Heatmap: Cluster_252 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.35 -0.36 -0.01 0.3 0.08 -0.13 0.34 0.17 0.2 -0.01 -0.1 -0.38
-0.39 -0.37 -0.09 0.35 0.25 0.11 0.35 0.05 -0.1 -0.14 -0.2 -0.07
-0.06 -0.12 -0.05 0.13 0.04 -0.12 0.14 0.38 0.01 -0.11 0.04 -0.42
-0.11 -0.09 -0.0 0.17 0.04 0.01 0.13 0.07 0.05 -0.04 -0.11 -0.15
-0.36 -0.16 -0.07 -0.08 0.19 -0.0 0.0 0.08 0.17 0.06 0.15 -0.07
-0.09 -0.19 -0.02 0.09 0.07 -0.02 0.01 0.16 0.08 0.02 -0.06 -0.07
-0.27 -0.24 0.0 0.04 0.06 -0.15 0.18 0.11 0.21 0.03 -0.01 -0.06
-0.65 -0.67 0.02 0.49 0.41 0.11 -0.06 0.07 0.14 -0.1 0.12 -0.37
-0.24 -0.29 0.11 0.05 0.02 0.03 0.11 0.15 0.11 0.01 -0.11 -0.03
-0.12 -0.27 0.07 0.0 0.2 -0.01 0.15 0.1 0.12 -0.15 -0.03 -0.12
-0.3 -0.08 -0.02 -0.34 0.1 -0.01 0.09 0.16 0.16 0.01 0.04 0.1
-0.28 -0.1 -0.07 -0.3 0.12 0.17 0.1 0.01 0.04 0.06 0.09 0.07
-0.15 -0.12 0.05 0.1 -0.0 -0.24 0.05 0.17 0.2 -0.04 0.06 -0.15
-0.14 -0.22 -0.48 -0.36 0.11 0.28 0.16 0.03 -0.04 0.12 0.15 0.18
-0.07 -0.28 -0.06 0.18 0.19 0.09 0.08 0.06 -0.02 -0.12 -0.15 0.03
-0.23 -0.92 -0.17 0.16 0.34 -0.17 0.21 0.09 0.16 0.22 -0.07 -0.01
-0.27 -0.3 0.17 0.28 0.16 -0.06 0.32 0.27 0.03 -0.07 -0.3 -0.51
-0.46 -0.15 0.2 0.16 0.01 0.16 0.02 0.17 0.25 -0.04 -0.23 -0.28
-3.37 -1.68 -0.9 0.38 0.66 0.71 0.95 0.68 0.36 -0.39 -0.95 -1.18
-0.26 -0.13 -0.16 -0.03 0.17 -0.17 0.15 0.13 0.11 0.21 0.02 -0.13
-0.5 -0.14 0.01 0.13 -0.01 0.08 0.06 0.15 0.19 0.19 0.04 -0.36
-0.25 -0.26 0.18 0.16 0.39 -0.1 0.04 0.16 0.01 -0.19 -0.14 -0.16
-0.71 -0.69 0.04 -0.63 0.21 0.4 0.26 0.3 0.1 -0.07 -0.08 0.28
-0.12 -0.52 -0.08 0.35 0.29 0.17 0.07 0.2 0.1 0.08 -0.36 -0.48
-0.42 -0.31 0.09 0.37 0.39 0.22 0.22 0.12 -0.03 -0.11 -0.3 -0.6
-0.54 -0.11 0.1 -0.01 0.15 -0.04 0.11 0.19 0.2 -0.1 -0.03 -0.07
-0.66 -0.08 -0.31 -0.4 0.15 -0.14 0.22 0.22 0.26 0.16 0.31 -0.08
-0.34 -0.24 0.02 0.13 0.17 0.02 0.08 0.27 0.14 -0.06 -0.16 -0.17
-0.51 -0.2 0.13 0.42 0.2 0.03 0.2 0.12 0.07 -0.16 -0.18 -0.4
-0.36 -0.03 0.04 0.18 0.01 -0.02 0.08 0.21 0.07 -0.08 -0.09 -0.1
-0.62 -0.36 -0.18 0.25 -0.02 -0.1 0.18 0.27 0.29 0.16 0.08 -0.26
-0.13 -0.26 -0.06 0.04 0.13 0.12 0.09 0.09 0.11 -0.06 -0.14 -0.01
-0.47 -0.3 0.11 -0.04 0.16 -0.07 0.2 0.17 0.06 0.05 0.03 -0.03
-0.4 -0.2 0.13 0.09 0.16 0.08 0.1 0.27 0.15 -0.13 -0.25 -0.15
-0.68 0.1 -0.24 0.92 0.42 -0.55 -0.04 0.08 0.05 -0.03 -0.15 -0.74
-0.5 -0.28 -0.03 0.14 0.02 -0.19 0.09 -0.02 0.26 0.21 0.03 0.09
-1.14 -0.19 -0.11 0.59 0.11 0.12 0.49 0.16 0.18 0.03 -0.35 -0.73
-0.51 -0.17 0.07 -0.07 0.18 0.11 0.17 0.06 0.07 -0.07 -0.02 0.06
-0.31 -0.29 0.08 0.07 0.2 0.16 0.1 0.15 0.09 0.06 -0.26 -0.18
-0.31 -0.12 -0.02 0.15 0.11 -0.04 0.2 0.32 0.11 0.09 -0.27 -0.4
-0.15 -0.2 0.16 -0.34 0.06 0.04 0.02 0.18 0.15 -0.04 0.03 0.0
-0.29 -0.16 -0.02 0.13 0.17 -0.05 0.17 0.23 0.15 -0.03 -0.1 -0.32
-0.14 -0.09 0.01 0.05 0.18 0.04 -0.02 0.07 0.09 -0.07 -0.08 -0.09
-0.44 -0.33 -0.05 0.0 0.31 -0.19 -0.03 0.11 0.3 0.3 0.02 -0.23
-0.18 -0.29 0.05 -0.05 0.25 -0.06 0.17 0.2 0.1 -0.1 -0.06 -0.14
-0.57 -0.19 -0.19 0.21 0.3 0.3 0.3 0.22 0.07 -0.24 -0.37 -0.19
-0.31 -0.31 -0.01 0.25 0.06 -0.05 0.01 0.31 0.1 0.15 -0.13 -0.23
-0.31 -0.27 0.06 0.13 0.04 0.03 0.08 0.18 0.28 0.09 -0.21 -0.27
-0.75 -0.32 0.19 0.45 -0.05 0.16 0.18 0.17 0.26 0.02 -0.14 -0.65
-0.99 -0.6 0.37 0.44 0.64 -0.39 0.37 0.04 0.15 -0.11 -0.05 -0.86
-0.81 -0.39 -0.14 0.2 0.26 0.27 0.62 0.47 0.2 -0.33 -0.52 -0.63
-0.57 -0.34 0.0 0.19 0.21 0.24 0.15 0.25 -0.02 -0.17 -0.05 -0.14
-0.72 -0.51 -0.12 0.55 0.27 0.18 -0.04 -0.21 0.08 0.21 -0.07 -0.06
-1.36 -0.27 0.71 0.54 0.02 -0.02 0.07 0.2 -0.13 -0.25 -0.41 -0.03
-0.11 -0.09 0.03 0.06 0.14 0.0 0.06 0.03 0.07 -0.04 -0.13 -0.05
-0.78 -0.17 0.15 0.37 0.15 -0.12 0.11 0.29 0.11 -0.02 -0.12 -0.29
-0.06 -0.29 0.06 0.05 0.24 0.06 0.02 0.13 -0.06 -0.0 -0.25 0.0

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.