Heatmap: Cluster_94 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.07 0.38 0.09 0.0 0.32 0.35 0.17 0.05 0.06 0.49 0.09 0.16
0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.11 0.0 0.11 0.12 0.0
0.0 0.15 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03
0.37 0.34 0.09 0.06 0.1 0.0 0.11 0.21 0.55 0.41 0.23 0.05
0.0 0.14 0.09 0.04 0.1 0.06 0.03 0.06 0.08 0.09 0.08 0.04
1.56 1.74 2.2 0.94 4.84 1.78 6.73 4.07 5.91 6.46 4.62 1.35
0.0 0.2 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.09 0.19 0.0
0.11 0.44 0.37 0.0 0.05 0.1 0.0 0.23 0.0 0.34 0.13 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.1 0.0
0.0 0.24 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.2 0.0 0.0
0.07 0.32 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.04 0.26 0.0 0.0
2.91 2.78 3.26 0.36 1.63 1.24 2.21 0.73 1.03 1.54 1.81 2.29
0.0 0.03 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.7 1.47 1.25 0.9 1.38 1.32 1.48 1.03 1.99 1.51 0.93 1.12
0.0 1.41 0.71 0.11 0.99 0.0 0.08 0.11 0.37 1.12 1.45 0.09
0.0 0.59 0.07 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.08 0.55 0.0 0.0
0.14 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.21 0.5 0.86 0.0
0.0 0.36 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0
0.0 0.04 0.06 0.0 0.03 0.03 0.09 0.0 0.05 0.14 0.08 0.05
3.6 6.2 9.65 6.39 10.4 4.79 5.97 4.43 6.07 8.45 5.82 7.15
0.0 0.09 0.03 0.0 0.03 0.08 0.0 0.0 0.0 0.25 0.05 0.0
29.31 35.79 33.69 25.01 31.84 36.12 31.31 40.23 32.25 36.9 39.46 26.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.13 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0
0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.13 0.0 0.0
0.0 0.21 0.0 0.28 0.05 0.0 0.0 0.0 0.09 0.29 0.0 0.05
0.0 0.1 0.1 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0
0.0 0.39 0.0 0.0 0.06 0.17 0.17 0.19 0.07 0.42 0.0 0.07
0.11 0.9 0.32 0.12 0.71 0.65 0.28 0.27 0.35 0.88 1.06 0.26
17.12 18.16 17.84 13.43 18.08 17.58 20.57 15.29 20.91 19.7 18.67 20.6
0.04 0.0 0.0 0.09 0.07 0.09 0.06 0.02 0.0 0.12 0.17 0.0
0.36 0.71 0.52 0.51 0.52 0.71 0.88 0.45 0.76 0.18 0.25 0.24
0.0 0.83 0.21 0.09 0.53 0.13 0.34 0.33 0.32 0.44 1.03 0.0
0.0 0.0 0.1 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.05 0.15 0.4 0.05
0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
6.65 8.56 8.44 6.94 9.89 10.42 11.76 9.86 11.51 11.71 8.95 8.01
0.0 0.16 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02
74.6 68.85 75.95 76.74 86.92 89.03 90.17 81.84 87.83 73.1 81.89 76.76
0.0 0.97 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.13 0.11
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.04 0.06 0.02 0.0
0.21 0.32 0.08 0.06 0.3 0.17 0.32 0.06 0.35 0.61 0.18 0.2
0.04 0.56 0.26 0.02 0.24 0.09 0.22 0.12 0.15 0.06 0.22 0.16
0.04 0.08 0.0 0.0 0.08 0.04 0.0 0.04 0.02 0.1 0.06 0.04
0.0 0.07 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.47 0.48 0.28 0.06 0.44 0.12 0.61 0.15 0.57 0.89 0.26 0.86
0.0 0.14 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
0.69 0.62 0.61 1.05 1.19 2.26 1.72 0.63 1.41 0.8 0.56 0.3
1.61 1.97 1.37 2.36 1.38 1.47 1.58 1.67 2.01 1.09 0.71 0.65
0.25 0.25 0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.04 0.05 0.46 0.0
0.21 0.33 0.32 0.31 0.42 0.29 0.37 0.18 0.24 0.56 0.24 0.22
3.43 4.78 7.76 6.08 7.34 10.23 11.56 6.49 7.17 11.58 7.41 1.5
36.91 37.84 36.15 42.07 42.3 41.5 43.65 41.66 39.54 44.48 40.5 42.28
0.75 0.28 0.62 0.02 0.78 0.81 1.33 0.09 0.95 1.42 0.6 0.69
1.69 1.53 1.52 2.22 2.59 2.26 2.08 1.73 2.63 2.73 2.53 1.83
46.87 49.55 50.5 54.58 58.3 50.15 60.61 58.82 56.61 60.15 55.15 54.14
16.7 17.19 17.3 17.41 17.28 18.46 16.68 18.12 17.07 18.25 16.96 17.89
0.0 1.48 0.53 0.62 0.54 0.23 0.31 1.11 0.44 1.13 0.71 0.22
0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.0
30.28 32.5 37.15 36.61 38.54 42.79 36.86 37.98 45.56 37.86 38.56 32.59
0.0 0.02 0.09 0.02 0.08 0.08 0.06 0.09 0.05 0.09 0.02 0.0
0.28 0.66 0.42 0.2 0.34 0.67 0.22 0.46 0.38 0.81 0.38 0.15
0.0 0.0 0.23 0.0 0.07 0.0 0.14 0.0 0.0 0.25 0.0 0.07
0.18 0.19 0.11 0.31 0.4 0.34 0.17 0.12 0.06 0.73 0.54 0.03
0.32 0.73 0.38 0.0 0.54 0.17 0.22 0.0 0.27 0.31 0.3 0.0
0.0 0.27 0.01 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.05 0.35 0.14 0.0
0.0 0.22 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.04 0.0 0.02 0.0 0.1 0.0 0.0
0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0
122.14 124.64 132.65 122.63 147.71 141.69 139.64 134.75 141.91 136.65 124.69 132.26
0.0 1.1 0.02 0.04 1.01 0.0 0.03 0.15 0.05 1.27 0.0 0.02
0.78 0.81 2.14 1.25 0.83 0.77 0.34 0.61 0.44 0.58 0.83 0.24
0.0 0.18 0.06 0.0 0.03 0.0 0.03 0.09 0.03 0.03 0.13 0.0
5.13 4.18 5.47 5.87 6.9 7.15 6.57 4.72 8.33 6.97 5.71 4.83
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0
0.0 0.54 0.0 0.0 0.06 0.0 0.23 0.09 0.2 0.51 0.25 0.13
1.59 0.98 1.99 1.14 1.35 2.57 2.41 1.46 1.61 2.55 1.83 1.34
0.26 0.0 0.99 0.61 0.35 1.12 1.1 0.93 0.57 0.78 0.83 0.19
0.0 0.29 0.07 0.0 0.12 0.08 0.08 0.0 0.05 0.0 0.08 0.14
0.04 0.15 0.14 0.05 0.02 0.06 0.02 0.15 0.02 0.19 0.09 0.03
0.2 1.11 0.88 0.98 1.02 1.57 1.35 0.43 1.04 1.3 1.35 0.43
0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0
22.35 24.18 22.72 17.32 20.16 14.12 15.8 15.87 16.5 21.38 25.93 20.0
2.96 2.48 2.22 0.57 1.15 0.75 2.03 0.39 1.66 2.97 1.26 3.19
0.04 0.11 0.04 0.02 0.11 0.05 0.0 0.0 0.05 0.1 0.04 0.05
0.0 0.0 0.09 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.1 0.28 0.0 0.0
0.0 0.21 0.15 0.02 0.11 0.1 0.0 0.02 0.05 0.15 0.28 0.05
5.36 7.07 6.37 6.7 7.92 7.29 7.7 7.38 7.7 7.95 8.19 7.53
0.79 0.52 0.73 0.53 0.48 0.27 0.72 0.35 0.55 0.57 0.57 0.52
0.0 0.0 0.06 0.0 0.21 0.0 0.03 0.05 0.1 0.19 0.25 0.04
0.0 0.0 0.22 0.11 0.0 0.0 0.21 0.0 0.1 0.32 0.0 0.22

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)