0.35 0.13 0.1 0.38 0.08 0.15 0.0 0.0
3.92 1.58 3.11 2.88 3.31 3.39 4.08 3.47 4.17 3.25 4.69 3.79
17.3 20.47 20.74 19.05 20.19 20.07 20.88 21.98 24.13 22.14 24.01 23.38
0.11 0.0 0.0 0.06 0.22 0.32 0.27 0.33 0.14 0.26 0.62 0.0
0.0 0.28 0.41 0.0 0.13 0.0 0.41 0.42 0.15 0.19 0.5 0.07
6.67 5.31 4.71 5.75 5.63 6.33 6.13 7.67 6.1 5.87 7.23 5.42
97.87 90.56 96.35 83.47 93.66 83.13 94.72 103.39 90.23 107.52 122.74 92.41
10.37 10.08 11.24 11.37 12.21 11.0 11.69 11.5 11.77 11.15 12.01 11.13
11.41 11.12 11.76 10.47 13.36 12.6 12.62 14.9 15.18 13.03 13.07 11.55
0.21 0.0 0.49 0.0 0.89 0.25 1.53 0.61 0.84 0.51 2.34 1.23
12.21 10.16 13.96 9.13 10.03 11.4 17.87 10.31 16.12 13.96 14.24 12.48
3.78 3.33 3.42 2.95 2.73 2.72 2.7 4.33 4.2 3.79 3.33 2.86
2.73 2.08 2.44 2.34 2.73 2.34 3.24 2.78 3.31 2.73 3.08 2.26
0.35 0.08 0.08 0.29 0.16 0.0 0.54 0.21 0.34 0.36 1.27 0.41
9.33 8.32 9.21 9.61 10.17 10.26 13.16 12.25 16.05 17.77 14.4 11.49
0.0 0.07 0.11 0.0 0.07 0.07 0.14 0.22 0.1 0.04 0.08 0.04
6.73 5.96 7.3 6.25 7.34 6.78 7.15 7.25 7.01 6.94 7.35 4.82
1.72 1.5 1.62 1.71 1.69 1.86 1.76 2.29 2.09 1.78 2.58 2.08
36.11 36.11 36.93 35.41 40.08 33.68 38.71 45.64 44.71 49.43 44.45 41.78
3.4 0.27 2.65 3.85 5.08 2.71 4.24 2.7 3.56 2.83 6.28 2.05
1.06 0.34 0.48 1.43 1.43 1.02 0.82 0.96 0.62 0.76 1.07 1.14
32.07 27.3 30.28 28.26 31.18 29.7 35.86 33.25 35.08 30.0 35.81 30.1
12.22 14.23 15.08 14.07 17.6 14.0 15.96 18.11 18.13 16.6 15.86 16.16
1.21 0.84 0.98 0.83 1.22 1.08 1.15 1.3 1.2 1.09 1.44 1.08
1.15 1.32 1.26 1.32 1.17 0.67 0.35 1.23 1.97 1.68 0.74 0.78
0.21 0.0 0.63 0.11 0.4 0.34 0.19 0.0 0.24 0.14 0.71 0.43
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.09 0.17 0.08 0.03 0.1 0.04
8.16 8.49 8.88 8.57 9.22 8.77 9.42 10.04 9.61 8.77 8.75 6.67
31.64 26.9 33.69 36.03 34.08 30.14 36.1 35.24 36.79 36.16 33.33 33.46
37.34 48.62 56.81 44.82 50.94 47.05 59.2 48.59 53.31 46.92 63.53 23.48
0.0 0.21 0.18 0.04 0.23 0.08 0.26 0.17 0.15 0.12 0.1 0.02
0.0 0.0 0.08 0.0 0.17 0.0 0.63 0.11 0.37 0.0 0.61 0.19
0.0 0.39 0.18 0.0 0.64 0.34 0.33 0.49 0.55 0.4 0.0 0.29
0.17 0.05 0.06 0.19 0.16 0.13 0.23 0.02 0.13 0.03 0.06 0.07
0.0 0.0 0.25 0.0 0.23 0.0 0.19 0.0 0.09 0.11 0.16 0.0
6.52 9.02 9.22 10.83 9.51 7.54 9.41 11.13 11.7 9.78 12.29 10.81
15.86 17.94 19.64 17.96 19.95 16.11 19.23 19.96 22.22 23.61 23.57 23.76
0.66 0.85 1.09 0.88 0.7 0.82 1.62 0.47 1.66 0.82 1.32 0.22
15.75 14.96 16.11 18.93 19.88 17.12 22.43 16.0 19.03 14.88 22.83 11.33
0.07 0.2 0.0 0.0 0.54 0.0 0.34 0.31 0.4 0.27 0.86 0.07
0.56 0.52 0.61 0.04 0.66 0.58 1.2 0.96 0.65 1.04 2.17 1.07
0.46 0.65 1.29 0.31 1.21 0.71 1.91 0.55 1.33 0.59 0.87 0.23
6.32 6.56 8.06 8.07 6.99 6.73 9.01 9.32 8.61 8.33 7.2 5.16
9.14 8.92 11.64 10.87 11.5 11.58 11.88 10.85 11.37 12.33 10.19 8.55
2.89 2.93 2.72 3.11 2.88 2.33 3.43 3.59 3.01 3.14 2.86 3.4
0.71 0.38 0.77 0.53 0.52 0.63 0.74 1.12 1.18 1.31 0.97 0.55
1.45 0.66 1.49 1.54 1.13 1.34 1.14 1.18 1.38 1.9 2.22 1.26
0.82 0.4 0.48 0.27 0.6 0.49 0.97 0.72 0.79 0.72 0.74 0.39
0.84 0.47 0.71 0.54 0.48 0.84 0.62 0.61 0.74 0.68 0.93 0.62
21.19 22.09 22.28 19.55 22.35 21.78 22.18 25.38 23.4 24.12 24.92 22.86
0.15 0.7 0.59 0.23 0.72 0.56 0.56 0.88 0.73 0.78 0.74 0.63
10.36 10.15 11.36 15.47 13.99 11.84 12.57 14.25 14.93 12.95 14.15 14.64
0.89 0.71 0.92 0.59 0.98 0.81 1.03 0.74 1.19 0.9 0.97 1.04
147.34 155.09 151.64 159.31 153.24 176.6 166.12 187.55 161.02 169.93 178.39 148.86
0.0 0.05 0.1 0.0 0.06 0.02 0.09 0.06 0.0 0.05 0.09 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)