Heatmap: Cluster_95 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
13 h after light
15 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
0.32 0.17 -0.16 -0.24 -0.32 -0.25 0.02 0.06 0.06 0.02 0.1 0.08
0.5 0.1 -0.33 -0.58 -0.34 -0.12 0.18 0.4 -0.02 -0.01 -0.06 -0.07
0.3 0.21 -0.01 -0.37 -0.17 -0.27 -0.05 0.08 0.11 0.08 -0.01 -0.02
0.23 0.03 -0.1 -0.16 -0.15 -0.17 0.06 0.22 0.32 0.01 -0.12 -0.31
0.13 -0.02 -0.12 -0.08 -0.1 -0.08 0.08 0.15 0.05 -0.01 0.01 -0.06
0.25 0.05 -0.06 -0.12 -0.09 -0.03 0.02 0.11 -0.05 -0.06 -0.02 -0.03
0.56 0.79 -0.17 -0.88 -1.03 -0.81 -0.25 0.29 -0.09 0.01 0.24 0.14
0.33 -0.01 -0.11 -0.37 -0.22 -0.06 0.06 0.11 0.15 0.03 -0.07 0.01
2.52 1.51 -0.77 -0.41 -2.95 -2.66 -1.13 - -1.0 -1.3 -1.2 -
0.73 0.08 -0.31 -0.29 -0.25 -0.06 0.14 0.2 0.16 -0.15 -0.24 -0.43
0.71 0.21 -0.18 -0.73 -0.48 -0.37 -0.08 0.09 0.08 0.05 0.26 -0.1
0.22 -0.2 -0.24 -0.13 -0.08 0.08 0.09 0.36 0.04 0.04 0.01 -0.34
0.89 0.02 -0.49 -0.61 -0.76 -0.23 -0.27 0.56 0.09 0.13 -0.08 -0.11
0.01 0.09 -0.11 -0.2 -0.19 -0.13 0.03 0.15 0.19 0.11 0.01 -0.01
0.16 0.17 0.06 -0.18 0.01 -0.02 0.07 0.14 0.02 -0.1 -0.24 -0.17
0.37 -0.27 -0.11 -0.58 0.01 -0.53 0.04 -0.11 0.2 0.2 0.22 0.22
0.58 0.13 -0.78 -1.31 -0.78 -0.09 0.18 0.44 0.26 0.11 0.26 -0.09
0.31 0.07 -0.12 -0.4 -0.18 -0.22 0.12 0.25 0.2 0.01 -0.05 -0.15
0.47 0.13 -0.4 -0.78 -0.48 0.08 0.42 0.46 -0.06 -0.15 -0.13 -0.14
0.17 0.1 -0.08 -0.09 -0.09 0.02 -0.01 0.14 0.02 -0.05 -0.09 -0.08
1.96 1.92 -0.52 -2.04 -1.82 -3.19 -0.42 0.33 -2.75 -0.94 -2.18 -3.22
0.72 0.45 -0.22 -0.54 -0.44 -0.3 -0.13 0.02 -0.16 -0.1 0.02 0.14
0.45 0.34 -0.07 -0.25 -0.35 -0.31 0.04 0.22 -0.03 -0.05 -0.08 -0.17
0.49 0.32 -0.02 -0.64 -0.5 -0.31 0.05 0.29 -0.03 -0.1 0.01 0.03
0.25 -0.05 -0.18 -0.21 -0.04 0.03 0.05 0.2 -0.02 -0.02 0.01 -0.09
0.27 0.05 -0.11 -0.03 -0.15 -0.0 -0.1 0.11 -0.03 0.03 -0.02 -0.06
0.32 0.05 -0.07 -0.27 -0.2 -0.08 -0.1 0.07 0.04 0.13 0.04 -0.02
0.26 0.09 -0.21 -0.31 -0.23 -0.03 0.1 0.0 0.09 0.1 0.04 -0.02
1.92 1.74 0.49 -0.95 - - - 1.0 - - - -0.09
0.91 0.46 0.25 -0.55 -0.22 -0.29 -0.3 -0.39 -0.5 -0.37 -0.22 0.35
0.1 0.13 -0.13 -0.29 -0.14 -0.12 0.01 0.21 0.23 -0.02 0.03 -0.1
0.74 0.38 -0.03 -0.39 -0.16 -0.26 -0.04 -0.11 -0.07 -0.04 -0.15 -0.27
0.16 0.08 -0.32 -0.46 -0.31 -0.28 0.01 0.24 0.37 0.16 0.06 0.03
0.36 0.1 -0.03 -0.14 -0.12 0.02 -0.03 0.2 0.01 -0.1 -0.09 -0.29
0.26 0.08 0.1 -0.24 -0.01 -0.13 -0.12 0.09 0.13 0.03 -0.01 -0.27
2.85 1.11 - -2.65 -0.59 - -1.59 -2.46 -0.18 -2.0 - -2.77
0.19 -0.16 -0.16 -0.17 0.02 -0.15 0.05 0.22 0.2 0.05 -0.1 -0.08
0.03 -0.05 -0.18 -0.08 0.03 0.02 0.07 0.19 -0.0 -0.01 -0.02 -0.02
0.28 0.12 0.07 -0.08 -0.08 -0.29 0.03 0.04 0.13 0.05 -0.01 -0.36
0.35 0.06 -0.0 -0.13 -0.09 -0.11 0.08 0.16 0.02 -0.16 -0.13 -0.13
0.17 -0.03 -0.11 -0.19 -0.18 -0.0 -0.06 0.17 0.08 0.11 0.04 -0.04
-0.01 0.02 -0.09 -0.18 -0.21 -0.04 -0.0 0.2 0.13 0.08 0.08 -0.03
0.9 0.43 -0.16 -0.72 -0.54 -0.61 -0.09 0.21 -0.02 -0.04 -0.02 -0.15
0.31 -0.16 -0.23 -0.16 0.03 -0.01 0.05 0.13 0.06 0.07 0.03 -0.23
0.43 0.17 0.13 -0.13 -0.23 -0.35 -0.05 0.13 -0.14 -0.12 -0.02 0.01
2.26 -2.25 -1.28 -0.75 -1.02 -0.19 -0.05 0.13 0.43 -2.83 0.11 -
0.48 0.21 -0.13 -0.32 -0.3 -0.24 -0.13 0.13 -0.05 0.02 0.07 0.04
0.29 0.11 -0.03 -0.11 -0.12 -0.08 -0.03 0.09 -0.1 -0.09 -0.06 0.07
0.36 0.21 -0.14 -0.41 -0.33 -0.12 0.0 0.06 0.02 0.12 0.06 0.0
0.81 -0.14 -0.88 -0.95 -0.53 -0.13 0.1 0.33 0.23 0.14 0.02 0.08
0.05 -0.14 -0.19 -0.29 -0.16 -0.09 0.09 0.16 0.31 0.06 0.13 -0.04
1.11 -0.0 -0.42 -0.26 -0.08 0.11 0.21 0.24 -0.36 -0.48 -0.48 -0.55
0.05 0.04 0.04 -0.24 -0.03 -0.07 0.03 0.09 0.17 0.07 -0.05 -0.17
0.23 0.17 -0.14 -0.33 -0.25 -0.14 0.06 0.16 0.17 -0.06 -0.1 0.1
0.51 0.27 -0.01 -0.56 -0.26 -0.33 -0.07 0.08 0.05 -0.03 0.01 0.05
0.34 0.05 -0.13 -0.19 0.02 -0.24 0.03 0.24 0.05 -0.01 -0.08 -0.2
0.37 0.4 -0.1 -0.37 -0.35 -0.25 -0.06 0.04 -0.13 0.03 0.11 0.07
0.52 0.24 0.02 -0.35 -0.24 -0.13 -0.27 0.1 -0.01 -0.03 -0.07 -0.01
0.51 0.3 0.04 -0.42 -0.21 -0.23 -0.09 0.06 -0.06 -0.18 -0.09 0.12
0.07 0.06 -0.1 -0.26 -0.2 -0.14 -0.08 0.1 0.18 0.14 0.09 0.06
0.33 0.36 -0.31 -0.75 -0.79 -0.39 0.02 0.27 0.25 0.14 0.16 0.11
0.38 -0.12 -0.23 0.04 0.11 0.23 -0.13 0.49 -0.14 -0.15 -0.11 -0.75
0.55 0.32 0.02 -0.22 -0.18 -0.2 -0.02 -0.02 -0.11 -0.04 -0.09 -0.22
0.05 -0.13 -0.1 -0.17 0.04 -0.07 0.04 0.12 0.14 0.08 0.09 -0.14
0.39 0.1 -0.03 -0.08 -0.18 -0.24 0.04 0.12 0.07 -0.23 -0.07 -0.01
0.5 0.21 -0.07 -0.19 -0.26 -0.25 -0.18 0.1 -0.11 -0.08 0.05 0.07
0.49 -0.17 -0.34 -0.48 -0.14 -0.15 0.03 0.15 0.15 0.08 0.07 0.06
0.39 0.02 -0.17 -0.22 -0.18 -0.04 0.1 0.26 -0.01 -0.09 -0.15 -0.04
0.32 -0.18 -0.27 -0.43 -0.22 -0.08 -0.07 0.43 0.42 0.18 -0.15 -0.28
0.39 0.13 0.06 -0.15 -0.17 0.1 -0.01 0.23 0.04 -0.13 -0.21 -0.48
0.46 -0.13 -0.42 -0.24 -0.16 0.02 0.05 0.08 0.1 -0.0 0.06 0.0
1.02 0.38 -0.34 -0.45 -0.63 -0.35 0.04 0.35 0.21 -0.21 -0.43 -0.64
1.79 1.92 -0.82 -0.94 -0.72 -2.56 -3.55 -0.39 -1.34 -1.17 -1.18 -0.43
0.73 0.28 0.16 -0.35 -0.08 -0.32 -0.03 0.0 -0.09 -0.12 -0.12 -0.46
0.45 0.3 0.06 -0.28 -0.3 -0.24 -0.15 0.03 0.02 -0.09 -0.07 0.07
0.22 -0.18 -0.18 -0.17 -0.07 -0.08 0.17 0.31 0.07 -0.1 -0.06 -0.03
0.24 -0.15 -0.22 -0.39 -0.14 -0.2 0.08 0.15 0.1 0.05 0.21 0.12
0.2 -0.0 -0.06 -0.13 0.02 -0.03 0.02 -0.0 0.05 -0.02 -0.02 -0.05
0.35 -0.05 -0.31 -0.36 -0.23 -0.06 0.08 0.02 0.08 0.14 0.02 0.16
0.23 0.05 -0.01 -0.22 -0.18 -0.06 -0.06 -0.0 0.08 0.1 0.02 -0.01
0.75 0.21 -0.37 -0.81 -0.64 -0.29 0.0 0.21 0.26 0.19 -0.01 -0.2
0.26 0.2 -0.1 -0.39 -0.27 -0.18 -0.02 0.15 0.12 0.04 -0.03 0.09
0.5 -0.04 -0.12 -0.18 -0.03 0.01 -0.03 -0.1 0.01 -0.08 -0.08 0.01
0.99 -0.03 -0.41 -0.66 -0.36 -0.3 0.11 0.16 0.1 -0.04 -0.2 -0.07
0.06 0.03 -0.15 -0.24 0.04 -0.12 0.05 0.0 0.23 -0.04 0.17 -0.1
0.17 0.11 -0.21 -0.29 -0.21 -0.04 -0.09 0.15 0.05 0.14 0.12 0.01
0.66 0.13 -0.23 -0.22 -0.25 -0.16 -0.11 0.06 0.13 -0.1 0.05 -0.25
0.63 0.09 -0.19 -0.05 -0.1 -0.1 0.12 0.03 -0.06 -0.07 -0.14 -0.4
0.21 0.05 -0.07 -0.08 -0.02 -0.09 0.08 0.23 0.06 -0.1 -0.11 -0.24
-0.11 -0.62 -1.5 0.13 0.93 -0.66 -0.39 1.23 -0.2 -0.15 0.24 -1.44
0.45 0.04 -0.34 -0.43 -0.19 -0.28 0.05 0.33 0.06 -0.06 0.09 0.03
0.2 0.13 -0.09 -0.32 0.04 -0.26 -0.02 0.05 0.22 0.08 -0.1 -0.05
0.44 0.07 -0.12 -0.31 -0.17 -0.02 -0.09 0.33 0.02 0.01 -0.09 -0.25
2.49 1.36 0.52 -0.76 - - - 0.39 - -1.09 - -
0.42 -0.1 -0.09 -0.09 -0.2 -0.3 -0.14 0.15 0.15 -0.01 0.02 0.05
0.33 0.02 -0.23 -0.36 -0.21 0.01 0.23 0.54 0.11 -0.05 -0.25 -0.49
0.32 0.0 -0.29 -0.27 -0.29 -0.04 0.0 0.15 0.45 0.12 0.0 -0.42
0.13 0.15 0.02 -0.07 -0.04 -0.11 0.01 0.02 0.1 0.01 -0.04 -0.22
2.48 2.05 -0.17 -0.97 - - -0.84 - -1.59 - - -
0.29 0.08 -0.04 -0.13 -0.09 -0.08 -0.02 0.07 0.17 0.0 -0.13 -0.21
0.2 -0.1 -0.03 -0.35 -0.11 -0.28 -0.04 0.1 0.39 0.21 -0.04 -0.12
0.46 0.02 -0.05 -0.32 -0.02 -0.04 0.09 0.23 0.04 -0.17 -0.13 -0.28
0.78 -0.18 -0.51 -0.22 -0.17 0.09 0.26 0.2 0.04 -0.21 -0.24 -0.34
0.34 0.12 -0.08 -0.12 -0.09 0.02 0.03 0.05 0.05 -0.06 -0.18 -0.17
0.54 0.07 -0.17 -0.5 -0.28 -0.17 0.14 0.41 0.04 -0.09 -0.17 -0.15
0.9 0.29 -0.34 -0.74 -0.65 -0.58 -0.21 0.34 -0.02 -0.02 0.09 0.07
0.8 0.56 -0.1 -0.65 -0.63 -0.33 -0.21 0.16 -0.17 -0.14 0.03 -0.03
0.36 -0.14 -0.17 -0.52 -0.2 -0.16 0.06 0.3 0.26 0.09 0.01 -0.11
0.25 0.08 0.06 -0.21 -0.03 0.02 0.08 0.15 0.01 -0.11 -0.14 -0.23
0.22 0.1 -0.11 -0.17 -0.23 -0.08 0.0 0.43 -0.0 -0.02 0.01 -0.3
0.42 0.28 0.12 -0.33 -0.11 0.04 -0.1 0.08 -0.07 -0.21 -0.14 -0.16
0.06 0.01 -0.06 -0.19 0.1 -0.29 0.19 0.03 0.14 0.11 -0.02 -0.16
0.57 0.42 0.11 -0.21 -0.41 -0.28 -0.02 0.21 0.1 -0.18 -0.31 -0.4
0.78 0.48 -0.22 -0.69 -0.24 -0.43 -0.03 -0.09 0.04 -0.08 0.06 -0.17
0.57 0.14 -0.05 -0.11 -0.19 -0.24 -0.19 -0.09 -0.03 -0.11 0.03 0.08

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.