1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_10 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.0 0.0 0.27 0.0 0.47 0.47 0.0 0.0 0.0 0.06 0.17 0.0
0.0 0.09 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.05 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.02 0.09 0.0 0.0 0.02 0.0
0.28 0.0 0.1 0.0 0.0 0.02 0.0 0.08 0.01 0.0 0.07 0.0
0.0 0.0 1.22 0.11 0.73 0.0 0.67 0.37 0.51 0.72 0.21 0.0
0.0 0.0 0.76 0.0 0.71 0.17 0.33 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0
1.34 1.79 2.08 0.89 2.07 1.34 1.75 1.75 1.32 1.65 1.26 2.14
0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.21 0.09 0.0 0.0 0.08 0.12 0.0
0.2 0.02 0.19 0.06 0.16 0.0 0.04 0.04 0.07 0.01 0.15 0.0
0.0 0.0 0.07 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.05 0.09 0.0 0.2
0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11
0.0 0.2 0.15 0.0 0.14 0.08 0.0 0.0 0.18 0.13 0.0 0.0
0.11 0.38 1.75 0.22 1.55 0.15 0.21 0.32 0.44 0.46 0.16 0.81
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11
1.08 2.61 5.99 3.85 7.48 3.78 6.16 5.34 6.28 5.28 2.31 3.47
0.02 0.22 1.47 0.02 1.4 0.03 0.05 0.05 0.06 0.03 0.0 0.32
0.0 0.0 0.08 0.04 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.43 1.95 4.28 1.37 3.97 2.06 1.21 1.51 0.54 1.28 0.43 1.42
0.35 0.0 0.21 0.32 0.69 0.41 0.17 0.11 0.08 0.15 0.0 0.09
0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.61 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0
28.94 51.9 61.08 34.09 58.94 31.43 24.57 27.52 40.85 49.9 24.21 31.68
0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.18 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.1 0.38 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.13 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.28 0.92 0.9 0.47 0.52 0.48 0.24 0.44 0.38 0.57 0.11 0.04
7.54 25.64 50.65 21.31 51.51 18.82 30.23 22.56 26.29 38.74 19.36 33.89
0.0 0.19 0.45 0.0 0.56 0.0 0.23 0.0 0.1 0.13 0.0 0.51
11.1 8.72 16.72 4.53 7.2 2.71 4.74 5.94 3.45 4.41 2.93 3.93
0.0 0.0 0.28 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.87 3.25 4.33 3.23 4.79 4.29 4.54 6.47 4.61 6.51 5.39 2.88
0.32 0.17 0.32 0.27 0.07 0.49 0.06 0.09 0.3 0.06 0.08 0.13
1.14 0.42 0.53 0.24 0.88 0.25 0.57 0.87 0.61 0.18 1.34 0.56
1.29 0.77 4.93 0.54 4.83 1.11 1.24 0.93 0.52 1.0 0.33 1.29
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.45 0.94 1.65 0.57 0.85 0.56 0.59 0.39 0.6 0.48 0.62 0.42
0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
18.29 17.58 18.25 17.06 20.32 18.39 17.33 16.52 17.42 18.08 15.45 14.89
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
0.0 0.05 0.08 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0
0.0 0.07 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.1
0.11 0.0 0.04 0.0 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.42 5.35 10.66 3.95 12.68 4.98 7.58 7.65 6.37 7.91 4.01 5.36
24.6 19.06 23.47 19.54 20.34 16.67 20.07 20.1 20.07 21.31 19.95 18.41
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.5 0.19 1.3 0.57 1.07 0.22 0.21 0.59 0.15 0.73 0.0 0.09
0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.1 0.06 0.0
1.55 3.2 7.72 2.84 5.87 4.06 6.56 5.51 3.47 4.65 2.11 3.7
4.96 5.9 14.49 2.52 9.05 2.11 4.06 1.68 2.64 5.88 1.73 5.58
0.11 0.0 0.18 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.12 0.05 0.07 0.0
1.74 2.2 1.71 2.34 1.85 1.84 1.6 1.83 1.94 2.18 1.75 3.31
0.94 1.78 1.24 3.97 3.54 4.71 1.89 2.19 1.92 1.17 1.85 1.26
0.26 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.07 0.18 0.0 0.16 0.13 0.0 0.07 0.0 0.09 0.0 0.0
0.0 0.09 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
5.41 4.31 4.08 3.74 3.82 3.34 3.86 3.67 3.84 3.93 4.68 4.66
0.11 0.37 0.7 0.1 0.46 0.31 0.13 0.49 0.25 0.03 0.62 0.53
0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0
64.21 48.61 58.81 49.37 48.81 44.1 47.93 44.64 49.62 54.76 56.3 55.04
0.23 0.0 0.15 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.1 0.0
79.83 74.4 67.7 70.19 69.53 70.41 71.98 73.15 70.48 71.35 80.51 75.93
2.03 11.61 18.95 6.63 13.49 9.36 11.05 13.84 11.84 10.54 5.72 8.43
0.14 0.41 0.23 0.0 0.13 0.0 0.0 0.08 0.12 0.13 0.08 0.07
0.11 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.46 3.07 5.69 4.27 6.44 3.6 3.86 4.15 4.51 5.18 3.5 2.6
0.0 0.05 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.07 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.06 0.02
0.0 1.0 0.55 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0
0.0 0.08 0.18 0.11 0.15 0.12 0.14 0.0 0.1 0.06 0.07 0.02
0.65 0.38 0.48 0.27 0.31 0.35 0.4 0.56 0.5 0.73 0.38 0.56
0.0 0.16 0.14 0.0 0.05 0.04 0.02 0.0 0.18 0.07 0.11 0.02
0.0 0.0 0.12 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.16 0.28 0.25 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.05 0.0 0.03 0.0 0.03
0.02 0.08 0.12 0.0 0.12 0.06 0.03 0.15 0.0 0.11 0.17 0.09
0.0 0.11 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.0 0.09
0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.12 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.54 1.41 0.26 1.58 0.44 0.3 0.22 0.37 0.48 0.24 0.12
1.8 1.79 2.48 1.45 2.22 1.79 2.19 2.1 2.12 1.86 1.29 2.03
0.42 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.08 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03
0.14 0.08 0.0 0.0 0.16 0.17 0.06 0.0 0.05 0.06 0.0 0.16
0.84 1.4 2.37 0.67 3.01 0.98 1.42 0.86 1.67 2.45 1.24 2.87
0.0 0.0 0.22 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.0 0.07 0.0 0.02 0.08 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
8.0 6.34 6.14 6.0 6.83 5.82 7.09 7.31 7.82 8.68 6.9 6.85

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)