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Heatmap: Cluster_91 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.44 -0.21 0.45 0.12 -0.37 -0.87 -0.29 -0.69 0.73 0.18 0.17 -0.64
0.14 0.04 -0.05 -0.14 -0.06 -0.16 0.11 0.07 0.03 0.0 -0.03 0.02
- 1.93 -1.4 -1.91 -0.73 0.04 0.47 -0.2 -0.43 -0.19 -1.3 0.71
-0.16 0.14 -0.12 -0.05 -0.19 -0.08 0.05 0.03 0.21 0.13 0.06 -0.09
0.12 -0.12 -0.35 -0.23 -0.26 0.03 0.02 0.12 0.08 0.23 0.13 0.11
0.13 -0.06 -0.2 -0.25 -0.11 -0.1 0.16 0.01 0.1 0.1 0.09 0.06
0.13 -0.04 -0.09 -0.28 -0.12 -0.36 0.2 0.12 0.12 0.24 0.04 -0.09
-0.41 -0.13 0.01 0.06 0.03 -0.29 0.15 0.05 0.35 0.18 0.08 -0.26
0.28 0.09 -0.13 -0.08 -0.17 -0.05 0.13 -0.01 -0.0 -0.08 -0.02 -0.0
0.05 0.13 0.06 -0.1 -0.11 -0.13 0.01 -0.06 -0.04 0.09 0.07 0.01
0.08 -0.03 -0.17 -0.5 -0.2 -0.14 0.14 0.15 0.13 0.15 0.32 -0.11
0.08 0.03 -0.1 -0.15 -0.2 -0.34 0.01 0.05 0.16 0.19 0.16 0.01
0.77 0.52 0.22 -0.1 -0.04 -0.62 -0.19 -0.01 -0.24 -0.25 -0.27 -0.39
0.19 -0.42 0.38 -0.38 -0.56 -0.45 0.02 0.04 -0.67 1.02 0.24 -0.39
- 2.1 - - - - 1.72 - - 2.14 - -
0.7 0.39 -0.08 -0.11 0.01 -0.53 -0.12 0.12 -0.09 -0.23 -0.13 -0.33
0.08 0.05 -0.03 -0.77 -0.04 -0.26 0.16 0.15 0.46 0.46 -0.03 -0.81
0.02 0.08 -0.04 -0.17 0.01 -0.12 -0.05 -0.07 -0.02 0.11 0.15 0.05
- 3.02 - - - - - - - 1.95 - -
-0.26 0.41 0.75 -0.69 -1.22 -0.37 0.06 -0.43 0.45 0.93 -0.44 -0.9
0.51 0.17 -0.02 -0.2 -0.3 -0.29 -0.03 -0.1 0.04 0.07 -0.07 0.05
0.16 -0.21 -0.33 -0.25 -0.01 -0.16 -0.03 0.09 0.14 0.2 0.19 0.07
0.1 -0.12 0.02 -0.25 -0.02 -0.3 0.03 0.09 0.21 0.16 0.1 -0.12
0.34 1.89 - - 0.25 -0.56 -0.82 - 0.06 -0.93 1.59 -
0.45 -0.29 -0.23 -0.62 -0.66 0.17 -0.14 -0.01 0.38 0.2 0.17 0.1
0.05 0.18 0.08 0.15 -0.02 -0.21 -0.0 -0.1 -0.06 0.06 -0.14 -0.06
0.34 0.0 -0.3 -0.28 -0.26 -0.14 -0.11 -0.05 0.14 0.1 0.18 0.21
0.22 -0.01 -0.22 -0.25 -0.16 -0.05 0.06 0.07 0.1 0.11 0.13 -0.06
0.63 -0.36 -0.62 -1.54 -0.14 -0.47 -0.05 -0.15 0.15 0.36 0.64 0.3
- 1.01 -0.19 -1.73 -1.03 1.1 -0.41 - 0.72 1.39 -0.16 -2.03
0.07 0.06 0.0 -0.0 -0.05 -0.04 -0.02 0.04 0.01 -0.01 -0.04 -0.02
-0.04 -0.05 0.04 -0.07 -0.06 -0.02 -0.04 0.06 0.02 0.04 0.1 0.02
0.22 0.06 -0.08 -0.12 -0.14 -0.13 0.1 0.05 -0.07 0.06 -0.02 0.04
- 1.0 0.29 - -0.6 -0.73 0.01 0.0 -0.16 1.64 0.42 -2.61
-2.08 1.52 -1.25 -1.33 0.67 0.5 -0.22 0.77 0.44 -0.18 -2.69 -3.1
0.22 0.32 0.18 -0.19 -0.1 -0.14 0.11 -0.11 0.01 -0.07 -0.15 -0.19
-0.11 0.13 0.03 -0.05 0.0 -0.22 -0.17 -0.2 0.02 0.15 0.31 0.01
- 0.03 -0.45 - - -0.1 -1.94 0.1 1.42 0.32 1.67 -0.21
0.12 0.08 0.19 -0.25 -0.1 -0.38 0.01 -0.0 0.18 0.15 -0.02 -0.1
- 1.97 1.65 - -0.03 - 1.98 - - - - -
-0.04 -0.02 0.17 0.02 -0.07 -0.1 0.01 0.07 0.04 -0.07 -0.01 -0.02
0.03 0.02 -0.11 -0.14 -0.03 -0.14 0.03 0.02 -0.04 0.1 0.13 0.08
0.02 0.08 -0.03 -0.02 -0.06 -0.04 0.04 -0.12 0.01 -0.01 0.01 0.11
0.04 0.01 -0.03 -0.19 -0.07 -0.25 0.07 0.05 0.15 0.14 0.08 -0.03
- 0.8 0.52 -1.13 -0.34 -1.14 1.19 0.04 0.26 0.8 -0.56 -2.25
-0.14 0.13 0.09 -0.05 0.01 -0.13 0.09 0.02 0.09 0.04 -0.04 -0.14
0.09 0.07 0.18 -0.02 -0.03 -0.16 -0.02 -0.13 -0.01 0.03 -0.02 -0.02
0.25 -0.04 -0.39 -0.2 -0.19 -0.13 0.14 0.06 0.2 0.03 0.17 -0.03
0.51 0.58 0.55 0.25 0.26 -1.92 -0.03 -0.24 -0.12 0.3 -0.78 -1.27
- 2.22 - 0.09 - - - - 0.91 1.03 1.24 -
-1.38 1.05 0.41 -4.34 0.18 0.25 -0.19 -0.28 0.5 0.48 -0.14 -1.19
0.14 0.28 0.16 -0.09 -0.05 -0.22 -0.03 -0.02 0.01 -0.0 -0.08 -0.16
0.25 -0.01 0.05 -0.27 -0.08 -0.27 -0.08 0.11 0.17 0.15 0.04 -0.17
- 0.65 1.27 - - -0.09 1.28 0.24 0.92 -1.61 -0.21 -1.4
0.11 -0.11 -0.18 -0.06 -0.02 -0.11 0.04 0.01 -0.0 0.08 0.1 0.1
- 1.57 0.25 - -1.02 -0.73 1.46 0.64 -0.11 0.61 - -
0.2 0.27 -0.02 -0.19 -0.12 -0.02 0.01 0.01 -0.03 -0.03 -0.01 -0.15
-0.94 -0.14 0.37 0.06 -0.16 0.01 0.06 0.23 0.19 0.12 -0.1 -0.05
-0.13 0.04 0.15 0.15 -0.03 -0.01 -0.1 0.05 -0.01 0.06 -0.04 -0.17
0.09 0.13 0.04 -0.21 -0.08 -0.15 0.06 -0.03 0.04 0.08 0.06 -0.06
0.36 0.04 -0.36 -0.34 0.04 -1.02 0.01 -0.22 0.55 0.41 0.15 -0.27
- 2.51 - -1.61 -0.39 -0.48 0.14 - - 1.34 -1.5 -0.99
0.11 0.17 0.12 -0.12 -0.21 -0.15 0.03 0.04 -0.0 -0.03 0.05 -0.06
- 0.97 - 0.78 0.25 - 1.26 -0.84 - 1.75 - -0.27
0.06 0.08 -0.09 -0.15 -0.06 -0.18 0.04 0.04 0.07 0.07 0.03 0.06
-1.83 1.01 0.37 - 0.08 - -1.41 0.8 0.52 0.28 1.12 -1.26
- 2.63 - - - - 2.05 - - - - 0.73
- 2.15 0.66 - - - - - - 2.58 - -
0.37 0.12 -0.32 -0.53 -0.07 -0.27 -0.11 0.1 -0.04 0.02 0.2 0.28
0.2 -0.07 -0.18 -0.31 -0.07 0.02 0.06 0.03 0.15 0.12 0.02 -0.05
0.31 0.2 0.01 -0.09 -0.05 -0.16 -0.05 -0.04 -0.12 -0.03 0.04 -0.09
0.13 -0.1 -0.1 -0.13 -0.06 -0.12 -0.02 -0.07 0.12 0.07 0.17 0.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.