Heatmap: Cluster_297 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
-0.29 -0.44 -0.15 -0.09 0.24 0.02 -0.12 0.39 0.04 0.09 0.03 0.09
-0.61 -0.59 -0.08 -0.02 0.16 0.02 0.27 0.1 0.2 0.13 0.11 0.04
-0.17 -0.58 -0.43 -0.15 -0.0 0.03 0.33 -0.1 0.26 0.2 0.28 0.03
-0.08 -0.15 -0.11 0.05 0.06 -0.06 0.04 0.07 0.08 0.08 0.04 -0.05
-0.07 -0.53 -0.4 -0.19 0.05 0.07 0.15 0.1 0.19 0.11 0.29 0.01
0.01 -0.11 -0.03 0.05 0.04 -0.06 -0.12 -0.2 0.03 0.13 0.12 0.09
-0.14 -0.3 -0.33 -0.12 0.03 0.05 0.14 -0.06 0.14 0.13 0.13 0.21
-0.13 -0.35 -0.16 -0.03 0.11 0.09 -0.03 0.14 0.03 0.01 0.02 0.22
-0.39 -0.4 -0.2 0.11 0.07 0.11 0.2 0.08 0.12 0.13 0.05 -0.03
-0.14 -0.18 -0.14 -0.16 0.12 0.11 0.07 0.05 0.05 0.07 0.01 0.1
-0.2 -0.72 -0.23 -0.09 0.2 0.05 0.09 0.29 0.16 0.03 0.18 -0.01
-0.17 -0.51 -0.16 -0.04 0.1 0.04 0.15 0.1 0.14 0.11 0.07 0.03
-0.74 -1.03 -0.45 0.48 0.25 -0.01 0.62 0.26 0.31 -0.14 0.28 -0.97
-1.84 -0.32 -0.48 0.13 0.07 0.47 -0.17 0.29 0.05 0.21 0.28 0.2
-0.34 -1.22 -0.33 0.07 -0.02 -0.22 -0.24 -0.08 0.54 0.52 0.4 0.12
-0.17 -0.22 -0.14 -0.07 0.17 0.08 0.05 0.09 0.03 0.03 0.02 0.08
-0.11 -0.21 -0.13 -0.01 0.07 0.04 0.03 0.02 0.01 0.14 0.09 0.02
-0.07 -0.53 -0.18 0.04 0.1 0.03 -0.07 0.05 0.01 0.08 0.28 0.12
-0.07 -0.29 -0.23 -0.01 0.27 0.28 0.2 -0.01 -0.13 -0.03 -0.07 -0.04
-0.22 -0.35 -0.41 -0.47 0.04 0.25 0.31 0.5 0.04 0.04 -0.09 0.02
-0.09 -0.06 -0.09 -0.03 -0.06 -0.02 -0.11 -0.15 0.13 0.14 0.12 0.17
-0.14 -0.12 -0.03 0.02 0.03 0.03 -0.01 0.06 -0.01 0.06 0.09 0.0
-0.37 -0.67 0.05 0.24 -0.05 0.07 0.04 0.2 -0.05 0.25 0.16 -0.13
-0.16 -0.16 -0.03 -0.13 0.01 0.05 0.12 0.06 0.06 0.11 0.03 0.01
-0.37 -0.07 -0.03 0.07 0.02 0.0 -0.03 0.12 -0.0 0.13 0.08 0.04
-0.11 -0.18 -0.17 -0.11 0.01 0.06 0.05 0.14 0.06 0.05 0.14 0.02
-0.16 -0.19 -0.11 0.12 0.14 -0.04 0.02 0.03 0.05 0.12 0.04 -0.07
-0.45 -0.51 0.01 -0.02 0.17 0.08 -0.01 0.03 0.02 0.31 0.24 -0.08
-0.15 -0.18 -0.12 -0.14 0.04 -0.07 0.14 0.05 -0.0 0.17 0.17 0.04
-0.34 -0.78 -0.49 0.0 0.26 0.26 0.19 0.09 0.1 0.17 0.12 0.04
-0.38 -0.65 -0.28 -0.09 0.05 0.06 0.13 0.15 0.23 0.2 0.22 0.1
-0.21 -0.59 -0.1 0.09 0.28 0.15 0.27 -0.08 0.47 -0.09 -0.07 -0.46
-0.24 -0.43 -0.32 -0.04 0.0 -0.19 -0.23 -0.11 0.27 0.29 0.31 0.39
0.07 -0.14 -0.1 -0.12 -0.07 -0.18 -0.12 0.09 0.07 0.14 0.13 0.16
0.01 -0.21 -0.17 -0.16 -0.0 -0.08 0.06 0.07 -0.0 0.26 0.18 -0.04
-0.18 -0.06 -0.14 -0.13 0.01 -0.02 0.02 0.17 0.12 0.02 0.18 -0.05
-0.11 -0.48 -0.12 -0.12 0.18 0.02 0.18 0.0 0.08 0.1 0.14 0.02
-0.74 -1.01 -0.12 -0.22 0.22 0.38 0.02 0.28 0.39 0.22 0.19 -0.3
-0.6 -0.12 0.06 -0.16 -0.26 0.05 -0.09 0.05 0.14 0.35 0.38 -0.06
-0.48 0.02 0.12 -0.45 0.1 0.26 -0.24 -0.16 -0.01 0.39 0.29 -0.14
-0.46 -0.29 -0.13 -0.12 0.19 0.14 -0.02 0.04 0.14 0.28 0.08 -0.01
-0.43 0.05 -0.2 -0.06 -0.12 -0.19 -0.08 -0.4 0.13 0.18 0.52 0.3
-0.1 -0.5 -0.27 -0.14 0.03 0.04 0.14 0.24 0.19 -0.04 0.26 -0.04
-0.2 -0.27 -0.19 0.0 0.08 0.16 0.11 -0.01 0.1 0.09 0.04 0.03
-0.27 -0.56 -0.26 -0.12 0.08 0.08 0.11 0.1 0.17 0.19 0.21 0.08
-0.14 -0.06 -0.1 -0.19 -0.06 0.07 0.03 0.01 0.06 0.1 0.1 0.14
-0.29 -0.32 -0.07 0.02 0.04 0.12 -0.08 -0.05 0.13 0.36 0.15 -0.14
-0.27 -0.31 -0.09 -0.07 0.04 0.05 0.02 0.06 0.09 0.14 0.18 0.07
-0.41 -0.32 -0.17 -0.04 0.14 0.17 0.32 0.15 0.11 0.16 0.09 -0.43
-0.4 -0.1 -0.18 -0.0 -0.27 0.28 -0.19 -0.06 0.23 0.41 -0.15 0.2
-0.25 -0.03 0.03 -0.14 -0.0 0.02 0.03 -0.0 0.03 0.16 0.22 -0.11
-0.49 -0.33 -0.29 -0.27 0.22 0.02 -0.37 -0.19 0.2 0.46 0.51 0.1
-0.07 -0.04 -0.13 0.07 0.13 0.17 0.04 -0.0 0.04 0.05 -0.12 -0.19
-0.3 -0.24 0.01 -0.05 0.09 0.01 0.0 0.04 0.15 0.14 0.16 -0.09
-0.11 -0.37 -0.13 -0.02 0.24 0.01 -0.07 -0.04 0.12 0.22 0.19 -0.17
-0.3 -0.34 -0.08 -0.04 0.07 -0.02 0.13 0.18 0.09 0.11 0.11 -0.03
-0.01 -0.48 -0.41 0.08 0.15 0.09 0.08 0.07 0.07 0.13 0.11 -0.03
-0.1 -0.25 -0.04 0.04 0.04 0.0 0.03 0.11 0.05 0.08 0.08 -0.09
-0.59 -0.63 -0.61 -0.24 -0.05 0.22 0.24 0.23 0.18 0.24 0.35 0.15
-0.35 -0.46 -0.21 -0.07 0.18 0.02 0.12 0.09 0.24 0.14 0.06 0.05
0.03 -0.52 -0.07 -0.16 -0.16 -0.23 -0.14 -0.06 0.19 0.18 0.28 0.41
-0.1 -0.14 -0.19 -0.21 0.02 -0.03 0.09 0.09 0.23 -0.12 0.14 0.14
-0.51 -0.37 -0.27 -0.45 0.24 0.12 0.24 0.23 0.18 0.15 0.09 0.05
0.09 -0.61 -0.29 -0.16 0.02 0.0 -0.11 0.01 0.11 0.29 0.37 0.02
-0.42 -0.04 -0.28 -0.18 -0.01 -0.19 -0.21 -0.3 0.33 0.42 0.42 0.14
0.08 -0.65 -0.25 -0.01 0.33 0.04 0.14 -0.0 0.18 0.03 0.01 -0.11
-0.37 -0.53 -0.23 -0.11 0.18 0.09 0.24 0.16 0.14 0.12 0.0 0.09

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.