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Heatmap: Cluster_73 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.05 -0.44 -0.66 -0.46 -0.16 -0.29 -0.01 0.08 0.25 0.26 0.48 0.4
0.04 -0.19 -0.96 -1.29 -0.5 -0.48 -0.21 0.08 0.46 0.56 0.32 0.79
0.0 -0.3 -0.32 -0.28 -0.19 -0.19 -0.02 0.03 0.18 0.24 0.34 0.29
0.11 -0.26 -0.34 -0.38 -0.32 -0.28 -0.06 0.11 0.29 0.24 0.21 0.38
0.32 -0.25 -0.64 -0.63 -0.27 -0.21 -0.06 0.15 0.13 0.16 0.3 0.5
0.13 -0.13 -0.32 -0.42 -0.27 -0.26 0.06 0.16 0.16 0.12 0.29 0.25
-0.17 -0.04 -0.19 -0.22 -0.24 -0.12 -0.07 0.08 0.12 0.05 0.27 0.37
0.01 -0.18 -0.22 -0.23 0.02 -0.27 -0.01 -0.01 0.08 0.22 0.21 0.26
0.67 -0.76 -0.83 -1.13 -0.74 -0.37 -0.62 -0.24 0.43 0.51 0.66 0.66
0.18 -0.02 -0.22 -0.42 -0.25 -0.18 -0.14 0.08 0.1 0.15 0.15 0.38
-0.04 -0.04 -0.22 -0.25 -0.12 -0.11 -0.02 0.08 0.11 0.09 0.13 0.29
0.58 -0.39 -1.16 -0.64 -0.41 -0.51 -0.09 -0.09 0.35 -0.05 0.7 0.54
-0.52 -0.24 -0.2 -0.35 -0.05 -0.23 0.24 -0.06 0.21 0.15 0.25 0.48
0.02 -0.05 -0.12 -0.29 -0.26 -0.23 -0.06 0.08 0.01 0.17 0.27 0.31
-0.23 -0.06 -0.07 -0.23 -0.23 -0.21 0.01 0.06 0.11 0.21 0.21 0.29
0.06 -0.12 -0.2 -0.07 0.01 -0.2 0.02 -0.11 0.14 0.11 0.15 0.15
-0.11 -0.21 -0.17 -0.21 -0.26 -0.31 0.09 -0.03 0.33 0.22 0.2 0.26
0.49 -0.52 -0.68 -0.59 -0.34 -0.35 -0.23 0.15 0.28 0.24 0.39 0.44
-0.28 -0.18 -0.01 -0.17 -0.05 -0.05 0.01 -0.02 0.08 0.24 0.23 0.12
-0.1 -0.12 -0.02 -0.03 -0.14 -0.17 -0.06 -0.01 0.09 0.09 0.24 0.17
0.28 -0.11 -0.44 -0.23 -0.23 -0.17 -0.04 -0.01 0.21 -0.07 0.23 0.36
0.02 -0.01 -0.13 -0.15 -0.1 -0.2 -0.09 0.01 0.09 0.07 0.15 0.27
0.03 -0.07 -0.12 -0.06 -0.09 -0.15 -0.07 -0.13 0.09 0.12 0.16 0.23
-1.76 -0.73 -0.92 -0.17 0.51 -0.28 -0.33 0.15 -0.02 0.45 0.69 0.64
0.22 -0.08 -0.26 -0.27 -0.29 -0.13 -0.12 -0.17 -0.11 0.08 0.24 0.6
-0.01 -0.07 -0.11 -0.22 -0.11 -0.14 0.03 0.04 0.15 0.09 0.09 0.19
0.01 -0.79 -0.68 -0.87 -0.16 0.0 -0.05 0.35 0.39 0.21 0.33 0.47
0.01 -0.35 -0.53 -0.74 -0.15 -0.14 0.07 0.09 0.14 0.24 0.2 0.65
0.03 -0.35 -0.35 -0.19 -0.51 -0.39 -0.06 -0.08 0.39 0.5 0.26 0.33
-0.1 -0.19 -0.18 -0.36 -0.07 -0.06 -0.1 0.1 0.03 0.22 0.27 0.3
0.12 -0.16 -0.17 -0.18 -0.08 -0.14 -0.02 -0.03 0.03 0.08 0.19 0.27
0.07 -0.27 -0.27 -0.14 -0.0 -0.11 -0.02 0.09 0.04 0.13 0.17 0.22
0.08 -0.17 -0.13 -0.16 -0.09 -0.11 -0.08 -0.05 0.08 0.12 0.1 0.32
0.2 -0.14 -0.28 -0.28 -0.2 -0.01 -0.06 -0.03 0.02 0.18 0.15 0.31
0.15 -0.07 -0.21 -0.39 -0.21 -0.3 -0.09 0.08 0.09 0.15 0.28 0.32
-0.05 -0.08 -0.11 -0.15 -0.11 -0.1 -0.04 0.06 0.09 0.08 0.16 0.2
-0.15 -0.71 -0.55 -0.96 -0.21 -0.13 -0.05 0.37 0.48 0.26 0.35 0.47
0.02 -0.03 -0.17 -0.22 -0.09 -0.18 -0.02 0.07 0.11 0.1 0.18 0.17
0.05 -0.11 -0.12 -0.28 -0.22 -0.21 -0.07 0.0 0.18 0.1 0.25 0.28
-0.01 -0.34 -0.53 -0.47 -0.33 -0.19 -0.04 0.22 0.2 0.36 0.38 0.34
0.17 -0.23 -0.24 -0.15 -0.05 -0.19 -0.05 -0.0 0.06 0.0 0.23 0.32
0.41 -0.05 -0.55 -0.81 -0.68 -0.5 -0.12 -0.11 0.21 0.22 0.32 0.77
-0.01 -0.22 -0.38 -0.22 -0.16 0.04 -0.14 0.15 0.08 0.19 0.22 0.3
0.0 0.08 -0.12 -0.23 -0.18 -0.16 -0.05 0.11 -0.0 0.14 0.16 0.18
-0.0 -0.15 -0.18 -0.22 -0.04 -0.15 0.06 0.04 0.08 0.06 0.12 0.29
0.02 -0.1 -0.2 -0.36 -0.2 -0.16 -0.02 0.06 0.15 0.16 0.2 0.3
0.13 -0.03 -0.12 -0.2 -0.05 -0.17 -0.1 -0.07 0.12 0.16 0.21 0.05
0.07 -0.1 -0.17 -0.3 -0.2 -0.13 -0.09 0.08 0.04 0.21 0.28 0.17
0.15 -0.08 -0.25 -0.36 -0.1 -0.12 -0.09 0.07 0.02 0.13 0.17 0.32
0.15 -0.26 -0.26 -0.18 0.05 -0.13 -0.05 -0.03 0.08 0.14 0.16 0.23
0.05 -0.08 -0.15 -0.07 -0.03 -0.08 0.03 -0.03 0.08 0.04 0.07 0.14
-0.06 -0.3 -0.26 -0.14 -0.01 -0.19 -0.12 -0.09 0.22 0.26 0.24 0.26
0.14 -0.06 -0.06 -0.25 -0.22 -0.21 -0.12 0.05 -0.02 0.14 0.26 0.24
-0.19 -0.24 -0.33 -0.33 0.08 0.02 -0.1 -0.25 -0.02 0.14 0.41 0.51
0.09 -0.28 -0.2 -0.23 -0.03 -0.19 -0.05 -0.02 0.13 -0.02 0.22 0.43
0.38 -0.36 -0.74 -0.52 -0.32 -0.09 -0.14 0.03 0.29 0.22 0.42 0.29
0.1 -0.2 -0.16 -0.14 0.05 -0.22 0.07 -0.06 0.11 0.04 0.12 0.21
-0.13 -0.17 -0.15 -0.28 -0.12 -0.22 0.11 0.06 0.26 0.12 0.07 0.32
0.26 -0.15 -0.17 -0.43 -0.23 -0.11 0.11 -0.11 -0.03 0.06 0.15 0.44
0.06 -0.19 -0.3 -0.31 -0.1 -0.21 0.14 -0.06 0.09 0.15 0.3 0.25
0.16 -0.13 -0.16 -0.24 -0.09 -0.21 0.04 -0.03 0.14 0.04 0.17 0.2
-0.01 -0.26 -0.4 -0.52 -0.21 -0.1 0.05 0.14 0.22 0.18 0.23 0.4
-0.04 -0.03 -0.12 -0.21 -0.22 -0.06 -0.11 0.02 0.08 0.18 0.22 0.17
0.19 -0.04 -0.18 -0.13 -0.03 -0.28 -0.09 -0.06 0.04 0.08 0.21 0.22
-0.17 -0.11 -0.08 -0.11 -0.08 -0.02 0.03 0.01 0.09 0.1 0.17 0.13
0.12 -0.16 -0.25 -0.35 -0.06 -0.21 0.06 0.08 0.11 0.18 0.19 0.15
0.16 -0.07 -0.26 -0.21 -0.09 -0.18 -0.05 0.02 0.12 0.07 0.14 0.25
0.14 -0.28 -0.46 -0.68 -0.24 -0.25 -0.09 0.1 0.22 0.34 0.31 0.43
-1.13 -0.15 -0.53 -0.38 -0.75 -1.26 -0.08 0.38 0.34 0.55 0.62 0.72
0.1 -0.08 -0.22 -0.15 -0.07 -0.0 0.03 0.05 0.06 -0.04 0.08 0.19
-0.28 -0.22 -0.15 -0.09 -0.08 -0.09 0.05 0.05 0.15 0.14 0.18 0.23
0.49 -0.16 -0.52 -0.5 -0.29 -0.38 -0.18 0.1 0.21 0.1 0.28 0.39
0.07 -0.09 -0.17 -0.13 -0.16 -0.04 -0.09 -0.03 -0.03 0.12 0.13 0.32
-0.04 -0.15 -0.23 -0.23 -0.09 -0.03 -0.02 0.09 0.11 0.21 0.17 0.12
0.38 -0.24 -0.66 -0.49 -0.12 -0.2 -0.11 -0.02 -0.15 -0.03 0.32 0.74
0.09 -0.03 -0.3 -0.39 -0.23 -0.22 -0.06 0.06 0.1 0.2 0.26 0.32
0.01 -0.21 -0.05 -0.02 0.14 -0.18 -0.0 -0.04 -0.02 0.02 0.12 0.17
-0.04 -0.26 -0.29 -0.51 -0.06 -0.1 0.01 0.07 0.24 0.24 0.27 0.22

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.